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Ambion RNA extraction reagents and kit는 배양 세포 또는 조직 샘플, 식물, 세균 또는 포유류 세포로 시작하는지 여부에 관계없이 연구에 적합한 제품을 제공합니다. Ambion 브랜드에는 신뢰할 수 있는 TRIzol Reagent 및 PureLink purification kit와 같은 기존 Invitrogen 제품과 Cells-to-CT, MagMAX, RNAlater 키트 및 시약과 같은 최고의 Ambion 제품이 포함됩니다.
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액체 샘플에 최적화 | 무핵 적혈구를 제거하는 특수 키트 | HTP 요구에 맞는 96 컬럼의 필터 플레이트 형태 | 안정화된 혈액 샘플의 정제에 최적화된 HTP | 모든 크기의 RNA를 복구할 수 있는 HTP 형태(microRNA 포함) | 전혈에서 직접 높은 RNA 수율, WBC 분리 불필요 | |
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TRIzol LS | PureLink Total RNA Blood Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | MagMAX for Stabilized Blood Tubes RNA Isolation Kit | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | RiboPure Blood Kit | |
최고 판매품 | ✓ | |||||
호환되는 안정화 시약 | EDTA, 헤파린, 구연산, RNAlater | EDTA, 헤파린, 구연산 | EDTA, 헤파린, 구연산 | Tempus 또는 PaxGene 튜브 | EDTA 또는 구연산 | EDTA, 헤파린, 구연산, RNAlater |
안정화 시약 포함 | ✓ RNAlater | |||||
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 2시간에 12개 튜브 | 1시간 미만에 96개 샘플 | 30분 | |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | ✓ |
혈액 작업에 대한 자세한 내용은 기술 자료를 검토하십시오.
배양된 세포로부터 RNA를 정제하는 것은 전통적으로 종종 독성 유기 화학물질의 사용을 포함하는 매우 반복적이고 시간 및 노동 집약적인 절차였습니다. 당사의 RNA 전문가가 개발한 이 제품을 사용하면 몇 가지 기술 형태(유기 추출, 유리 섬유 컬럼, 마그네틱 비드 및 이들의 조합)를 사용하여 최대 수율, 순도 및 무결성의 RNA를 분리할 수 있습니다.
RNA를 먼저 분리하지 않고 배양된 세포 용해물을 분석 할 수도 있습니다. 훨씬 짧은 시간에 정제된 RNA의 결과와 동등하거나 더 나은 qPCR 결과를 얻을 수 있습니다. Cells-to-CT 및 Single Cell-to-CT 제품군과 같은 Invitrogen 제품은 놀라운 성능과 처리 상의 이점을 제공합니다.
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고순도 원형(intact) RNA | RNA를위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 형태(> 200nt) | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | 제한된 샘플 주입으로 빠르고 편리한 컬럼 기반 방법(Rna> 200 nt) | small RNA 종을 위한 빠르고 편리한 방법 | RNA 정제 없이 세포에서 qRT-PCR로 이어지는 완벽한 시스템 | |
TRIzol Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | PureLink RNA Micro Scale Kit | MirVana miRNA Isolation Kit | Cells-to-CT 키트 | |
최고 판매품 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 20분 | 30분 | <10분 |
세포 용해 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 무독성 guanidine-isothio-cyanate lysis | 무독성 guanidine-isothio-cyanate lysis | 무독성 guanidine-isothio-cyanate llysis | 유기 추출 후 알코올 침전 | Cells-to-CT lysis |
시작 물질의 양 | 최대 1x107 세포 | 5x106 ~ 1x108 세포 | 5x106 ~ 1x108 세포 | 최대 5x105 세포 | 102-107 배양 세포 | 10–100,000개 세포 |
애플리케이션 | 모든 RNA 발현 방법 | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | Micro RNA 분석 | qRT-PCR |
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 제거합니다.
