Extracción de ARN

Independientemente de que esté empezando con células cultivadas o muestras de tejido, o trabajando con plantas, bacterias o células de mamíferos, los kits y reactivos de extracción de ARN Ambion ofrecen el producto adecuado para su investigación. La marca Ambion incluye productos Invitrogen existentes, tales como los fiables reactivos TRIzol y kits de purificación PureLink, junto con los principales productos Ambion, tales como kits y reactivos Cells-to-CT, MagMAX y RNAlater.

¿Qué kit de extracción de ARN de muestra de sangre es adecuado para usted?

 Pedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahora
 Optimizado para muestras líquidasKit especializado agota eritrocitos no nucleadosFormato de placas de filtración con 96 columnas, para necesidades HTPHTP optimizado para la purificación de muestras de sangre estabilizadasFormato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN)Alta producción de ARN directamente de sangre completa, sin necesidad de aislar leucocitos
 TRIzol LS Kit de sangre de ARN total PureLink Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit MagMAX para aislamiento de ARN de tubos de sangre estabilizados Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana Kit de sangre RiboPure
El más vendido     
Reactivos de estabilización compatibles EDTA, heparina, citrato, RNAlaterEDTA, heparina, citratoEDTA, heparina, citratoTubos Tempus o PaxGeneEDTA o citratoEDTA, heparina, citrato, RNAlater
Incluye reactivo de estabilización     
RNAlater
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumnas de sílice rápidas y cómodas en formato de placasFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)
Tiempo de preparación1 hora20 minutos 12 tubos en 2 horas≥ 96 muestras en < 1 h30 minutos
Compatible con alto rendimiento   

Para obtener más información sobre cómo trabajar con sangre, consulte nuestros artículos técnicos:

Protocolos adicionales

Artículos de notas técnicas

La purificación de ARN de células cultivadas tradicionalmente ha sido un procedimiento altamente repetitivo, que requiere mucho tiempo y trabajo, y que a menudo implica el uso de productos químicos orgánicos tóxicos. Los productos desarrollados por nuestros expertos en ARN permiten aislar ARN de máximo rendimiento, pureza e integridad utilizando diversas tecnologías (extracción orgánica, columnas de fibra de vidrio, gránulos magnéticos y combinaciones de estas tecnologías).

También puede analizar lisados de células cultivadas sin aislar primero el ARN. En un tiempo significativamente menor, obtendrá resultados de qPCR equivalentes a los de ARN purificado o, en algunos casos, mejores. Los productos Invitrogen como, por ejemplo, la línea de productos Cells-to-CT y Single Cell-to-CT, ofrecen enormes ventajas de rendimiento y manipulación.

¿Qué kit de aislamiento de ARN de células cultivadas es adecuado para usted?

 Pedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahoraPedir ahora
 ARN intacto y altamente puroFormato basado en columnas rápido y cómodo para ARN (> 200 nt)Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt)Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeñoSistema completo para células a qRT-PCR sin purificación de ARN
 Reactivo TRIzolMinikit de ARN PureLinkKit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de micromuestras de ARN PureLinkKit de aislamiento de miARN MirVanaKits Cells-to-CT
El más vendido  
Tiempo de preparación1 hora20 minutos20 minutos20 minutos30 minutos< 10 minutos
Método de lisis celularExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadLisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadLisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadExtracción orgánica seguida de precipitación de alcoholLisis Cells-to-CT
Cantidad de material de partidaHasta 1 x 107 célulasDe 5 x 106 a 1 x 108 célulasDe 5 x 106 a 1 x 108 célulasHasta 5 x 105 células102-107 células cultivadas10-100 000 células
AplicaciónTodos los métodos de expresión de ARNqRT-PCR, NGSqRT-PCR, NGSqRT-PCR, NGSAnálisis de micro ARNqRT-PCR

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ARN de muestras de FFPE es adecuado para usted?

