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암 유전체학 전문기업으로서 라이프 테크놀로지스는 약물 탐색 과정에서 대량의 데이터와 지식을 성공적으로 생성하고 있습니다. 라이프 테크놀로지스는 세부적인 부분까지 각별한 관심을 갖고 최신 암 유전체학 데이터를 신속하게 수집, 분석, 통합할 수 있도록 다각적인 노력을 펼치고 있습니다. 라이프 테크놀로지스의 능동적인 데이터 수집 과정에서는 연구 저작자와의 직접적인 서신 교환이 가능하여 사용 가능한 모든 샘플 정보를 수집할 수 있으며, 흔히 이러한 정보는 기존의 논문에 발표된 정보를 넘어서는 수준의 것입니다.

표적 등 다양한 정보 검색

정확한 정보 추출

유전자 발현 표시, Cluster, 유전자 세트 모듈을 계산하는 강력한 분석 기능 세트에 내장된 OncomineTM 데이터 결과 자료집 전체에서 동료 연구자가 검토한 확실한 분석 방법을 일관적으로 적용하여 정확한 생물학적 정보를 자동으로 추출합니다.

학술적 암 연구용 솔루션

Oncomine™ Platform은 미시간대학교의 의사, 과학자 및 소프트웨어 엔지니어가 고안한 제품입니다. Oncomine™ Research Edition은 학술 연구자들에게는 계속 무료로 제공됩니다. 추가로 개발된 상업용 솔루션은, 학술 버전으로 일반적으로 적절한 라이선스 수수료를 내야 사용할 수 있습니다.

간편한 솔루션

약물 탐색과 개발에 암 정보를 적용하는 새로운 방식을 개발하는 데 주력하고 있는 당사의 이행성 생물정보학 팀은 Compendia Biosciences의 기술과 계산 생물학 전문성을 활용해 당사 고객이 제기한 특정 과학적 문제를 해결하는 데 초점을 두고 있습니다.

상업적 암 연구를 위한 솔루션

상업용 Oncomine™ 버전은 암 연구자들의 약물 개발 및 임상 실습 역량을 강화하겠다는 비전을 갖고 개발되었습니다.

 

 

Comprehensive collection

라이프 테크놀로지스는 임상 데이터 품질 표준에 따라 The Compendia Ontology에서 구성한 게놈 데이터 정리 및 관리 원칙을 적용하고 있습니다. The Compendia Ontology는 일관적인 다음 단계 분석을 유도하는 Oncomine™ 데이터, 메타데이터 및 분석법의 특징을 분석한 광범위한 방식입니다.

Oncomine™ 버전이 사용하는 정보:

  • 데이터세트 700개 이상
  • 샘플 86,000개 이상
  • 샘플 정보 1,660,000개 이상
 

라이프 테크놀로지스의 맞춤 서비스 보고서에서 사용하는 정보:

  • 개인식별정보를 제외한 임상 샘플 35,000개
  • 세포주 모델 1,200개
  • NGS 엑솜(exome) 5,000개
  • 전사 표시 5,000개
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Oncomine™ resource library 

From practical applications to ground breaking research, users and potential users of the Oncomine Platform can access information to make their research more effective.

비디오 및 Webinar

Oncomine™ 데이터 기능 #1 - CCLE

August 2012 :: Matt Anstett가 암 세포주 백과사전(Cancer Cell Line Encyclopedia, CCLE)에 대해 설명합니다.  

Oncomine™ 데이터베이스에서 데이터를 찾고, 그러면서 여러 팁을 배울 수 있습니다.

 

 

NOTE: 이 비디오에서는 Oncomine™ Concepts Edition을 사용하고 Oncomine™ Research Edition에서 찾아볼 수 없는 특징과 분석에 대해 다룹니다.  

 

Oncomine™ 데이터 기능 #2 - 전립선 암

Matt Anstett가 거세에 대한 Mutational Landscape에 대해 설명합니다. 

NOTE: 이 비디오에서는 Oncomine™ Concepts Edition을 사용하고 Oncomine™ Research Edition에 찾아볼 수 없는 특징과 분석에 대해 다룹니다.

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High-throughput, systematic analysis of paired-end next-generation sequencing data to characterize the gene fusion landscape in cancer

Seth E. Sadis, Nickolay A. Khazanov, Armand Bankhead III, Dinesh Cyanam, Paul D. Williams, Sean F. Eddy, Peter J. Wyngaard, Daniel R. Rhodes
AACR Annual Meeting, 5-10 APR, 2013, Washington, DC, USA

mag-analysis

Analysis of 3,000 cancer exomes to identify novel cancer drivers and therapeutic opportunities

Nickolay A. Khazanov, Peter Wyngaard, Paul D. Williams, Armand R. Bankhead III, Supra R. Gajjala, Mark Tomilo, Santhoshi Bandla, Emma T. Bowden, Seth Sadis, Daniel R. Rhodes
Second Annual TCGA Scientific Symposium, 27-28 NOV 2012, Crystal City, VA, USA