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DNA 유형별 유전체 DNA 추출
모든 DNA 추출에 적합한 제품
당사의 DNA 추출 제품에는 Cell-Free DNA, 미생물 DNA, PCR 클린업(Clean-up) 및 염기서열 특이적 DNA의 정제를 위한 키트 및 시약이 포함되어 있습니다.
다음 용도의 DNA 추출 제품에 대해 자세히 알아보기.
Cell-Free 샘플에서 DNA 추출
혈장, 혈청 및 소변과 같은 생물학적 유체 샘플에는 Cell-Free DNA(cfDNA)가 포함되어 있습니다. cfDNA는 병원체 검출에 사용되며 cfDNA 표적은 종양학 연구에서 바이오마커로 사용됩니다. cfDNA는 일반적인 샘플에서 존재량이 적기 때문에 분리하기 어렵습니다. 병원체 검출에서 바이러스 입자 역시 일반적으로 존재량이 적어서 포착하기 어렵습니다. 따라서 분석을 위해 충분한 양의 cfDNA를 얻기 위해서는 대량의 생물학적 유체(취급하기 어려울 수 있음)가 필요합니다. 당사는 여러 형식의 다양한 샘플 유형에서 cfDNA를 효율적으로 회수하면서 이러한 대량의 샘플을 처리할 수 있는 확장 가능한 제품을 개발했습니다.
혈장, 혈청 및 소변 샘플에 적합한 DNA 추출 키트는 무엇입니까?
| 주문하기 | 주문하기 | 주문하기 | |
| 바이러스 핵산의 빠른 분리 | 간편한 사용, 높은 감도 | 자동화된 형식, 대량의 혈장 처리 가능 | |
|---|---|---|---|
| PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit | PureLink Pro 96 Viral RNA/DNA Purification Kit | MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit | |
| 샘플 주입 | 500 µL | 200 µL | 0.5–10 mL |
| 적합한 샘플 | 혈장, 혈청, 뇌척수액 | 혈장, 혈청, 뇌척수액 | 혈장, 혈청, 소변 |
| 분리 방법 | 실리카막 | 필터 플레이트 | 마그네틱 비드 |
| 고처리량 적합성 | 아니오 | 예 | 예 |
| 적합한 응용분야 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 |
| 전처리 시간 | 15분 | 35 분 | 24 <1시간 이내의 샘플 |
| Prep size | 50 Prep | 4 x 96 Prep | 50 Prep |
PureLink Microbiome DNA Purification Kit
Invitrogen PureLink Microbiome DNA Purification Kit를 통해 대변 및 토양과 같은 까다로운 샘플 등의 다양한 샘플 유형에서 고품질의 미생물 및 숙주 DNA를 신속하게 분리할 수 있습니다. 이 키트는 PCR 및 염기서열분석과 같은 다운스트림 애플리케이션에서 바로 사용할 수 있으며 박테리아 또는 곰팡이에서 정제된 DNA의 높은 수율을 위해 입증된 기술인 PureLink 스핀 컬럼 기술을 사용합니다. 이 키트는 고효율 삼중 세포용해(triple-lysis) 접근법, 빠른 억제제 제거 및 이 DNA 추출 절차의 다기능성을 제공하므로 다양한 샘플에서 병원성 세균을 빠르게 검출하기 위한 프로그램 뿐만 아니라 마이크로바이옴 연구 프로젝트를 위한 최고의 키트입니다.
PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 다음을 제공합니다.
- 특수 비드를 통한 열, 화학적 및 기계적 파괴와 조합한 모든 미생물(두껍고 복잡한 세포벽이 있어 내구성을 가지는 종 포함)의 효율적인 세포용해
- 새로운 세척 완충액을 사용하여 침전에 의한 억제 화합물 제거
- 다양한 생물학적 샘플을 위한 간소화된 프로토콜
- PCR, 염기서열분석 및 기타 다양한 유형의 다운스트림 분석과 호환되는 고순도 DNA의 회수
다양한 샘플 유형에서 미생물 및 숙주의 DNA를 분리하는 하나의 키트
PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 광범위한 생물학적 샘플에 사용하도록 최적화되었기 때문에 "특수" 키트를 주문할 필요가 없도록 설계되었습니다. 이 다목적 키트는 다음 샘플에서 미생물(및 숙주, 해당되는 경우) DNA의 정제를 가능하게 합니다.