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 Aislamiento de bajo rendimiento de ARN y ADN de la misma sección de FFPEAislamiento ampliable de ARN y ADN de la misma sección de FFPE
  Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll para FFPE Kit MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra
Tiempo de preparación4,5 horas (tiempo total para 16 muestras)
2,5 horas de tiempo de manipulación
4 horas (tiempo total para 96 preparaciones)
1 hora de tiempo de manipulación
Producto final extraídoARN total, microARN y ADNgARN total, microARN y ADNg
Método de aislamientopurificación de columnaspurificación de gránulos magnéticos
Requiere desparafinación
Compatible con automatización (posdesparafinización) 
(guiones para KF Flex y Duo Prime)
Intervalo de muestras de FFPE compatibleSecciones de hasta 4 x 20 micras
(tejido de 300 mm2)
Secciones de hasta 2 x 20 micras
(tejido de 300 mm2)
Volumen de muestra~ 50 µl de ADN purificado
~ 50 µl de ARN purificado
~ 50 µl de ADN purificado
~ 50 µl de ARN purificado
Compatible con paneles de ADN Ion AmpliSeq (p. ej., Cancer Hotspot Panel v2)
Compatible con paneles de ARN Ion AmpliSeq (p. ej., RNA cancer y RNA fusion)

¿Por qué el aislamiento de ARN de FFPE supone un desafío?

La recuperación de ARN de calidad de muestras de FFPE puede ser bastante difícil. El proceso de fijación provoca un enlace cruzado entre los ácidos nucleicos y las proteínas, y modifica de forma covalente el ARN mediante la adición de grupos monometílicos a las bases. Como resultado, las moléculas se vuelven rígidas y susceptibles al cizallamiento mecánico, y los enlaces cruzados pueden poner en peligro el uso del ARN como sustrato para la transcripción inversa. Por tanto, a fin de utilizar tejidos de FFPE como origen para el análisis de la expresión génica, se requiere un método fiable para la extracción de ARN de la matriz entrecruzada.

¿Cómo puede aumentar sus posibilidades de éxito con FFPE?

Existen una serie de factores que pueden afectar a la calidad y al rendimiento generales del ARN aislado de tejidos de FFPE. A continuación se presentan recomendaciones para abordar varios factores clave:

  1. Obtención de tejidos y preparación de muestras de tejidos en fases anteriores: si es posible, los tejidos se deben fijar en el plazo de una hora después de la resección quirúrgica. Se puede producir una gran degradación del ARN antes de completar el proceso de fijación. El tiempo de fijación óptimo es de entre 12 y 24 horas, utilizando formalina tamponada neutra o paraformaldehído. Los tejidos fijados se deben deshidratar completamente antes del proceso de inclusión.
  2. Almacenamiento de bloques: el almacenamiento de bloques sin caras cortadas, cuando sea posible, previene daños continuos por exposición al oxígeno atmosférico, al agua y a otros factores ambientales, tales como la luz y la infestación (hongos, insectos, etc.).
  3. Tipo, tamaño y cantidad de tejido que se va a utilizar para el aislamiento de ARN: el grosor de tejido recomendado es de 10-20 µm. El número de secciones utilizadas se determina por el tipo de tejido (que afecta a la densidad celular) y el área de superficie (tamaño recomendado: 50-300 mm2). El exceso de material de partida puede causar la obstrucción del filtro, lo que da como resultado una baja producción.
  4. Cantidad excesiva de parafina utilizada para la inclusión de tejidos: cuando sea posible, se debe eliminar el exceso de parafina antes de iniciar el protocolo de purificación. Para los métodos de purificación basados en xileno, deberían ser suficientes dos tratamientos de xileno a temperatura ambiente para una desparafinización completa. Si se desea, se puede realizar un tratamiento más riguroso de 37-55 °C durante 30 minutos. Después de la desparafinización del xileno, es crucial que se retire completamente el etanol al 100 % y que los sedimentos estén secos después de los dos lavados de etanol al 100 %. El método de gránulos magnéticos emplea novedosas sustancias químicas para tratar la parafina que limita la entrada a secciones de 20 µm.

Los kits MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra están diseñados para un aislamiento rápido, eficiente y automatizado del ARN total y el ADN de muestras de FFPE utilizando partículas magnéticas Invitrogen MagMAX. Los kits Invitrogen MagMAX FFPE NA ofrecen flujos de trabajo más rápidos y utilizan reactivos menos tóxicos, sin sacrificar la calidad. Estos kits ayudan a ofrecer una producción y una pureza de ácidos nucleicos comparables a las del mejor sistema basado en filtros RecoverAll de su clase. Los kits MagMAX FFPE NA superan el rendimiento de productos con protocolos similares y logran producciones de ARN y ADN comparables a las de protocolos más largos, más peligrosos y de menor rendimiento.

