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차세대 시퀀싱을 위한 Ion PGM™ System
The #1 selling benchtop sequencing solution just got better
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Ion AmpliSeq™ target 기술과 Ion PGM™ System, 새로 선보이는 자동 Ion Chef™ System**까지 갖추어 하루에 샘플에서부터 유전자 패널 sequencing 분석 후 정리까지
다중 유전자 패널을 위한 최대 100% 민감도, Torrent Suite™ 소프트웨어, 개선된 변이 호출 알고리즘으로 SNP 검출에 확실한 정확성을 제공합니다.
샘플당 비용을 크게 낮추는 Ion PGM™ v2 chip과 타제품 비용의 일부에 지나지 않는 Ion PGM™ System으로 비용 부담 없는 sequencing 가능.
Ion semiconductor sequencing으로 누구나 우수한 품질의 차세대 시퀀싱을 이용할 수 있습니다.
이제 보다 많은 실험실에서 강력한 차세대 sequencing 기술을 도입해 높은 처리율과 정확성으로 보다 빠르게 답을 구하고, 샘플 준비부터 데이터 분석까지 간편한 워크플로우를 이용할 수 있습니다. Ion Torrent™ Personal Genome Machine® (PGM) System으로 인간 질병 연구자는 암과 유전 질환에서 표적 유전자 sequencing의 변이를 검출할 수 있고 미생물학자는 보다 쉽게 박테리아나 바이러스 유형을 파악하고 새로운 미생물을 분석할 수 있습니다.
미생물 sequencing 솔루션 다운로드.
가장 간편하고 빠른* 워크플로우
Ion AmpliSeq™ target 기술과 Ion PGM™ System, 그리고 새로 선보이는 Ion Chef™ System**의 완전 자동화 template 준비 기능을 모두 통합하여 유전자 패널 sequencing에 가장 간편하고 빠른* 워크플로우를 제공합니다. Chef™ System에서 제공하는 라이브러리에서 sequence에 바로 사용할 수 있는 칩을 준비하고 Ion PGM™ System에서 빠르게 sequencing을 진행할 수 있는 우수한 multiplexed Ion AmpliSeq™ DNA 패널로 타제품의 절반도 안 되는 시간에 의미있는 결과를 얻을 수 있습니다. 샘플부터 결과까지 원심분리 단계가 없고 피펫 처리 단계나 수동 작업 시간을 다른 NGS 워크플로우의 절반으로 줄였습니다.
샘플부터 결과 도출까지 전체 시간을 절반으로 단축
Ion AmpliSeq™ panel을 사용하면 전체 게놈 sequencing에서 시간이 오래 걸리는 bioinformatic 분석 없이 심도 있는 sequencing을 할 수 있습니다.
Tania Tabone, Ph. D., Postdoctoral Fellow
Cancer Council Western Australia
Pathology and Laboratory Medicine, University of Western Australia
Ion AmpliSeq™ 가 우리의 요구사항과 맞았기 때문에 Ion PGM™을 선택했습니다. 무엇보다 맞춤형 설계로 임상 연구 시장의 수요에 부합합니다. 둘째, Ion AmpliSeq™은 사용하기가 매우 편리한데 이는 NGS 경험이 많지 않은 우리 연구원들에게 매우 중요한 점입니다. 셋째, Ion PGM™으로는 Ion AmpliSeq™ panel의 데이터 분석을 쉽게 할 수 있습니다. 마지막으로 Ion AmpliSeq™은 우리가 목표로 하는 임상 연구 시장에 맞는 합리적인 가격을 제공합니다.
Zhao WeiWei, Technical Director
Kingmed Diagnostics
Guangzhou, China
다중 유전자 패널에 최고의 정확성 제공
유전자 패널 sequencing에서 확실하게 변이를 확인할 수 있는 것이 중요합니다. Torrent Suite™ 소프트웨어는 유전자 패널 sequencing 솔루션에 꼭 필요한 부분입니다. 새로운 Torrent Suite™ software v3.6은 Ion AmpliSeq™의 Ready-to-use 및 Community panel에 최적화된 개선된 변이 호출 기능을 제공하고 쉽게 조정할 수 있는 파라미터와 사전 설정된 high/ low stringency, 생식세포 및 체세포 연구 분석 모드가 있습니다.