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동영상: 대변 검체에서 미생물 및 숙주 DNA를 정제하는 방법
지역사회에서 샘플링된 다양한 미생물을 정확하게 반영하는 미생물 DNA의 분리 방법에 대해 알아보기. 이 동영상은 대변 미생물 DNA 분리에 대한 개요, 몇 가지 팁과 요령을 제공합니다. PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 대변 이외에도 소변, 타액, 스왑, 수송 배지, 미생물 배양 및 토양으로부터 DNA를 분리하는 데 사용할 수 있습니다.
동영상: 세균 검출 : 마이크로바이옴에 대해 이해.
애리조나 대학 암 센터의 Genomics Shared Service의 공동 이사인 Watts 박사는 질병 발생 및 진행에 있어 인간 마이크로바이옴과 그의 역할에 대해 이해하는 데 초점을 맞추고 있습니다. 특히 당뇨병성 족부 궤양 환자의 존재하는 모든 세균을 정확하게 식별할 수 있도록 16S RNA 염기서열분석을 사용합니다.
실험 데이터 지원
그림 1. 인간 대변에서 미생물 및 숙주 DNA 정제. PureLink Microbiome DNA Purification Kit(PL) 및 주요 경쟁사 키트(MB)를 사용하여 세 기증자(D1–D3)로부터 채취한 대변 샘플 0.2 g(3중)에서 DNA를 분리했습니다. (A) Thermo Scientific NanoDrop 분광광도계 및 Invitrogen Qubit 형광계로 측정한 DNA 농도 및 DNA 순도(A260/A230, A260/A280). 용리량: 두 키트 모두에 대해 100µL. PureLink 키트는 경쟁사의 키트에 비해 DNA를 2~5배 더 많이 회수하였습니다. (B) 0.8% 아가로스 젤에서의 DNA 분석. M: 1 kb ladder. PureLink 키트는 경쟁사 키트에 비해 훨씬 많은 양의 높은 무결성 DNA를 회수했습니다. (C) 세 가지 세균 표적(Bifidobacterium, E. coli, 및 Bacteroides/Prevotela)에 대해 해당 Applied Biosystems TaqMan assay를 사용한 qPCR 분석 PureLink 키트를 사용하여 생성된 샘플은 경쟁사 키트로 생성된 샘플보다 역치 사이클(CT)이 낮았으며 이는 PCR 증폭이 더 잘 되었음을 나타냅니다. 더 많은 양의 DNA 템플릿과 더 낮은 수준의 억제제가 모두 PCR 증폭의 효율성에 기여합니다.
그림 2. 배양 배지에서 세균 DNA 정제.E. coli DNA는 0.2, 0.4, 및 1mL의 배양 샘플(3중)에서 PureLink Microbiome DNA Purification Kit를 사용하여 분리되었습니다. (A) Thermo Scientific NanoDrop 분광광도계(파란색 막대) 및 Invitrogen Qubit 형광계(빨간색 막대)를 사용하여 측정한 DNA의 농도를 표시합니다. 모든 준비 과정에서 DNA의 순도는 매우 높았습니다. A260/A280 = 1.9, A260/A230 = 2.1–2.3. (B) E. coli–특이적 TaqMan assay를 이용한 qPCR 분석. 역치 사이클(CT)은 3개의 샘플 주입 부피와 함께 수행되는 분리에 대해 표시됩니다.
사용자 안내서
복잡한 DNA 혼합물에 대한 PCR 클린업
PCR 클린업은 일상적이지만 시간 소모적인 실험실 절차입니다. 이제 더 쉽고 빠르며 안전한 방법을 사용하여 우수한 결과를 얻을 수 있습니다. PCR 반응에서 짧은 프라이머, 비결합 dNTP, 효소, 짧은-실패 PCR 산물 및 염을 효율적으로 제거하는 간단하고 빠른 PCR 클린업 방법을 사용하여 DNA를 정제하십시오.