El procedimiento del kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll requiere unos 45 minutos de manipulación y se puede completar fácilmente en menos de un día cuando se aísla ARN. Las muestras FFPE se desparafinan con una serie de lavados de etanol y xileno. A continuación, se las somete a una rigurosa digestión de proteasas con un tiempo de incubación adaptado a la recuperación de ARN o ADN. Los ácidos nucleicos se purifican con un método rápido de filtrado con vidrio que incluye un tratamiento de nucleasa en el filtro y se eluyen en agua o en el tampón bajo en sal proporcionado.

Recursos técnicos

Artículos de notas técnicas

Consejos desde la mesa de trabajo

Sus datos

Nota de aplicación

Boletín de producto

¿Qué kit de aislamiento de ARN vegetal es adecuado para usted?

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 Excelente para muestras complicadas (semillas y tejidos de coníferas)Rápido y fácil de utilizarRecuperación eficaz de ARN pequeño y microARNRápido y totalmente automático
  Reactivo de ARN de plantas Minikit de ARN PureLink Kit de aislamiento de miARN mirVana Kit de aislamiento de ARN total MagMAX-96
El más vendido   
Tipos de ARN aisladosolo moléculas de ARN grandessolo moléculas de ARN grandesMoléculas de ARN grandes y pequeñas solo moléculas de ARN grandes
Tiempo de preparación60 minutos<20 minutos30 minutos< 45 minutos
Cantidad de material de partidaHasta 1 g<250 mgDe 0,5 a 250 mgHasta 10 mg
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos
Compatible con alto rendimiento   
Productos compatibles Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes
Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes
Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes

Eliminar polisacáridos

Uno de los principales problemas relacionados con el aislamiento de ARN vegetal es la presencia de biomoléculas problemáticas, como compuestos polifenólicos y polisacáridos. El medio a aislamiento de ARN vegetal Ambion minimiza muchos de estos contaminantes con la adición de polivinilpirrolidona, un polímero de alto peso molecular que se une a polifenolicos y polisacáridos, y con un paso de centrifugación previo a la extracción.

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Minimiza la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ARN de tejidos es adecuado para usted?

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 Criterio de referencia para ARN intacto y altamente puroMétodo sencillo, fiable y rápidoFormato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt)Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeñoTRIzol de máxima pureza + purificación de columnas, no se requiere precipitaciónFormato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN)
  Reactivo TRIzolMinikit de ARN PureLinkKit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de micromuestras de ARN PureLinkKit de aislamiento de miARN mirVanaSistema de purificación de ARN TRIZol PlusAislamiento de ARN total MagMAX mirVana
El más vendido      
Método de aislamiento Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtraciónColumnas de sílice rápidas y cómodasExtracción orgánica combinada con prácticas columnas de síliceMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos
Tiempo de preparación 1 hora20 minutos20 minutos20 minutos30 minutos1 hora< 1 hora
Cantidad de material de partidaHasta 100 mgDe 10 mg a 100 mgDe 10 células a 10 mgHasta 10 mgHasta tejido de 250 mgHasta 100 mgHasta 50 mg
Compatible con alto rendimiento     
Tamaño de preparación100 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones

Producción de ARN de tejidos animales

El contenido de ARN puede variar ampliamente entre tejidos, tipos de células, estados fisiológicos, etc. En esta tabla se proporcionan directrices generales para estimar las producciones de ARN de una variedad de células y tejidos.

Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos

Tabla 1. Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos.

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ADN de levadura es adecuado para usted?

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 Rápido y totalmente automáticoRápido y fácil de utilizarDiseñado para paredes celulares rígidas de levadura manteniendo los perfiles de expresiónFormato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)
 Kit Platinum Taq MagMAX de aislamiento de ARN total para micromatrices Minikit de ARN PureLinkKit RiboPure-Yeast Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96
El más vendido   
Incluye gránulos especializados para lisis celularNoNoGránulos de circónNo
Método de aislamientoFormato ampliable y flexible para la máxima pureza; incluye extracción orgánica y gránulos magnéticosColumna de sílice rápida y cómodaMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánicaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos
Tiempo de preparación< 1 hora20 minutos90 minutos (incluye tratamiento de ADNasa)20 minutos
Cantidad de material de partida Hasta 5 x 106 célulasHasta 5 x 108 célulasHasta 3 x 108 células1,8 ml de células de levadura frescas en fase logarítmica (OD660=0,6-0,8)
Compatible con alto rendimiento   
Tamaño del kit96 preparaciones50 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones

Recursos técnicos

A diferencia de las células eucariotas, la levadura y muchas cepas bacterianas están protegidas por paredes celulares que pueden ser difíciles de alterar. Como primer paso, se requiere una lisis celular efectiva (normalmente mediante interrupción mecánica o pretratamiento enzimático) antes de cualquier procedimiento de aislamiento de ARN.

