Transforming small molecule identification and characterization

Vaya más allá con la inteligencia y la tecnología

El espectrómetro de masas Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid combina la tecnología de analizador de masas líder del sector dedicada al análisis de moléculas pequeñas con la estrategia de adquisición de datos del MSn inteligente Thermo Scientific AcquireX, para recopilar datos más significativos. Al capturar más analitos de baja abundancia y aprovechar las herramientas de análisis de datos y predicción de espectros de masas optimizadas, el flujo de trabajo automatizado e intuitivo del sistema acelera los resultados para que pueda ir más allá más rápidamente.


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Supere los obstáculos

small molecule compound

Resolver la "crisis de identidad" de la identificación de compuestos de moléculas pequeñas.

En este seminario web tratamos un nuevo enfoque fundamental para el análisis de moléculas pequeñas no dirigidas que incluye espectrómetros de masas optimizados, nuevas y potentes estrategias de adquisición de datos y un arsenal de nuevas herramientas de software para convertir espectros de masas Orbitrap de alta calidad en estructuras de moléculas más pequeñas asignadas con fiabilidad.

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Hay pequeñas moléculas en todas partes. Vea cómo el espectrómetro de masas Thermo Scientific Orbitrap ID-X con flujo de trabajo AcquireX le ayuda a superar los cuellos de botella y crear bibliotecas de espectros de masas precisas para caracterizar sus muestras; ahorrándole tiempo y dinero.

Ventajas clave del espectrómetro de masas Orbitrap ID-X Tribrid

Se centra en los procesos científicos, no en la configuración del instrumento.Recopila los datos más importantes, no solo más datos.Velocidad, simplicidad y flexibilidad que se adaptan a su análisis.Clarifica los compuestos desconocidos con datos del MSn.
Perfila sus muestras complejas con la combinación de la arquitectura Thermo Scientific Tribrid, las plantillas del editor de métodos y los parámetros experimentales listos para usar, que le permiten adquirir datos de forma eficaz sin necesidad de contar con una amplia experiencia de usuario.Aumenta la eficacia del perfilado mediante la automatización de los métodos de adquisición de datos del MSn con la herramienta de adquisición de datos inteligente Thermo Scientific AcquireX y obtenga un mayor número de compuestos con fragmentaciones distinguibles que se pueden analizar más a fondo.Produce datos del MSn con mucha información en muestras complejas para conseguir un procesamiento de datos rápido y automatizado. Extrae resultados fiables de datos complejos mediante un conjunto completo e integrado de herramientas de análisis de datos.Identifica los compuestos conocidos y los desconocidos de forma segura y elucida las estructuras de los compuestos desconocidos con herramientas basadas en LC/MS para la elucidación estructural, incluidos árboles espectrales de masa del MSn, fragmentación en sílice y huellas digitales de iones precursores.

Guía para el pedido de Orbitrap ID-X


Aprenda cómo funciona el espectrómetro de masas Orbitrap ID-X Tribrid

Vea qué hace que el espectrómetro de masas Orbitrap ID-X Tribrid sea la solución preferida para transformar la identificación y caracterización de moléculas pequeñas.

El espectrómetro de masas combina el cuadrupolo, la trampa iónica y la tecnología del analizador de masas HRAM Thermo Scientific Orbitrap para adquirir más datos del MSn para cada análisis de muestras. Las técnicas de fragmentación dual CID y HCD están disponibles en cualquier etapa del MSn, con un análisis de masas subsecuentes en la trampa iónica o en el analizador de masas Orbitrap con una resolución extremadamente alta.

Rastro de iones del MS Orbitrap ID-X Tribrid

Orbitrap ID-X Tribrid MS ion path

Al capturar más analitos de baja abundancia y aprovechar un conjunto de herramientas de análisis de software optimizadas, completas e integradas, el problema relacionado con la identificación de elucidación estructural de moléculas pequeñas se puede resolver significativamente, haciendo más factible la identificación y la caracterización. Esto le permite avanzar más rápido que nunca.

Los tres niveles de las opciones de adquisición de datos AcquireX permiten el perfilado rápido de múltiples muestras o la interpretación exhaustiva de muestras a través de inyecciones replicadas. Cada método aumenta el número de muestras de compuestos que se han tomado con espectros de fragmentación distinguibles para la caracterización de muestras y estudios.

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Transforme la identificación y la caracterización de moléculas pequeñas con la herramienta de adquisición AcquireX para generar espectros de fragmentación más significativos.


