생명과학 및 생체의학 분야를 지원하는 현미경 이미징 시각화, 프로세싱, 분석을 위한 강력하고 다차원적인 2D-5D 소프트웨어

Thermo Scientific Amira 소프트웨어는 광학 및 전자 현미경 검사, CT, MRI 및 기타 이미지 기법 등 다양한 이미징 장비에서 생명과학 및 생체의학 연구 데이터를 시각화, 분석 및 이해하기 위한 강력하고 종합적이며 다기능적인 2D-5D 솔루션입니다. 놀라운 속도와 유연성을 갖춘 Amira 소프트웨어는 구조 및 세포 생물학, 조직 이미징, 신경과학, 전임상 이미징 및 생물공학에 이르는 다양한 연구 분야에서 고급 2D-5D 생물 이미징 워크플로우를 지원합니다. Amira 소프트웨어는 타임 시리즈 및 멀티 채널을 포함한 모든 3D 이미지 데이터에서 포괄적인 데이터 시각화, 프로세싱 및 분석 기능을 제공합니다. Amira 소프트웨어는 생명과학 및 생체의학 연구자들이 다른 스케일과 다른 모드로부터 얻은 데이터에서 귀중한 통찰력을 얻을 수 있도록 합니다.

이미징 데이터

Amira Software workflow

프로세싱

Amira Software workflow

시각화

Amira Software workflow

분석

Amira Software workflow

맞춤화

신뢰성

이 제품은  강력한  분할 및  이미지  프로세싱 기능 및 워크플로우,  20년 이상  이어진  과학계 및 수천 명의 연구자들과의 협력으로  생체의학 및 생명과학 연구 분야에서  신뢰할 만한 해답을 제공하는 디지털 이미징 기반 워크플로우로  입증되었습니다.

맞춤화

맞춤화

고객의 요구 사항은 고유하고 지속적으로 발전하고 있기 때문에 당사의 소프트웨어 솔루션은 완벽하게 유연성을 갖추고 있으며 맞춤화가 가능합니다. 스크립팅 인터페이스(Python, TCL), MATLAB와의 연결, 프로그래밍 API 덕분에 소프트웨어 솔루션을 확장하고 자체 IP(지적 재산권)를 통합할 수 있습니다. 또한 필요에 따라 당사의 전문 서비스팀이 고객의 요구에 맞는 고유한 솔루션을 설계할 수 있도록 도와드립니다.

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지원

전담 전문가 지원팀 덕분에 최고의 전문가들에게 문의할 수 있어 의문 사항을 확실히 해결할 수 있습니다. 그리고 교육, 컨설팅 옵션, 지속적으로  확장되는 학습 자료 및 방법 컬렉션을 통해 보다 쉽게 학습하고 해답을 얻는 데 집중할 수 있습니다.

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자동화

자동화 기능과  계속해서  확장되는  온라인  애드온  저장소(Xtra Gallery)를 추가하게 되어  반복 가능한  워크플로우를 쉽게 재현가능한 레시피로  캡슐화할 수 있습니다.  인공 지능이 추가되어  비이미지  처리 분석 전문가를 통한  분석이   가능하며  복잡한  분석에서 시간을 절약하는  동시에  결과의  일관성을 보장합니다.


응용분야

동료들의 통찰력

실험실 워크플로우를 지원할 수 있는 업계 최고의 통찰력과 연구를 확인해 보십시오. 최첨단 종합적인 이미징 데이터 분석 도구 모음을 갖춘 Amira 소프트웨어는 실험실의 역량을 강화하는 데 도움이 됩니다.

과학자들이 생명 과학, 재료 과학 및 산업 분야에서 획기적인 발견을 할 수 있도록 지원합니다.

