Para analisar e comparar várias sequências de primer simultaneamente.

Escreva ou cole as sequências dose primers no campo de entrada (janela superior). O analisador aceita texto e formato de tabela (pode ser copiado de um arquivo Excel, por exemplo). Nota: Este analisador requer pelo menos duas sequências de primer no campo de entrada. Para primers únicos (determinação de Tm do primer), você pode escolher a calculadora de Tm para PCR.

  • Um nome é necessário para cada primer (por exemplo, Seq1 agtcagtcagtcagtcagtc).
  • O nome e a sequência podem ser separados por espaço ou tabulação, desde que o estilo seja o mesmo para todos os primers
  • Sequências de primer degeneradas também são aceitas
  • OBSERVAÇÃO: Se o primer de PCR tiver regiões não complementares (mismatches) , por exemplo, para criar uma mutação ou um sítio de restrição, certifique-se de calcular a Tm somente para a sequência corretamente complementar.

Os resultados aparecerão instantaneamente nos campos de saída (janelas inferiores) e serão atualizados automaticamente se você fizer alterações nas sequências. O analisador apresentará os seguintes resultados:

  • Tm (°C)*
  • Conteúdo de CG (%)
  • Comprimento dos primers (nt)
  • Número de bases individuais (A, T, C e G)
  • Coeficiente de extinção (L/(mol·cm))
  • Peso molecular (g/mol)
  • /Quantidade/ unidade OD (nmol/OD260)
  • Massa (µg/OD260)
  • Estimativa de formação de dímeros de primer**

*A Tm calculada para um determinado primer pode variar significativamente entre os diferentes métodos de cálculo. Esta calculadora de Tm usa um método de aproximação modificado com base no método descrito por Breslauer et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 83, 3746-50 (1986).

**O analisador relata possíveis dímeros de primer com base nos parâmetros de detecção fornecidos abaixo da janela de entrada de sequência. As informações de dímero devem ser usadas como um guia preliminar ao selecionar combinações de primer adequadas. Não são dados conclusivos. Na reação real de amplificação , a formação de dímeros de primer pode variar dependendo das condições da PCR.

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.