Invitrogen Platinum SuperFi DNA Polymerase

Para maior confiança na acurácia da sequência gerada na PCR

DNA polimerase Platinum SuperFi II..é uma DNA polimerase com atividade revisora, com tecnologia hot-start, projetada para proporcionar fidelidade e especificidade superiores à PCR. Com a fidelidade >300x Taq e tampão formulado especificamente para a hibridização de primer a 60º C, a DNA polimerase Platinum SuperFi II oferece a eficiência e simplicidadenecessárias às aplicações de PCR que exigem a mais alta precisão, como clonagem, sequenciamento, e mutagênese.

Destaques

  • Precisão excepcional – Fidelidade maior que 300x Taq, como determinado pelo sequenciamento de nova geração
  • Fluxo de trabalho simplificado – Buffer formulado para hibridização de primer a 60º C (sem necessidade de uma calculadora T m)
  • Maior sucesso em PCR – Amplificação robusta de alvos ricos em GC, de DNA com impurezas e de sequências longas
  • Automação habilitada – Alta especificidade e estabilidade na bancada por 24 horas após a configuração da reação, habilitada pela tecnologia hot-start Invitrogen Platinum
  • Pipetagem reduzida – Opções de Master Mix, disponíveis corantes de carregamento direto no gel

Histórias de clientes sobre a enzima Platinum SuperFi II

Benefícios oferecidos pela DNA polimerase Platinum SuperFi II

Fidelidade >300x Taq

A DNA polimerase Platinum SuperFi II oferece o mais alto nível de confiança ao preservar a precisão da sequência de DNA com uma taxa de erro extremamente baixa. Usando o sequenciamento de nova geração, a fidelidade relativa da DNA polimerase Platinum SuperFi II foi calculada para ser de >300x aquela da polimerase de DNA Taq.

Gráfico de barras de enzimas Taq disponíveis no mercado mostrando a enzima Platinum SuperFi II com fidelidade superior a 350X em relação à enzima Taq.

Figura 1. Comparação da fidelidade entre enzimas disponíveis no mercado em relação `enzima Taq. Uma sequência de 3,9 kb foi amplificada por PCR usando diferentes polimerases de DNA, e os amplicons de PCR resultantes foram então fragmentados com uma transposase de MuA. Identificadores moleculares exclusivos (UMI), que consistem em 12  nucleotídeos aleatórios, foram introduzidos durante a fragmentação para identificar cada produto individualmente. Após o sequenciamento de nova geração, as leituras foram alinhadas na sequência correta, agrupadas por famílias UMI e os erros foram identificados. A identificação dos erros considerou apenas os que estavam presentes em todas as leituras na família UMI, os que não estavam foram descartados como erros de sequenciamento. As fidelidades da polimerase foram normalizadas em relação à Taq DNA polimerase.

Vídeo: O que é PCR de alta fidelidade?

Saiba mais sobre a fidelidade de polimerase de DNA, métodos de medição da fidelidade enzimática e benefícios da utilização de uma polimerase de DNA de alta fidelidade em PCR.

Hibridização de primer a 60º C

A formulação exclusiva do tampão Platinum SuperFi II ajuda a reduzir a trabalhosa etapa de otimização de PCR O cálculo das temperaturas de melting para a etapa de hibridização não é mais necessário com a DNA polimerase Platinum SuperFi II. A formulação inovadora do tampão permite a hibridização de primers a 60C, independetemente de suas sequências desde que sigam regras gerais de desenho de primers ( Figura 2). O tampão também permite amplificação bem-sucedida quando Tms calculados são usados na etapa de hibridização (dados não mostrados).

Gráfico de barras de enzimas Taq disponíveis no mercado mostrando a enzima Platinum SuperFi II com fidelidade superior a 350X em relação à enzima Taq.

Figura 2.A DNA polimerase Platinum SuperFi II gera produtos de PCR com alta especificidade e rendimento, seguindo a temperatura de hibridização universal a 60º C. Conjuntos de primers com temperaturas de hibridização variável foram usados para amplificar 12 alvos a partir de 50 ng de DNA genômico humano e temperatura de hibridização de 60ºC de temperatura de hibridização. O marcador de peso molecular é o Invitrogen TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder. As temperaturas de hibridização declaradas foram calculadas usando a calculadora T m para a polimerase de DNA Platinum SuperFi.

Saiba a importância da etapa de hibridização na PCR, como contornar as etapas de otimização usando um tampão de PCR especialmente formulado e os benefícios de uma temperatura de hibridização universal habilitada pelo tampão.

Protocolo universal

Devido ao seu inovador tampão de reação, a DNA polimerase Platinum SuperFi II permite uma temperatura de hibridização universal e um tempo de extensão flexível ciclagem todos os ensaios.

