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Independientemente de que esté empezando con células cultivadas o muestras de tejido, o trabajando con plantas, bacterias o células de mamíferos, los kits y reactivos de extracción de ARN Ambion ofrecen el producto adecuado para su investigación. La marca Ambion incluye productos Invitrogen existentes, tales como los fiables reactivos TRIzol y kits de purificación PureLink, junto con los principales productos Ambion, tales como kits y reactivos Cells-to-CT, MagMAX y RNAlater.
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Optimizado para muestras líquidas | Kit especializado agota eritrocitos no nucleados | Formato de placas de filtración con 96 columnas, para necesidades HTP | HTP optimizado para la purificación de muestras de sangre estabilizadas | Formato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN) | Alta producción de ARN directamente de sangre completa, sin necesidad de aislar leucocitos | |
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TRIzol LS | Kit de sangre de ARN total PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit MagMAX para aislamiento de ARN de tubos de sangre estabilizados | Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana | Kit de sangre RiboPure | |
El más vendido | ✓ | |||||
Reactivos de estabilización compatibles | EDTA, heparina, citrato, RNAlater | EDTA, heparina, citrato | EDTA, heparina, citrato | Tubos Tempus o PaxGene | EDTA o citrato | EDTA, heparina, citrato, RNAlater |
Incluye reactivo de estabilización | ✓ RNAlater | |||||
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columnas de sílice rápidas y cómodas en formato de placas | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 12 tubos en 2 horas | ≥ 96 muestras en < 1 h | 30 minutos | |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | ✓ | ✓ |
Para obtener más información sobre cómo trabajar con sangre, consulte nuestros artículos técnicos:
La purificación de ARN de células cultivadas tradicionalmente ha sido un procedimiento altamente repetitivo, que requiere mucho tiempo y trabajo, y que a menudo implica el uso de productos químicos orgánicos tóxicos. Los productos desarrollados por nuestros expertos en ARN permiten aislar ARN de máximo rendimiento, pureza e integridad utilizando diversas tecnologías (extracción orgánica, columnas de fibra de vidrio, gránulos magnéticos y combinaciones de estas tecnologías).
También puede analizar lisados de células cultivadas sin aislar primero el ARN. En un tiempo significativamente menor, obtendrá resultados de qPCR equivalentes a los de ARN purificado o, en algunos casos, mejores. Los productos Invitrogen como, por ejemplo, la línea de productos Cells-to-CT y Single Cell-to-CT, ofrecen enormes ventajas de rendimiento y manipulación.
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ARN intacto y altamente puro | Formato basado en columnas rápido y cómodo para ARN (> 200 nt) | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt) | Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeño | Sistema completo para células a qRT-PCR sin purificación de ARN | |
Reactivo TRIzol | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de micromuestras de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN MirVana | Kits Cells-to-CT | |
El más vendido | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 20 minutos | 30 minutos | < 10 minutos |
Método de lisis celular | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Extracción orgánica seguida de precipitación de alcohol | Lisis Cells-to-CT |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 x 107 células | De 5 x 106 a 1 x 108 células | De 5 x 106 a 1 x 108 células | Hasta 5 x 105 células | 102-107 células cultivadas | 10-100 000 células |
Aplicación | Todos los métodos de expresión de ARN | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | Análisis de micro ARN | qRT-PCR |
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Aislamiento de bajo rendimiento de ARN y ADN de la misma sección de FFPE | Aislamiento ampliable de ARN y ADN de la misma sección de FFPE | |
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Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll para FFPE | Kit MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra | |
Tiempo de preparación | 4,5 horas (tiempo total para 16 muestras) 2,5 horas de tiempo de manipulación | 4 horas (tiempo total para 96 preparaciones) 1 hora de tiempo de manipulación |
