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Soluções de PCR em tempo real para pesquisa de SARS-CoV-2
Soluções para cada estágio de sua pesquisa
A Thermo Fisher Scientific orgulha-se de apoiar cientistas que realizam pesquisas vitais sobre SARS-CoV-2 com nossas soluções abrangentes de PCR em tempo real (qPCR). A PCR em tempo real é conhecida como o padrão ouro para testagem de coronavírus e é uma tecnologia comprovada que pode ajudar a acelerar descobertas que salvam vidas nas seguintes áreas de pesquisa sobre o SARS-CoV-2:
- Pesquisa básica: Explore questões sobre o ciclo de vida e a patogênese do SARS-CoV-2 analisando a biologia viral, a resposta imunológica e a genômica do hospedeiro.
- Pesquisa translacional: Descubra potenciais vacinas e candidatos terapêuticos investigando novos alvos e pequenas moléculas, seus efeitos sobre fatores genômicos e resposta imune e farmacogenômica.
- Desenvolvimento vacinas e terapêutica: Avance no desenvolvimento e na fabricação de processos quantificando formulações de ácido nucleico ou detectando micróbios em culturas e estoques de bioprodução.
- Epidemiologia: Minimize a disseminação potencial do vírus e informe as políticas públicas monitorando os determinantes genéticos virais e humanos nas populações e conduzindo a vigilância ambiental.
- Desenvolvimento de ensaio proprietário: desenvolva seu próprio ensaio de coronavírus usando nossos produtos complementares e um fluxo de trabalho eficiente e fácil de usar.
Soluções de PCR em tempo real da Applied Biosystems
A montagem de uma solução de PCR em tempo real exclusiva para as suas necessidades de pesquisa SARS-CoV-2 dependerá, em primeiro lugar, do tipo de análise ou aplicação que você usará: expressão gênica, variação genética ou miRNA e RNA não codificante. Para cada aplicação, oferecemos fluxos de trabalho completos e fáceis de usar, apoiados por um ecossistema sinérgico de reagentes de preparação de amostras, ensaios, master mixes, instrumentação e software de análise.
Detecte e quantifique RNA viral ou estude a expressão de gene de hospedeiro
Estude as variações genéticas de hospedeiro e vírus com implicações para infeção e patogênese da doença
Analise o papel do miRNA viral e hospedeiro nainfecção, progressão da doença e resposta imune do hospedeiro
Avance em sua pesquisa sobre SARS-CoV-2
A pesquisa sobre SARS-CoV-2 continua em um ritmo rápido e, à medida que as variantes do vírus continuam a surgir, a necessidade de entender a biologia do patógeno e as interações entre vírus-hospedeiro se torna cada vez mais essencial. A Thermo Fisher Scientific está comprometida em fornecer soluções de qPCR abrangentes e informações relevantes para ajudar a acelerar as descobertas que ajudarão a combater esse vírus.
Oferecemos soluções que vão desde ensaios TaqMan pré-desenhados da Applied Biosystems para a maioria, se não todos, os alvos de SARS-CoV-2 mais citados, até novos arrays flexíveis, especificamente desenvolvidos para estudar fatores de entrada do vírus, fatores de restrição antiviral e mediadores de sinalização imunológica.
Faça o download da nossa brochura de soluções para saber mais sobre todas as nossas soluções para expressão gênica e variação genética para sua pesquisa SARS-CoV-2.
Série de webinars: Acelere sua pesquisa sobre SARS-CoV-2
Ter um entendimento mais profundo da biologia do patógeno e responder a perguntas sobre a interação vírus-hospedeiro é fundamental para aprender como controlá-lo e as respectivas variantes futuras. O conhecimento das ferramentas e soluções disponíveis para tornar essa pesquisa potencialmente mais eficiente pode ajudá-lo a obter essas respostas mais rapidamente.
Pegue uma xícara de café e assista aos dois webinars sob demanda seguintes, focados na pesquisa do SARS-CoV-2:
Webinar 1: Patogênese do SARS CoV-2 e resposta do hospedeiro: Onde estamos em nosso entendimento sobre esse vírus?
Palestrante:
Dr. Archana Gupta,
Cientista de Aplicações
Ciências genéticas, Thermo Fisher Scientific
Dr. Gupta tem PhD em imunologia e microbiologia em pesquisa
experiência em doenças crônicas emergentes originadas de infecções por vírus.
Webinar 2: Soluções TaqMan selecionadas para acelerar sua pesquisa sobre SARS-CoV-2
Palestrante:
Phillip Kilgas
Gerente de produto, Ensaios e arrays de expressão gênica
Ciências genéticas – qPCR, Thermo Fisher Scientific
Phillip tem bacharelado em neurociência com estudos estendidos em físiologia médica.
