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Thermo Scientific Proteome Discoverer 소프트웨어는 단백질체학(Proteomics) 연구자를 위하여 편리하고 혁신적인 기능들을 제공할 뿐 아니라, 복잡한 분석 결과에서도 맞춤형 데이터 분석을 위한 데이터 처리 워크플로에 필요한 기능들을 지원합니다. 통계 분석, 생물학적 표시 및 데이터 해석용 데이터 세트를 관리하고 광범위한 단백질체학 워크플로에서 복잡한 생물학적 시료 내 단백질의 식별 및 정량화 과정을 간단히 수행할 수 있습니다. 이 소프트웨어는 데이터 독립적 획득(Data-independent acquisitions, DIA), 데이터 종속적 획득(Data-dependent acquisitions, DDA), 와이드 윈도우 획득(Wide window acquisitions, WWA)을 통한 펩타이드 및 단백질 식별, PTM 분석, 동중원소 질량 태그 지정, 비표지 정량 분석(Label-free quantification, LFQ) 등의 모든 주요 단백질체학 분석 데이터의 프로세싱 과정을 간소화합니다. 글리코펩타이드 분석, 탑-다운(Top-down) 단백질체학, 단백질형 분석, 화학적 교차 결합 XL-MS의 질량분석 기반의 구조 생물학 등에서 요구되는 분석 결과를 모두 동일한 통합형, 다기능 단백질 인포매틱 시스템에서 달성해 보세요. Proteome Discoverer 소프트웨어는 동일한 워크플로 내에서 다양한 데이터베이스 기반의 검색 알고리즘 및 해리 기법을 지원하여 포괄적으로 데이터를 분석합니다.

인텔리전트 INFERYS™ 리스코어링과 MSAID에서 개발한 새로운 CHIMERYS™ 검색 알고리즘을 통해 단순한 검색을 뛰어넘는 새로운 발견을 경험하세요. 이러한 혁신적인 접근 방식으로 단백질 식별률, 단백질 커버리지, PTM 및 고유한 펩타이드 식별 수가 크게 증가되어 연구자들은 기존 데이터와 새로 획득한 데이터를 통해 생물학적으로 더욱 진보한 결과에 대한 이해와 해석이 가능합니다. CHIMERYS 2.0은 또한 DIA, DDA, WWA 획득에서 LFQ뿐만 아니라 동중원소 질량 표지법에 대한 단백질 정량 분석 기능을 향상시킵니다.

 

맞춤형 데이터 분석 상대적 정량 분석 수행확장 가능한 워크플로 툴 

노드 기반의 워크플로 편집기를 사용하여 커버리지와 데이터 신뢰성을 최대화하는 맞춤형 데이터 분석이 가능합니다. SEQUEST™ HT, Mascot, MSAmanda, Protein Metrics의 Byonic™ 및 Thermo Scientific ProSightPD 소프트웨어와 같은 여러 검색 엔진의 데이터베이스 검색 결과를 통합합니다. INFERYS 리스코어링을 사용하여 펩타이드 식별 및 정량화에 대한 데이터 신뢰도를 높이고 CHIMERYS 2.0 지능형 검색 알고리즘을 사용하여 보다 심층적인 DIA, DDA 또는 WWA 데이터 마이닝이 가능합니다.

다음에 대한 동위원소 표지 펩타이드의 상대적인 수준을 측정하고 확인합니다.

  • TMT SPS MS3
  • 글리코펩타이드 식별 및 정량 분석
  • 포스포펩타이드 식별 및 정량 분석
  • 탑-다운(Top-down) 단백질체학
  • 교차 결합(Cross-linking)

통합형 통계 및 시각화 도구를 통해 데이터를 높은 신뢰도를 바탕으로 효율적으로 해석하여 의미 있는 결과를 신속하게 얻을 수 있습니다.

타사 노드 활용 및 스크립팅 노드를 통한 맞춤형 기능 구축으로 Proteome Discoverer 소프트웨어 프레임워크에 완전한 통합을 유지하면서 시각화, 통계 분석, 생물학적 해석 도구를 활용하여 분석 수준을 한 차원 높일 수 있습니다.

단백질체학 연구를 위한 포괄적인 도구

광범위한 데이터베이스 검색 옵션과 여러 알고리즘의 결과를 결합할 수 있는 기능을 갖춘 Proteome Discoverer 소프트웨어는 교차 검증을 통해 결과와 의사 결정에 대한 신뢰성을 향상시킵니다. 지능형 INFERYS 리스코어링으로 검색을 보완하여 펩타이드의 식별 및 정량화에 대한 신뢰도를 높입니다. DIA, DDA 또는 WWA 모드 중 데이터를 어떤 방법으로 획득하든, CHIMERYS 2.0 지능형 검색 알고리즘은 데이터를 보다 심층적으로 분석하여 고유한 펩타이드 식별 수가 크게 향상되고 단백질 커버리지를 개선하며, 정량화 기능의 확장까지 결과에 대한 새로운 이해와 견해를 발견할 수 있도록 돕습니다.

목적에 맞는 검색 엔진과 연계된 충돌 유도 해리(CID), 고에너지 충돌 유도 해리(HCD), 전자 전달 해리(ETD) 등 여러 가지 이온 충돌 기법을 지원하여 완전한 펩타이드의 염기 서열 커버리지 및 신뢰성 있는 번역 후 변형(PTM)도 식별할 수 있습니다.

맞춤형 데이터 분석 워크플로

여러 정량 분석 워크플로우를 완벽하게 지원하는 맞춤형 워크플로를 통해 데이터 분석을 자동화하고 간소화할 수 있습니다. TMT 및 TMTpro 시약 또는 기타 동위원소를 표지한 분석 데이터 처리 시, 사용한 동중원소 질량 표지 방법으로 정량 분석에서의 실험적 유연성을 제공하며, 이 외에 비표지 정량 분석에도 활용할 수도 있습니다. 연구 관리를 통해 정량화 데이터를 생물학적 정보에 매핑하고 피크 선택 및 펩타이드 정량화에 빠르고 안정적인 알고리즘을 활용하여 단백질체학의 정량분석 결과 확인 시 최대한의 정보를 추출할 수 있습니다.

분석 시 활용할 수 있도록 포함 이온 목록(inclusion list) 및 제외 이온 목록(exclusion list)을 기기 분석법으로 직접 적용할 수 있어 데이터 획득에 대한 전략적인 측면을 개선합니다. HUPO Proteomics Standards Initiative (PSI)에서 개발한 데이터 표준에 따라 신뢰할 수 있고 간편한 방법으로 데이터를 비교, 교환 및 검증할 수 있습니다.

화산 플롯 및 농축 분석
데이터 시각화
경로 맵
커뮤니티 강화 노드

 

Proteome Discoverer 소프트웨어 워크플로 툴

Proteome Discoverer 소프트웨어는 광범위한 커뮤니티 기반 노드 및 스크립트를 사용하여 신속성과 확장성을 제공하도록 설계되어, 당단백질체학, 탑-다운(Top-down) 단백질체학, PTM 분석, 교차 연결 등의 추가적인 워크플로 기능을 활용할 수 있습니다.

워크플로 툴 다운로드

CHIMERYS 지능형 검색 알고리즘 안내 동영상

Proteome Discoverer 3.1 software

 

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단백질체학 연구에 대한 지능적인 접근법

* Proteome Discoverer 3.1 소프트웨어는 2023년 9월부터 주문할 수 있습니다.

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