Producto final extraído | ARN total, microARN y ADNg | ARN total, microARN y ADNg |
Método de aislamiento | purificación de columnas | purificación de gránulos magnéticos |
Requiere desparafinación | ✓ | ✓ |
Compatible con automatización (posdesparafinización) | ✓ (guiones para KF Flex y Duo Prime) | |
Intervalo de muestras de FFPE compatible | Secciones de hasta 4 x 20 micras (tejido de 300 mm2) | Secciones de hasta 2 x 20 micras (tejido de 300 mm2) |
Volumen de muestra | ~ 50 µl de ADN purificado ~ 50 µl de ARN purificado | ~ 50 µl de ADN purificado ~ 50 µl de ARN purificado |
Compatible con paneles de ADN Ion AmpliSeq (p. ej., Cancer Hotspot Panel v2) | ✓ | ✓ |
Compatible con paneles de ARN Ion AmpliSeq (p. ej., RNA cancer y RNA fusion) | ✓ | ✓ |
La recuperación de ARN de calidad de muestras de FFPE puede ser bastante difícil. El proceso de fijación provoca un enlace cruzado entre los ácidos nucleicos y las proteínas, y modifica de forma covalente el ARN mediante la adición de grupos monometílicos a las bases. Como resultado, las moléculas se vuelven rígidas y susceptibles al cizallamiento mecánico, y los enlaces cruzados pueden poner en peligro el uso del ARN como sustrato para la transcripción inversa. Por tanto, a fin de utilizar tejidos de FFPE como origen para el análisis de la expresión génica, se requiere un método fiable para la extracción de ARN de la matriz entrecruzada.
Existen una serie de factores que pueden afectar a la calidad y al rendimiento generales del ARN aislado de tejidos de FFPE. A continuación se presentan recomendaciones para abordar varios factores clave:
Los kits MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra están diseñados para un aislamiento rápido, eficiente y automatizado del ARN total y el ADN de muestras de FFPE utilizando partículas magnéticas Invitrogen MagMAX. Los kits Invitrogen MagMAX FFPE NA ofrecen flujos de trabajo más rápidos y utilizan reactivos menos tóxicos, sin sacrificar la calidad. Estos kits ayudan a ofrecer una producción y una pureza de ácidos nucleicos comparables a las del mejor sistema basado en filtros RecoverAll de su clase. Los kits MagMAX FFPE NA superan el rendimiento de productos con protocolos similares y logran producciones de ARN y ADN comparables a las de protocolos más largos, más peligrosos y de menor rendimiento.
El procedimiento del kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll requiere unos 45 minutos de manipulación y se puede completar fácilmente en menos de un día cuando se aísla ARN. Las muestras FFPE se desparafinan con una serie de lavados de etanol y xileno. A continuación, se las somete a una rigurosa digestión de proteasas con un tiempo de incubación adaptado a la recuperación de ARN o ADN. Los ácidos nucleicos se purifican con un método rápido de filtrado con vidrio que incluye un tratamiento de nucleasa en el filtro y se eluyen en agua o en el tampón bajo en sal proporcionado.
Artículos de notas técnicas
Consejos desde la mesa de trabajo
Sus datos
Nota de aplicación
Boletín de producto
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Excelente para muestras complicadas (semillas y tejidos de coníferas) | Rápido y fácil de utilizar | Recuperación eficaz de ARN pequeño y microARN | Rápido y totalmente automático | |
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Reactivo de ARN de plantas | Minikit de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN mirVana | Kit de aislamiento de ARN total MagMAX-96 | |
El más vendido | ✓ | |||
Tipos de ARN aislado | solo moléculas de ARN grandes | solo moléculas de ARN grandes | Moléculas de ARN grandes y pequeñas | solo moléculas de ARN grandes |
Tiempo de preparación | 60 minutos | <20 minutos | 30 minutos | < 45 minutos |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 g | <250 mg | De 0,5 a 250 mg | Hasta 10 mg |
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | |||
Productos compatibles | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes |
Uno de los principales problemas relacionados con el aislamiento de ARN vegetal es la presencia de biomoléculas problemáticas, como compuestos polifenólicos y polisacáridos. El medio a aislamiento de ARN vegetal Ambion minimiza muchos de estos contaminantes con la adición de polivinilpirrolidona, un polímero de alto peso molecular que se une a polifenolicos y polisacáridos, y con un paso de centrifugación previo a la extracción.