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동일한 FFPE 절편에서 RNA 및 DNA의 저처리량 분리 | 동일한 FFPE 절편에서 RNA 및 DNA의 확장 가능한 분리 | |
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FFPE를 위한 RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit | |
전처리 시간 | 4.5시간(16개 샘플에 대한 총 소요 시간) 수작업 2.5시간 | 4시간(96개 전처리를 위한 총 소요 시간) 수작업 1시간 |
최종 산물 추출 | 총 RNA, microRNA, gDNA | 총 RNA, microRNA, gDNA |
분리 방법 | 컬럼 정제 | 마그네틱 비드 정제 |
탈파라핀화 필요 | ✓ | ✓ |
자동화 가능(탈파라핀화 후) | ✓ (KF Flex 및 Duo Prime 스크립트) | |
호환되는 FFPE 샘플 범위 | 최대 4 x 20미크론 절편 (300 mm2 조직) | 최대 2 x 20미크론 절편 (300 mm2 조직) |
샘플 부피 | ~50µL 정제 DNA ~50µL 정제 RNA | ~50uL 정제 DNA ~50µL 정제 RNA |
Ion AmpliSeq DNA 패널(예 Cancer Hotspot Panel v2)과 호환 | ✓ | ✓ |
Ion AmpliSeq RNA 패널(예: RNA 암 및 RNA 융합)과 호환 | ✓ | ✓ |
FFPE 검체에서 RNA 품질을 회복하는 것은 상당히 어려울 수 있습니다. 고정 공정은 핵산과 단백질 사이의 가교 결합을 유발하고 염기에 모노메틸기를 첨가함으로써 RNA를 공유 변형시킵니다. 결과적으로, 분자는 단단하고 기계적 전단에 취약하며 가교 결합은 역전사를 위한 기질로서 RNA의 사용을 저해할 수 있습니다. 따라서 유전자 발현 분석을 위한 공급원으로서 FFPE 조직을 사용하기 위해서는 가교 결합된 매트릭스로부터 RNA 추출을 위한 신뢰할 수 있는 방법이 필요합니다.
FFPE 조직으로부터 분리된 RNA의 전체 품질 및 수율에 영향을 미칠 수 있는 많은 요소가 있습니다. 다음은 몇 가지 주요 요소를 해결하기 위한 권장 사항입니다.
MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit는 Invitrogen MagMAX magnetic particle를 사용하여 FFPE 샘플에서 총 RNA 및 DNA를 빠르고 효율적으로 자동 분리하도록 설계되었습니다. Invitrogen MagMAX FFPE NA kit는 공정 중 품질을 저하시키지 않으면서 더 빠른 워크플로우를 제공하고 독성이 적은 시약을 사용합니다. 이 키트는 동급 최고의 RecoverAll 필터 기반 시스템과 유사한 핵산 수율 및 순도를 제공합니다. MagMAX FFPE NA kit는 유사한 프로토콜을 사용하는 제품보다 성능이 우수하며, 더 길고 위험하며 처리량이 적은 프로토콜과 유사한 RNA 및 DNA 수율을 달성합니다.
RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit 절차에서는 수작업 시간이 약 45분이며 RNA 분리를 하루 내에 쉽게 완료할 수 있습니다. FFPE 샘플은 자일렌 및 에탄올 세척을 통해 탈파라핀화합니다. 그런 다음 RNA 또는 DNA 회수에 맞는 배양 시간 동안 확실한 프로테아제 분해를 실시합니다. 핵산은 온-필터 뉴클레아제 처리를 포함하는 신속한 유리-필터 방법을 사용하여 정제되며 제공된 물 또는 저염 완충액으로 용리됩니다.
TechNotes 자료
실험실 팁
실험 데이터
애플리케이션 노트
제품 공고
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까다로운 샘플에 적합(침엽수 조직 및 씨앗) | 신속하고 간편한 사용 | microRNA 및 small RNA의 효율적 회수 | 신속하고 완전한 자동화 | |
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식물 RNA 시약 | PureLink RNA Mini Kit | mirVana miRNA Isolation Kit | MagMAX-96 Total RNA Isolation Kit | |
인기 판매품 | ✓ | |||
분리되는 RNA 유형 | large RNA 분자만 분리 | large RNA 분자만 분리 | Small & large RNA 분자 | large RNA 분자만 분리 |
전처리 시간 | 60분 | <20분 | 30분 | <45분 |
시작 물질의 양 | 최대 1g | <250 mg | 0.5 ~ 250mg | 최대 10mg |
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 |
고처리량 적합성 | ✓ | |||
호환 제품 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 |
식물 RNA 분리와 관련된 주요 문제 중 하나는 폴리페놀 화합물 및 다당류와 같이 문제가 있는 바이오분자의 존재입니다. Ambion Plant RNA Isolation Aid는 폴리페놀 및 다당류에 결합하는 고분자량 고분자인 폴리비닐피롤리돈과 추출 전 스핀 단계를 통해 이러한 오염 물질을 최소화합니다.
