Modelos del Sistema Ion GeneStudio | Thermo Fisher Scientific

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	Sistema Ion GeneStudio S5	Sistema Ion GeneStudio S5 Plus	Sistema Ion GeneStudio S5 Prime
Rendimiento máximo/día (tipo de chip)	15 GB (un chip Ion 540)	30 GB (dos chips Ion 540)	50 GB (dos chips Ion 550)
Tiempo total de secuenciación y análisis al máximo rendimiento	19 h (chip Ion 540)	10 h (chip Ion 540) 11,5 h (chip Ion 550)	6,5 h (chip Ion 540) 8,5 h (chip Ion 550)
Chips compatibles	Chips Ion 510, 520, 530 y 540	Chips Ion 510, 520, 530, 540 y 550

Especificaciones detalladas del sistema

Flexibilidad en el rendimiento y el flujo de trabajo para una gran gama de aplicaciones de NGS.

Tipo de chip	Número de lecturas	Longitud de lectura (rendimiento) †	Sistema Ion GeneStudio S5	Sistema Ion GeneStudio S5 Plus	Sistema Ion GeneStudio S5 Prime
Tipo de chip	Número de lecturas	Longitud de lectura (rendimiento) †	*Tiempo de procesamiento (secuenciación y análisis)**
Chip Ion 510	2-3 M	200 pb (0,3-0,5 GB)	4,5 h	3 h	3 h
Chip Ion 510	2-3 M	400 pb (0,6-1 GB)	10,5 h	5 h	5 h
Chip Ion 520	4-6 M	200 pb (0,6-1 GB)	7,5 h	3,5 h	3 h
	4-6 M	400 pb (1,2-2 GB)	12 h	5,5 h	5,5 h
	3-4 M	600 pb (0,5-1,5 GB)	12 h	5,5 h	5,5 h
Chip Ion 530	15-20 M	200 pb (3-4 GB)	10,5 h	5 h	4 h
	15-20 M	400 pb (6-8 GB)	21,5 h	8 h	6,5 h
	9-12 M	600 pb (1,5-4,5 GB)	21 h	8 h	7 h
Chip Ion 540	60-80 M	200 pb (10-15 GB)	19 h	10 h	6,5 h
Chip Ion 540	60-80 M	200 pb (20-30 GB) 2 secuenciaciones en 1 día	N/A	20 h	10 h**
Chip Ion 550	100-130 M	200 pb (20-25 GB)	N/A	11,5 h	8,5 h
Chip Ion 550	100-130 M	200 pb (40-50 GB) 2 secuenciaciones en 1 día	N/A	N/A	12 h**

† Rendimiento esperado con un >99 % de exactitud alineada/medida. El rendimiento depende de la longitud de la lectura y de la aplicación.
* Los tiempos de la secuenciación oscilan entre 2,5 y 4 horas.
** El análisis de la primera secuenciación se realiza simultáneamente con la segunda secuenciación.

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Ejemplo de nuestros paneles y aplicaciones más populares	Descripción del panel	Número de muestras por secuenciación*
	Descripción del panel	Chip Ion 510 2-3 M de lecturas	Chip Ion 520 4-6 M de lecturas	Chip Ion 530 15-20 M de lecturas	Chip Ion 540 60-80 M de lecturas	Chip Ion 550 100-130 M de lecturas
Investigación en Cáncer
Panel Ion AmpliSeq Cancer Hotspot v2	Identificación de SNV hotspots asociados a cáncer partiendo de 10 ng de ADN obtenido de FFPE	4	8	26	84	NA
Panel Oncomine Focus	Identificación de SNVs, indeles, CNVs y fusiones génicas relevantes en tumores sólidos en 52 genes	4	8	26	NA	NA
Panel Oncomine Comprenhensive v3	Hace posible el descubrimiento de biomarcadores como SNVs e indeles y secuenciación completa de 161 genes	NA	NA	NA	8	16
Panel Oncomine Lung cfDNA	Detección de mutaciones somáticas raras en genes relevantes en cáncer de pulmón de células no pequeñas	NA	NA	8	32	~60-64
Panel Oncomine Pan-Cancer Cell-Free	Detección de mutaciones somáticas raras en genes de múltiples tipos de cáncer	NA	NA	1	4	7-8
Panel Oncomine Immune Response Research	Análisis de la función de los genes implicados en las vías de respuesta inmunitaria	NA	4	8	NA	NA
Expresión génica
Panel Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression	Investigación de los niveles de expresión génica global	NA	NA	2	8	16
Panel Ion AmpliSeq Transcriptome Mouse Gene Expression	Investigación de los niveles de expresión génica global	NA	NA	2	8	16
Investigación de enfermedades hereditarias
Panel Ion AmpliSeq Exome RDY	Descubrimiento de mutaciones raras del exoma completo	NA	NA	NA	2	4
Panel Ion AmpliSeq Pharmacogenomics Research (40 genes)	Investigación de variantes conocidas asociadas al metabolismo de fármacos	48	96	384	384	NA
Panel Ion AmpliSeq bajo demanda	Identificación de variantes en genes asociados a enfermedades hereditarias	Hasta 384 (varía según el número de genes del panel)
Investigación en salud reproductiva
Kits Ion ReproSeq PGS	Identificación aneuploidías en el ADN de muestras de embriones	16	24	96	NA	NA
Investigación en enfermedades infecciosas
Ion AmpliSeq TB Research Panel	Identificación de variantes asociadas a la resistencia antimicrobiana de Mycobacterium tuberculosis (TB)	48	84	272	384	NA
Panel Ion AmpliSeq Ebola Research	Identificación de la presencia del virus del Ébola	48	84	272	384	NA
Kit Ion 16S Metagenomics	Identificación de bacterias en muestras mixtas	24	48	192	NA	NA
* El número de muestras por secuenciación/chip sirve de guía, y el número real de muestras procesadas dependerá de sus necesidades de número de lecturas y profundidad de cobertura. Es importante señalar que, a medida que aumenta el número de bibliotecas por chip, resulta más difícil equilibrar las lecturas entre bibliotecas. Además, las bibliotecas de tejido FFPE tienden a producir resultados más variables. Se sugiere combinar menos bibliotecas al principio y determinar los límites reales empíricamente.