美国国家癌症研究所—治疗选择分子分析 (MATCH) 试验使用Ion Torrent靶向测序技术对无数肿瘤样本进行测序

芝加哥-2015美国临床肿瘤学会(ASCO) 年会-(2015年6月1日)讯— 一项新的国家肿瘤学临床试验将招募多达1,000名美国患者,该试验将使用Thermo Fisher Scientific的靶向二代测序 (NGS) 技术获取基因测序信息。今日,美国联邦药品管理局 (FDA) 在美国临床肿瘤学会 (ASCO) 年会上宣布,美国国家癌症研究所-治疗选择分子分析 (NCI-MATCH) 项目正被引入与ECOG-ACRIN合作,并且已经获得实验性新药 (IND) 授权。

NCI-MATCH试验将采用遍布全国的2,400多个区域性设施,对NCI支持的国家临床试验网络开放。为了支持该研究,马里兰州弗里德里克市 NCI分子鉴定实验室、休斯顿德克萨斯大学安德森癌症中心、波士顿马萨诸塞综合医院和康涅狄格州纽黑文市耶鲁大学将对多达3,000个肿瘤样本进行测序。这些地方都将采用使用Thermo Fisher的Oncomine试剂和Ion Torrent测序系统开发的标准NGS操作流程。

这种靶向测序方法只需极少的样本量(DNA和RNA)且在Ion Torrent上的周转时间更快,可为大量不同类型肿瘤样本,包括少量活检和细针抽吸活检,提供精确可靠的测序分析。

“这种规模和类型的临床试验必须依赖于技术,这种技术应该能够通过对福尔马林固定石蜡包埋的活检标本或细针吸取标本中少量DNA和cDNA进行一次检验即可精密检测大范围稀有基因改变,”ECOG-ACRIN实验室的领导、安德森癌症中心病理学和实验室医学主管Stanley R. Hamilton博士说道。“能够满足这些需求,是我们在完成评估程序后选择该平台的主要决定因素。这些相同的检测需求将有助于实现精准医学。”

靶向测序检测包括使用Oncomine Knowledgebase选出的143个基因,Oncomine Knowledgebase是世界上最大的肿瘤学数据库,也是制药公司、合约研究机构 (CROs) 和转化研究实验室长期信任的资源。独特的Panel设计实现了同时对大量基因变化进行测序,包括单核苷酸变异 (SNV) 、小插入和缺失 (indels) 、拷贝数改变和染色体异位。

根据这些测序结果,研究领导可以将项目参与者按照与他们肿瘤相关的基因改变类型分配到不同的实验组中,而不是按照他们的癌症类型进行分配。该试验将包括约20种或更多来自多个制药合作公司的药物。类似于NCI-MATCH的多组研究设计允许研究者布下更大的网,有助于将相对罕见的肿瘤突变考虑进来,并促进有前景的新疗法的发展。

“这种规模的研究是无法使用一个样品、一个标记物的传统检测方法完成的,”Thermo Fisher执行副总裁、生命科学解决方案业务部门总裁Mark Stevenson说道。“这是第一个将本着奥巴马总统精准医疗计划的精神展开的国家肿瘤学试验,这将可能转变癌症治疗的未来。”

Oncomine Comprehensive Assay和Ion PGM仅用于研究用途,不可用于诊断操作。