PCR em tempo real para pesquisa básica
A PCR em tempo real é uma técnica rápida, fácil e acessível para quantificar os níveis de vírus e realizar a expressão gênica, microRNA, genotipagem de SNP e análise de variação do número de cópias.
O SARS-CoV-2 é um vírus envelopado, não segmentado, RNA fita simples senso positiva (+ssRNA) e recém identificado beta-coronavírus. O SARS-CoV-2 não havia sido visto anteriormente em humanos e há muito desconhecimento sobre o ciclo de vida e a patogênese desse vírus.
Análise de expressão gênica
Detecte e quantifique o RNA do SARS-CoV-2 em diferentes tecidos, culturas ou espécimes para elucidar os fundamentos da biologia do patógeno, incluindo tropismo, cinética de replicação, transmissão e patogênese (1). Use nossos ensaios para pesquisa pré-desenhados para os genes N e S de SARS-CoV-2 ou use primers e sondas customizadas para detectar outros genes virais de interesse.
Análise de variação genética
Compreenda os impactos fenotípicos da variabilidade genética do SARS-CoV-2, como resíduos polimórficos no gene S (2-4), para obter uma visão mais aprofundada sobre infecciosidade e patogenicidade. Use nossos ensaios customizados de genotipagem de SNP TaqMan para detectar variantes ou SNPs de interesse como um fluxo de trabalho independente ou combine com NGS para quantificar dados transcriptômicos e realizar estudos de acompanhamento com SNPs de interesse.
Análise de miRNA e RNA não codificante
Explore como os RNAs codificantes contribuem para o ciclo de vida e a patogênese do vírus. Estudos recentes sugerem que o miRNA viral pode modular epigeneticamente múltiplas vias de sinalização do hospedeiro, contribuindo para o escape imune e a patogênese (5-8).
Veja nossas soluções para análise de miRNA e de RNA não codificante ›
Como todos os vírus, o SARS-CoV-2 é um patógeno intracelular obrigatório que exige a permissão de fatores do hospedeiro para sua entrada, para a síntese de RNA viral, tradução de mRNAs virais e montagem de vírions. Use nossas soluções de PCR em tempo real para pesquisar como as diferentes interações patógeno-hospedeiro afetam o ciclo de vida e a patogênese do vírus.
Análise de expressão gênica
Obtenha informações valiosas sobre o tropismo viral e a transmissão estudando os padrões de expressão de fatores do hospedeiro que o SARS-CoV-2 usa para entrar em uma célula (9), incluindo o receptor ACE2 (1, 10-13), a protease serina TMPRSS2 (12-14) e a NRP1 (15). Ou explore o papel dos fatores de restrição do hospedeiro na defesa antiviral (16-20). Nosso portfólio de painéis com conteúdo flexível inclui uma variedade de novos painéis para estudos de vias relacionadas à infecção viral e doenças.
NOVO! Simplifique seus fluxos de trabalho de análise com nossos novos painéis com conteúdo flexível que incluem ensaios de expressão gênica para os genes mais citados envolvidos em entrada viral ou restrição de hospedeiro durante a infeção com SARS-CoV-2 e outros coronavírus.
Painel de fatores de entrada do coronavírus TaqMan Array : Humano | Camundongo | Rato
Painel TaqMan Array de restrição do coronavírus: Humano | camundongo | rato
Análise de genotipagem
Os determinantes genéticos do hospedeiro podem afetar a suscetibilidade ou resistência ao SARS-CoV-2 (20-22). A tecnologia de sondas MGB proporciona a máxima discriminação de sequência da diferença de base única nos alelos hospedeiros, o que nos permite oferecer ensaios pré-desenhados que detectam praticamente todos os genes humanos ou SNP. Use nossos ensaios de genotipagem de SNP TaqMan como um fluxo de trabalho independente ou combine com NGS para quantificar dados transcriptômicos e realizar estudos com SNPs de interesse. Explore a nossa lista de SNPs selecionados que, na literatura, mostraram afetar a gravidade do SARS-CoV-2.
Análise de miRNA e RNA não codificante
Investigue como o microRNA hospedeiro regula a expressão gênica em resposta ao SARS-CoV-2 (6,8,23). Os miRNAs têm demonstrado desempenhar um papel importante na regulação da expressão ACE2 e TMRSS2 (6,24,25), o que sugere uma caraterização mais detalhada que pode revelar percepções essenciais sobre a suscetibilidade do hospedeiro e os mecanismos da patogênese do SARS-CoV-2.
Veja nossas soluções para análise de miRNA e RNA não codificante ›
As sequelas das infeções SARS-CoV-2 são altamente variáveis e o questionamento das diferenças nas respostas imunes inatas e adaptativas em pacientes assintomáticos, levemente sintomáticos ou agudamente doentes é fundamental para compreender as vias da doença e possíveis alvos terapêuticos (20,26,28).