Soluciones de software y biblioteca para optimizar el análisis de datos

Adapte sus requisitos de análisis con un software que proporcione velocidad, simplicidad y flexibilidad y que supere los retos en el análisis de datos de barrido completo del MS y la interpretación de moléculas pequeñas.

El software Thermo Scientific Compound Discoverer extrae de forma eficaz la información de alta fiabilidad a partir de los datos de HRAM de moléculas pequeñas con gran cantidad de información. Este software de análisis de datos de espectrometría de masas ofrece un conjunto completo de herramientas para resolver los problemas relacionados con el análisis de datos de moléculas pequeñas. El software optimiza la identificación desconocida, la determinación de diferencias reales entre las muestras y la elucidación de las vías biológicas. Es un centro donde se conectan los usuarios sin problemas con las herramientas que necesitan para analizar de forma productiva y segura.

Las bibliotecas y bases de datos de espectros de masas pueden ser necesarias para identificar compuestos desconocidos cuando no se dispone de patrones de referencia. Sobre todo en el caso de estudios en áreas como la metabolómica, la toxicología forense, alimentos & bebidas, contaminantes ambientales emergentes o sustancias extraíbles & lixiviables. Clasifique la búsqueda de la forma más eficaz con la biblioteca de espectros de fragmentación de mzcloud líder en el sector.

Obtenga más información sobre la biblioteca de espectros de masa de mzCloud.

Descubra todo lo que las bibliotecas de espectros de masas de alta resolución pueden cambiar al resolver los problemas relacionados con la caracterización de moléculas pequeñas desconocidas y cómo las potentes herramientas de análisis de datos pueden sacar el máximo partido de estas bibliotecas. Estas herramientas le permiten encontrar respuestas de forma rápida y segura para impulsar el proceso de toma de decisiones.

Admite la búsqueda de árboles de iones espectrales del MSn y permite la creación de bibliotecas personalizadas.

La identificación fiable de compuestos desconocidos de moléculas pequeñas y la elucidación estructural pueden requerir mucho trabajo y mucho tiempo. Simplifique y agilice este proceso con el software Thermo Scientific Mass Frontier que utiliza las bibliotecas experimentales de fragmentación y espectros disponibles de mayor calidad y completamente depuradas para proporcionar una mayor comprensión y fiabilidad a la hora de convertir sus datos en conocimientos prácticos.

Si las pequeñas moléculas desconocidas no proporcionan un resultado espectral positivo, ¿cómo podemos identificarlas?

El algoritmo de análisis de datos mzLogic maximiza fácilmente los datos del MSn.

Reduzca la confusión de docenas o cientos de posibilidades de bases de datos químicas mediante el uso de sus datos de fragmentación reales combinados con la biblioteca de espectros depurada de mayor calidad.  Aproveche mzLogic y combine la similitud de la biblioteca espectral con la búsqueda en bases de datos químicas de una forma completamente nueva. Así, podrá aprovechar la información de fragmentación del mundo real y proponer los mejores candidatos para los verdaderos compuestos desconocidos.

Maximice sus datos de fragmentación real combinando la búsqueda de similitudes en las bibliotecas de espectros con la búsqueda en bases de datos químicas.

Los datos de alta calidad del MSn proporcionados por el espectrómetro de masas Orbitrap ID-X consiguen resolver el problema actual de la identificación de compuestos. Lo logran mediante la combinación de la huella de iones precursores con el análisis de subestructura de metabolitos desconocidos. Entre las herramientas adicionales disponibles para la elucidación de estructuras basadas en LC-MS se incluyen los árboles espectrales de masa del MSn y la fragmentación en sílice.

Compound annotation using MSn to demystify unknowns

Espectros comparativos de MS/MS para dos isómeros estructurales flavonoides donde la única diferencia estructural está asociada con la subestructura de la aglicona. La adición de los dos anillos de azúcar a la subestructura de la base de la aglicona da lugar a patrones espectrales MS/MS similares que impiden una identificación estructural correcta a pesar de los errores de masa baja de los iones precursores y del producto MS/MS. La incorporación del MS3 activada por la pérdida neutra realiza un análisis espectral de masa en tándem y la posterior adquisición de MS3, lo que resulta en la definición clara de los dos compuestos isoméricos.

Monitor your mass spectrometry analyses anywhere, anytime.

Controle sus análisis de espectrometría de masas en cualquier momento y lugar.

El uso de la aplicación web y de smartphone Thermo Scientific Almanac le permite acceder y administrar de forma remota los sistemas de LC-MS, lo que le permite concentrarse en otras tareas importantes durante el día.