Diagrama ilustrando a amplificação simultânea de réplicas para 3 alvos de PCR distintos com um protocolo universal em 1 a 2 horas.
Figura 3. Economia de tempo e ciclagem simultânea permitida pelo protocolo de PCR universal. Os ensaios de PCR que utilizam reagentes de PCR convencionais requerem protocolos específicos para a amplificação de cada fragmento de DNA, devido às diferentes temperaturas de hibridização do primer e etapas de extensão, por isso, vários alvos muitas vezes não podem ser amplificados em conjunto na mesma reação de PCR. Com a DNA polimerase Platinum SuperFi II, diferentes ensaios de PCR podem ser reunidos e submetidos a ciclos usando um protocolo com uma temperatura de hibridização de primer universal e a extensão do tempo selecionada para o fragmento mais longo a ser amplificado (Figura 4).
Análise em gel de cinco fragmentos de PCR de tamanhos distintos, amplificados com a DNA polimerase Platinum SuperFi II utilizando o mesmo protocolo

Figura 4. A DNA polimerase Platinum SuperFi II permite a rrealização de ciclos simultâneos para amplicons mais curtos e longos.  Fragmentos de 0,7 kb, 2,0 kb, 4,8 kb e 14 kb foram amplificados a partir de 100 ng de DNA genômico humano usando o mesmo protocolo para todos os quatro alvos: desnaturação a 98º C por 10 s, hibridização a 60º C por 10 s, extensão de 72º C por 7 min. O tempo de extensão foi baseado no comprimento do alvo mais longo.

Carregamento direto no gel

O Platinum SuperFi II Green PCR Master Mix oferece a conveniência do Carregamento direto no gel de produtos de PCR, eliminando etapas tediosas de adição de corante a amostras de PCR e ajudando a reduzir erros de pipetagem. O tampão verde é compatível com aplicações posteriores, incluindo sequenciamento de DNA, ligação e digestão com enzimas de restrição..

Etapas diagramadas que ilustram a amplificação de um produto de PCR com o Platinum SuperFi II Green PCR Master Mix e a resolução da mistura de reação verde para marcadores azuis e amarelos.
Figura 5. O formato do master mix com tampão verde permite o carregamento direto dos produtos de PCR no gel para análise. O master mix da DNA polimerase Platinum SuperFi II está disponível em formato com tampão verde, contendo um reagente de densidade e dois corantes de rastreamento. A migração de DNA é facilmente rastreada com dois corantes (azul e amarelo) que são facilmente visíveis durante a eletroforese (as faixas para 5 e 15 min na figura à direita).

Fidelidade >300x Taq

A DNA polimerase Platinum SuperFi II oferece o mais alto nível de confiança ao preservar a precisão da sequência de DNA com uma taxa de erro extremamente baixa. Usando o sequenciamento de nova geração, a fidelidade relativa da DNA polimerase Platinum SuperFi II foi calculada para ser de >300x aquela da polimerase de DNA Taq.

Gráfico de barras de enzimas Taq disponíveis no mercado mostrando a enzima Platinum SuperFi II com fidelidade superior a 350X em relação à enzima Taq.

Figura 1. Comparação da fidelidade entre enzimas disponíveis no mercado em relação `enzima Taq. Uma sequência de 3,9 kb foi amplificada por PCR usando diferentes polimerases de DNA, e os amplicons de PCR resultantes foram então fragmentados com uma transposase de MuA. Identificadores moleculares exclusivos (UMI), que consistem em 12  nucleotídeos aleatórios, foram introduzidos durante a fragmentação para identificar cada produto individualmente. Após o sequenciamento de nova geração, as leituras foram alinhadas na sequência correta, agrupadas por famílias UMI e os erros foram identificados. A identificação dos erros considerou apenas os que estavam presentes em todas as leituras na família UMI, os que não estavam foram descartados como erros de sequenciamento. As fidelidades da polimerase foram normalizadas em relação à Taq DNA polimerase.

Vídeo: O que é PCR de alta fidelidade?

Saiba mais sobre a fidelidade de polimerase de DNA, métodos de medição da fidelidade enzimática e benefícios da utilização de uma polimerase de DNA de alta fidelidade em PCR.

Hibridização de primer a 60º C

A formulação exclusiva do tampão Platinum SuperFi II ajuda a reduzir a trabalhosa etapa de otimização de PCR O cálculo das temperaturas de melting para a etapa de hibridização não é mais necessário com a DNA polimerase Platinum SuperFi II. A formulação inovadora do tampão permite a hibridização de primers a 60C, independetemente de suas sequências desde que sigam regras gerais de desenho de primers ( Figura 2). O tampão também permite amplificação bem-sucedida quando Tms calculados são usados na etapa de hibridização (dados não mostrados).