Análise de expressão gênica
Investigue como a expressão diferencial de genes de citocinas, quimiocinas e fatores de crescimento modula as vias de transdução de sinais em resposta ao SARS-CoV-2. O SARS-CoV-2 é conhecido por desregular uma variedade de vias envolvidas na inflamação, estresse oxidativo e respostas antivirais precoces da célula T (26,29-32).
NOVO! Agora oferecemos uma seleção de 29 ensaios para citocinas, quimiocinas e fatores de crescimento, envolvidos na resposta imune à SARS-CoV-2 e outros coronavírus no Painel de sinalização imune para coronavírus: Humano | camundongo | rato.
Análise de genotipagem
Identificar os determinantes genéticos do hospedeiro que podem afetar a resposta imune à infecção por SARS-CoV-2 (20,21,33). Oferecemos ensaios pré-desenhados para detectar praticamente todos os SNPs humanos.
Análise de miRNA e RNA não codificante
Identifique o microRNA hospedeiro, expresso diferencialmente, para entender o papel que essas moléculas desempenham na inibição ou promoção da infecção, incluindo a expansão e ativação de células imunes ou a evasão viral da vigilância do sistema imune (6,7,23,34).
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PCR em tempo real para pesquisa translacional
A PCR em tempo real pode ser usada em todo o pipeline de desenvolvimento terapêutico e de vacinas para permitir que os pesquisadores desenvolvam terapias potenciais que bloqueiem a replicação e disseminação do vírus.
Embora as orientações clínicas emitidas pelo CDC atualmente listem biomarcadores associados ao SARS-CoV-2, os pesquisadores têm necessidade imediata de identificar e desenvolver outros biomarcadores, como indicadores de processos biológicos subjacentes a infecções sintomáticas e à progressão da doença.
Análise de expressão gênica
Examine as vias de expressão gênica diferencial em pacientes com SARS-CoV-2 para identificar novos biomarcadores e possíveis alvos terapêuticos (20,26-28). Além de ensaios individuais que podem ser usados em reações singleplex ou em reações multiplex para interrogar vários alvos em uma única reação, oferecemos uma variedade de painéis de vias de sinalização para analisar uma ampla gama de alvos simultaneamente.
Análise de genotipagem
Identifique biomarcadores e alvos no contexto de variantes virais específicas, sistemas modelos ou históricos genéticos do hospedeiro para compreender como os determinantes genéticos do hospedeiro e do vírus podem afetar a suscetibilidade ou resistência ao SARS-CoV-2 (20,21). Nosso portfólio de genotipagem expandido garante que tenhamos um ensaio pré-desenhados para ajudar a acelerar seus estudos de genotipagem de SNP de humanos e camundongos, enquanto nossos ensaios customizados de genotipagem de SNP podem ser desenvolvidos para qualquer organismo hospedeiro suscetível ao SARS-CoV-2.
Análise de miRNA e RNA não codificante
Analise a expressão de miRNA do hospedeiro para identificar alvos terapêuticos potenciais (8,23,24,35) ou estude miRNAs no sangue como biomarcadores para SARS-CoV-2 (34,36). Nossos versáteis ensaios TaqMan miRNA são compatíveis com tecidos e biofluidos, incluindo soro e plasma, tornando-os uma ferramenta ideal para pesquisa de biomarcadores.
Veja nossas soluções para análise de miRNA e RNA não codificante ›
Embora a concepção de novos produtos terapêuticos possa levar anos de pesquisa e passar por muitos testes de segurança e eficácia, existem medicamentos com dados estabelecidos de segurança, farmacologia e toxicologia que podem ser reposicionados para a pesquisa SARS-CoV-2. Se você está pesquisando um novo composto candidato ou elucidando a promessa clínica de um medicamento existente, oferecemos soluções de PCR em tempo real para acelerar sua pesquisa.
Análise de expressão gênica
Realize o perfil transcricional do hospedeiro para determinar se genes imunológicos, como citocinas pró-inflamatórias e quimiocinas, estão sendo ativados ou modulados em resposta às possíveis terapias (29,37,38) ou quantificar o RNA viral antes e depois da administração de um composto antiviral.
Análise de genotipagem
Identifique polimorfismos nos genes que codificam as enzimas metabolizadoras de fármacos (DMEs) e as proteínas de transporte associadas para elucidar a eficácia e os riscos potenciais de fármacos novos ou reposicionados. Os ensaios TaqMan DME aproveitam nossa tecnologia MGB, altamente sensível e específica, para a detecção e discriminação dos marcadores genéticos PGX mais importantes, cobrindo 95% dos marcadores principais, definidos pelo grupo PharmaADME. Oferecemos mais de 2.700 ensaios únicos para detectar polimorfismos em 221 genes, incluindo polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs), polimorfismos de nucleotídeos múltiplos (MNPs) e inserções/deleções(in/Dels).