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Minimiza la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Criterio de referencia para ARN intacto y altamente puro | Método sencillo, fiable y rápido | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt) | Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeño | TRIzol de máxima pureza + purificación de columnas, no se requiere precipitación | Formato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN) | |
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Reactivo TRIzol | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de micromuestras de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN mirVana | Sistema de purificación de ARN TRIZol Plus | Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana | |
El más vendido | ✓ | ||||||
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración | Columnas de sílice rápidas y cómodas | Extracción orgánica combinada con prácticas columnas de sílice | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 20 minutos | 30 minutos | 1 hora | < 1 hora |
Cantidad de material de partida | Hasta 100 mg | De 10 mg a 100 mg | De 10 células a 10 mg | Hasta 10 mg | Hasta tejido de 250 mg | Hasta 100 mg | Hasta 50 mg |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | ✓ | |||||
Tamaño de preparación | 100 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones |
El contenido de ARN puede variar ampliamente entre tejidos, tipos de células, estados fisiológicos, etc. En esta tabla se proporcionan directrices generales para estimar las producciones de ARN de una variedad de células y tejidos.
Tabla 1. Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos.
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Rápido y totalmente automático | Rápido y fácil de utilizar | Diseñado para paredes celulares rígidas de levadura manteniendo los perfiles de expresión | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | |
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Kit Platinum Taq MagMAX de aislamiento de ARN total para micromatrices | Minikit de ARN PureLink | Kit RiboPure-Yeast | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | |
El más vendido | ✓ | |||
Incluye gránulos especializados para lisis celular | No | No | Gránulos de circón | No |
Método de aislamiento | Formato ampliable y flexible para la máxima pureza; incluye extracción orgánica y gránulos magnéticos | Columna de sílice rápida y cómoda | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos |
Tiempo de preparación | < 1 hora | 20 minutos | 90 minutos (incluye tratamiento de ADNasa) | 20 minutos |
Cantidad de material de partida | Hasta 5 x 106 células | Hasta 5 x 108 células | Hasta 3 x 108 células | 1,8 ml de células de levadura frescas en fase logarítmica (OD660=0,6-0,8) |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | |||
Tamaño del kit | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones |
A diferencia de las células eucariotas, la levadura y muchas cepas bacterianas están protegidas por paredes celulares que pueden ser difíciles de alterar. Como primer paso, se requiere una lisis celular efectiva (normalmente mediante interrupción mecánica o pretratamiento enzimático) antes de cualquier procedimiento de aislamiento de ARN.
Una gama de productos desarrollados por los expertos en ARN de Ambion le ayudará a aislar una elevada producción de ARN puro e intacto de bacterias y levadura.
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Sin procedimientos de lisis | Rápido y fácil, 20 min | Formato de placas de filtración basado en columna de sílice rápida y cómoda | HTP, 45 min | Ideal para bacterias + gram difíciles de lisar | |
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Kit de aislamiento de ARN bacteriano TRIzol Max con reactivo de mejora bacteriana TRIZol & Max | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX | Kit RiboPure-Bacteria | |
El más vendido | ✓ | ||||
Incluye gránulos especializados para lisis celular | No | No | No | Gránulos de circón | Gránulos de circón |
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 45 minutos | 1 hora |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 x 108 células | Hasta 1 x 109 células | Hasta 1 x 109 células | Hasta 0,3 g de muestras sólidas o 175 µl de muestras líquidas | Hasta 109 células |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | ✓ | |||
Tamaño del kit | 100 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 100 preparaciones | 50 preparaciones |
El análisis vírico de muestras biológicas (animales, insectos, plantas, hongos, bacterias) y ambientales (agua, aire, alimentos) se realiza cada vez más utilizando estrategias de análisis molecular que requieren ARN o ADN vírico de las muestras que se están analizando. La purificación de ARN vírico plantea desafíos únicos para la obtención de una buena sensibilidad de recuperación y detección. Los expertos en ARN de Ambion han desarrollado productos de purificación de ARN optimizados para proporcionar la máxima producción, pureza e integridad de ARN vírico de una amplia gama de tipos de muestras en varias opciones de formato.