Una gama de productos desarrollados por los expertos en ARN de Ambion le ayudará a aislar una elevada producción de ARN puro e intacto de bacterias y levadura.

¿Qué kit de aislamiento de ARN bacteriano es adecuado para usted?

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 Sin procedimientos de lisisRápido y fácil, 20 minFormato de placas de filtración basado en columna de sílice rápida y cómodaHTP, 45 minIdeal para bacterias + gram difíciles de lisar
 Kit de aislamiento de ARN bacteriano TRIzol Max con reactivo de mejora bacteriana TRIZol & Max Minikit de ARN PureLink Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX Kit RiboPure-Bacteria
El más vendido    
Incluye gránulos especializados para lisis celularNoNoNoGránulos de circónGránulos de circón
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillosFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)
Tiempo de preparación1 hora20 minutos20 minutos45 minutos1 hora
Cantidad de material de partidaHasta 1 x 108 célulasHasta 1 x 109 célulasHasta 1 x 109 célulasHasta 0,3 g de muestras sólidas o 175 µl de muestras líquidasHasta 109 células
Compatible con alto rendimiento   
Tamaño del kit100 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones100 preparaciones50 preparaciones

Recursos técnicos

El análisis vírico de muestras biológicas (animales, insectos, plantas, hongos, bacterias) y ambientales (agua, aire, alimentos) se realiza cada vez más utilizando estrategias de análisis molecular que requieren ARN o ADN vírico de las muestras que se están analizando. La purificación de ARN vírico plantea desafíos únicos para la obtención de una buena sensibilidad de recuperación y detección. Los expertos en ARN de Ambion han desarrollado productos de purificación de ARN optimizados para proporcionar la máxima producción, pureza e integridad de ARN vírico de una amplia gama de tipos de muestras en varias opciones de formato.

«El ARN vírico altamente concentrado del minikit de ADN/ARN vírico PureLink proporciona una herramienta para un análisis posterior más sensible y delicado de genomas víricos»
Dr. Dongning Wang, en el laboratorio de Feng Gao, MD, Duke Human Vaccine Institute, Universidad de Duke

Especificaciones del producto

 Aplicación posterior más adecuada
ProductoFormatoRT-PCR en tiempo realAnálisis de micromatricesSecuenciaciónNorthern blotClonación

ARN total

Minikit de ADN/ARN vírico PureLinkLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice   
Kit RNAqueousLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice  
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX AI⁄NDLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas   
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 AI⁄NDLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   

ADN/ARN

Kit de purificación de ADN/ARN vírico PureLink Pro 96Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización    
Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAXLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   
AN vírico Dynabeads SILANELisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos, compatible con automatización     
Kit de virus iPrep PureLinkLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, compatible con automatización    
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAXLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas    
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 (5 x 96 reacciones)Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización    

Micro ARN

Kit de aislamiento de miARN mirVanaLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice    
Kit de aislamiento mirVana miRNA (sin fenol - se debe adquirir por separado)Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice    
Reactivo TRIzol LSLisis en reactivo TRIzol, reactivo de un paso 

ARNm

Kit Dynabeads mRNA DIRECTLisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos   
Microkit Dynabeads mRNA DIRECTLisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos   
Resources
  • Protocol Videos—Videos to help you isolate nucleic acids using a variety of techniques.
  • DNA & RNA Selection Guide—Find the right purification products.
  • Videos—View our library of DNA & RNA purification and analysis videos.
  • Application Notes—Explore our application notes from scientists sharing data for isolation products

¿Qué kit de extracción de ARN de muestra de sangre es adecuado para usted?