Análise de miRNA e RNA não codificante
Analise os perfis miRNA do hospedeiro para pesquisar respostas à terapêutica direcionada (7,36) usando nossos ensaios TaqMan miRNA compatíveis com tecido e sangue.
Veja nossas soluções para análise de miRNA e RNA não codificante ›
A PCR em tempo real é uma ferramenta indispensável, amplamente utilizada na pesquisa e desenvolvimento de vacinas e a Thermo Fisher Scientific oferece um portfólio abrangente de ferramentas de PCR em tempo real para acelerar a pesquisa e o desenvolvimento de vacinas.
Análise de expressão gênica
Faça o perfil transcricional do hospedeiro para determinar se genes imunes, como citocinas pró-inflamatórias e quimiocinas, estão sendo ativados ou modulados em resposta a essas vacinas e terapêutica (39), ou quantificar o RNA viral após infeção ou desafio (39-41).
Análise de genotipagem
Avalie a eficácia dessas vacinas em variantes virais específicas ou no contexto de determinados históricos genéticos do hospedeiro (20).
PCR em tempo real para a produção de vacinas e produtos terapêuticos
A PCR em tempo real é uma ferramenta indispensável, amplamente utilizada para o desenvolvimento vacinal e terapêutico, incluindo a quantificação da dosagem de vacinas baseadas em vírus ou genes e o monitoramento de culturas, estoques de vírus e a bioprodução para agentes adventícios.
Análise de expressão gênica
Quantifique as vacinas baseadas em ácido nucleico usando PCR em tempo real para garantir que as vacinas sejam produzidas na especificação e dosagem corretas. Os ensaios de PCR em tempo real oferecem sensibilidade, especificidade e linearidade padrão-ouro, o que é ideal para a quantificação de vacinas baseadas em ácido nucleico.
Análise de expressão gênica
Avalie a contaminação microbiana em culturas e estoques de bioprodução em larga escala usando ensaios pré-desenhados de expressão gênica. Nossos ensaios TaqMan e Primers e sondas customizados também possibilitam multiplexar vários alvos em uma única reação, para maior produtividade e tempos de resposta mais rápidos, visando atender aos cronogramas de produção.
PCR em tempo real para epidemiologia
A vigilância epidemiológica é conduzida para quantificar a disseminação da infecção pelo SARS-CoV-2 em uma população, os fatores que influenciam a suscetibilidade ou a liberação da infeção nessa população e os impactos econômicos e de saúde dessas infecções. Essa pesquisa, por sua vez, informará as políticas de saúde pública que ajudam a reduzir a disseminação e melhorar os resultados clínicos. Nosso ecossistema de ensaios coordenado, master mixes e soluções de preparação de amostras pode acomodar vários tipos diferentes de amostras.
Análise de genotipagem
A tipagem de vírus é essencial para determinar a amplitude da diversidade genética SARS-CoV-2 e identificar variantes de vírus que afetam a infecção do hospedeiro. O sequenciamento de nova geração (NGS) é uma ferramenta ideal para sequenciamento completo do genoma do SARS-CoV-2, incluindo todas as variantes e possíveis sorotipos, e a PCR em tempo real é o padrão ouro para validar dados de NGS e detectar SNPs específicos ou variantes genéticas de interesse em um grande número de amostras.
O monitoramento de vírus é essencial para identificar padrões de transmissão e monitorar medidas de contenção ou atenuação de surtos. O monitoramento também tem um papel na compreensão da evolução da cepa viral e da transmissão zoonótica. A PCR em tempo real fornece boa relação custo-benefício, processamento e tempo de resposta necessários para a pesquisa de monitoramento da doenças por SARS-CoV-2.
Análise de expressão gênica
Pesquise a resposta do hospedeiro ao SARS-CoV-2 no nível da população para determinar a variação nos padrões de expressão entre as comunidades ou em resposta a diferentes variantes.
Análise de genotipagem
Pesquise determinantes genéticos virais e humanos que influenciam a distribuição e os padrões da doença em uma população ou em um grande tamanho amostral. Nossos ensaios pré-desenhados para detectar praticamente todos os genes ou SNPs humanos estão prontos para implementação imediata em estudos epidemiológicos. Nossa Ferramenta personalizada de ensaios pode ser usada para elaborar ensaios com base em SNPs virais de interesse para monitoramento de variantes virais.
PCR em tempo real para desenvolvimento de ensaios
Análise de expressão gênica
Desenvolva seu próprio teste para detecção de coronavírus usando nossos primers e sondas customizados e outros produtos complementares.
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Recursos
Soluções de pesquisa de SARS-CoV-2
Recursos do qPCR
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.