Ion GeneStudio System 型號 | Thermo Fisher Scientific

選擇您的型號

	Ion GeneStudio S5 系統	Ion GeneStudio S5 Plus 系統	Ion GeneStudio S5 Prime 系統
每日最大通量 (晶片型號)	15 Gb (一個 Ion 540 晶片)	30 Gb (兩個 Ion 540 晶片)	50 Gb (兩個 Ion 550 晶片)
最大通量之總定序和分析時間	19 小時 (Ion 540 晶片)	10 小時 (Ion 540 晶片) 11.5 小時 (Ion 550 晶片)	6.5 小時 (Ion 540 晶片) 8.5 小時 (Ion 550 晶片)
相容的晶片	Ion 510、520、530、540 晶片	Ion 510、520、530、540 及 550 晶片

詳細系統規格

各種 NGS 應用的通量與流程靈活度

晶片型號	片段數量	片段長度 (輸出) †	Ion GeneStudio S5 系統	Ion GeneStudio S5 Plus 系統	Ion GeneStudio S5 Prime 系統
晶片型號	片段數量	片段長度 (輸出) †	*檢驗報告時間 (定序與分析時間)**
Ion 510 晶片	2–3M	200 bp (0.3–0.5 Gb)	4.5 小時	3 小時	3 小時
Ion 510 晶片	2–3M	400 bp (0.6–1 Gb)	10.5 小時	5 小時	5 小時
Ion 520 晶片	4–6M	200 bp (0.6–1 Gb)	7.5 小時	3.5 小時	3 小時
	4–6M	400 bp (1.2–2 Gb)	12 小時	5.5 小時	5.5 小時
	3–4M	600 bp (0.5–1.5 Gb)	12 小時	5.5 小時	5.5 小時
Ion 530 晶片	15–20M	200 bp (3–4 Gb)	10.5 小時	5 小時	4 小時
	15–20M	400 bp (6-8 Gb)	21.5 小時	8 小時	6.5 小時
	9–12M	600 bp (1.5–4.5 Gb)	21 小時	8 小時	7 小時
Ion 540 晶片	60–80M	200 bp (10–15 Gb)	19 小時	10 小時	6.5 小時
Ion 540 晶片	60–80M	200 bp (20–30 Gb) 於 1 天內執行 2 次	不適用	20 小時	10** 小時
Ion 550 晶片	100–130M	200 bp (20–25 Gb)	不適用	11.5 小時	8.5 小時
Ion 550 晶片	100–130M	200 bp (40–50 Gb) 於 1 天內執行 2 次	不適用	不適用	12** 小時

†預期輸出可達 >99% 比對 / 測量準確度。結果輸出取決於片段長度和應用。
* 定序時間介於 2.5 至 4 小時之間。
** 第一次定序的分析階段與第二次定序操作為同時進行。

選擇您的晶片

常用基因試劑盤與應用範例	試劑盤說明	每次操作之樣本數 *
常用基因試劑盤與應用範例	試劑盤說明	Ion 510 晶片 2-3 百萬個片段	Ion 520 晶片 4-6 百萬個片段	Ion 530 晶片 1.5-2 千萬個片段	Ion 540 晶片 6-8 千萬個片段	Ion 550 晶片 1-1.3 億個片段
癌症研究
Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2	自 FFPE 獲取 10 ng DNA 找出癌症SNV熱點	4	8	26	84	不適用
Oncomine Focus Assay	從 52 個基因中找出實體瘤相關的單核苷酸變異、序列的插入與缺失、拷貝數變異以及基因融合	4	8	26	不適用	不適用
Oncomine Comprehensive Assay v3	可於161個基因的全基因定序找出單核苷酸變異和序列插入缺失的生物標記	不適用	不適用	不適用	8	16
Oncomine Lung cfDNA Assay	檢測非小細胞肺癌相關基因中的罕見體細胞突變	不適用	不適用	8	32	約 60-64
Oncomine Pan-Cancer Cell-Free Assay	檢測多種癌症類型的罕見體細胞突變	不適用	不適用	1	4	7-8
Oncomine Immune Response Research Assay	探討參與免疫反應途徑的基因	不適用	4	8	不適用	不適用
基因表現
Ion AmpliSeq 轉錄體人類基因表現試劑組	研究整體基因表現量	不適用	不適用	2	8	16
Ion AmpliSeq 轉錄體鼠類基因表現試劑組	研究整體基因表現量	不適用	不適用	2	8	16
遺傳性疾病研究
Ion AmpliSeq 外顯子體 RDY 試劑盤	透過全外顯子探索罕見突變	不適用	不適用	不適用	2	4
Ion AmpliSeq 藥物基因體學研究試劑盤 (40 個基因)	調查與藥物代謝相關的已知變異	48	96	384	384	不適用
Ion AmpliSeq On-Demand 試劑盤	找出與遺傳疾病相關的基因變異	高達 384 種 (依試劑盤中的基因數而異)
生殖醫學研究
Ion ReproSeq PGS 試劑組	從胚胎樣本中鑑定非整倍體 DNA	16	24	96	不適用	不適用
傳染病研究
Ion AmpliSeq 結核病研究試劑盤	找出與結核分枝桿菌 (Mycobacterium tuberculosis，TB) 之抗藥性相關的變異株	48	84	272	384	不適用
Ion AmpliSeq 伊波拉研究試劑盤	判別是否存在伊波拉病毒	48	84	272	384	不適用
Ion 16S 總基因體學試劑組	鑑定混合樣本中的菌種	24	48	192	不適用	不適用
* 每次操作或各晶片所用的樣本量僅供參考，實際載入的樣本量取決於您所需的片段數量和覆蓋深度。要注意的是，隨著晶片的樣本庫數量增加，平衡樣本庫之間的片段變得更加困難。此外，來自 FFPE 組織的樣本庫複雜度較高也會產生較多樣化的結果。我們建議一開始先合併較少的樣本庫，再依據經驗決定實際操作限制。