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 Optimizado para muestras líquidasKit especializado agota eritrocitos no nucleadosFormato de placas de filtración con 96 columnas, para necesidades HTPHTP optimizado para la purificación de muestras de sangre estabilizadasFormato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN)Alta producción de ARN directamente de sangre completa, sin necesidad de aislar leucocitos
 TRIzol LS Kit de sangre de ARN total PureLink Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit MagMAX para aislamiento de ARN de tubos de sangre estabilizados Aislamiento de ARN total MagMAX mirVana Kit de sangre RiboPure
El más vendido     
Reactivos de estabilización compatibles EDTA, heparina, citrato, RNAlaterEDTA, heparina, citratoEDTA, heparina, citratoTubos Tempus o PaxGeneEDTA o citratoEDTA, heparina, citrato, RNAlater
Incluye reactivo de estabilización     
RNAlater
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumnas de sílice rápidas y cómodas en formato de placasFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)
Tiempo de preparación1 hora20 minutos 12 tubos en 2 horas≥ 96 muestras en < 1 h30 minutos
Compatible con alto rendimiento   

Para obtener más información sobre cómo trabajar con sangre, consulte nuestros artículos técnicos:

Protocolos adicionales

Artículos de notas técnicas

La purificación de ARN de células cultivadas tradicionalmente ha sido un procedimiento altamente repetitivo, que requiere mucho tiempo y trabajo, y que a menudo implica el uso de productos químicos orgánicos tóxicos. Los productos desarrollados por nuestros expertos en ARN permiten aislar ARN de máximo rendimiento, pureza e integridad utilizando diversas tecnologías (extracción orgánica, columnas de fibra de vidrio, gránulos magnéticos y combinaciones de estas tecnologías).

También puede analizar lisados de células cultivadas sin aislar primero el ARN. En un tiempo significativamente menor, obtendrá resultados de qPCR equivalentes a los de ARN purificado o, en algunos casos, mejores. Los productos Invitrogen como, por ejemplo, la línea de productos Cells-to-CT y Single Cell-to-CT, ofrecen enormes ventajas de rendimiento y manipulación.

¿Qué kit de aislamiento de ARN de células cultivadas es adecuado para usted?

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 ARN intacto y altamente puroFormato basado en columnas rápido y cómodo para ARN (> 200 nt)Formato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt)Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeñoSistema completo para células a qRT-PCR sin purificación de ARN
 Reactivo TRIzolMinikit de ARN PureLinkKit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de micromuestras de ARN PureLinkKit de aislamiento de miARN MirVanaKits Cells-to-CT
El más vendido  
Tiempo de preparación1 hora20 minutos20 minutos20 minutos30 minutos< 10 minutos
Método de lisis celularExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Lisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadLisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadLisis de isotiocianato de guanidina sin toxicidadExtracción orgánica seguida de precipitación de alcoholLisis Cells-to-CT
Cantidad de material de partidaHasta 1 x 107 célulasDe 5 x 106 a 1 x 108 célulasDe 5 x 106 a 1 x 108 célulasHasta 5 x 105 células102-107 células cultivadas10-100 000 células
AplicaciónTodos los métodos de expresión de ARNqRT-PCR, NGSqRT-PCR, NGSqRT-PCR, NGSAnálisis de micro ARNqRT-PCR

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ARN de muestras de FFPE es adecuado para usted?

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 Aislamiento de bajo rendimiento de ARN y ADN de la misma sección de FFPEAislamiento ampliable de ARN y ADN de la misma sección de FFPE
  Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll para FFPE Kit MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra
Tiempo de preparación4,5 horas (tiempo total para 16 muestras)
2,5 horas de tiempo de manipulación
4 horas (tiempo total para 96 preparaciones)
1 hora de tiempo de manipulación
Producto final extraídoARN total, microARN y ADNgARN total, microARN y ADNg
Método de aislamientopurificación de columnaspurificación de gránulos magnéticos
Requiere desparafinación
Compatible con automatización (posdesparafinización) 
(guiones para KF Flex y Duo Prime)
Intervalo de muestras de FFPE compatibleSecciones de hasta 4 x 20 micras
(tejido de 300 mm2)
Secciones de hasta 2 x 20 micras
(tejido de 300 mm2)
Volumen de muestra~ 50 µl de ADN purificado
~ 50 µl de ARN purificado
~ 50 µl de ADN purificado
~ 50 µl de ARN purificado
Compatible con paneles de ADN Ion AmpliSeq (p. ej., Cancer Hotspot Panel v2)
Compatible con paneles de ARN Ion AmpliSeq (p. ej., RNA cancer y RNA fusion)

¿Por qué el aislamiento de ARN de FFPE supone un desafío?

