Ion GeneStudio 시스템 모델 | Thermo Fisher Scientific

시스템 선택

	Ion GeneStudio S5 시스템	Ion GeneStudio S5 Plus 시스템	Ion GeneStudio S5 Prime 시스템
Max. throughput/day (chip type)	15Gb (Ion 540 칩 1개)	30Gb (Ion 540 칩 2개)	50Gb (Ion 550 칩 2개)
최대 처리량의 총 염기서열분석 및 분석 시간	19시간 (Ion 540 칩)	10시간 (Ion 540 칩) 11.5시간 (Ion 550 칩)	6.5시간 (Ion 540 칩) 8.5시간 (Ion 550 칩)
칩 호환성	Ion 510, 520, 530, 540 칩	Ion 510, 520, 530, 540 및 550 칩

시스템 사양 상세 정보

광범위한 NGS 애플리케이션을 위한 샘플 처리량과 워크플로우의 유연성

칩 유형	Number of reads	Read length (output) †	Ion GeneStudio S5 시스템	Ion GeneStudio S5 Plus 시스템	Ion GeneStudio S5 Prime 시스템
칩 유형	Number of reads	Read length (output) †	*처리 시간 (염기서열분석 실행 및 분석 시간)**
Ion 510 칩	2~3M	200bp (0.3~0.5Gb)	4.5시간	3시간	3시간
Ion 510 칩	2~3M	400bp (0.6~1Gb)	10.5시간	5시간	5시간
Ion 520 칩	4~6M	200bp (0.6~1Gb)	7.5시간	3.5시간	3시간
	4~6M	400bp (1.2~2Gb)	12시간	5.5시간	5.5시간
	3~4M	600bp (0.5~1.5Gb)	12시간	5.5시간	5.5시간
Ion 530 칩	15~20M	200bp (3~4Gb)	10.5시간	5시간	4시간
	15~20M	400bp (6~8Gb)	21.5시간	8시간	6.5시간
	9~12M	600bp (1.5~4.5Gb)	21시간	8시간	7시간
Ion 540 칩	60~80M	200bp (10~15Gb)	19시간	10시간	6.5시간
Ion 540 칩	60~80M	하루에 200bp (20~30Gb) 2회 실행	해당 없음	20시간	10**시간
Ion 550칩	100~130M	200bp (20~25Gb)	해당 없음	11.5시간	8.5시간
Ion 550칩	100~130M	하루에 200bp (40~50Gb) 2회 실행	해당 없음	해당 없음	12**시간

† Expected output with >99% aligned/measured accuracy. Output dependent on read length and application.
* Sequencing run times are between 2.5 and 4 hrs.
** Analysis of first run occurs concurrently with the second sequencing run.

칩 선택

인기 있는 패널 및 애플리케이션의 예	패널 설명	Number of samples per run*
인기 있는 패널 및 애플리케이션의 예	패널 설명	Ion 510 칩 2~3M reads	Ion 520 칩 4~6M reads	Ion 530 칩 15~20M reads	Ion 540 칩 60~80M reads	Ion 550 칩 100~130M reads
암 연구
Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2	10ng FFPE 유래 DNA에서 암 집중 부위의 SNV를 확인합니다	4	8	26	84	NA
Oncomine Focus Assay	52개 유전자에서 고형암 관련 SNV, indel, CNV 및 gene fusion 확인	4	8	26	NA	NA
Oncomine Comprehensive Assay v3	SNV 및 indel의 바이오마커 발견 및 161개의 유전자의 전체 유전자 염기서열 분석 가능	NA	NA	NA	8	16
Oncomine Lung cfDNA Assay	비소세포폐암 관련 유전자에서 희귀 체세포 돌연변이 검출	NA	NA	8	32	약 60~64
Oncomine Pan-Cancer Cell-Free Assay	다양한 암 유형에서 유전자 내 희귀 체세포 돌연변이 검출	NA	NA	1	4	7~8
Oncomine Immune Response Research Assay	면역 반응 경로에 관여하는 유전자 조회	NA	4	8	NA	NA
유전자 발현
Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit	전 세계 유전자 발현 연구	NA	NA	2	8	16
Ion AmpliSeq Transcriptome Mouse Gene Expression Kit	전 세계 유전자 발현 연구	NA	NA	2	8	16
유전 질환 연구
Ion AmpliSeq Exome RDY Panel	엑솜 전체 (whole exome)의 희귀 돌연변이 탐색	NA	NA	NA	2	4
Ion AmpliSeq Pharmacogenomics Research Panel (40개 유전자)	약물 대사와 관련되어 있다고 알려진 변이 조회	48	96	384	384	NA
Ion AmpliSeq On-Demand Panel	유전성 질환과 관련된 유전자 변이 확인	최대 384 (패널의 유전자 수에 따라 다름)
생식 건강 연구
Ion ReproSeq PGS Kits	배아 시료에서 DNA의 비배수성 (aneuploidy) 확인	16	24	96	NA	NA
감염병 연구
Ion AmpliSeq TB Research Panel	결핵균( Mycobacterium tuberculosis, TB)에서 항생제 내성과 관련된 변이 확인	48	84	272	384	NA
Ion AmpliSeq Ebola Research Panel	에볼라 바이러스 존재 확인	48	84	272	384	NA
Ion 16S Metagenomics Kit	혼합 시료에서 세균 종 확인	24	48	192	NA	NA
* 실행/칩당 시료 수는 가이드 역할을 하며 실제 로딩한 시료 수는 판독(reads)과 적용 범위 심도(depth of coverage)에 대한 요구에 따라 달라집니다. 참고로 중요한 점은 칩당 라이브러리 수가 증가함에 따라 라이브러리 간 판독 균형을 맞추는 것이 더욱 어려워진다는 것입니다. 또한 FFPE 조직의 라이브러리는 더 많은 가변적인 결과를 생성하는 경향이 있습니다. 처음에 더 적은 수의 라이브러리를 결합하고 경험적으로 실제 한계치를 결정하는 것이 좋습니다.