분리된 DNA는 서열분석, PCR, 전사, 맵핑, 클로닝, 라벨링에 사용할 수 있습니다. 당사는 광범위한 Invitrogen PCR Clean-Up kit와 높은 수율의 순수한 DNA를 얻는데 필요한 지원을 제공합니다.
나에게 맞는 PCR product clean-up kit 알아보기
| 주문하기 | 주문하기 | 주문하기 | 주문하기 | |
| 부산물의 빠르고 효율적인 제거 | 저수율 PCR 산물 농축에 이상적 | 간단하고 신뢰할 수 있으며 빠른 방법, 96-웰 형태 | 빠르고 확장 가능한 마그네틱 비드 형태 | |
|---|---|---|---|---|
| PureLink PCR Purification Kit | PureLink PCR Micro Purification Kit | PureLink 96 PCR Purification Kit | ChargeSwitch PCR Clean-Up Kit | |
| 형식 | 스핀/진공 컬럼 | 스핀/진공 컬럼 | 96-웰 플레이트(진공/원심분리) | 마그네틱 비드 |
| 프로토콜 시간 | 15분 | 15 분 | 15 분 | 5 분 |
| 샘플 부피 | 50–100 µL | 50–100 µL | 50–100 µL | 25–50 µL |
| 수율 플라스미드 DNA | 최대 40 µg | 최대 20 µg | 최대 20 µg | 최대 30 µg |
| DNA 단편 크기 | 100 bp–15 kb | 100 bp–15 kb | 100 bp–15 kb | 90 bp–40 kb |
| 결합 용량 | 최대 40 µg | 최대 40 µg | 최대 40 µg | 1mg당 ~25 µg 비드 |
| 다운스트림 애플리케이션 | 서열분석, 서열분석(차세대), 핵산 라벨링, PCR, 클로닝 | 서열분석, 핵산 라벨링, PCR, 클로닝 | 서열분석, 클로닝 | 서열분석, 서열분석(차세대), 마이크로어레이 분석, PCR, 클로닝 |
| 고처리량 사용 가능 | 아니오 | 아니오 | 예 | 예 |
| 포장 크기 | 50개 전처리 250개 전처리 | 50 전처리 250개 전처리 | 4개 플레이트 | 100개 전처리 960개 전처리 |
| 카탈로그 번호 | K310001 K310002 | K310050 K310250 | K3100-96A | CS12000 CS12000-10 |
PCR 정제와 gel 추출을 모두 수행합니까?
그렇다면 단일 키트로 두 가지 프로세스를 수행할 수 있는 Invitrogen PureLink combo kit를 고려하십시오.
Invitrogen PureLink Quick Gel Extraction and PCR Purification Combo Kit에 대해 자세히 알아보기
빠르고 간편한 DNA gel 추출
PureLink Quick Gel Extraction Kit는 30분 안에 아가로스 젤에서 DNA 단편을 정제하도록 설계되었습니다. 이 간단한 절차는 고유한 실리카막 스핀 컬럼을 사용하여 pH 조정 없이 40bp ~ 10kb의 DNA 단편을 포착하고 정제합니다. 분리된 DNA는 단백질, 염료 및 아가로스가 없으며 DNA 염기서열분석, PCR, in vitro 전사, 제한 맵핑, 클로닝 및 라벨링 등 다양한 응용분야에서 바로 사용할 수 있습니다(그림 1).
그림 1. PureLink Quick Gel Extraction Kit를 사용하여 분리된 DNA의 증폭. 재조합 Taq DNA Polymerase를 사용하여 100 bp ~ 5.4 kb의 다양한 크기의 PCR 앰플리콘을 준비했습니다. 각 PCR 반응의 일부는 1% UltraPure Agarose gel에서 실행되었으며(데이터 표시 안 됨), PureLink Quick Gel Extraction Kit를 사용하여 앰플리콘 밴드를 절제 및 추출하였습니다. 비정제 및 젤-추출 PCR 산물을 1% 아가로스 젤에 로드하였으며 SYBR Safe DNA Gel Stain을 사용하여 시각화했습니다.