상관관계(Correlative) 현미경 검사: Amira 소프트웨어로 암의 전이 파악하기
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Amira 소프트웨어는 3D 시각화 및 분석을 통해 수의학 연구를 가속화합니다.
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기술

상관관계(Correlative) 이미징

Amira 소프트웨어는 멀티 모드 이미징 기술에서 오래동안 사용되어 온 애플리케이션으로 다양한 이미징 모드의 데이터를 사용하는 많은 연구자들이 선택하는 도구입니다. Amira 아키텍쳐는 처음부터 다양한 부피의 데이터 프로세싱과 시각화를 지원합니다. Multi-Planar Workroom과 함께 Amira 소프트웨어 표준판에 통합된 자동 등록 도구는 가장 일반적으로 사용되는 자동 등록 매트릭스와 최적화 도구의 유연성을 제공하므로 데이터 요구사항을 충족시키도록 등록 파라미터를 조정할 수 있습니다.

 

막 검출

Amira 소프트웨어는 필라멘트와 막과 같은 세포 기능의 자동 감지를 사용하여 세분화를 가속화합니다. cryo-tomogram 상에서 고급 이미지 분석과 통계 분석을 수행하여, Amira 소프트웨어는 이들 개별 구조로부터의 데이터를 결합하고 노이즈를 평균화하고 콘트라스트를 증가시켜 더욱 고분해능으로 복합 모델을 생성합니다.

 

세포 검출

세포 스페로이드(spheroid)는 전통적인 세포 단일층보다 생체내(in vivo) 조직을 더 잘 나타내는 3D 세포배양으로, 많은 응용분야에서 암, 당뇨, 줄기 세포를 연구하는 연구자의 능력을 향상시킵니다. 그러나, 이러한 3D 멀티컬러 물체에서의 세포 분석은 특히 연구 대상을 파괴하지 않고는 정확하게는 불가능합니다. Amira 소프트웨어는 자동으로 세포를 분리하고 이들 스페로이드의 3D 데이터에서 개별 세포와 그 핵의 부피, 형태, 강도 측정을 수행할 수 있습니다. Amira 소프트웨어는 또한 연구자들이 기존의 2D 세포 단일층을 분석하는 데에도 도움을 드립니다.

 

High Content Screening

Amira 소프트웨어는 면역 종양학, 신경과학, 오가노이드 건강을 포함하여 HCS에 사용되는 가장 까다로운 과학적, 실험적 모델을 조사할 수 있는 멀티채널 정량 기능을 지원합니다. 놀라운 속도와 유연성 덕분에 Amira 소프트웨어는 구조 및 세포 생물학에서 3D 모델의 뉴런 및 구형 형태학에 이르기까지 다양한 연구 영역에서 고급 2D–5D 바이오 이미징 워크플로우를 가능하게 합니다. 이러한 고급 분석을 용이하게 하기위해, Amira 소프트웨어는 "지능형 노이즈 제거 기능을 포함하여 향상된 교육과 예측을 위한 딥 러닝을 제공합니다.

자세히 알아보기

 

멀티 채널 및 타임 시리즈 시각화

Amira 소프트웨어의 새로운 Xplore5D 확장 기능을 사용하여 생명 과학자들은 하나의 플랫폼에서 이미지 크기나 메모리 한계에 대한 걱정 없이 대형 멀티 채널 및 타임 시리즈 데이터를 쉽게 시각화하고 상호 연관시키며 처리할 수 있습니다. Xplore5D는 스마트 파일 형식을 사용하여 획득 중에 수집된 귀중한 정보를 잃지 않고 모든 이미지 데이터를 압축할 수 있습니다.

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필라멘트 추적

Amira 소프트웨어를 통해 템플릿-일치 알고리즘을 사용하여 노이즈가 많은 극저온 EM 또는 DualBeam 데이터에서 이들 미세 필라멘트를 자동으로 검출하고 추적할 수 있습니다. 또한 Amira 소프트웨어를 사용하여 필라멘트 네트워크를 재구성하고 결과 그래프를 편집하여 필라멘트로 잘못 인식된 이미지 형상을 제거하거나 네트워크의 누락 부분을 추가할 수 있습니다. 그런 다음, 양, 길이, 두께, 방향, 순위 등과 같은 측정 파라미터에 의해 필라멘트 그래프를 정량화할 수 있습니다. 재구성된 모델과 계산된 파라미터로부터 강력한 3D 렌더링을 생성할 수 있습니다.