Compruebe el estado del sistema y las adquisiciones en tiempo real, configure los correos electrónicos automatizados para que le notifiquen de una adquisición finalizada o un error, programe el acceso al instrumento, controle la utilización o envíe archivos de mantenimiento para ayudar en el diagnóstico del sistema y maximizar el tiempo de actividad.

Herramientas fundamentales de Almanac

  • Plataforma de conexión de instrumentos: administre sus sistemas y datos en una única ubicación.
  • Estado del instrumento: vea lo que sucede en tiempo real.
  • Libro de registro de instrumentos y eventos: vea fácilmente lo que ha ocurrido y registre la información importante.
  • Informes sobre el uso de instrumentos: evalúe el uso del sistema con el tiempo.
  • Programador de instrumentos: administre el acceso y la utilización del sistema.
  • Presionar para realizar el mantenimiento: minimice el tiempo que se tarda en diagnosticar problemas.
Almanac Workflow

Conecte su laboratorio: Esté siempre informado de lo que sucede en su laboratorio con cualquier dispositivo conectado a la nube. Maximice la utilización del sistema con una tendencia a largo plazo del uso del sistema y el rendimiento de las muestras mediante la comprobación de la adquisición de datos y otras muchas herramientas de productividad.

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Aplicaciones idóneas para utilizar el espectrómetro de masas Orbitrap ID-X

Actualmente, la insuficiente anotación del metaboloma limita la interpretación biológica de estudios metabolómicos no dirigidos. El MS Orbitrap ID-X proporciona un enfoque optimizado para lograr de forma rutinaria una cobertura completa del metaboloma con anotaciones compuestas fiables contra bibliotecas de espectros y elucidación estructural de novo de metabolitos desconocidos. El MS Orbitrap ID-X combina la potencia de la tecnología del analizador de masas HRAM Orbitrap con la adquisición inteligente del MSn, AcquireX, para la metabolómica no dirigida. Reinventan la forma en que se hace la metabolómica hoy en día para lograr resolver el problema de la identificación.

Higher efficiency - Orbitrap ID-X

El MS Orbitrap ID-X proporciona un muestreo de MS/MS mejorado al excluir automáticamente los iones de fondo y enfocar la adquisición en componentes de muestras reales. Este novedoso enfoque basado en datos, Acquire X, utiliza inyecciones secuenciales para interpretar más compuestos únicos. AcquireX aumentó el número de compuestos con datos de fragmentación en plasma humano (NIST SRM1950) sobre el DDA tradicional en un 139 % después de tres inyecciones.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Distribution of precursor intensity per subsequent injection

AcquireX evita la fragmentación redundante de compuestos muy abundantes, lo que permite tomar muestras de más analitos de menor abundancia con inyecciones posteriores. En el análisis del plasma humano (NIST SRM1950), los compuestos más abundantes solo se fragmentaron en la inyección uno, lo que resultó en una intensidad media 5 veces menor de la de los compuestos fragmentados de la inyección 1 a la inyección 3.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Higher quality - Orbitrap ID-X part1

El Orbitrap ID-X ofrece la fragmentación multietapa (MSn) y la flexibilidad de las técnicas de disociación complementarias (HCD, CID) para aumentar la probabilidad de generar espectros de iones de productos con información abundante en más clases compuestas. La fragmentación del metabolito quinurenina ilustra la complementariedad de HCD y CID.

Higher quality - Orbitrap ID-X part2

La anotación de espectros de mayor calidad mejora la cobertura de los metabolitos y permite la anotación completa de la vía y la interpretación funcional de los resultados. Las anotaciones fiables de metabolitos en la vía de degradación del triptófano permitieron detectar cambios en los niveles de ácido antranílico en una comparación entre donantes sanos y donantes con la enfermedad de Crohn.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Higher efficiency - Orbitrap ID-X

El MS Orbitrap ID-X proporciona un muestreo de MS/MS mejorado al excluir automáticamente los iones de fondo y enfocar la adquisición en componentes de muestras reales. Este novedoso enfoque basado en datos, Acquire X, utiliza inyecciones secuenciales para interpretar más compuestos únicos. AcquireX aumentó el número de compuestos con datos de fragmentación en plasma humano (NIST SRM1950) sobre el DDA tradicional en un 139 % después de tres inyecciones.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Distribution of precursor intensity per subsequent injection

AcquireX evita la fragmentación redundante de compuestos muy abundantes, lo que permite tomar muestras de más analitos de menor abundancia con inyecciones posteriores. En el análisis del plasma humano (NIST SRM1950), los compuestos más abundantes solo se fragmentaron en la inyección uno, lo que resultó en una intensidad media 5 veces menor de la de los compuestos fragmentados de la inyección 1 a la inyección 3.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Higher quality - Orbitrap ID-X part1

El Orbitrap ID-X ofrece la fragmentación multietapa (MSn) y la flexibilidad de las técnicas de disociación complementarias (HCD, CID) para aumentar la probabilidad de generar espectros de iones de productos con información abundante en más clases compuestas. La fragmentación del metabolito quinurenina ilustra la complementariedad de HCD y CID.