PureLink Quick Gel Extraction Kit의 친환경 이점
PureLink Combo Kit
복잡한 PCR 혼합물에서 DNA를 분리하고 아가로스 젤에서 밴드를 회수해야 합니까? 콤보 키트를 사용해 보십시오.
PureLink Quick Gel Extraction and PCR Purification Combo Kit는 단일 키트로 젤 추출 및 PCR 정제를 모두 수행할 수 있습니다.
PureLink Quick Gel Extraction and PCR Purification Combo Kit에 대해 자세히 알아보기 ›
기술 리소스
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염기 서열 특이적 RNA/DNA 정제
Invitrogen streptavidin-coupled Dynabeads는 특정 RNA 또는 DNA 염기 서열을 포착한 다음 용액에서 직접적으로 추출하는 데 사용할 수 있는 강력한 다목적 도구입니다. 이 단일사이즈의 초상자성 Dynabeads는 니트로셀룰로오스에 대한 효율적이고 고체상의 대안을 제공하며 비교할 수 없는 수준의 결과물 품질 및 데이터 일관성을 제공합니다. 뛰어난 근액체상 반응 역학을 통해 매우 빠른 프로토콜을 사용할 수 있습니다. 자성 취급이 기본적으로 쉽기 때문에 다운스트림 조작과 완충액 변경은 자석을 사용하여 튜브 벽에 비드 바인딩 된 타겟을 농축한 다음 상등액을 폐기하는 것만큼 간단합니다. 이 비드는 대부분의 체액, 식물의 비가공 용해물, 동물 및 미생물 유래 및 정제된 총 RNA 또는 DNA를 포함한 매우 광범위한 샘플 유형과 호환됩니다. 이러한 Dynabeads는 특정 표적 RNA 또는 DNA 분자만 상호 작용하므로 총 RNA 또는 DNA의 업스트림 정제는 거의 항상 불필요한 단계입니다.
직접 포착 절차는 이중 가닥 PCR 결과물을 비드에 고정시키는 작업을 포함합니다. 이들은 단일 가닥 비드 결합 템플릿으로 쉽게 변환되며, 용액에서 직접 특정 RNA 또는 DNA 분자를 포착하는 데 사용됩니다.
경우에 따라 대안적인 간접 포착 접근 방식이 더 빠른 반응 역학을 제공할 것입니다. 이 간접 포착 절차는 마그네틱 비드를 고정하기 전에 타겟 염기 서열을 포착할 수 있습니다. 우선, 비오틴이 부착된 포착 염기 서열(단일 가닥 DNA)을 검체와 함께 인큐베이션 하여 용액 내 표적 RNA 또는 DNA 분자와 혼합할 수 있도록 합니다. 그 다음, 스트렙타비딘 코팅 Dynabeads를 혼합물에 추가하며 혼합된 서열(sequence)은 스트렙타비딘-비오틴 결합을 통해 Dynabeads에 고정됩니다.
1 µm의 Dynabeads MyOne Streptavidin C1은 비드 mg당 표면적이 매우 높아 적은 양의 RNA 또는 DNA의 고농축을 가능하게 합니다. 뇌척수액과 같이 점성이 더 높은 샘플에서 핵산을 채취하기 위해서는 보다 큰 2.8 µm 크기의 Dynabeads M-270Streptavidin이 권장됩니다. 이러한 Dynabeads(MyOne Streptavidin C1 및 M-270 Streptavidin)는 비표적 핵산 서열의 비특이적 결합을 무시할 수 없도록 약간 음전하를 띤 표면을 갖도록 최적으로 설계되었습니다.
응용분야에는 RNA/DNA 감염성 제제 분리(1,2,3,4), 감산 혼성화(5,6,7), cDNA 선택 및 농축, 돌연변이형 염기 서열의 검출 및 격리(8,9,10), 세포 특이적 전사체 분리 및 mRNA 차이 표시가 포함됩니다.
Nucleic Acid Capture Assays에 대해 자세히 알아보기 ›
- Meng Q. et al. (2001) Automated multiplex assay system for simultaneous detection of hepatitis B virus DNA, hepatitis C virus RNA and human immunodeficiency virus type 1 RNA. J.Clin.Microbiol. 39(8):2937-2945.