«El ARN vírico altamente concentrado del minikit de ADN/ARN vírico PureLink proporciona una herramienta para un análisis posterior más sensible y delicado de genomas víricos»
Aplicación posterior más adecuada | ||||||
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Producto | Formato | RT-PCR en tiempo real | Análisis de micromatrices | Secuenciación | Northern blot | Clonación |
ARN total | ||||||
Minikit de ADN/ARN vírico PureLink | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ✓ | |||
Kit RNAqueous | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ✓ | ✓ | ||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX AI⁄ND | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas | ✓ | ✓ | |||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 AI⁄ND | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
ADN/ARN | ||||||
Kit de purificación de ADN/ARN vírico PureLink Pro 96 | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
AN vírico Dynabeads SILANE | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos, compatible con automatización | |||||
Kit de virus iPrep PureLink | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, compatible con automatización | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 (5 x 96 reacciones) | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ||||
Micro ARN | ||||||
Kit de aislamiento de miARN mirVana | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ||||
Kit de aislamiento mirVana miRNA (sin fenol - se debe adquirir por separado) | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ||||
Reactivo TRIzol LS | Lisis en reactivo TRIzol, reactivo de un paso | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
ARNm | ||||||
Kit Dynabeads mRNA DIRECT | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos | ✓ | ✓ | |||
Microkit Dynabeads mRNA DIRECT | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos | ✓ | ✓ |
Nucleic Acid Purification and Analysis Support Center
Find tips, troubleshooting help, and resources for your nucleic acid purification & analysis applications.
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Optimizado para muestras líquidas | Kit especializado agota eritrocitos no nucleados | Formato de placas de filtración con 96 columnas, para necesidades HTP | HTP optimizado para la purificación de muestras de sangre estabilizadas | Formato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN) | Alta producción de ARN directamente de sangre completa, sin necesidad de aislar leucocitos | |
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TRIzol LS | Kit de sangre de ARN total PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit MagMAX para aislamiento de ARN de tubos de sangre estabilizados | Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana | Kit de sangre RiboPure | |
El más vendido | ✓ | |||||
Reactivos de estabilización compatibles | EDTA, heparina, citrato, RNAlater | EDTA, heparina, citrato | EDTA, heparina, citrato | Tubos Tempus o PaxGene | EDTA o citrato | EDTA, heparina, citrato, RNAlater |
Incluye reactivo de estabilización | ✓ RNAlater | |||||
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columnas de sílice rápidas y cómodas en formato de placas | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 12 tubos en 2 horas | ≥ 96 muestras en < 1 h | 30 minutos | |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | ✓ | ✓ |
Para obtener más información sobre cómo trabajar con sangre, consulte nuestros artículos técnicos:
La purificación de ARN de células cultivadas tradicionalmente ha sido un procedimiento altamente repetitivo, que requiere mucho tiempo y trabajo, y que a menudo implica el uso de productos químicos orgánicos tóxicos. Los productos desarrollados por nuestros expertos en ARN permiten aislar ARN de máximo rendimiento, pureza e integridad utilizando diversas tecnologías (extracción orgánica, columnas de fibra de vidrio, gránulos magnéticos y combinaciones de estas tecnologías).
También puede analizar lisados de células cultivadas sin aislar primero el ARN. En un tiempo significativamente menor, obtendrá resultados de qPCR equivalentes a los de ARN purificado o, en algunos casos, mejores. Los productos Invitrogen como, por ejemplo, la línea de productos Cells-to-CT y Single Cell-to-CT, ofrecen enormes ventajas de rendimiento y manipulación.