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 최소화합니다.
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고순도 원형(intact) RNA를 위한 골드 스탠다드 | 간단하고 신뢰할 수 있는 빠른 방법 | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | 제한된 샘플 주입으로 빠르고 편리한 컬럼 기반 방법(Rna> 200 nt) | small RNA 종을 위한 빠르고 편리한 방법 | 최고 순도의 TRIzol + 컬럼 정제, 침전 불필요 | 모든 크기의 RNA를 복구할 수 있는 HTP 형태(microRNA 포함) | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | PureLink RNA Micro Scale Kit | mirVana miRNA Isolation Kit | TRIzol Plus RNA Purification System | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | |
인기 판매품 | ✓ | ||||||
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 빠르고 편리한 마이크로 실리카 컬럼 | 편리한 실리카 컬럼과 결합된 유기 추출 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 20분 | 30분 | 1시간 | <1시간 |
시작 물질의 양 | 최대 100 mg | 10 mg ~ 100 mg | 10 세포 ~ 10 mg | 최대 10 mg | 최대 250 mg 조직 | 최대 100 mg | 최대 50 mg |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | |||||
전처리 크기 | 100개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 |
RNA 함량은 조직, 세포 유형, 생리학적 상태 등에 따라 크게 다를 수 있습니다. 이 차트는 다양한 세포와 조직에서 RNA 수율을 추정하기 위한 일반적인 지침을 제공합니다.
표 1. 1mg의 다양한 조직에서 일반적인 총 RNA 수율.
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 제거합니다.
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신속하고 완전한 자동화 | 신속하고 간편한 사용 | 발현 프로파일을 유지하면서 단단한 효모 세포벽에 맞도록 설계 | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | |
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Platinum Taq MagMAX for Microarrays Total RNA Isolation Kit | PureLink RNA Mini Kit | RiboPure-Yeast Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | |
인기 판매품 | ✓ | |||
lysis를 위한 특수 비드 포함 | 아니오 | 아니오 | 지르코니아 비드 | 아니오 |
분리 방법 | 최고 순도를 위한 확장 가능하고 유연한 형태, 유기 추출 및 마그네틱 비드 포함 | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함 | 96웰 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 |
전처리 시간 | <1시간 | 20분 | 90분(DNase 처리 포함) | 20분 |
시작 물질의 양 | 최대 5 x 106 세포 | 최대 5 x 108 세포 | 최대 3 x 108 세포 | 신선한 log-phase 효모 세포 1.8 mL(OD660=0.6–0.8) |
고처리량 적합성 | ✓ | |||
키트 크기 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 |
진핵 세포와 달리 효모 및 많은 세균 균주는 파괴하기 어려운 세포벽에 의해 보호됩니다. 첫 번째 단계로 RNA 분리 절차 전에 효과적인 세포 용해(일반적으로 기계적 파괴 또는 효소 전처리를 통해)가 필요합니다.
Ambion RNA 전문가가 개발한 다양한 제품을 사용하면 세균과 효모에서 순수한 순수 RNA를 고수율로 분리할 수 있습니다.
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lysis 절차 없음 | 빠르고 간편함, 20분 | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 기반, 필터 플레이트 형태 | HTP, 45분 | lysis하기 어려운 그람 + 세균에 이상적 | |
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TRIzol Max Bacterial RNA Isolation Kit w/TRIzol & Max Bacterial Enhancement Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit | RiboPure-Bacteria Kit | |
인기 판매품 | ✓ | ||||
lysis를 위한 특수 비드 포함 | 아니오 | 아니오 | 아니오 | 지르코니아 비드 | 지르코니아 비드 |
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 96웰 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 45분 | 1시간 |
시작 물질의 양 | 최대 1 x 108 세포 | 최대 1 x 109 세포 | 최대 1 x 109 세포 | 최대 0.3 g의 고체 시료 또는 175 µl의 액체 시료 | 최대 109 세포 |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | |||
키트 크기 | 100개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 100개 전처리 | 50개 전처리 |
생물학적 샘플(동물, 곤충, 식물, 곰팡이, 세균) 및 환경 샘플(물, 공기, 음식)의 바이러스 분석시 테스트 중인 샘플의 바이러스 RNA 또는 DNA를 필요로 하는 분자 테스트 전략을 사용하는 경우가 점차 늘고 있습니다. 바이러스 RNA의 정제는 우수한 회수 및 검출 감도를 얻는데 있어 고유한 과제를 제기합니다. Ambion RNA 전문가는 여러 가지 형태 옵션으로 광범위한 샘플 유형에서 최대 바이러스 RNA 수율, 순도 및 무결성을 제공하도록 최적화된 RNA 정제 제품을 개발했습니다.
"PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit의 고농축 바이러스 RNA는 바이러스 게놈에 대해 보다 민감하고 섬세한 다운스트림 분석을 위한 도구를 제공합니다."
가장 적합한 다운스트림 애플리케이션 | ||||||
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제품 | 형태 | Real-Time RT-PCR | 마이크로어레이 분석 | 서열분석 | Northern Blot | 클로닝 |
총 RNA | ||||||
PureLink Viral RNA⁄DNA Mini Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ✓ | |||
RNAqueous Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
MagMAX AI⁄ND Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자 | ✓ | ✓ | |||
MagMAX-96 AI⁄ND Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
DNA/RNA | ||||||
PureLink Pro 96 Viral RNA⁄DNA Purification Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
MagMAX-96 Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
Dynabeads SILANE Viral NA | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드, 자동화 가능 | |||||
iPrep PureLink Virus Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MagMAX Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자 | ✓ | ||||
MagMAX-96 Viral RNA Isolation Kit(5 x 96 rxns) | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MicroRNA | ||||||
mirVana miRNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ||||
mirVana miRNA Isolation Kit(페놀 미포함 - 별도 구매해야 함) | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ||||
TRIzol LS Reagent | TRIzol 시약에서 lysis, 원스텝 시약 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
mRNA | ||||||
Dynabeads mRNA DIRECT Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드 | ✓ | ✓ | |||
Dynabeads mRNA DIRECT Micro Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드 | ✓ | ✓ |
Nucleic Acid Purification and Analysis Support Center
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액체 샘플에 최적화 | 무핵 적혈구를 제거하는 특수 키트 | HTP 요구에 맞는 96 컬럼의 필터 플레이트 형태 | 안정화된 혈액 샘플의 정제에 최적화된 HTP | 모든 크기의 RNA를 복구할 수 있는 HTP 형태(microRNA 포함) | 전혈에서 직접 높은 RNA 수율, WBC 분리 불필요 | |
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TRIzol LS | PureLink Total RNA Blood Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | MagMAX for Stabilized Blood Tubes RNA Isolation Kit | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | RiboPure Blood Kit | |
최고 판매품 | ✓ | |||||
호환되는 안정화 시약 | EDTA, 헤파린, 구연산, RNAlater | EDTA, 헤파린, 구연산 | EDTA, 헤파린, 구연산 | Tempus 또는 PaxGene 튜브 | EDTA 또는 구연산 | EDTA, 헤파린, 구연산, RNAlater |
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분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 2시간에 12개 튜브 | 1시간 미만에 96개 샘플 | 30분 | |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | ✓ |
혈액 작업에 대한 자세한 내용은 기술 자료를 검토하십시오.
배양된 세포로부터 RNA를 정제하는 것은 전통적으로 종종 독성 유기 화학물질의 사용을 포함하는 매우 반복적이고 시간 및 노동 집약적인 절차였습니다. 당사의 RNA 전문가가 개발한 이 제품을 사용하면 몇 가지 기술 형태(유기 추출, 유리 섬유 컬럼, 마그네틱 비드 및 이들의 조합)를 사용하여 최대 수율, 순도 및 무결성의 RNA를 분리할 수 있습니다.
RNA를 먼저 분리하지 않고 배양된 세포 용해물을 분석 할 수도 있습니다. 훨씬 짧은 시간에 정제된 RNA의 결과와 동등하거나 더 나은 qPCR 결과를 얻을 수 있습니다. Cells-to-CT 및 Single Cell-to-CT 제품군과 같은 Invitrogen 제품은 놀라운 성능과 처리 상의 이점을 제공합니다.