 

상관관계(Correlative) 이미징

Amira 소프트웨어는 멀티 모드 이미징 기술에서 오래동안 사용되어 온 애플리케이션으로 다양한 이미징 모드의 데이터를 사용하는 많은 연구자들이 선택하는 도구입니다. Amira 아키텍쳐는 처음부터 다양한 부피의 데이터 프로세싱과 시각화를 지원합니다. Multi-Planar Workroom과 함께 Amira 소프트웨어 표준판에 통합된 자동 등록 도구는 가장 일반적으로 사용되는 자동 등록 매트릭스와 최적화 도구의 유연성을 제공하므로 데이터 요구사항을 충족시키도록 등록 파라미터를 조정할 수 있습니다.

 

막 검출

Amira 소프트웨어는 필라멘트와 막과 같은 세포 기능의 자동 감지를 사용하여 세분화를 가속화합니다. cryo-tomogram 상에서 고급 이미지 분석과 통계 분석을 수행하여, Amira 소프트웨어는 이들 개별 구조로부터의 데이터를 결합하고 노이즈를 평균화하고 콘트라스트를 증가시켜 더욱 고분해능으로 복합 모델을 생성합니다.

 

세포 검출

세포 스페로이드(spheroid)는 전통적인 세포 단일층보다 생체내(in vivo) 조직을 더 잘 나타내는 3D 세포배양으로, 많은 응용분야에서 암, 당뇨, 줄기 세포를 연구하는 연구자의 능력을 향상시킵니다. 그러나, 이러한 3D 멀티컬러 물체에서의 세포 분석은 특히 연구 대상을 파괴하지 않고는 정확하게는 불가능합니다. Amira 소프트웨어는 자동으로 세포를 분리하고 이들 스페로이드의 3D 데이터에서 개별 세포와 그 핵의 부피, 형태, 강도 측정을 수행할 수 있습니다. Amira 소프트웨어는 또한 연구자들이 기존의 2D 세포 단일층을 분석하는 데에도 도움을 드립니다.

 

High Content Screening

Amira 소프트웨어는 면역 종양학, 신경과학, 오가노이드 건강을 포함하여 HCS에 사용되는 가장 까다로운 과학적, 실험적 모델을 조사할 수 있는 멀티채널 정량 기능을 지원합니다. 놀라운 속도와 유연성 덕분에 Amira 소프트웨어는 구조 및 세포 생물학에서 3D 모델의 뉴런 및 구형 형태학에 이르기까지 다양한 연구 영역에서 고급 2D–5D 바이오 이미징 워크플로우를 가능하게 합니다. 이러한 고급 분석을 용이하게 하기위해, Amira 소프트웨어는 "지능형 노이즈 제거 기능을 포함하여 향상된 교육과 예측을 위한 딥 러닝을 제공합니다.

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멀티 채널 및 타임 시리즈 시각화

Amira 소프트웨어의 새로운 Xplore5D 확장 기능을 사용하여 생명 과학자들은 하나의 플랫폼에서 이미지 크기나 메모리 한계에 대한 걱정 없이 대형 멀티 채널 및 타임 시리즈 데이터를 쉽게 시각화하고 상호 연관시키며 처리할 수 있습니다. Xplore5D는 스마트 파일 형식을 사용하여 획득 중에 수집된 귀중한 정보를 잃지 않고 모든 이미지 데이터를 압축할 수 있습니다.

자세히 알아보기

 

필라멘트 추적

Amira 소프트웨어를 통해 템플릿-일치 알고리즘을 사용하여 노이즈가 많은 극저온 EM 또는 DualBeam 데이터에서 이들 미세 필라멘트를 자동으로 검출하고 추적할 수 있습니다. 또한 Amira 소프트웨어를 사용하여 필라멘트 네트워크를 재구성하고 결과 그래프를 편집하여 필라멘트로 잘못 인식된 이미지 형상을 제거하거나 네트워크의 누락 부분을 추가할 수 있습니다. 그런 다음, 양, 길이, 두께, 방향, 순위 등과 같은 측정 파라미터에 의해 필라멘트 그래프를 정량화할 수 있습니다. 재구성된 모델과 계산된 파라미터로부터 강력한 3D 렌더링을 생성할 수 있습니다.