- Stevens SJC. et al. (1999) Monitoring of Epstein-Barr virus DNA load in peripheral blood by quantitative competitive PCR. J.Clin. Microbiol. 37:2852-2857.
- Mangiapan G. et al. (1996) Sequence capture-PCR improves detection of mycobacterial DNA in clinical specimens. J. Clin. Microbiol. 34(5):1209-1215.
- Shuber AP. et.al. (2002) Accurate, noninvasive detection of Helicobacter pylori DNA from stool samples: potential usefulness for monitoring treatment. J. Clin. Microbiol. 40(1):262-264.
- Hansen-Hagge TE. et.al. (2001) Identification of sample-specific sequences in mammalian cDNA and genomic DNA by the novel ligation-mediated subtraction (LIMES). Nucl. Acids Res. 29(4):e20.
- Pradel N. et.al. (2002) Genomic subtraction to identify and characterize sequences of Shiga toxin-producing Escherichia coli O91:H21. Appl. Env. Microbiol. 68(5):2316-2325.
- Laveder P. et.al. (2002) A two-step strategy for constructing specifically self-subtracted cDNA libraries. Nucleic Acids Res. 30(9):e38.
- Lindblad-Toh K.et.al. (2000) Large-scale discovery and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the mouse. Nature Genetics. 24:381-386.
- Miyashiro I. et.al. (2001) Molecular strategy for detecting metastatic cancers with use of multiple tumor-specific MAGE-A genes. Clin.Chem. 47(3):505-512.
- Dong SM. et.al. (2001) Detection of colorectal cancer in stool with the use of multiple genetic targets. J Natl. Cancer Inst. 93(11):858-865.
Cell-Free 샘플에서 DNA 추출
혈장, 혈청 및 소변과 같은 생물학적 유체 샘플에는 Cell-Free DNA(cfDNA)가 포함되어 있습니다. cfDNA는 병원체 검출에 사용되며 cfDNA 표적은 종양학 연구에서 바이오마커로 사용됩니다. cfDNA는 일반적인 샘플에서 존재량이 적기 때문에 분리하기 어렵습니다. 병원체 검출에서 바이러스 입자 역시 일반적으로 존재량이 적어서 포착하기 어렵습니다. 따라서 분석을 위해 충분한 양의 cfDNA를 얻기 위해서는 대량의 생물학적 유체(취급하기 어려울 수 있음)가 필요합니다. 당사는 여러 형식의 다양한 샘플 유형에서 cfDNA를 효율적으로 회수하면서 이러한 대량의 샘플을 처리할 수 있는 확장 가능한 제품을 개발했습니다.
혈장, 혈청 및 소변 샘플에 적합한 DNA 추출 키트는 무엇입니까?
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| 바이러스 핵산의 빠른 분리 | 간편한 사용, 높은 감도 | 자동화된 형식, 대량의 혈장 처리 가능 | |
|---|---|---|---|
| PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit | PureLink Pro 96 Viral RNA/DNA Purification Kit | MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit | |
| 샘플 주입 | 500 µL | 200 µL | 0.5–10 mL |
| 적합한 샘플 | 혈장, 혈청, 뇌척수액 | 혈장, 혈청, 뇌척수액 | 혈장, 혈청, 소변 |
| 분리 방법 | 실리카막 | 필터 플레이트 | 마그네틱 비드 |
| 고처리량 적합성 | 아니오 | 예 | 예 |
| 적합한 응용분야 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 | 클로닝, qPCR, 염기서열분석, 유전형 분석 |
| 전처리 시간 | 15분 | 35 분 | 24 <1시간 이내의 샘플 |
| Prep size | 50 Prep | 4 x 96 Prep | 50 Prep |
PureLink Microbiome DNA Purification Kit
Invitrogen PureLink Microbiome DNA Purification Kit를 통해 대변 및 토양과 같은 까다로운 샘플 등의 다양한 샘플 유형에서 고품질의 미생물 및 숙주 DNA를 신속하게 분리할 수 있습니다. 이 키트는 PCR 및 염기서열분석과 같은 다운스트림 애플리케이션에서 바로 사용할 수 있으며 박테리아 또는 곰팡이에서 정제된 DNA의 높은 수율을 위해 입증된 기술인 PureLink 스핀 컬럼 기술을 사용합니다. 이 키트는 고효율 삼중 세포용해(triple-lysis) 접근법, 빠른 억제제 제거 및 이 DNA 추출 절차의 다기능성을 제공하므로 다양한 샘플에서 병원성 세균을 빠르게 검출하기 위한 프로그램 뿐만 아니라 마이크로바이옴 연구 프로젝트를 위한 최고의 키트입니다.
PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 다음을 제공합니다.
- 특수 비드를 통한 열, 화학적 및 기계적 파괴와 조합한 모든 미생물(두껍고 복잡한 세포벽이 있어 내구성을 가지는 종 포함)의 효율적인 세포용해
- 새로운 세척 완충액을 사용하여 침전에 의한 억제 화합물 제거
- 다양한 생물학적 샘플을 위한 간소화된 프로토콜
- PCR, 염기서열분석 및 기타 다양한 유형의 다운스트림 분석과 호환되는 고순도 DNA의 회수
다양한 샘플 유형에서 미생물 및 숙주의 DNA를 분리하는 하나의 키트
PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 광범위한 생물학적 샘플에 사용하도록 최적화되었기 때문에 "특수" 키트를 주문할 필요가 없도록 설계되었습니다. 이 다목적 키트는 다음 샘플에서 미생물(및 숙주, 해당되는 경우) DNA의 정제를 가능하게 합니다.
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동영상: 대변 검체에서 미생물 및 숙주 DNA를 정제하는 방법
지역사회에서 샘플링된 다양한 미생물을 정확하게 반영하는 미생물 DNA의 분리 방법에 대해 알아보기. 이 동영상은 대변 미생물 DNA 분리에 대한 개요, 몇 가지 팁과 요령을 제공합니다. PureLink Microbiome DNA Purification Kit는 대변 이외에도 소변, 타액, 스왑, 수송 배지, 미생물 배양 및 토양으로부터 DNA를 분리하는 데 사용할 수 있습니다.
동영상: 세균 검출 : 마이크로바이옴에 대해 이해.
애리조나 대학 암 센터의 Genomics Shared Service의 공동 이사인 Watts 박사는 질병 발생 및 진행에 있어 인간 마이크로바이옴과 그의 역할에 대해 이해하는 데 초점을 맞추고 있습니다. 특히 당뇨병성 족부 궤양 환자의 존재하는 모든 세균을 정확하게 식별할 수 있도록 16S RNA 염기서열분석을 사용합니다.
실험 데이터 지원
그림 1. 인간 대변에서 미생물 및 숙주 DNA 정제. PureLink Microbiome DNA Purification Kit(PL) 및 주요 경쟁사 키트(MB)를 사용하여 세 기증자(D1–D3)로부터 채취한 대변 샘플 0.2 g(3중)에서 DNA를 분리했습니다. (A) Thermo Scientific NanoDrop 분광광도계 및 Invitrogen Qubit 형광계로 측정한 DNA 농도 및 DNA 순도(A260/A230, A260/A280). 용리량: 두 키트 모두에 대해 100µL. PureLink 키트는 경쟁사의 키트에 비해 DNA를 2~5배 더 많이 회수하였습니다. (B) 0.8% 아가로스 젤에서의 DNA 분석. M: 1 kb ladder. PureLink 키트는 경쟁사 키트에 비해 훨씬 많은 양의 높은 무결성 DNA를 회수했습니다. (C) 세 가지 세균 표적(Bifidobacterium, E. coli, 및 Bacteroides/Prevotela)에 대해 해당 Applied Biosystems TaqMan assay를 사용한 qPCR 분석 PureLink 키트를 사용하여 생성된 샘플은 경쟁사 키트로 생성된 샘플보다 역치 사이클(CT)이 낮았으며 이는 PCR 증폭이 더 잘 되었음을 나타냅니다. 더 많은 양의 DNA 템플릿과 더 낮은 수준의 억제제가 모두 PCR 증폭의 효율성에 기여합니다.