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ARN intacto y altamente puro | Formato basado en columnas rápido y cómodo para ARN (> 200 nt) | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt) | Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeño | Sistema completo para células a qRT-PCR sin purificación de ARN | |
Reactivo TRIzol | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de micromuestras de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN MirVana | Kits Cells-to-CT | |
El más vendido | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 20 minutos | 30 minutos | < 10 minutos |
Método de lisis celular | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidad | Extracción orgánica seguida de precipitación de alcohol | Lisis Cells-to-CT |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 x 107 células | De 5 x 106 a 1 x 108 células | De 5 x 106 a 1 x 108 células | Hasta 5 x 105 células | 102-107 células cultivadas | 10-100 000 células |
Aplicación | Todos los métodos de expresión de ARN | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | qRT-PCR, NGS | Análisis de micro ARN | qRT-PCR |
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Aislamiento de bajo rendimiento de ARN y ADN de la misma sección de FFPE | Aislamiento ampliable de ARN y ADN de la misma sección de FFPE | |
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Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll para FFPE | Kit MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra | |
Tiempo de preparación | 4,5 horas (tiempo total para 16 muestras) 2,5 horas de tiempo de manipulación | 4 horas (tiempo total para 96 preparaciones) 1 hora de tiempo de manipulación |
Producto final extraído | ARN total, microARN y ADNg | ARN total, microARN y ADNg |
Método de aislamiento | purificación de columnas | purificación de gránulos magnéticos |
Requiere desparafinación | ✓ | ✓ |
Compatible con automatización (posdesparafinización) | ✓ (guiones para KF Flex y Duo Prime) | |
Intervalo de muestras de FFPE compatible | Secciones de hasta 4 x 20 micras (tejido de 300 mm2) | Secciones de hasta 2 x 20 micras (tejido de 300 mm2) |
Volumen de muestra | ~ 50 µl de ADN purificado ~ 50 µl de ARN purificado | ~ 50 µl de ADN purificado ~ 50 µl de ARN purificado |
Compatible con paneles de ADN Ion AmpliSeq (p. ej., Cancer Hotspot Panel v2) | ✓ | ✓ |
Compatible con paneles de ARN Ion AmpliSeq (p. ej., RNA cancer y RNA fusion) | ✓ | ✓ |
La recuperación de ARN de calidad de muestras de FFPE puede ser bastante difícil. El proceso de fijación provoca un enlace cruzado entre los ácidos nucleicos y las proteínas, y modifica de forma covalente el ARN mediante la adición de grupos monometílicos a las bases. Como resultado, las moléculas se vuelven rígidas y susceptibles al cizallamiento mecánico, y los enlaces cruzados pueden poner en peligro el uso del ARN como sustrato para la transcripción inversa. Por tanto, a fin de utilizar tejidos de FFPE como origen para el análisis de la expresión génica, se requiere un método fiable para la extracción de ARN de la matriz entrecruzada.
Existen una serie de factores que pueden afectar a la calidad y al rendimiento generales del ARN aislado de tejidos de FFPE. A continuación se presentan recomendaciones para abordar varios factores clave:
Los kits MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra están diseñados para un aislamiento rápido, eficiente y automatizado del ARN total y el ADN de muestras de FFPE utilizando partículas magnéticas Invitrogen MagMAX. Los kits Invitrogen MagMAX FFPE NA ofrecen flujos de trabajo más rápidos y utilizan reactivos menos tóxicos, sin sacrificar la calidad. Estos kits ayudan a ofrecer una producción y una pureza de ácidos nucleicos comparables a las del mejor sistema basado en filtros RecoverAll de su clase. Los kits MagMAX FFPE NA superan el rendimiento de productos con protocolos similares y logran producciones de ARN y ADN comparables a las de protocolos más largos, más peligrosos y de menor rendimiento.