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고순도 원형(intact) RNA | RNA를위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 형태(> 200nt) | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | 제한된 샘플 주입으로 빠르고 편리한 컬럼 기반 방법(Rna> 200 nt) | small RNA 종을 위한 빠르고 편리한 방법 | RNA 정제 없이 세포에서 qRT-PCR로 이어지는 완벽한 시스템 | |
TRIzol Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | PureLink RNA Micro Scale Kit | MirVana miRNA Isolation Kit | Cells-to-CT 키트 | |
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전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 20분 | 30분 | <10분 |
세포 용해 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 무독성 guanidine-isothio-cyanate lysis | 무독성 guanidine-isothio-cyanate lysis | 무독성 guanidine-isothio-cyanate llysis | 유기 추출 후 알코올 침전 | Cells-to-CT lysis |
시작 물질의 양 | 최대 1x107 세포 | 5x106 ~ 1x108 세포 | 5x106 ~ 1x108 세포 | 최대 5x105 세포 | 102-107 배양 세포 | 10–100,000개 세포 |
애플리케이션 | 모든 RNA 발현 방법 | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | Micro RNA 분석 | qRT-PCR |
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 제거합니다.
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동일한 FFPE 절편에서 RNA 및 DNA의 저처리량 분리 | 동일한 FFPE 절편에서 RNA 및 DNA의 확장 가능한 분리 | |
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FFPE를 위한 RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit | |
전처리 시간 | 4.5시간(16개 샘플에 대한 총 소요 시간) 수작업 2.5시간 | 4시간(96개 전처리를 위한 총 소요 시간) 수작업 1시간 |
최종 산물 추출 | 총 RNA, microRNA, gDNA | 총 RNA, microRNA, gDNA |
분리 방법 | 컬럼 정제 | 마그네틱 비드 정제 |
탈파라핀화 필요 | ✓ | ✓ |
자동화 가능(탈파라핀화 후) | ✓ (KF Flex 및 Duo Prime 스크립트) | |
호환되는 FFPE 샘플 범위 | 최대 4 x 20미크론 절편 (300 mm2 조직) | 최대 2 x 20미크론 절편 (300 mm2 조직) |
샘플 부피 | ~50µL 정제 DNA ~50µL 정제 RNA | ~50uL 정제 DNA ~50µL 정제 RNA |
Ion AmpliSeq DNA 패널(예 Cancer Hotspot Panel v2)과 호환 | ✓ | ✓ |
Ion AmpliSeq RNA 패널(예: RNA 암 및 RNA 융합)과 호환 | ✓ | ✓ |
FFPE 검체에서 RNA 품질을 회복하는 것은 상당히 어려울 수 있습니다. 고정 공정은 핵산과 단백질 사이의 가교 결합을 유발하고 염기에 모노메틸기를 첨가함으로써 RNA를 공유 변형시킵니다. 결과적으로, 분자는 단단하고 기계적 전단에 취약하며 가교 결합은 역전사를 위한 기질로서 RNA의 사용을 저해할 수 있습니다. 따라서 유전자 발현 분석을 위한 공급원으로서 FFPE 조직을 사용하기 위해서는 가교 결합된 매트릭스로부터 RNA 추출을 위한 신뢰할 수 있는 방법이 필요합니다.
FFPE 조직으로부터 분리된 RNA의 전체 품질 및 수율에 영향을 미칠 수 있는 많은 요소가 있습니다. 다음은 몇 가지 주요 요소를 해결하기 위한 권장 사항입니다.
MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit는 Invitrogen MagMAX magnetic particle를 사용하여 FFPE 샘플에서 총 RNA 및 DNA를 빠르고 효율적으로 자동 분리하도록 설계되었습니다. Invitrogen MagMAX FFPE NA kit는 공정 중 품질을 저하시키지 않으면서 더 빠른 워크플로우를 제공하고 독성이 적은 시약을 사용합니다. 이 키트는 동급 최고의 RecoverAll 필터 기반 시스템과 유사한 핵산 수율 및 순도를 제공합니다. MagMAX FFPE NA kit는 유사한 프로토콜을 사용하는 제품보다 성능이 우수하며, 더 길고 위험하며 처리량이 적은 프로토콜과 유사한 RNA 및 DNA 수율을 달성합니다.
RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit 절차에서는 수작업 시간이 약 45분이며 RNA 분리를 하루 내에 쉽게 완료할 수 있습니다. FFPE 샘플은 자일렌 및 에탄올 세척을 통해 탈파라핀화합니다. 그런 다음 RNA 또는 DNA 회수에 맞는 배양 시간 동안 확실한 프로테아제 분해를 실시합니다. 핵산은 온-필터 뉴클레아제 처리를 포함하는 신속한 유리-필터 방법을 사용하여 정제되며 제공된 물 또는 저염 완충액으로 용리됩니다.
