不仅可进行自动化蛋白质组学样品制备,还可大大提高可靠性和生产力

打破蛋白质组学样品制备的成本限制和挑战。Thermo Scientific AccelerOme 自动化样品制备平台不仅仅是一个仪器,它还是一个经过优化的生态系统,可提供快速、准确和可重现的结果。凭借集成的实验设计软件、硬件以及商业试剂和试剂盒,您不仅可进行样品制备,还可以扩展发现,实现新的突破。

样品处理可靠性极佳

采用预置的经验证的样品制备方法和试剂盒,可确保所有技能水平的用户均能实现无错误样品处理,从而取得较高的实验可靠性。经验证的试剂盒内装有即用型缓冲液和试剂,并采用托盘进行便利包装,以便于放置在 AccelerOme 平台上,从而可实现无缝样品制备,大大减少手动操作时间。样品制备试剂盒可确保在实验室内具有可重现性,并极大程度地提高方法转移的可靠性。

仪器硬件基于久经考验的液体处理形式构建,可实现可重现的样品处理,以及优化的在线 μSPE 样品纯化(用于去除清洁剂和提高肽回收率),并通过精确的紫外分光光度分析进行质量控制,从而可在 LC-MS 分析之前测定 肽浓度。

方法灵活出色

凭借集成的工作流程和仪器功能,致力于在蛋白质组学实验室中广泛应用。从发现分析到高通量定量生物学,预置方法和试剂盒同时支持免标记定量(LFQ)和串联质谱标签(TMT)多通路工作流程,小规模和大规模研究均适用。经验证的 TMT 多通路试剂盒可用于 Thermo Scientific TMT11plex 和 TMTpro 16plex 标记试剂,从而可提供更高的通量选择,并大大提高效率。每个循环可自动制备多达 36 个免标记样品,33 个 TMT11plex 同位素标记试剂样品以及 32 个 TMTpro 16plex 标记试剂样品。TMT 多通路技术可用于蛋白质含量范围为 10 至 100 μg 的细胞、组织、生物流体以及纯化蛋白质。

经验证的试剂盒可大大提高可重现性

试剂由旁通管路进入,与缓冲液混合,然后借助专为 AccelerOme 样品制备平台设计的预先制备的 Thermo Scientific 试剂盒上样至板中。化学方法得以优化,从而可进一步降低样品超声处理的需求,并进一步缩短孵育时间,同时大大提高酶切和标记效率。LFQ 和 TMT 多通路工作流程可使用预先制备的试剂盒,确保在 当下、将来和整个研究期间都能成功进行可重现的样品制备。

用户体验超群

借助 Experiment Designer 软件,可简化整个实验流程。集成软件通过使用简单易学的分步工作流程来创建样品名称、分配 LFQ 和 TMT 多通路实验的研究因素和数值(包括添加 TMT 样品随机化情况)以及桥接(如果需要),简化了实验计划。Experiment Designer 软件可提供图形显示,以直观呈现实验,并可将样品命名规则链接到下游处理,包括 Thermo Scientific Orbitrap 质谱仪上的数据采集队列,以及在 Thermo Scientific Proteome Discoverer 软件中的数据处理研究设计。

此外,Experiment Designer 软件还具有可确定实验规模的统计功效的功能,并可提供一些建议,帮助达到所要求的置信区间。

视频

革新样品制备过程,实现快速、准确、高可重现性的样品制备

AccelerOme 自动化样品制备平台介绍

使用 AccelerOme 平台和 Experiment Designer 软件确保实验成功

Daniel Lopez-Ferrer 说明 AccelerOme 平台的优势。

以更少的接触点,更快地获得结果

AccelerOme 平台采用 Home-brew 试剂或替代自动化实验方案(如下所示),相比手动方案,可省去制备 36 个免标记样品的大部分手动操作步骤。AccelerOme 平台可减少出于混合和移取试剂的需要而不时前往实验室的次数,从而减少可能因此造成的随机错误。平台自动化和优化的化学方法加速了样品制备过程,同时大大提高了 LC-MS 分析的样品质量和可重现性,从而提高了生产率。

图 1

Time comparison- LFQ

在进行 LC-MS 分析之前,使用 TMT 标记试剂制备33份样品需进行额外的步骤来创建样品桥接器,进行标记、混合并提供等份试液。AccelerOme 平台简化了样品制备过程,接触点更少,可在更短的时间内提供高品质样品。

Time comparison - TMT

通过提高自动化水平并优化试剂和缓冲液,大大提高生产率,在节省时间的同时提供可靠的结果。

ASMS 早餐研讨会演讲

蛋白质组学样品自动制备的全新体验

  • 通过标准化和样品制备自动化推广蛋白质组学,演讲人:Daniel Lopez Ferrer
  • 通过自动化样品制备推动基于质谱分析的蛋白组学研究,演讲人:Maowei Dou
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蛋白质组学凭借高灵敏度和精确的质谱分析,已从一种定性技术发展为一种连续的定性和定量技术,用以揭示生物学新洞见,广泛应用于生物学、生物化学、生物标记物发现和精准医学等领域。

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获得新的工作流程,这种流程可产生定量的、可重现的、标准化和可扩展的临床相关 结果。随着质谱分析技术的进步,转化蛋白质组学方面的能力突飞猛进,为其他组学学科(如基因组学、转录组学和代谢组学/脂质组学)提供了补充。

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