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「蛍光色素、塩基数、塩基配列」 の記入済み注文書をご用意しました。
発注日と注文合計数をご記入の上、ご利用ください。
参考:腸管出血性大腸菌 O26、O103、O111、O121、O145 及び O157 の検査法について(食安監発 1120 第 1 号)
参考:Real-Time Quantitative PCR Detection method for Pork, Chicken, Beef, Mutton, Horseflesh in Foods.
「Real-Time PCRによる食品中の豚肉・鶏肉・牛肉・羊肉および馬肉の定量的検出法」,
Soichi TANABE, Makiko HASE, Takeo YANO, Masahiko SATO, Tatsuya FUJIMURA, and Hiroshi AKIYAMA
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
RNase P に設計した長短2つのアンプリコンの増幅量を比較することで、FFPE サンプルなどから調製したDNA の定量と断片化具合を評価するアッセイについてのご案内です。
これまで短いアンプリコンを検出するアッセイとしてTaqMan® RNase P Detection Reagents (製品番号:4316831) をご利用いただき、長いアンプリコンを検出するアッセイとして配列非公開のカスタムアッセイ (FFPE DNA QCアッセイ) をご利用いただいておりました。
これまで配列非公開で提供していたFFPE DNA QCアッセイについて、論文投稿などのために配列公開の要望を多くいただいておりました。そこで、この度配列非公開であった本アッセイの配列を公開することとしました。
また、FFPE DNA QCアッセイが TaqMan® Universal Master Mix II with UNG で増幅不良がみられるとの指摘をいただきましたので、配列を見直し、新たに設計し直したものを FFPE DNA QC アッセイ v2 として公開させていただきます。
FFPE DNA QC アッセイと FFPE DNA QC アッセイ v2 については、性能にほとんど差がないことを確認しております。 FFPE DNA QC アッセイと FFPE DNA QC アッセイ v2 の性能比較については、アプリケーションノート(DNA 断片化を評価する TaqMan® Assay の注意点について)をご覧ください。
下記1. 2. のうち、どちらかのアッセイをお選び下さい。
[配列]
Fwd Primer: | 5'-AGCTGAGTGCGTCCTGTCACT-3' |
Rev Primer: | 5'-ACCTCACCTCAGCCATTGAACT-3' |
TaqMan® MGB Probe (FAM): | 5'-CACTCCCATGTCCC-3' |
[配列]
Fwd Primer: | 5'-CCCTTGGGAAGGTCTGAGACTAG-3' |
Rev Primer: | 5'-CGGAGGAGAGTAGTCTGAATTGG-3' |
TaqMan® MGB Probe (FAM): | 5'-CTCACCTCAGCCATTG-3' |
図1 DNA の断片化を評価する仕組み
短い増幅断片を増幅する TaqMan Assay と長い増幅断片を増幅する TaqMan Assay で増幅を比較することにより、DNA の断片化を評価することができる。Short Assay として TaqMan® RNase P Detection Kit を用い、Long Assay として FFPE DNA QC Assay もしくは FFPE DNA QC Assay v2 を用いる
図2 断片化した DNA の short assay と long asasy の増幅
断片化している DNA では long assay の増幅が悪くなる。
お客様情報及びご注文本数をご記入の上、弊社販売店までご注文ください。
※注文用エクセルファイルには、20×プローブプライマーミックスの調整法に関する参考資料を追加しております。
この製品は研究用であり、診断目的には使用できません。
製品の仕様及び価格は、予告なく変更される場合があります。
注文書やE-mail、その他のご提供いただいた資料等は、弊社で適切に処分させていただきます。
秘密保持の観点から、合成をご注文をいただいた配列情報についてのお問い合わせはお受けしておりません。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.