그림 2. 배양 배지에서 세균 DNA 정제.E. coli DNA는 0.2, 0.4, 및 1mL의 배양 샘플(3중)에서 PureLink Microbiome DNA Purification Kit를 사용하여 분리되었습니다. (A) Thermo Scientific NanoDrop 분광광도계(파란색 막대) 및 Invitrogen Qubit 형광계(빨간색 막대)를 사용하여 측정한 DNA의 농도를 표시합니다. 모든 준비 과정에서 DNA의 순도는 매우 높았습니다. A260/A280 = 1.9, A260/A230 = 2.1–2.3. (B) E. coli–특이적 TaqMan assay를 이용한 qPCR 분석. 역치 사이클(CT)은 3개의 샘플 주입 부피와 함께 수행되는 분리에 대해 표시됩니다.
사용자 안내서
복잡한 DNA 혼합물에 대한 PCR 클린업
PCR 클린업은 일상적이지만 시간 소모적인 실험실 절차입니다. 이제 더 쉽고 빠르며 안전한 방법을 사용하여 우수한 결과를 얻을 수 있습니다. PCR 반응에서 짧은 프라이머, 비결합 dNTP, 효소, 짧은-실패 PCR 산물 및 염을 효율적으로 제거하는 간단하고 빠른 PCR 클린업 방법을 사용하여 DNA를 정제하십시오.
분리된 DNA는 서열분석, PCR, 전사, 맵핑, 클로닝, 라벨링에 사용할 수 있습니다. 당사는 광범위한 Invitrogen PCR Clean-Up kit와 높은 수율의 순수한 DNA를 얻는데 필요한 지원을 제공합니다.
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| 부산물의 빠르고 효율적인 제거 | 저수율 PCR 산물 농축에 이상적 | 간단하고 신뢰할 수 있으며 빠른 방법, 96-웰 형태 | 빠르고 확장 가능한 마그네틱 비드 형태 | |
|---|---|---|---|---|
| PureLink PCR Purification Kit | PureLink PCR Micro Purification Kit | PureLink 96 PCR Purification Kit | ChargeSwitch PCR Clean-Up Kit | |
| 형식 | 스핀/진공 컬럼 | 스핀/진공 컬럼 | 96-웰 플레이트(진공/원심분리) | 마그네틱 비드 |
| 프로토콜 시간 | 15분 | 15 분 | 15 분 | 5 분 |
| 샘플 부피 | 50–100 µL | 50–100 µL | 50–100 µL | 25–50 µL |
| 수율 플라스미드 DNA | 최대 40 µg | 최대 20 µg | 최대 20 µg | 최대 30 µg |
| DNA 단편 크기 | 100 bp–15 kb | 100 bp–15 kb | 100 bp–15 kb | 90 bp–40 kb |
| 결합 용량 | 최대 40 µg | 최대 40 µg | 최대 40 µg | 1mg당 ~25 µg 비드 |
| 다운스트림 애플리케이션 | 서열분석, 서열분석(차세대), 핵산 라벨링, PCR, 클로닝 | 서열분석, 핵산 라벨링, PCR, 클로닝 | 서열분석, 클로닝 | 서열분석, 서열분석(차세대), 마이크로어레이 분석, PCR, 클로닝 |
| 고처리량 사용 가능 | 아니오 | 아니오 | 예 | 예 |
| 포장 크기 | 50개 전처리 250개 전처리 | 50 전처리 250개 전처리 | 4개 플레이트 | 100개 전처리 960개 전처리 |
| 카탈로그 번호 | K310001 K310002 | K310050 K310250 | K3100-96A | CS12000 CS12000-10 |
PCR 정제와 gel 추출을 모두 수행합니까?
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빠르고 간편한 DNA gel 추출
PureLink Quick Gel Extraction Kit는 30분 안에 아가로스 젤에서 DNA 단편을 정제하도록 설계되었습니다. 이 간단한 절차는 고유한 실리카막 스핀 컬럼을 사용하여 pH 조정 없이 40bp ~ 10kb의 DNA 단편을 포착하고 정제합니다. 분리된 DNA는 단백질, 염료 및 아가로스가 없으며 DNA 염기서열분석, PCR, in vitro 전사, 제한 맵핑, 클로닝 및 라벨링 등 다양한 응용분야에서 바로 사용할 수 있습니다(그림 1).
