进一步了解 3D 生命科学数据分析

Amira Software Extensions

Thermo Scientific Amira 软件是一款功能强大的多层面三维分析平台,用于可视化、探索和解析来自计算机断层扫描、显微镜、MRI 和众多其他成像模态的生命科学数据。

Amira 软件提供可配置的解决方案。根据您的 3D 数据可视化和分析需求提供匹配的扩展模块。

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该扩展模块提供了多种先进的工具,可用于图像增强、简化和自动化分割以及对物体、细胞和组织特征进行广泛测量和定量分析。

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XImagePAQ

由中国台湾国立实验动物中心 - 国立应用研究实验室提供

方便地从150多种文件格式(由 Bio-Formats 提供技术支持,与 Glencoe 软件配套使用)中加载 3D 或 4D+ 数据。

该扩展模块允许您读取从最新的显微镜中采集的、广泛使用的图像数据。

Bioformats 现已集成在 XLVolume 模块中:


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该扩展可在极度嘈杂的图像中检测和追踪丝状体或管状结构,例如,能够在电子断层图中分析肌动蛋白纤维或微管。

XTracing

高效网格生成器可为 FEA/CFD 模拟生成优质三维四面体网格。该扩展还专门用于模拟数据(从流动数据到热力数据)和应力数据的先进后处理。 

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XWind
数据由 Visible Cement Dataset 提供

管理和可视化高达数兆字节的大型数据。远远超出可用系统内存的限制。

XLVolume 扩展包中使用的多分辨率技术可在大型数据集中实现交互式可视化和导航。

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该扩展将 Amira 软件强大的 3D 数据可视化功能(如硬件加速体积绘制)与专用于分子可视化和分析的工具(如分子表面、序列对齐、构型密度计算和分子轨迹动画)融为一体。

XMolecular
数据由莱顿大学 NeCEN Gorlaeus 实验室 Sacha de Carlo 提供

Amira 软件解决方案使用弥散加权 MRI 进行水分子弥散分析。这样用户就能计算表观扩散系数、各向异性分数和方向编码彩色图。弥散张量成像的目的是定位和可视化纤维束。全脑灌注分析可以在动态对比增强 MRI 或 CT 检查中进行。 

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XNeuro
由雷根斯堡大学医院的 Alexander Brawanski 教授提供

该扩展模块允许您利用在变形过程中采集的物体 3D 图像计算精确的内部位移和应变图。 

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XDigitalVolumeCorrelation
由朴茨茅斯大学 Gianluca Tozzi 博士提供

该扩展模块允许对一组相连区域进行表征和建模,球体和线条分别代表这些区域及其连接。

XPoreNetworkModeling
数据由日本岛津公司 (inspeXio SMX-225CT FPD HR) 提供

使用 C++ 编程语言为 Amia 软件创建新的自定义组件,例如文件阅读器和编写器、计算模块乃至新的可视化模块。