La recuperación de ARN de calidad de muestras de FFPE puede ser bastante difícil. El proceso de fijación provoca un enlace cruzado entre los ácidos nucleicos y las proteínas, y modifica de forma covalente el ARN mediante la adición de grupos monometílicos a las bases. Como resultado, las moléculas se vuelven rígidas y susceptibles al cizallamiento mecánico, y los enlaces cruzados pueden poner en peligro el uso del ARN como sustrato para la transcripción inversa. Por tanto, a fin de utilizar tejidos de FFPE como origen para el análisis de la expresión génica, se requiere un método fiable para la extracción de ARN de la matriz entrecruzada.

¿Cómo puede aumentar sus posibilidades de éxito con FFPE?

Existen una serie de factores que pueden afectar a la calidad y al rendimiento generales del ARN aislado de tejidos de FFPE. A continuación se presentan recomendaciones para abordar varios factores clave:

  1. Obtención de tejidos y preparación de muestras de tejidos en fases anteriores: si es posible, los tejidos se deben fijar en el plazo de una hora después de la resección quirúrgica. Se puede producir una gran degradación del ARN antes de completar el proceso de fijación. El tiempo de fijación óptimo es de entre 12 y 24 horas, utilizando formalina tamponada neutra o paraformaldehído. Los tejidos fijados se deben deshidratar completamente antes del proceso de inclusión.
  2. Almacenamiento de bloques: el almacenamiento de bloques sin caras cortadas, cuando sea posible, previene daños continuos por exposición al oxígeno atmosférico, al agua y a otros factores ambientales, tales como la luz y la infestación (hongos, insectos, etc.).
  3. Tipo, tamaño y cantidad de tejido que se va a utilizar para el aislamiento de ARN: el grosor de tejido recomendado es de 10-20 µm. El número de secciones utilizadas se determina por el tipo de tejido (que afecta a la densidad celular) y el área de superficie (tamaño recomendado: 50-300 mm2). El exceso de material de partida puede causar la obstrucción del filtro, lo que da como resultado una baja producción.
  4. Cantidad excesiva de parafina utilizada para la inclusión de tejidos: cuando sea posible, se debe eliminar el exceso de parafina antes de iniciar el protocolo de purificación. Para los métodos de purificación basados en xileno, deberían ser suficientes dos tratamientos de xileno a temperatura ambiente para una desparafinización completa. Si se desea, se puede realizar un tratamiento más riguroso de 37-55 °C durante 30 minutos. Después de la desparafinización del xileno, es crucial que se retire completamente el etanol al 100 % y que los sedimentos estén secos después de los dos lavados de etanol al 100 %. El método de gránulos magnéticos emplea novedosas sustancias químicas para tratar la parafina que limita la entrada a secciones de 20 µm.

Los kits MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra están diseñados para un aislamiento rápido, eficiente y automatizado del ARN total y el ADN de muestras de FFPE utilizando partículas magnéticas Invitrogen MagMAX. Los kits Invitrogen MagMAX FFPE NA ofrecen flujos de trabajo más rápidos y utilizan reactivos menos tóxicos, sin sacrificar la calidad. Estos kits ayudan a ofrecer una producción y una pureza de ácidos nucleicos comparables a las del mejor sistema basado en filtros RecoverAll de su clase. Los kits MagMAX FFPE NA superan el rendimiento de productos con protocolos similares y logran producciones de ARN y ADN comparables a las de protocolos más largos, más peligrosos y de menor rendimiento.

El procedimiento del kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales RecoverAll requiere unos 45 minutos de manipulación y se puede completar fácilmente en menos de un día cuando se aísla ARN. Las muestras FFPE se desparafinan con una serie de lavados de etanol y xileno. A continuación, se las somete a una rigurosa digestión de proteasas con un tiempo de incubación adaptado a la recuperación de ARN o ADN. Los ácidos nucleicos se purifican con un método rápido de filtrado con vidrio que incluye un tratamiento de nucleasa en el filtro y se eluyen en agua o en el tampón bajo en sal proporcionado.

Recursos técnicos

Artículos de notas técnicas

Consejos desde la mesa de trabajo

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Nota de aplicación

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¿Qué kit de aislamiento de ARN vegetal es adecuado para usted?