El procedimiento del kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll requiere unos 45 minutos de manipulación y se puede completar fácilmente en menos de un día cuando se aísla ARN. Las muestras FFPE se desparafinan con una serie de lavados de etanol y xileno. A continuación, se las somete a una rigurosa digestión de proteasas con un tiempo de incubación adaptado a la recuperación de ARN o ADN. Los ácidos nucleicos se purifican con un método rápido de filtrado con vidrio que incluye un tratamiento de nucleasa en el filtro y se eluyen en agua o en el tampón bajo en sal proporcionado.
Artículos de notas técnicas
Consejos desde la mesa de trabajo
Sus datos
Nota de aplicación
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Excelente para muestras complicadas (semillas y tejidos de coníferas) | Rápido y fácil de utilizar | Recuperación eficaz de ARN pequeño y microARN | Rápido y totalmente automático | |
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Reactivo de ARN de plantas | Minikit de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN mirVana | Kit de aislamiento de ARN total MagMAX-96 | |
El más vendido | ✓ | |||
Tipos de ARN aislado | solo moléculas de ARN grandes | solo moléculas de ARN grandes | Moléculas de ARN grandes y pequeñas | solo moléculas de ARN grandes |
Tiempo de preparación | 60 minutos | <20 minutos | 30 minutos | < 45 minutos |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 g | <250 mg | De 0,5 a 250 mg | Hasta 10 mg |
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | |||
Productos compatibles | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes | Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion Elimina los contaminantes de plantas comunes |
Uno de los principales problemas relacionados con el aislamiento de ARN vegetal es la presencia de biomoléculas problemáticas, como compuestos polifenólicos y polisacáridos. El medio a aislamiento de ARN vegetal Ambion minimiza muchos de estos contaminantes con la adición de polivinilpirrolidona, un polímero de alto peso molecular que se une a polifenolicos y polisacáridos, y con un paso de centrifugación previo a la extracción.
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Minimiza la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Criterio de referencia para ARN intacto y altamente puro | Método sencillo, fiable y rápido | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt) | Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeño | TRIzol de máxima pureza + purificación de columnas, no se requiere precipitación | Formato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN) | |
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Reactivo TRIzol | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de micromuestras de ARN PureLink | Kit de aislamiento de miARN mirVana | Sistema de purificación de ARN TRIZol Plus | Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana | |
El más vendido | ✓ | ||||||
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración | Columnas de sílice rápidas y cómodas | Extracción orgánica combinada con prácticas columnas de sílice | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 20 minutos | 30 minutos | 1 hora | < 1 hora |
Cantidad de material de partida | Hasta 100 mg | De 10 mg a 100 mg | De 10 células a 10 mg | Hasta 10 mg | Hasta tejido de 250 mg | Hasta 100 mg | Hasta 50 mg |
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Tamaño de preparación | 100 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones |
El contenido de ARN puede variar ampliamente entre tejidos, tipos de células, estados fisiológicos, etc. En esta tabla se proporcionan directrices generales para estimar las producciones de ARN de una variedad de células y tejidos.
Tabla 1. Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos.
La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.
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Rápido y totalmente automático | Rápido y fácil de utilizar | Diseñado para paredes celulares rígidas de levadura manteniendo los perfiles de expresión | Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt) | |
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Kit Platinum Taq MagMAX de aislamiento de ARN total para micromatrices | Minikit de ARN PureLink | Kit RiboPure-Yeast | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | |
El más vendido | ✓ | |||
Incluye gránulos especializados para lisis celular | No | No | Gránulos de circón | No |
Método de aislamiento | Formato ampliable y flexible para la máxima pureza; incluye extracción orgánica y gránulos magnéticos | Columna de sílice rápida y cómoda | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos |
Tiempo de preparación | < 1 hora | 20 minutos | 90 minutos (incluye tratamiento de ADNasa) | 20 minutos |
Cantidad de material de partida | Hasta 5 x 106 células | Hasta 5 x 108 células | Hasta 3 x 108 células | 1,8 ml de células de levadura frescas en fase logarítmica (OD660=0,6-0,8) |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | |||
Tamaño del kit | 96 preparaciones | 50 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones |
A diferencia de las células eucariotas, la levadura y muchas cepas bacterianas están protegidas por paredes celulares que pueden ser difíciles de alterar. Como primer paso, se requiere una lisis celular efectiva (normalmente mediante interrupción mecánica o pretratamiento enzimático) antes de cualquier procedimiento de aislamiento de ARN.