그림 1. PureLink Quick Gel Extraction Kit를 사용하여 분리된 DNA의 증폭. 재조합 Taq DNA Polymerase를 사용하여 100 bp ~ 5.4 kb의 다양한 크기의 PCR 앰플리콘을 준비했습니다. 각 PCR 반응의 일부는 1% UltraPure Agarose gel에서 실행되었으며(데이터 표시 안 됨), PureLink Quick Gel Extraction Kit를 사용하여 앰플리콘 밴드를 절제 및 추출하였습니다. 비정제 및 젤-추출 PCR 산물을 1% 아가로스 젤에 로드하였으며 SYBR Safe DNA Gel Stain을 사용하여 시각화했습니다.
PureLink Quick Gel Extraction Kit의 친환경 이점
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염기 서열 특이적 RNA/DNA 정제
Invitrogen streptavidin-coupled Dynabeads는 특정 RNA 또는 DNA 염기 서열을 포착한 다음 용액에서 직접적으로 추출하는 데 사용할 수 있는 강력한 다목적 도구입니다. 이 단일사이즈의 초상자성 Dynabeads는 니트로셀룰로오스에 대한 효율적이고 고체상의 대안을 제공하며 비교할 수 없는 수준의 결과물 품질 및 데이터 일관성을 제공합니다. 뛰어난 근액체상 반응 역학을 통해 매우 빠른 프로토콜을 사용할 수 있습니다. 자성 취급이 기본적으로 쉽기 때문에 다운스트림 조작과 완충액 변경은 자석을 사용하여 튜브 벽에 비드 바인딩 된 타겟을 농축한 다음 상등액을 폐기하는 것만큼 간단합니다. 이 비드는 대부분의 체액, 식물의 비가공 용해물, 동물 및 미생물 유래 및 정제된 총 RNA 또는 DNA를 포함한 매우 광범위한 샘플 유형과 호환됩니다. 이러한 Dynabeads는 특정 표적 RNA 또는 DNA 분자만 상호 작용하므로 총 RNA 또는 DNA의 업스트림 정제는 거의 항상 불필요한 단계입니다.
직접 포착 절차는 이중 가닥 PCR 결과물을 비드에 고정시키는 작업을 포함합니다. 이들은 단일 가닥 비드 결합 템플릿으로 쉽게 변환되며, 용액에서 직접 특정 RNA 또는 DNA 분자를 포착하는 데 사용됩니다.
경우에 따라 대안적인 간접 포착 접근 방식이 더 빠른 반응 역학을 제공할 것입니다. 이 간접 포착 절차는 마그네틱 비드를 고정하기 전에 타겟 염기 서열을 포착할 수 있습니다. 우선, 비오틴이 부착된 포착 염기 서열(단일 가닥 DNA)을 검체와 함께 인큐베이션 하여 용액 내 표적 RNA 또는 DNA 분자와 혼합할 수 있도록 합니다. 그 다음, 스트렙타비딘 코팅 Dynabeads를 혼합물에 추가하며 혼합된 서열(sequence)은 스트렙타비딘-비오틴 결합을 통해 Dynabeads에 고정됩니다.
1 µm의 Dynabeads MyOne Streptavidin C1은 비드 mg당 표면적이 매우 높아 적은 양의 RNA 또는 DNA의 고농축을 가능하게 합니다. 뇌척수액과 같이 점성이 더 높은 샘플에서 핵산을 채취하기 위해서는 보다 큰 2.8 µm 크기의 Dynabeads M-270Streptavidin이 권장됩니다. 이러한 Dynabeads(MyOne Streptavidin C1 및 M-270 Streptavidin)는 비표적 핵산 서열의 비특이적 결합을 무시할 수 없도록 약간 음전하를 띤 표면을 갖도록 최적으로 설계되었습니다.
응용분야에는 RNA/DNA 감염성 제제 분리(1,2,3,4), 감산 혼성화(5,6,7), cDNA 선택 및 농축, 돌연변이형 염기 서열의 검출 및 격리(8,9,10), 세포 특이적 전사체 분리 및 mRNA 차이 표시가 포함됩니다.
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