マイクロアレイ お試し解析　～マイクロアレイの受託解析をお考えの方へ

マイクロアレイ上には各DNAプローブが固定化されている小さな区切りが多数あり、この区切り一つ一つのことをプローブセルと呼んでいます。各プローブセルには同一のDNAプローブが多数固定化されており、それぞれのプローブセル上にあるDNAプローブが解析したい遺伝子に対応しています。
DNAマイクロアレイ上のプローブセルの数が多ければ多いほど多数の遺伝子やエクソンを解析できます。当社の発現解析マイクロアレイのうち、もっともプローブセルの数が多い製品はClariom Dで、その数は実に600万以上になります。

マイクロアレイ法による発現解析では、調製を行ったサンプルをマイクロアレイ上のプローブと結合（ハイブリダイゼーション）させ、洗浄染色を経て蛍光ラベル化し、その蛍光強度をスキャンしてデータ解析を行います。
サンプル中の発現量が多い転写産物はたくさんのプローブと結合しますので、蛍光強度が強くなります。逆にサンプル中の発現量が少ない転写産物は、蛍光強度が弱くなります。こうした各プローブセルごとの蛍光強度の強さを測定することで、サンプル中の各転写産物の発現量を解析できるのです。

マイクロアレイの遺伝子発現解析では、アレイの数値データを正規化を行った後、Quality Checkにてサンプル調製やハイブリが問題なく行われていたか、アウトライヤーとなるデータがないかなどの確認を行います。
その後、様々なグラフ（Scatter PlotやVolcano Plot）やヒートマップ解析、パスウェイ解析などでデータを確認し、発現差異のあった遺伝子の絞り込みを行うと言うのが一般的な流れです。

当社の無償ソフトウェアTACでは、Scatter Plot、Volcano Plotのグラフ作成や、ヒートマップ解析（階層的クラスタリング）、WEB上のWikipathwayと連動させたパスウェイ解析が簡単に行えます。そのほか、ベン図の作成、遺伝子リストのエクスポート、GO解析に必要なアノテーション情報やReal-time PCRを行うためのTaqman Probeのリンク情報を取得したり、更に選択的スプライシングの検出※を行えたりと、幅広い機能を備えています。
当社WEBよりClariom SやClariom DなどのTAC用サンプルデータのダウンロードができますので、使い勝手を知りたい方はぜひお気軽に使用を試してみてください。

※選択的スプライシングが行えるアレイ（Clariom Dなど）に限ります。