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我们总结了一系列要点提示和技巧并建立了一个详细的知识库,以满足您的各类科研需求,助您优化试验,获得最理想的结果。
浏览下列相关问题答疑:
表达载体通常包含以下元件:
附加元件包括:
请浏览下表来了解常用的组成型和诱导型启动子。
宿主 | 组成型启动子 | 诱导型启动子 | 诱导剂 |
大肠杆菌 | 通常没有 | Lac(乳糖操纵子); | IPTG |
酵母 | GAP(甘油醛-3-磷酸脱氢酶) | AOX1(乙醇氧化酶); | 甲醇 |
昆虫 | Ac5(肌动蛋白); | MT(金属硫蛋白) | 铜 |
哺乳动物 | CMV(巨细胞病毒),EF-1(人延伸因子-1),UbC(人泛素C),SV40(猿猴病毒40) | 带有TetO2(四环素操纵子)的启动子; | 四环素或强力霉素; |
不能;尽管可生成转录本,但是没有翻译启始所需的核糖体结合位点(RBS)或Shine-Dalgarno序列。因此,大肠杆菌中将会转录mRNA,但不会翻译为蛋白。
核糖体结合位点(RBS)是mRNA分子5'(上游)的区段,能够结合核糖体正确定位至翻译启始位点。RBS能够控制mRNA翻译启始的准确度和效率。
在原核mRNA中,RBS序列位于起始密码子(即第一个AUG)上游7个核苷酸处。本序列也称为Shine-Dalgarno序列,是由位于AUG起始密码子5'端的多鸟苷酸序列AGGAGG所组成的。由于这一序列能够与30S核糖体亚基中16S rRNA的3'端实现互补,因此该信使RNA能够与核糖体高效结合。Shine-Dalgarno序列是必需的。
真核生物中的蛋白合成过程与这一模型不同。mRNA的5'端具有一个经修饰的化学结构(“帽”结构),能够被核糖体所识别,后者随之与mRNA相结合并沿着mRNA移动(“扫描”)直至找到第一个AUG密码子。碱基的特征模式(称为“Kozak序列”)有时在该密码子的周围被发现,以使人想起Shine-Dalgarno序列的方式帮助正确定位mRNA,但不与核糖体RNA形成碱基配对。因此,Kozak序列并非是核糖体结合位点,而是一个翻译启始增强子。保守的Kozak序列为G/ANNAUGG,其中的AUG表示起始密码子。-3位点的一个嘌呤(A/G)碱基具有显性效应;如果-3位点是一个嘧啶(C/T)碱基,则翻译进程会对-1,-2和+4位点的改变更为敏感。当-3位点从嘌呤变为嘧啶时,表达水平可能降低达95%以上。+4位点对于表达水平的影响较低,只发现有50%左右的降低影响。注意:酵母不遵循这一规则。果蝇中优化的Kozak序列会有些许的不同(C/AAAA/CAUG)。
ATG通常对于高效的翻译启始是足够的,尽管翻译效率要视目的基因而定。最佳的建议应是保持cDNA中天然起始位点,除非确定这一位点的功能性不理想。如果从表达的角度来考虑,推荐构建并测试两种载体,一个具有天然的起始位点,另一个具有保守的Kozak序列。通常情况下,所有N-端融合型表达载体都已包含了一个RBS或翻译起始位点。
IRES的全称为内部核糖体进入位点,能够介导不依赖末端的翻译启始过程。如果想在同一个启动子下,表达两个乃至更多基因,科研人员通常会在它们间加入IRES位点。
转录过程的终止是目的基因序列后的终止序列所介导的。以下列举了一些转录终止子的例子:
大肠杆菌:T7终止子
酵母:AOX与CYC1终止子
昆虫:SV40终止子
哺乳动物:SV40与BGH
病毒:3'LTR
通常情况下,引入表位标签是为了与您的目的基因进行融合,来使目的基因更易检测或快速纯化。表位标签可融合于目的基因的N-端或C-端。使用表位标签时有一些需要考虑的事项:
这里有一些用于帮助您选择表位标签的基础指南:
目的 | 描述 | 标签举例 |
检测 | 针对该标签有经良好验证的抗体 | V5, Xpress, myc, 6XHis, GST, BioEase™, capTEV™, GFP, Lumio™ |
纯化 | 有易于纯化的树脂 | 6XHis, GST, BioEase™, capTEV™ |
可切割 | 为了在表达后去除标签以获得天然蛋白,引入蛋白酶识别位点(TEV,EK) | 任一标签(仅位于N-端)后面都附带了蛋白酶识别位点 |
我们所提供A、B和C型载体之间的差异在于载体多克隆位点(MCS)中增加或删除了单个碱基对。这些单个碱基的改变在每种类型的载体上形成了三种不同的阅读框。这些特性将帮助用户通过特定的限制性内切酶,插入目的基因使其与C-端标签在同一阅读框中。三种阅读框A、B和C的载体将以三个独立的试剂管形式提供。
请参考下表,以了解每种系统的不同特性:
特性 | 大肠杆菌 | 酵母 | 昆虫 | 哺乳动物 |
细胞生长 | 迅速(30分钟) | 快速(90分钟) | 慢(18-24小时) | 慢(24小时) |
生长培养基的复杂性 | 低 | 低 | 复杂 | 复杂 |
生长培养基的成本 | 低 | 低 | 高 | 高 |
表达水平 | 高 | 低-高 | 低-高 | 低-中等 |
胞外表达 | 分泌至周质 | 分泌至培养基 | 分泌至培养基 | 分泌至培养基 |
翻译后修饰 | 无 | 中等 | 高 | 高 |
蛋白折叠 | 通常需要重新折叠 | 通常需要重新折叠 | 正确折叠 | 正确折叠 |
N型糖基化 | 无 | 高甘露糖 | 简单,无唾液酸 | 复杂 |
O型糖基化 | 否 | 是 | 是 | 是 |
磷酸化 | 否 | 是 | 是 | 是 |
乙酰化作用 | 否 | 是 | 是 | 是 |
酰化作用 | 否 | 是 | 是 | 是 |
Gamma-羧酸作用 | 否 | 否 | 否 | 是 |
宿主生物 | 最常见应用 | 优势 | 挑战 |
无细胞 |
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原核生物 |
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酵母 |
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昆虫 |
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| 更苛刻的培养条件 |
哺乳动物 |
| 最高水平的蛋白加工 |
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藻类 |
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仅限研究用途,不可用于诊断操作。