 

서비스

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입문 교육

Amira, Avizo 및 PerGeos Software 신규 사용자를 위해 특별히 설계된 이 입문 교육을 통해 학습 커브를 단축하고 투자를 극대화 해보세요.

이 교육은 실습 교육이 있는 강의로 이루어져 있습니다. 교육 자료는 Amira, Avizo 및 PerGeos Software의 기본 기능과 특징을 조명합니다.

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고급 교육

Amira, Avizo 및 PerGeos Software의 기존 사용자를 위해 특별히 설계된 이 고급 교육을 통해 결과를 얻기 까지의 시간을 단축하고 투자를 극대화 해보세요.

이 교육은 실습 교육이 있는 강의로 이루어져 있습니다. 교육 자료는 Amira, Avizo 및 PerGeos Software의 고급 기능과 특징을 조명합니다.

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맞춤형 개발

3D 및 이미지 프로세싱에서의 25년 이상의 경험과 크고 작은 조직에 수 백개의 맞춤형 프로젝트를 제공해 온 Thermo Fisher Scientific은 특정 요구에 맞는 맞춤형 솔루션을 제공할 수 있습니다.

저희는 당사의 소프트웨어를 다양한 수준으로 맞춤화하고 확장할 수 있습니다.


후기

VetCore, University of Veterinary Medicine에서는 Amira 소프트웨어를 사용합니다.

"Vetmeduni Vienna의 연구는 임상 및 전임상 연구 분야를 모두 포괄하며 매우 다양합니다. 현재 이미지 촬영 시설에서 4명이 근무하고 있으며, 이미지 획득(광시야현미경, CLSM, 회전식 디스크 공초점 현미경 검사 그리고 곧 STORM 초고해상도 현미경 검사, 현미경 X선 컴퓨터 단층촬영도 포함 예정)과 데이터 시각화 및 분석 분야의 연구자들을 위해 기기와 지원을 제공하고 있습니다. Amira 소프트웨어를 사용하면 네트워크를 구축하여 데이터 개체 간의 복잡한 상호 작용이 가능합니다. 생물학은 복잡하며, 생물학적 상호작용은 복잡한 네트워크입니다. 복잡한 질문에는 이를 해결하기 위한 복잡한 도구가 필요합니다. 이 점에 있어서 Amira 소프트웨어에 사용되는 분석 네트워크는 복잡한 데이터 분석 시 다른 대부분의 소프트웨어 접근 방식을 능가합니다. 또한, 저는 Amira 소프트웨어가 딥 러닝 네트워크 및 스크립팅(Tcl, Matlab, Python 등)의 통합과 관련하여 상당히 개방적이라는 점이 좋습니다."

Stephan Handschuh 박사
VetCore, University of Veterinary Medicine, Vienna

 

Amira 소프트웨어를 사용하는 EMBL and DKFZ

본 후기는 독일, 하이델베르그의 EMBL and DKFZ에서 Matthia A. Karreman (MSc, PhD)가 생체내 단일 암 세포를 효과적으로 표적화하는 멀티모드 상관관계 현미경법 프로젝트에서 Amira 소프트웨어를 사용한 방식을 설명합니다. 참조 자료 읽기.
동영상: 6 분


특징

이미징 데이터 가져오기 및 프로세스

    • 모든 종류, 스케일, 사이즈 처리:

    - Bio-Formats
    - Bitmap 형식
    - 현미경: 전자 및 광학
    - 의학 및 뉴로이미지 형식
    - 분자 형식
    - 기타 획득 장치 (MRI, 방사선 촬영 등)