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까다로운 샘플에 적합(침엽수 조직 및 씨앗) | 신속하고 간편한 사용 | microRNA 및 small RNA의 효율적 회수 | 신속하고 완전한 자동화 | |
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식물 RNA 시약 | PureLink RNA Mini Kit | mirVana miRNA Isolation Kit | MagMAX-96 Total RNA Isolation Kit | |
인기 판매품 | ✓ | |||
분리되는 RNA 유형 | large RNA 분자만 분리 | large RNA 분자만 분리 | Small & large RNA 분자 | large RNA 분자만 분리 |
전처리 시간 | 60분 | <20분 | 30분 | <45분 |
시작 물질의 양 | 최대 1g | <250 mg | 0.5 ~ 250mg | 최대 10mg |
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 |
고처리량 적합성 | ✓ | |||
호환 제품 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 | Ambion Plant RNA Isolation Aid 흔한 식물 오염 물질 제거 |
식물 RNA 분리와 관련된 주요 문제 중 하나는 폴리페놀 화합물 및 다당류와 같이 문제가 있는 바이오분자의 존재입니다. Ambion Plant RNA Isolation Aid는 폴리페놀 및 다당류에 결합하는 고분자량 고분자인 폴리비닐피롤리돈과 추출 전 스핀 단계를 통해 이러한 오염 물질을 최소화합니다.
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 최소화합니다.
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고순도 원형(intact) RNA를 위한 골드 스탠다드 | 간단하고 신뢰할 수 있는 빠른 방법 | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | 제한된 샘플 주입으로 빠르고 편리한 컬럼 기반 방법(Rna> 200 nt) | small RNA 종을 위한 빠르고 편리한 방법 | 최고 순도의 TRIzol + 컬럼 정제, 침전 불필요 | 모든 크기의 RNA를 복구할 수 있는 HTP 형태(microRNA 포함) | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | PureLink RNA Micro Scale Kit | mirVana miRNA Isolation Kit | TRIzol Plus RNA Purification System | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | |
인기 판매품 | ✓ | ||||||
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 빠르고 편리한 마이크로 실리카 컬럼 | 편리한 실리카 컬럼과 결합된 유기 추출 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 20분 | 30분 | 1시간 | <1시간 |
시작 물질의 양 | 최대 100 mg | 10 mg ~ 100 mg | 10 세포 ~ 10 mg | 최대 10 mg | 최대 250 mg 조직 | 최대 100 mg | 최대 50 mg |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | |||||
전처리 크기 | 100개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 |
RNA 함량은 조직, 세포 유형, 생리학적 상태 등에 따라 크게 다를 수 있습니다. 이 차트는 다양한 세포와 조직에서 RNA 수율을 추정하기 위한 일반적인 지침을 제공합니다.
표 1. 1mg의 다양한 조직에서 일반적인 총 RNA 수율.
RNAlater 솔루션은 원형(intact) 동물 조직, 기관, 세포 및 세균에서 RNA 보존을 위해 널리 사용됩니다. 이는 RNA 분리를 위해 샘플을 즉시 처리하거나 나중에 처리하기 위해 액체 질소에서 샘플을 동결해야 할 필요성을 제거합니다.
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신속하고 완전한 자동화 | 신속하고 간편한 사용 | 발현 프로파일을 유지하면서 단단한 효모 세포벽에 맞도록 설계 | 96개의 샘플을 위한 빠르고 편리한 컬럼 기반 필터 플레이트 형태(Rna> 200 nt) | |
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Platinum Taq MagMAX for Microarrays Total RNA Isolation Kit | PureLink RNA Mini Kit | RiboPure-Yeast Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | |
인기 판매품 | ✓ | |||
lysis를 위한 특수 비드 포함 | 아니오 | 아니오 | 지르코니아 비드 | 아니오 |
분리 방법 | 최고 순도를 위한 확장 가능하고 유연한 형태, 유기 추출 및 마그네틱 비드 포함 | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함 | 96웰 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 |
전처리 시간 | <1시간 | 20분 | 90분(DNase 처리 포함) | 20분 |
시작 물질의 양 | 최대 5 x 106 세포 | 최대 5 x 108 세포 | 최대 3 x 108 세포 | 신선한 log-phase 효모 세포 1.8 mL(OD660=0.6–0.8) |
고처리량 적합성 | ✓ | |||
키트 크기 | 96개 전처리 | 50개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 |
진핵 세포와 달리 효모 및 많은 세균 균주는 파괴하기 어려운 세포벽에 의해 보호됩니다. 첫 번째 단계로 RNA 분리 절차 전에 효과적인 세포 용해(일반적으로 기계적 파괴 또는 효소 전처리를 통해)가 필요합니다.
