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從驗證過、可供選購的即時定量PCR檢測試劑中自由挑選，訂製專屬於您的Applied Biosystems TaqMan SARS-CoV-2突變檢測套組，立即獲得您的實驗結果並隨時為未來做好準備。這種可擴展的解決套組靈活性高，您可以操作小規模的樣品、或批次分析數百個樣品，同時鑑定單一或多種突變，全程只需要在您現有的即時定量PCR儀器上進行。
- 客製化—由經驗證的即時 PCR檢測試劑中挑選並訂製專屬於您的套組，讓您成功鑑別當前SARS-CoV-2的相關突變，並在更多變異型或變異株出現時可迅速反應。
- 便利性—使用您現有的即時定量PCR儀器即可對 SARS-CoV-2 待檢樣品進行後續檢測。
- 擴展性—可選擇小量或者針對數百個樣品進行批次分析，鑑別出單一或多種突變。
- 獨特且簡化的實驗流程—搭配我們黃金標準 TaqMan SNP 基因分型檢測試劑與一步式(1-step) RT-PCR 反應，從RNA到實驗結果產出僅需1個多小時。
| 目標 | 從驗證過 v、可供選購的 即時定量PCR SNP 檢測試劑中自由挑選，訂製專屬於您的Applied Biosystems TaqMan SARS-CoV-2突變檢測套組 |
| 試劑設計 | 設計具有序列專一性的前置引子(forward primer)和反置引子(reverse primer)，以擴增目標序列區域。反置引子同時啟動了SARS-CoV-2 基因組 RNA的反轉錄。每組檢測試劑盒包括兩種帶有非螢光遮蔽物 (nonfluorescent quenchers, NFQ) 的 TaqMan MGB (minor groove binder) 探針： |
| 可供選購的規格 | 可進行 375 次反應 可進行 1,250 次 反應 |
| 樣品類型 | 於 SARS-CoV-2 樣品中萃取的 RNA，CT 值小於或等於 30 |
| 反應時間 | 由 RNA 萃取到獲得實驗結果約需1小時10分鐘。 |
| 儀器設備 | 可兼容於任何 即時定量PCR 儀器 ，如Applied Biosystems 7500、7500 Fast Dx、7500 Fast、 QuantStudio 5和 QuantStudio 7 系統 。 |
| 適用軟體 | QuantStudio Design & Analysis Software (搭載基因型分析模組) v2.5或更新的版本。 |
圖 1.TaqMan SARS-CoV-2 突變檢測套組的工作流程 [點擊放大]
我們經驗證的即時定量PCR檢測試劑，能針對 SARS-CoV-2 突變株提供可信賴的分析結果。以下為使用 QuantStudio Design & Analysis Software (搭載基因型分析模組) v2.5顯示的結果分群圖。由這些分群圖可明顯分辨，野生型樣品(x軸上紅點)和突變樣品(y軸上藍點)。
S 基因 delH69V70 突變
[點擊放大]
圖2.S 基因 delH69V70 突變分群圖。 delH69V70(也稱為 69-70del)為 B.1.1.7 (501Y.V1 或英國變異株)的已知突變。delH69V70 突變並非 B.1.1.7 特有。
- 野生型偵測
- 可偵測到 delH68V70 突變
S 基因 N501Y 突變
[點擊放大]
圖3.S 基因 N501 突變分群圖。N501Y 常見於 B.1.1.7(英國變異株)、B.1.351(南非變異株)、P.1(巴西變異株)。
- 野生型偵測
- 可偵測到 N501Y 突變
工作原理
首先從 SARS-CoV-2 陽性樣本中分離 RNA，我們特有工作流程結合黃金標準 Applied Biosystems TaqMan SNP 基因分型分析與一步式 RT-PCR，來檢測您的樣本中是否存在已知突變。
本段影片中，我們將向您展示這種一步式 RT-PCR 的工作原理，以及您的實驗結果將以何種方式呈現。
培訓支持
本課程包含兩段簡短的教學影片，您將了解：
- SARS CoV-2 突變檢測套組的儀器軟體設定
- 使用 Applied Biosystems Design & Analysis Software v2.5 或最新版 (搭載基因分型分析模組)，來對Applied Biosystems即時定量 PCR 儀器的輸出檔案進行數據分析。
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分析軟體
關於您的實驗設置及分析結果的提與技巧
在本段短片中，您將學習：
- 如何在您的儀器軟體中設定基因分型分析
- 如何設定您的反轉錄實驗步驟
- 如何在設定基因分型分析時，選擇您的即時數據資料
- 如何查看實驗結果和讀取分群圖
透過搭載基因分型分析模組的 QuantStudio Design & Analysis Software v2.5 或最新版本，進行後續分析。
- 英國公共衛生行動中採用了基於 RT‑PCR 的基因分型分析快速跟踪 SARS-CoV-2 變體和突變分析。
- 使用靶向 RT-PCR SARS CoV-2 突變檢測套組可以快速高效的檢測SARS-CoV-2突變情況。
- 對比TaqMan 和 TIB Molbiol SARS-CoV-2 基因分型檢測在S 基因靶失敗中鑒定 B.1.1.7。
- 中歐地區利用 SGTF 和 一組含七种相關突變 RT-PCR SNP 檢測套組從而快速監測SARS-CoV-2。
- 基於真實世界觀測數據的與SARS-CoV-2 變異體相關聯的流行病學和生物學。
若要進行 TaqMan SARS-CoV-2 突變檢測套組，您將需要訂購以下產品：
我們最近修改了命名系統： 基因。突變。參考密碼子。突變密碼子。
例如： S.D215G.GAT.GGT
備註：若為多重核苷酸缺失(multi-nucleotide deletion)，參考密碼子和突變密碼子將不在命名系統之內。(如：S.delH69V70)
新的 Omicron 變異突變檢測： G339D, Q493R, T547K, A2710T, and T13195C
與該出版物相關的檢測方法，一種用於檢測 SARS-CoV-2 變異體， 快速監測循環變異，監測具有生物學意義的突變，以及早期檢測緊急變異體，例如 E. Lai, D. Becker 等科學家對Omicron的檢測， ，具體請看下方標藍的內容。
由於檢測引物和探針序列 (S477N, T478K, Q493R, P681H, 和delH69V70)下的相鄰突變，我們目前使用的一些 TaqMan SARS-CoV-2 突變檢測套組可能面對新型的 Omicron 變異體時效能有所降低。進一步的技術評估正在進行中，以瞭解相鄰突變是否會影響效能。選擇突變檢測套組時，如需幫助，請聯絡我們。
The TaqMan SARS-CoV-2 突變檢測套組頂級檢測試劑 AIF 文檔可以在下方的參考資料部分查閱。
AIF 文件包含在試劑貨運中。
*建議同時執行兩種檢測方式。變異株可能擁有兩組不同的突變密碼子，而導致相同的胺基酸改變。請參閱上表的命名系統，了解每個突變和相關變異株。
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