    • 유한 요소 모델링, 기하학적 모델링, CAD
    • 다중 데이터/다중 뷰, 다중 채널, 타임 시리즈, 대량 데이터 지원
    • 스케일링, 보정, 변환, 리샘플링(re-sampling)
    • 이미지 개선, 종합적인 필터링 및 컨볼루션, 푸리에 주파수 변환
    • 아티팩트(artifact) 감소 알고리즘
    • 고급 다중 모드 2D/3D 자동 등록
    • 이미지 스택 정렬, 산술, 상관 관계, 결합

    이미징 데이터를 쉽게 세분화

    • 임계값 계산 및 자동 세분화, 개체 분리, 자동 레이블 지정
    • 영역 확대, 스네이크, 보간, 래핑, 평활
    • 유역 및 분지를 포함한 형태학적 처리
    • 머신 러닝 기반 세분화
    • 개별 섬유 및 필라멘트 자동 추적
    • 골격화 및 필라멘트 네트워크 추출
    • 분할 및 공간 그래프 생성이나 편집을 위한 상호작용식 도구
    • 3D 표면 재현
    • FEA/CFD를 위한 그리드 생성

     

    분석 및 시각화 작업을 원활하게 출판하고 발표하기 위해 내보내기(export) 하세요.

    • 애니메이션 및 동영상 생성
    • 고급 키 프레임 및 객체 애니메이션
    • 이미지, 기하학적 모델, 측정 및 시뮬레이션 혼합
    • 주석, 측정 범례, 히스토그램 및 곡선 플롯
    • 스프레드시트 내보내기, 3D 모델, 고품질 이미지
    • 능동 및 수동 방식 3D 스테레오 비전
    • 단일 및 타일형 화면 디스플레이
    • 몰입형 환경

    이미징 데이터를 시각화하고 탐색해보세요.

    • 상호작용식 고품질 볼륨 및 멀티채널 시각화
    • 직교, 경사, 원통형 및 곡선 슬라이싱
    • 윤곽 및 등면(iso-surface) 추출
    • 최대 강도 또는 기타 유형의 투영
    • 벡터 및 텐서 시각화
    • 객체 및 추적
    • 분자적 시각화

    이미징 데이터를 분석하고 정량적 정보를 얻어보세요.

    • 직관적인 레시피 생성, 사용자 맞춤화, 자동 재생
    • 카운트, 볼륨, 영역, 경계선, 가로세로비 및 방향을 포함한 측정 방법 내장
    • 사용자 정의 측정
    • 스프레드시트 도구 및 차트를 사용하는 결과 뷰어
    • 자동 개별 형상 측정, 3D 국소화 및 스프레드시트 선택
    • 통계 자동화, 분포 그래프
    • 측정 기준을 사용한 형상 필터링
    • 데이터 정합, 변형, 비교 및 측정

     

    Amira Software를 특별한 요구에 맞게 쉽고 신속하게 조정해보세요.

    • 맞춤형 C++ 모듈 개발
    • MATLAB™ bridge
    • Python 스크립팅 API

    기기 카드 원본 스타일시트

    제품

    Amira 소프트웨어
    생명 과학

    • 2D-5D 바이오이미징 데이터 탐색
    • 구조 식별 및 이해
    • 통계적 정보 획득
    • 리포트 공유 및 우수한 애니메이션

    Krios G4 Cryo-TEM

    • 개선된 인체공학
    • 신생 실험실과 기존 실험실 모두에서 간편한 설치
    • 생산성과 자동화의 극대화
    • 고분해능 3D 재구성을 위한 최상의 이미지 품질

    Aquilos 2 Cryo-FIB

    • 복수의 박막층(lamella) 제작을 가능하게 하는 자동화 기술
    • 리프트 아웃 나노 조작기(lift-out nano-manipulator)를 사용한 관심 구조 표적화 및 추출
    • 고분해능 단층촬영을 위한 3D 시각화

    Apreo 2 SEM

    • 전방위적인 나노미터 미만 분해능을 위한 고성능 SEM
    • 민감하고 TV 속도 물질 대비를 위한 In-column T1 후방산란 검출기
    • 긴 작동 거리에서(10mm)에서 뛰어난 성능

    문의하기

    연구용으로만 사용하십시오. 진단용으로는 사용할 수 없습니다.

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