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以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
使用不正确的抗生素来筛选转化子 | 在含有100 μg/mL氨苄青霉素的LB琼脂糖平板上筛选转化子。 |
未使用蛋白酶K处理LR重组反应体系 | 在转化前使用蛋白酶K处理LR重组反应体系。 |
在LR反应中使用了过多的入门克隆DNA | 在LR反应中使用50-150 ng入门克隆DNA。 |
在LR反应中使用不当的入门克隆:DEST载体比例 | 入门克隆:DEST载体的摩尔比应为1:1。 |
对插入片段长于5 kb的LR重组反应体系只孵育1小时 | 对插入片段长度超过5 kb的片段,我们建议将LR反应体系孵育过夜。注意:过夜孵育也能提升小插入片段的克隆数目。 |
腺病毒Destination载体DNA发生了断裂 | 务必小心操作腺病毒Destination载体。不要进行过多可能造成DNA断裂的操作(如涡旋或剧烈吸打溶液)。 |
没有用推荐数量的LR Clonase II酶混合物,或LR Clonase II酶混合物已失活 | -请确保将LR Clonase II酶混合物保存于–20°C。 -请勿将LR Clonase II酶混合物冻融超过10次。 -请使用推荐用量的LR Clonase II酶混合物(参见使用手册第14页)。 -请尝试另一管分装的LR Clonase II酶混合物产品。 |
转化时使用的LR反应体系不足 | 使用适当的大肠杆菌感受态菌株来转化2-3 μL LR反应体系。使用转化效率 >1 x 108 cfu/μg的大肠杆菌细胞。 |
使用不足量的转化混合物进行铺板 | 增加大肠杆菌的铺板用量。 |
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
将LR反应体系转化至包含F'游离体和ccdA基因的大肠杆菌菌株中 | 使用不含F'游离体的大肠杆菌菌株进行转化(如TOP10、DH5α-T1R)。 |
(完全或部分)删除腺病毒Destination载体中的ccdB基因 | 腺病毒Destination载体以溶液形式提供,可直接应用于LR反应。不过,如果您希望扩增这些载体,我们推荐您使用One Shot ccdB Survival™ 2 T1R化学感受态细胞(货号A10460)。 -在含有50–100 μg/mL氨苄青霉素和15–30 μg/mL氯霉素的培养基中筛选转化子,以维持载体的完整性。 -从一个或多个克隆制备质粒DNA,并在使用前验证载体的完整性。 |
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
低转染效率: -腺病毒Destination载体发生了断裂 -不彻底的Pac I消化效果或消化后的DNA含有苯酚、乙醇或盐类 -使用了不健康的293A细胞;细胞活力较低 -293A在转染前一天培养密度过低 -质粒DNA与转染试剂之间的比例错误 | -小心操作腺病毒Destination载体。不要进行过多可能造成DNA断裂的操作(如涡旋或剧烈吸打溶液)。 -重新进行Pac I消化处理。请确保使用未含苯酚,乙醇或盐类的纯净DNA。 -使用健康的293A细胞;不要让细胞过度生长。 -转染时刻细胞(密度)应处于90-95%的融汇度。 -将质粒DNA(μg为单位):Lipofectamine 2000(μL为单位)的比例设置为1:2到1:3。如果您正在使用另一款转染试剂,请按照生产商的推荐用法进行条件优化。 |
病毒上清液稀释过度 | 通过CsCl离心或任意可选方法对病毒进行浓缩处理。 |
病毒上清液经多次冻融 | 请勿将病毒上清液冻融超过10次。 |
目的基因过长 | 病毒滴度通常随着插入片段长度的增加而降低;不推荐使用超过6 kb(在pAd/CMV/V5-DEST™中)和7.5 kb(在pAd/PL-DEST™中)的插入片段。 |
目的基因对细胞有毒性 | 不推荐构建包含激活型致癌基因或潜在有害基因的载体。 |
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
病毒母液未正确储存。 | 分装并将母液保存于–80°C。请勿将其冻融超过10次。 |
使用错误的细胞系进行病毒滴度测定 | 请按照 手册第23页中所讨论的属性选择细胞系,或直接使用293A细胞系。 |
未正确制备琼脂糖覆层 | 请确保向细胞加入的琼脂糖不会过热;过热的琼脂糖将杀死细胞。 |
病毒储存液的滴度过低或过高 | 以更宽广的续列稀释度(以10倍为单位,如10-2至10-8)来测定腺病毒的滴度。 |
这可能由病毒上清液的稀释度不足所致。我们推荐您使用从10-4至10-9续列稀释度来检测腺病毒滴度。
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
病毒母液未正确储存。 | 分装并将母液保存于–80°C。请勿将其冻融超过10次。 |
目的基因中含有一个Pac I位点 | 进行突变操作,来改变或去除PacI位点。 |
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
低转导效率: -哺乳动物细胞不够健康 -使用了非分裂型细胞 | -请确保您用的细胞在转导前保持健康状态。 -以更高的MOI比例值向您的细胞中转导腺病毒。 |
MOI值过低 | 以更高的MOI比例向您用的细胞中转导腺病毒。 |
病毒滴度过低 | 使用手册第20页的步骤扩增腺病毒母液。 |
腺病毒母液受RCA(具有复制能力的腺病毒)污染 | -筛查RCA污染。 -制备全新的腺病毒母液或噬菌斑纯化以分离重组的腺病毒。 |
转导操作后过早收获细胞 | 请至少在转导24小时之后收获细胞。 |
转导操作后过晚收获细胞 | 对于分裂活跃的细胞,请在转导5天内检测重组蛋白表达的最高水平。 |
目的基因对细胞有毒性 | 不推荐构建包含激活型致癌基因或潜在有害基因的载体。 |
以下为一些可能的原因与解决方案:
原因 | 解决方案 |
使用了过量的原始病毒母液 | -减少用于转导的原始病毒母液,或对原病毒母液进行稀释。 -Amplify the adenoviral stock. -Concentrate the crude viral stock. |
野生型RCA(具有复制能力的腺病毒)污染 | 筛查RCA污染。噬菌斑纯化以分离重组的腺病毒,或制备全新的腺病毒母液。 |
目的基因对细胞有毒性 | 不推荐构建包含激活型致癌基因或潜在有害基因的载体。 |
仅限研究用途,不可用于诊断操作。