Una gama de productos desarrollados por los expertos en ARN de Ambion le ayudará a aislar una elevada producción de ARN puro e intacto de bacterias y levadura.
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Sin procedimientos de lisis | Rápido y fácil, 20 min | Formato de placas de filtración basado en columna de sílice rápida y cómoda | HTP, 45 min | Ideal para bacterias + gram difíciles de lisar | |
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Kit de aislamiento de ARN bacteriano TRIzol Max con reactivo de mejora bacteriana TRIZol & Max | Minikit de ARN PureLink | Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96 | Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX | Kit RiboPure-Bacteria | |
El más vendido | ✓ | ||||
Incluye gránulos especializados para lisis celular | No | No | No | Gránulos de circón | Gránulos de circón |
Método de aislamiento | Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol) | Columna de sílice rápida y cómoda | Columna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos | Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos | Máxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación) |
Tiempo de preparación | 1 hora | 20 minutos | 20 minutos | 45 minutos | 1 hora |
Cantidad de material de partida | Hasta 1 x 108 células | Hasta 1 x 109 células | Hasta 1 x 109 células | Hasta 0,3 g de muestras sólidas o 175 µl de muestras líquidas | Hasta 109 células |
Compatible con alto rendimiento | ✓ | ✓ | |||
Tamaño del kit | 100 preparaciones | 50 preparaciones | 96 preparaciones | 100 preparaciones | 50 preparaciones |
El análisis vírico de muestras biológicas (animales, insectos, plantas, hongos, bacterias) y ambientales (agua, aire, alimentos) se realiza cada vez más utilizando estrategias de análisis molecular que requieren ARN o ADN vírico de las muestras que se están analizando. La purificación de ARN vírico plantea desafíos únicos para la obtención de una buena sensibilidad de recuperación y detección. Los expertos en ARN de Ambion han desarrollado productos de purificación de ARN optimizados para proporcionar la máxima producción, pureza e integridad de ARN vírico de una amplia gama de tipos de muestras en varias opciones de formato.
«El ARN vírico altamente concentrado del minikit de ADN/ARN vírico PureLink proporciona una herramienta para un análisis posterior más sensible y delicado de genomas víricos»
Aplicación posterior más adecuada | ||||||
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Producto | Formato | RT-PCR en tiempo real | Análisis de micromatrices | Secuenciación | Northern blot | Clonación |
ARN total | ||||||
Minikit de ADN/ARN vírico PureLink | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ✓ | |||
Kit RNAqueous | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ✓ | ✓ | ||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX AI⁄ND | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas | ✓ | ✓ | |||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 AI⁄ND | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
ADN/ARN | ||||||
Kit de purificación de ADN/ARN vírico PureLink Pro 96 | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ✓ | |||
AN vírico Dynabeads SILANE | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos, compatible con automatización | |||||
Kit de virus iPrep PureLink | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, compatible con automatización | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas | ✓ | ||||
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 (5 x 96 reacciones) | Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización | ✓ | ||||
Micro ARN | ||||||
Kit de aislamiento de miARN mirVana | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ||||
Kit de aislamiento mirVana miRNA (sin fenol - se debe adquirir por separado) | Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice | ✓ | ||||
Reactivo TRIzol LS | Lisis en reactivo TRIzol, reactivo de un paso | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | |
ARNm | ||||||
Kit Dynabeads mRNA DIRECT | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos | ✓ | ✓ | |||
Microkit Dynabeads mRNA DIRECT | Lisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos | ✓ | ✓ |
Explore cómo puede evitar, detectar e inhibir las ARNasas.