Ambion RNA 전문가가 개발한 다양한 제품을 사용하면 세균과 효모에서 순수한 순수 RNA를 고수율로 분리할 수 있습니다.
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lysis 절차 없음 | 빠르고 간편함, 20분 | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 기반, 필터 플레이트 형태 | HTP, 45분 | lysis하기 어려운 그람 + 세균에 이상적 | |
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TRIzol Max Bacterial RNA Isolation Kit w/TRIzol & Max Bacterial Enhancement Reagent | PureLink RNA Mini Kit | PureLink Pro 96 total RNA Purification Kit | MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit | RiboPure-Bacteria Kit | |
인기 판매품 | ✓ | ||||
lysis를 위한 특수 비드 포함 | 아니오 | 아니오 | 아니오 | 지르코니아 비드 | 지르코니아 비드 |
분리 방법 | 고순도 유기 추출(알코올 침전 필요) | 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 96웰 필터 플레이트 형태의 빠르고 편리한 실리카 컬럼 | 마그네틱 비드를 사용하여 확장 가능하고 유연한 형태 | 최고 순도 및 편리함, 유기 추출 및 실리카 컬럼 포함(침전 불필요) |
전처리 시간 | 1시간 | 20분 | 20분 | 45분 | 1시간 |
시작 물질의 양 | 최대 1 x 108 세포 | 최대 1 x 109 세포 | 최대 1 x 109 세포 | 최대 0.3 g의 고체 시료 또는 175 µl의 액체 시료 | 최대 109 세포 |
고처리량 적합성 | ✓ | ✓ | |||
키트 크기 | 100개 전처리 | 50개 전처리 | 96개 전처리 | 100개 전처리 | 50개 전처리 |
생물학적 샘플(동물, 곤충, 식물, 곰팡이, 세균) 및 환경 샘플(물, 공기, 음식)의 바이러스 분석시 테스트 중인 샘플의 바이러스 RNA 또는 DNA를 필요로 하는 분자 테스트 전략을 사용하는 경우가 점차 늘고 있습니다. 바이러스 RNA의 정제는 우수한 회수 및 검출 감도를 얻는데 있어 고유한 과제를 제기합니다. Ambion RNA 전문가는 여러 가지 형태 옵션으로 광범위한 샘플 유형에서 최대 바이러스 RNA 수율, 순도 및 무결성을 제공하도록 최적화된 RNA 정제 제품을 개발했습니다.
"PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit의 고농축 바이러스 RNA는 바이러스 게놈에 대해 보다 민감하고 섬세한 다운스트림 분석을 위한 도구를 제공합니다."
가장 적합한 다운스트림 애플리케이션 | ||||||
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제품 | 형태 | Real-Time RT-PCR | 마이크로어레이 분석 | 서열분석 | Northern Blot | 클로닝 |
총 RNA | ||||||
PureLink Viral RNA⁄DNA Mini Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ✓ | |||
RNAqueous Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
MagMAX AI⁄ND Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자 | ✓ | ✓ | |||
MagMAX-96 AI⁄ND Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
DNA/RNA | ||||||
PureLink Pro 96 Viral RNA⁄DNA Purification Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
MagMAX-96 Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ✓ | |||
Dynabeads SILANE Viral NA | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드, 자동화 가능 | |||||
iPrep PureLink Virus Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MagMAX Viral RNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자 | ✓ | ||||
MagMAX-96 Viral RNA Isolation Kit(5 x 96 rxns) | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 입자, 96-웰 처리, 자동화 가능 | ✓ | ||||
MicroRNA | ||||||
mirVana miRNA Isolation Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ||||
mirVana miRNA Isolation Kit(페놀 미포함 - 별도 구매해야 함) | 카오트로픽염 기반 lysis, 실리카 필터 | ✓ | ||||
TRIzol LS Reagent | TRIzol 시약에서 lysis, 원스텝 시약 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
mRNA | ||||||
Dynabeads mRNA DIRECT Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드 | ✓ | ✓ | |||
Dynabeads mRNA DIRECT Micro Kit | 카오트로픽염 기반 lysis, 마그네틱 비드 | ✓ | ✓ |
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