Higher quality - Orbitrap ID-X part2

La anotación de espectros de mayor calidad mejora la cobertura de los metabolitos y permite la anotación completa de la vía y la interpretación funcional de los resultados. Las anotaciones fiables de metabolitos en la vía de degradación del triptófano permitieron detectar cambios en los niveles de ácido antranílico en una comparación entre donantes sanos y donantes con la enfermedad de Crohn.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

El análisis de moléculas pequeñas de productos farmacéuticos abarca la ID de impureza de API, la ID del metabolito, el perfil de degradación y el análisis de sustancias extraíbles & lixiviables. Cada uno de ellos desempeña un papel fundamental y es parte integrante de la investigación & el desarrollo de los medicamentos. La espectrometría de masas de alta resolución (HRMS) ha sido una herramienta fundamental para estas aplicaciones.

El espectrómetro de masas Orbitrap ID-X eleva la capacidad de HRMS a un nuevo nivel. Gracias a la adquisición inteligente de datos de AcquireX, se eliminan las matrices complejas mediante la exclusión automática del fondo, garantizando así la captura de analitos de baja abundancia, lo cual mejora la identificación de forma significativa. Los fragmentos MSn, que contienen información abundante, proporcionan un conocimiento profundo de la estructura y facilitan la identificación de compuestos desconocidos o inesperados con alta fiabilidad. Además, las plantillas ya preparadas permiten a los usuarios llevar a cabo el análisis con facilidad.

Análisis de impurezas realizado en el espectrómetro de masas Orbitrap ID-X mediante estrategias de adquisición de datos AcquireX. Se realiza un análisis de la muestra excipiente junto con un análisis para determinar los precursores de fondo. Los precursores de fondo se incorporan automáticamente a una lista de exclusión y, posteriormente, se importan al método refinado. La lista de exclusión disminuye el número de compuestos de interés objetivo significativamente durante los métodos de análisis estándar dependientes de los datos, lo cual da lugar a una adquisición de datos de los MS/MS y MS3 más eficiente. Los tiempos de retención resaltados indican los tiempos de elución medidos para dos impurezas isoméricas.

Espectros de los MS y MS/MS de masa exacta (HRAM) de alta resolución comparativos adquiridos en los tiempos de retención identificados. Los espectros del MS HRAM de barrido completo muestran la complejidad de los iones de fondo co-eluidos así como las impurezas isoméricas resaltadas (Figuras 1 y 2) para los dos tiempos de retención. Los iones de fondo difieren significativamente y requieren la generación automatizada de listas de exclusión para aumentar la eficiencia de muestreo de los MS/MS y MS3 del DDA. Los espectros iónicos de productos comparativos muestran fragmentos similares que impiden la asignación estructural. Se adquirió un espectro del MS3 del ión resultante MS/MS iónico de m/z 704 para asignar estructuras de impureza probables.

Se evaluaron las estructuras de iones de precursores y productos plausibles utilizando la herramienta Fragments and Mechanisms del software Mass Frontier 8.0. Se evaluaron dos estructuras plausibles para las vías de fragmentación para predecir la formación del ión producto m/z 583.1873. La primera estructura tiene una vía directa que justifica la fragmentación m/z 704 para formar el ión producto m/z 583, mientras que la segunda estructura propuesta predice que el fragmento m/z 583.1873 se originaría a partir del ión producto de MS/MS m/z 601 en contraposición a la estructura de iones producto m/z 704 alternativa.

El espectrómetro de masas Orbitrap ID-X, en combinación con el software Compound Discoverer, AcquireX y mzLogic, ofrece una solución convincente para la industria farmacéutica. Aprenda a resolver los problemas relacionados con su ID de metabolito.

Descubra cómo la Universidad de Liverpool en el Reino Unido realizó estudios metabolómicos no dirigidos de biomarcadores de muestras de suero clínico utilizando el MS Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid para una identificación segura.

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