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 Excelente para muestras complicadas (semillas y tejidos de coníferas)Rápido y fácil de utilizarRecuperación eficaz de ARN pequeño y microARNRápido y totalmente automático
  Reactivo de ARN de plantas Minikit de ARN PureLink Kit de aislamiento de miARN mirVana Kit de aislamiento de ARN total MagMAX-96
El más vendido   
Tipos de ARN aisladosolo moléculas de ARN grandessolo moléculas de ARN grandesMoléculas de ARN grandes y pequeñas solo moléculas de ARN grandes
Tiempo de preparación60 minutos<20 minutos30 minutos< 45 minutos
Cantidad de material de partidaHasta 1 g<250 mgDe 0,5 a 250 mgHasta 10 mg
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos
Compatible con alto rendimiento   
Productos compatibles Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes
Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes
Medio de aislamiento de ARN vegetal Ambion
Elimina los contaminantes de plantas comunes

Eliminar polisacáridos

Uno de los principales problemas relacionados con el aislamiento de ARN vegetal es la presencia de biomoléculas problemáticas, como compuestos polifenólicos y polisacáridos. El medio a aislamiento de ARN vegetal Ambion minimiza muchos de estos contaminantes con la adición de polivinilpirrolidona, un polímero de alto peso molecular que se une a polifenolicos y polisacáridos, y con un paso de centrifugación previo a la extracción.

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Minimiza la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ARN de tejidos es adecuado para usted?

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 Criterio de referencia para ARN intacto y altamente puroMétodo sencillo, fiable y rápidoFormato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)Método basado en columnas rápido y cómodo de una entrada de muestras limitada (ARN > 200 nt)Método rápido y cómodo para especies de ARN pequeñoTRIzol de máxima pureza + purificación de columnas, no se requiere precipitaciónFormato HTP, capaz de recuperar ARN de todos los tamaños (incluidos microARN)
  Reactivo TRIzolMinikit de ARN PureLinkKit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de micromuestras de ARN PureLinkKit de aislamiento de miARN mirVanaSistema de purificación de ARN TRIZol PlusAislamiento de ARN total MagMAX mirVana
El más vendido      
Método de aislamiento Extracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtraciónColumnas de sílice rápidas y cómodasExtracción orgánica combinada con prácticas columnas de síliceMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)Formato ampliable y flexible con gránulos magnéticos
Tiempo de preparación 1 hora20 minutos20 minutos20 minutos30 minutos1 hora< 1 hora
Cantidad de material de partidaHasta 100 mgDe 10 mg a 100 mgDe 10 células a 10 mgHasta 10 mgHasta tejido de 250 mgHasta 100 mgHasta 50 mg
Compatible con alto rendimiento     
Tamaño de preparación100 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones

Producción de ARN de tejidos animales

El contenido de ARN puede variar ampliamente entre tejidos, tipos de células, estados fisiológicos, etc. En esta tabla se proporcionan directrices generales para estimar las producciones de ARN de una variedad de células y tejidos.

Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos

Tabla 1. Producción de ARN total habitual de 1 mg de varios tejidos.

Preservar y estabilizar su ARN

La solución RNAlater se usa ampliamente para la preservación del ARN en tejidos, órganos, células de animales intactos y bacterias. Elimina la necesidad de procesar inmediatamente las muestras para el aislamiento de ARN o de congelarlas en nitrógeno líquido para su posterior procesamiento.

Recursos técnicos

¿Qué kit de extracción de ADN de levadura es adecuado para usted?

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 Rápido y totalmente automáticoRápido y fácil de utilizarDiseñado para paredes celulares rígidas de levadura manteniendo los perfiles de expresiónFormato de placas de filtración basado en columnas rápido y cómodo para 96 muestras (ARN > 200 nt)
 Kit Platinum Taq MagMAX de aislamiento de ARN total para micromatrices Minikit de ARN PureLinkKit RiboPure-Yeast Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96
El más vendido   
Incluye gránulos especializados para lisis celularNoNoGránulos de circónNo
Método de aislamientoFormato ampliable y flexible para la máxima pureza; incluye extracción orgánica y gránulos magnéticosColumna de sílice rápida y cómodaMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánicaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillos
Tiempo de preparación< 1 hora20 minutos90 minutos (incluye tratamiento de ADNasa)20 minutos
Cantidad de material de partida Hasta 5 x 106 célulasHasta 5 x 108 célulasHasta 3 x 108 células1,8 ml de células de levadura frescas en fase logarítmica (OD660=0,6-0,8)
Compatible con alto rendimiento   
Tamaño del kit96 preparaciones50 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones

Recursos técnicos

A diferencia de las células eucariotas, la levadura y muchas cepas bacterianas están protegidas por paredes celulares que pueden ser difíciles de alterar. Como primer paso, se requiere una lisis celular efectiva (normalmente mediante interrupción mecánica o pretratamiento enzimático) antes de cualquier procedimiento de aislamiento de ARN.

