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安装

请按照相应GeneMapper软件版本的卸载说明进行操作。在尝试重新安装前,请确认您已经以管理员权限(Administrator)在本机登录,杀毒软件已经关闭或在安装过程中暂停使用,并且已经安装了TCP/IP协议。

在卸载前,请确保您有GeneMapper软件CD/DVD以及重新安装的注册码。然后,请按照您所安装GeneMapper软件版本的相应卸载说明进行操作。在尝试重新安装前,请确认您已经以管理员权限(Administrator)在本机登录,杀毒软件已经关闭或在安装过程中暂停使用,并且已经安装了TCP/IP协议。

如果您收到关于用户权限不足无法启动低级别驱动的错误信息,很有可能是您并没有以管理员权限(Administrator)在本机登录。请重新启动计算机,将域模式更改为本机模式,然后以管理员身份登录。

右键单击计算机(Computer),并选择属性(Properties)。在系统(System)部分中查看系统类型(System Type),确认是否已安装了32位或64位的Windows 7专业版操作系统。记录下系统信息,在安装过程中会用到它们。

安装必要的驱动程序:

  1. 打开浏览器,并跳转到https://www.ilok.com/#!home.
  2. 在页面的右侧,可以看到“免费下载许可证支持”链接。如果您的计算机安装了32位的Windows 7专业版,则选择中间选项(“Windows 32位XP,Vista,7,8”)。如果您的计算机安装了64位的Windows 7专业版,则选择第三个选项(“Windows 64位XP,Vista,7,8”)。

注意:如果浏览器让您选择打开(Run)或者保存(Save),请选择保存文件。对于Internet Explorer浏览器,您可以选择文件的保存位置。对于Mozilla Firefox和 Google Chrome浏览器,文件默认保存位置是Downloads文件夹。3.运行安装程序。安装完成后,重新启动计算机。

现在,您可以安装GeneMapper Software 5试用版了。

右键单击计算机(Computer),并选择属性(Properties)。在系统(System)部分中查看系统类型(System Type),确认是否已安装了32位或64位的Windows 7专业版操作系统。记录下系统信息,在安装过程中会用到它们。

安装必要的驱动程序:

  1. 打开浏览器,并跳转到https://www.ilok.com/#!home。
  2. 在页面的右侧,可以看到“免费下载许可证支持”链接。如果您的计算机安装了32位的Windows 7专业版,则选择中间选项(“Windows 32位XP,Vista,7,8”)。如果您的计算机安装了64位的Windows 7专业版,则选择第三个选项(“Windows 64位XP,Vista,7,8”)。

注意:如果浏览器让您选择打开(Run)或者保存(Save),请选择保存文件。对于Internet Explorer浏览器,您可以选择文件的保存位置。对于Mozilla Firefox和 Google Chrome浏览器,文件默认保存位置是Downloads文件夹。

   3. 运行安装程序。安装完成后,重新启动计算机。

现在,您可以安装GeneMapper Software 5试用版了。

请下载该PDF文件(GeneMapper v.4.0卸载 - 客户端安装),并按照其中所列步骤从独立计算机上卸载GeneMapper Software v.4.0。

请下载该PDF文件(GeneMapper v.4.0卸载–完整安装),并按照其中所列步骤从独立计算机上卸载GeneMapper Software v.4.0。

请下载该PDF文件(GeneMapper v.4.1卸载 - 客户端安装),并按照其中的指示卸载GeneMapper Software v.4.1。

请下载该PDF文件(GeneMapper v.4.1卸载步骤说明–完整安装),并按照其中的指示卸载GeneMapper Software v.4.1。

请下载该PDF文件(GeneMapper 5卸载 - 客户端安装),并按照其中的指示卸载GeneMapper Software 5。

请下载该PDF文件(GeneMapper 5卸载– 完整安装),并按照其中的指示卸载GeneMapper Software 5。

备份数据

备份数据是非常有用的,可以防止数据丢失,可以清理Oracle数据库以防止空间用尽,也可以发送数据到技术支持部门进行故障排除。

在GeneMapper软件中,有3处需要备份数据:

  1. Panel Manage - 包含Panel、Marker和Bin的信息。
  2. GeneMapper Manager – 包含Project(项目)自身的相关信息——项目、分析方法、分子量内标定义、表格设置、图谱设置、矩阵(仅限ABI PRISM 310 Genetic Analyzer)、簇图谱设置、SNP组和报告设置。
  3. 数据文件 - Project(项目)中使用的样本数据(.fsa文件)。

注意:旧版本的GeneMapper软件有存档功能,可直接备份整个数据库。然而,存档只能在同一个GeneMapper软件中重新导入。如果出现问题需要重新安装GeneMapper软件,则软件将被视为新软件,以前的存档无法导入。

按照下列步骤导出Panel Manager中的Kit、Panel、Marker和Bin组。

  1. 打开GeneMapper软件,进入Tools Panel Manager。
  1. 如要同时导出所有Kit(顶层文件夹)、Panel(子层文件夹)、Marker和Bin组,请在左侧Navigator(导航栏)中选中Panel Manager,然后点击File Export all Kits(文件 - 导出所有Kit)。



  2. 当显示出对话框后,设置希望保存文件的位置,并勾选Export all Kits(导出所有Kit)。只有第一个panel的名称会在文件名窗口中显示,但是所有文件都会被备份到所选位置。