이제 다양한 유전자 검사를 Ion PGM System에서 실시합니다. 데이터를 분석해보니 실험법에 특이도 99%, 민감도 99%, 신뢰도 99%가 나왔습니다. 직접 처리해야 하는 시간이 줄어 실험실 연구원들이 실험실의 다른 측면에 대해 고려할 여유를 갖게 되었습니다.
Jose Carlos Machado, Ph.D.
Institute of Molecular Pathology and Immunology
Faculty of Medicine at the University of Porto
Principal Investigator and Translational Research
우리는 AmpliSeq BRCA 1& 2 Panel design과 Ion PGM을 사용해 65가지 샘플을 sequencing했는데 놓치는 돌연변이가 없었습니다. 이 데이터는 Sanger의 sequencing 민감도를 보여주고 호모폴리머 영역도 처리되었습니다.
Marcel Nelen, Ph.D.
Department of Human Genetics, Laboratory of Tumor Genetics
Radboud University, Nijmegen Medical Centre
The Netherlands
1000 Genomes Project에서 수립한 인간 변이 카탈로그에 따르면 정상 인간 변이의 90% 이상이 단일 염기 다형성, 즉 SNP 때문입니다. SNP는 많은 변이를 보이는 부분입니다. Cancer Genome Atlas는 20가지 암 유형에 걸친 종양 엑솜 데이터의 대규모 데이터세트를 수립하였습니다. 4000개 이상의 샘플에서 가장 많은 20가지 암의 가장 흔한 체세포 돌연변이를 분석하여 암변이의 99% 이상이 SNP 때문이라고 관찰하였습니다.
SNP 분석에는 치환 변종에 대한 정확성이 높은 플랫폼을 사용해야 합니다. 최근 Nature Biotechnology 학술지(doi:10.1038/nbt.2522)에 따르면 우수한 Ion PGM™ 200 base sequencing kit를 사용하여 Ion PGM™ System에서 생성된 데이터가 벤치톱 시퀀서 중 치환 오류율이 가장 낮았습니다.
Torrent Suite Software v3.6의 Release Note 보기 >
최저 구입 및 운영비
이 제2세대 Ion chips은 chip 당 보다 많은 샘플을 처리하여 샘플당 비용을 크게 낮춥니다. Ion 314™ 및 Ion 316™ v2 chips의 처리량은 각각 100 Mb와 1 Gb로 10배 높아졌으며 Ion 318™ Chip 처리량은 그 2배인 2 Gb입니다. 예를 들어, Ion 318™ Chip v2에서 바코드 샘플을 사용하는 전형적인 200 amplicon Ion AmpliSeq™ panel 의 샘플당 비용은 $100입니다.
우리는 원래 Ion 314 version 1 chips당 Ion AmpliSeq BRCA 1 & 2의 임상 연구 샘플 3개를 sequensing했는데, version 2 chips을 사용해 chip 당 5개로 늘릴 수 있었습니다. 특히, 예상한 판독길이보다 많이 판독하고 판독 품질도 높아져 전반적으로 보다 많은 양을 보다 우수한 품질로 sequencing합니다.
José Luis Costa, Ph.D., Postdoctoral Fellow
Institute of Molecular Pathology and Immunology
Porto, Portugal
처음 새로운 318™ chip을 사용했을 때 매우 높은 loading coverage를 재현성있게 달성할 수 있다는 점을 확인했습니다. 그래서 일관적으로 높은 처리량을 유지해 이전보다 많은 샘플을 바코드하여 샘플당 비용을 낮출 수 있다고 생각합니다.
Dag Harmsen, M.D., Professor
Head of Research Department of Periodontology
University Hospital Münster, Germany
Ion Torrent는 누구나 비용부담 없이 sequencing을 할 수 있도록 생명과학 분야를 변화시키고 있습니다. Ion PGM™ System은 타시스템의 절반 가격인 준자동 시스템으로 이용할 수 있습니다.
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연구용으로만 사용할 수 있습니다. 진단 절차에 사용할 수 없습니다.
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.