Una gama de productos desarrollados por los expertos en ARN de Ambion le ayudará a aislar una elevada producción de ARN puro e intacto de bacterias y levadura.

¿Qué kit de aislamiento de ARN bacteriano es adecuado para usted?

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 Sin procedimientos de lisisRápido y fácil, 20 minFormato de placas de filtración basado en columna de sílice rápida y cómodaHTP, 45 minIdeal para bacterias + gram difíciles de lisar
 Kit de aislamiento de ARN bacteriano TRIzol Max con reactivo de mejora bacteriana TRIZol & Max Minikit de ARN PureLink Kit de purificación de ARN total PureLink Pro 96Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAX Kit RiboPure-Bacteria
El más vendido    
Incluye gránulos especializados para lisis celularNoNoNoGránulos de circónGránulos de circón
Método de aislamientoExtracción orgánica de gran pureza (requiere precipitación de alcohol)Columna de sílice rápida y cómodaColumna de sílice rápida y cómoda en formato de placas de filtración de 96 pocillosFormato ampliable y flexible con gránulos magnéticosMáxima pureza y comodidad; incluye columna de sílice y extracción orgánica (no es necesaria la precipitación)
Tiempo de preparación1 hora20 minutos20 minutos45 minutos1 hora
Cantidad de material de partidaHasta 1 x 108 célulasHasta 1 x 109 célulasHasta 1 x 109 célulasHasta 0,3 g de muestras sólidas o 175 µl de muestras líquidasHasta 109 células
Compatible con alto rendimiento   
Tamaño del kit100 preparaciones50 preparaciones96 preparaciones100 preparaciones50 preparaciones

Recursos técnicos

El análisis vírico de muestras biológicas (animales, insectos, plantas, hongos, bacterias) y ambientales (agua, aire, alimentos) se realiza cada vez más utilizando estrategias de análisis molecular que requieren ARN o ADN vírico de las muestras que se están analizando. La purificación de ARN vírico plantea desafíos únicos para la obtención de una buena sensibilidad de recuperación y detección. Los expertos en ARN de Ambion han desarrollado productos de purificación de ARN optimizados para proporcionar la máxima producción, pureza e integridad de ARN vírico de una amplia gama de tipos de muestras en varias opciones de formato.

«El ARN vírico altamente concentrado del minikit de ADN/ARN vírico PureLink proporciona una herramienta para un análisis posterior más sensible y delicado de genomas víricos»
Dr. Dongning Wang, en el laboratorio de Feng Gao, MD, Duke Human Vaccine Institute, Universidad de Duke

Especificaciones del producto

 Aplicación posterior más adecuada
ProductoFormatoRT-PCR en tiempo realAnálisis de micromatricesSecuenciaciónNorthern blotClonación

ARN total

Minikit de ADN/ARN vírico PureLinkLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice   
Kit RNAqueousLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice  
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX AI⁄NDLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas   
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 AI⁄NDLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   

ADN/ARN

Kit de purificación de ADN/ARN vírico PureLink Pro 96Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización    
Kit de aislamiento de ácidos nucleicos totales MagMAXLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización   
AN vírico Dynabeads SILANELisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos, compatible con automatización     
Kit de virus iPrep PureLinkLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, compatible con automatización    
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAXLisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas    
Kit de aislamiento de ARN vírico MagMAX-96 (5 x 96 reacciones)Lisis basada en sal caotrópica, partículas magnéticas, procesamiento de 96 pocillos, compatible con automatización    

Micro ARN

Kit de aislamiento de miARN mirVanaLisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice    
Kit de aislamiento mirVana miRNA (sin fenol - se debe adquirir por separado)Lisis basada en sal caotrópica, filtro de sílice    
Reactivo TRIzol LSLisis en reactivo TRIzol, reactivo de un paso 

ARNm

Kit Dynabeads mRNA DIRECTLisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos   
Microkit Dynabeads mRNA DIRECTLisis basada en sal caotrópica, gránulos magnéticos