  3. 保存文件时,每个kit都会保存1到2个文件。第一个文件名为 _Panels.txt,包含Panel和Maker信息。如果Panel有关联的Bin组,则会有第二个名为 _bins.txt的文件。

    如要备份单个Panel或Bin组,请点击希望备份的Panel和Maker所在的Kit(顶层文件夹)。然后,File(文件)菜单中的Export Panels(导出Panel)和Export Bin Sets(导出Bin组)选项会激活。

  4. 将文本文件保存到媒体存储(CD、DVD、网盘和U盘)。如果要重新安装GeneMapper软件或将信息导入另一个系统,可点击File Import Panels(文件 - 导入Panel)和 Import Bin Sets(导入Bin组),重新导入数据。

如要导出项目信息,请按照下列步骤操作:

  1. 进入Tools(工具)菜单,选择GeneMapper Manager。
  2. 点击包含希望备份或导出文件的选项卡。
  3. 选择希望导出的文件。选中后,点击窗口底部的Export(导出)。(项目可以成组选择,但是每个选中的项目都会出现相应的保存对话框。在所有其他选项卡中,文件都需要逐个导出。)
  4. 设置希望保存文件的位置,然后点击Export(导出)进行保存。
  5. 将文件保存到选择的媒体存储(CD、DVD、网盘和U盘)。如果要重新安装GeneMapper软件或将信息导入另一个系统,可进入GeneMapper Manager,选择希望导入的选项卡,然后点击Import(导入),导入文件。文件保存后,可删除旧文件或项目来释放或清空数据库空间。

创建GeneMapper项目时,样本文件并没有被导入GeneMapper软件,但样本文件的位置与项目相映射,编辑在项目中完成,原始数据仍被完好保留。这意味着备份项目并没有同时备份与项目关联的文件。这些文件需要单独备份,并且如果文件被删除或软件被卸载,这些文件需要与项目重新关联。

样本文件的位要么在ABI PRISM 310 Genetic Analyzer系统的Runs文件夹(D:/AppliedBio/310/Runs)中,要么由多毛细管平台数据采集软件中的Results Group(结果组)确定。如果不清楚样本文件的位置,可进入仪器设备的数据采集软件并转到Results Group部分(Unified Data Collection(统一数据采集)的左上角;对于3500数据采集软件,进入Library(库),并在Manage(管理)部分选择Results Group),打开Results Group,并查看样本文件文件夹位置。

将文件保存到选择的媒体存储(CD、DVD、网盘和U盘)。如果由于硬盘驱动器故障,需要将项目移动到新系统或重新安装GeneMapper软件,则可以将样本文件移动到新位置或新驱动器。当在GeneMapper软件中打开项目时,进入FileàAssociate Samples(文件 - 关联样本),浏览包含项目相关样本的文件夹。

关于GeneMapper文件、导出文件类型及每个文件包含数据的信息,请参见下表:

文件

导出文件
类型

文件包含数据

项目

.ser

样本文件列表,项目设置,项目更改

分析方法

.xml

分析设置和筛选信息

表格设置

.xml

样本和基因型表中的哪些列可见,字体和大小,以及排序方法

图谱设置

.xml

图谱显示默认值。样本图谱和基因型图谱中的表格外观、分子量表,标签和显示设置

簇图谱设置

.xml

簇图谱默认值。SNP表格,基因型簇图谱表,以及簇图谱的显示设置

矩阵

.mtx

用于ABI PRISM 310 Genetic Analyzer的矩阵文件。导出到数据采集软件中的矩阵文件夹

分子量标准

.xml

标准颜色和被调用峰值的峰值设置(bp)

SNP组

.xml

仅限SNPlex。基于提交的SNP库的信息

报告设置

.xml

个性化设置希望在分析报告中显示的信息

Panels

.txt

Kit、Panel、Marker信息(颜色、范围、名称等)

Bin组

.txt

与Panel关联的Bin,指定标记范围内的峰值位置

如要导入数据,需要先使用Panel Manager(Panel、Bin组),然后使用GeneMapper Manager(项目、分析方法等)。

  1. 打开GeneMapper软件,进入Tools Panel Manager(工具 - Panel Manager)。
  2. 如要导入Kit(顶级文件夹)、Panel(子层文件夹)和Maker,请在左侧的Navigator(导航)栏中选择Panel Manager。
  3. 点击File Import Panels(文件 - 导入Panel)。




  4. 选择希望导入的Panel,并点击Import(导入)。注意:通过这种方法只能每次导入一个Panel。


    这将导入您的Kit、Panel和Maker。导入后,点击包含希望与Bin Set关联的Panel和Maker的Kit(顶级文件夹)。File(文件)菜单中的Import Bin Set(导入Bin组)选项将会激活。



  5. 点击文件→Import Bin Set(导入Bin组),选择希望导入的Bin组,并点击Import(导入)。
  6. 导入Panel和Bin后,点击Apply(应用),然后点击OK(确定)。如果没有先点击Apply(应用),可能会导致更改被撤销。
  1. 进入Tools(工具)菜单并选择GeneMapper Manager。
  1. 点击包含希望导入文件的选项卡。



  2. 点击窗口底部的Import(导入),并选择要导入的文件。注意:可同时选择多个项目一次性导入,但是其他选项卡每次只能导入一个。




    导入后,新文件将会出现在列表中。完成后,在右下角点击Done(完成)。