Ion GeneStudio 系统型号 | Thermo Fisher Scientific

选择系统

	Ion GeneStudio S5 系统	Ion GeneStudio S5 Plus 系统	Ion GeneStudio S5 Prime 系统
最大通量/天（芯片类型）	15 Gb （一块 Ion 540 芯片）	30 Gb （两块 Ion 540 芯片）	50 Gb （两块 Ion 550 芯片）
在最大通量下测序和分析需要的时间	19 小时（Ion 540 芯片）	10小时（Ion 540 芯片） 11.5小时（Ion 550 芯片）	6.5小时（Ion 540 芯片） 8.5小时（Ion 550 芯片）
兼容芯片	Ion 510、520、530、540 芯片	Ion 510、520、530、540 和 550 芯片

详细系统规格

可变的通量和灵活的工作流程，适用于多种 NGS 应用

芯片类型	读段数量	读长（输出） †	Ion GeneStudio S5 系统	Ion GeneStudio S5 Plus 系统	Ion GeneStudio S5 Prime 系统
芯片类型	读段数量	读长（输出） †	*周转时间（测序运行和分析时间）**
Ion 510 芯片	2–3M	200 bp (0.3–0.5 Gb)	4.5小时	3小时	3小时
Ion 510 芯片	2–3M	400 bp (0.6–1 Gb)	10.5小时	5小时	5小时
Ion 520 芯片	4–6M	200 bp (0.6–1 Gb)	7.5小时	3.5小时	3小时
	4–6M	400 bp (1.2–2 Gb)	12小时	5.5小时	5.5小时
	3–4M	600 bp (0.5–1.5 Gb)	12小时	5.5小时	5.5小时
Ion 530 芯片	15–20M	200 bp (3–4 Gb)	10.5小时	5小时	4小时
	15–20M	400 bp (6-8 Gb)	21.5小时	8小时	6.5小时
	9–12M	600 bp (1.5–4.5 Gb)	21小时	8小时	7小时
Ion 540 芯片	60–80M	200 bp (10–15 Gb)	19小时	10小时	6.5小时
Ion 540 芯片	60–80M	200 bp (20–30 Gb)，1天运行2次	不适用	20小时	10** 小时
Ion 550 芯片	100–130M	200 bp (20–25 Gb)	不适用	11.5小时	8.5小时
Ion 550 芯片	100–130M	200 bp (40–50 Gb)，1天运行2次	不适用	不适用	12** 小时

† 经校准/测量准确度 >99% 时的预期输出。输出取决于读长和应用。
* 测序运行时间介于2.5到4小时之间。
** 首次运行的分析与第二次测序运行同时进行。

选择芯片

广受欢迎的检测组合和应用示例	检测组合说明	每次运行的样本数量*
广受欢迎的检测组合和应用示例	检测组合说明	Ion 510 芯片 2-3M 读段	Ion 520 芯片 4-6M 读段	Ion 530 芯片 15-20M 读段	Ion 540 芯片 60-80M 读段	Ion 550 芯片 100-130M 读段
癌症研究
Ion AmpliSeq 癌症热点检测组合 v2	可以从 10 ng FFPE 来源的 DNA 中鉴定出癌症热点 SNV	4	8	26	84	不适用
Oncomine Focus 测定	鉴定52个基因中与实体肿瘤相关的 SNV、插入缺失、CNV 和基因融合	4	8	26	不适用	不适用
Oncomine 综合性测定试剂盒 v3	可以从161个基因中发现 SNV 和插入缺失的生物标记物以及进行全基因测序	不适用	不适用	不适用	8	16
Oncomine 肺 cfDNA 测定	检测基因中与非小细胞肺癌相关的罕见体细胞突变	不适用	不适用	8	32	~60-64
Oncomine 泛癌细胞游离测定	检测基因中多种癌症类型的罕见体细胞突变	不适用	不适用	1	4	7-8
Oncomine 免疫应答研究测定	检测参与免疫应答途径的基因	不适用	4	8	不适用	不适用
基因表达
Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒	研究全局基因表达水平	不适用	不适用	2	8	16
Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒	研究全局基因表达水平	不适用	不适用	2	8	16
遗传性疾病研究
Ion AmpliSeq 外显子组 RDY 检测组合	发现整个外显子组的罕见突变	不适用	不适用	不适用	2	4
Ion AmpliSeq 药物基因组学研究检测组合（40个基因）	研究与药物代谢相关的已知变异	48	96	384	384	不适用
Ion AmpliSeq 按需检测组合	鉴定与遗传性疾病相关的基因变异	多达384个基因（依检测组合中的基因数而异）
生殖健康研究
Ion ReproSeq PGS 试剂盒	鉴定胚胎样本中的 DNA 非整倍性	16	24	96	不适用	不适用
感染性疾病研究
Ion AmpliSeq 结核病研究检测组合	鉴定结核分枝杆菌 (TB) 中与抗菌素耐药性相关的突变	48	84	272	384	不适用
Ion AmpliSeq 埃博拉研究检测组合	鉴定是否存在埃博拉病毒	48	84	272	384	不适用
Ion 16S 宏基因组试剂盒	鉴定混合样本中的细菌种类	24	48	192	不适用	不适用
* 每个运行/芯片的样本数量可作为指导，实际加载的样本数量取决于您对读段数量和覆盖深度的需求。值得注意的是，随着每个芯片的文库数量的增加，平衡各文库之间的读段会变得更加困难。此外，来自石蜡包埋组织的文库倾向于产生更多变化的结果。我们建议最初合并较少的文库并根据经验确定实际的限制。