Gráfico de barras de enzimas Taq disponíveis no mercado mostrando a enzima Platinum SuperFi II com fidelidade superior a 350X em relação à enzima Taq.

Figura 2.A DNA polimerase Platinum SuperFi II gera produtos de PCR com alta especificidade e rendimento, seguindo a temperatura de hibridização universal a 60º C. Conjuntos de primers com temperaturas de hibridização variável foram usados para amplificar 12 alvos a partir de 50 ng de DNA genômico humano e temperatura de hibridização de 60ºC de temperatura de hibridização. O marcador de peso molecular é o Invitrogen TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder. As temperaturas de hibridização declaradas foram calculadas usando a calculadora T m para a polimerase de DNA Platinum SuperFi.

Saiba a importância da etapa de hibridização na PCR, como contornar as etapas de otimização usando um tampão de PCR especialmente formulado e os benefícios de uma temperatura de hibridização universal habilitada pelo tampão.

Protocolo universal

Devido ao seu inovador tampão de reação, a DNA polimerase Platinum SuperFi II permite uma temperatura de hibridização universal e um tempo de extensão flexível ciclagem todos os ensaios.

Diagrama ilustrando a amplificação simultânea de réplicas para 3 alvos de PCR distintos com um protocolo universal em 1 a 2 horas.
Figura 3. Economia de tempo e ciclagem simultânea permitida pelo protocolo de PCR universal. Os ensaios de PCR que utilizam reagentes de PCR convencionais requerem protocolos específicos para a amplificação de cada fragmento de DNA, devido às diferentes temperaturas de hibridização do primer e etapas de extensão, por isso, vários alvos muitas vezes não podem ser amplificados em conjunto na mesma reação de PCR. Com a DNA polimerase Platinum SuperFi II, diferentes ensaios de PCR podem ser reunidos e submetidos a ciclos usando um protocolo com uma temperatura de hibridização de primer universal e a extensão do tempo selecionada para o fragmento mais longo a ser amplificado (Figura 4).
Análise em gel de cinco fragmentos de PCR de tamanhos distintos, amplificados com a DNA polimerase Platinum SuperFi II utilizando o mesmo protocolo

Figura 4. A DNA polimerase Platinum SuperFi II permite a rrealização de ciclos simultâneos para amplicons mais curtos e longos.  Fragmentos de 0,7 kb, 2,0 kb, 4,8 kb e 14 kb foram amplificados a partir de 100 ng de DNA genômico humano usando o mesmo protocolo para todos os quatro alvos: desnaturação a 98º C por 10 s, hibridização a 60º C por 10 s, extensão de 72º C por 7 min. O tempo de extensão foi baseado no comprimento do alvo mais longo.

Carregamento direto no gel

O Platinum SuperFi II Green PCR Master Mix oferece a conveniência do Carregamento direto no gel de produtos de PCR, eliminando etapas tediosas de adição de corante a amostras de PCR e ajudando a reduzir erros de pipetagem. O tampão verde é compatível com aplicações posteriores, incluindo sequenciamento de DNA, ligação e digestão com enzimas de restrição..

Etapas diagramadas que ilustram a amplificação de um produto de PCR com o Platinum SuperFi II Green PCR Master Mix e a resolução da mistura de reação verde para marcadores azuis e amarelos.
Figura 5. O formato do master mix com tampão verde permite o carregamento direto dos produtos de PCR no gel para análise. O master mix da DNA polimerase Platinum SuperFi II está disponível em formato com tampão verde, contendo um reagente de densidade e dois corantes de rastreamento. A migração de DNA é facilmente rastreada com dois corantes (azul e amarelo) que são facilmente visíveis durante a eletroforese (as faixas para 5 e 15 min na figura à direita).

Robustez oferecida pela DNA polimerase Platinum SuperFi II

A DNA polimerase Platinum SuperFi II amplifica uma ampla gama de comprimentos-alvo com alta especificidade e rendimento devido à robustez da enzima e à superior tecnologia hot-start. A tecnologia hot-start da Platinum, baseada em anticorpos, inibe a atividade enzimática até a etapa inicial de desnaturação da PCR, impedindo a amplificação não específica e a degradação do primer, ao mesmo tempo em que permite maior rendimento dos amplicons-alvo.

Análise em gel comparando a enzima Platinum SuperFi II com 3 polimerases de DNA disponíveis comercialmente e as respectivas capacidades de amplificação de fragmentos de DNA variando de 0,3 a 14 kb

Figura 6. Versatilidade em uma ampla gama de comprimentos de amplicons. A DNA polimerase Platinum SuperFi II (painel à esquerda) fornece alta especificidade e rendimento em uma faixa de fragmentos de DNA de 0,3 kb a 14 kb amplificados a partir de 100 ng de DNA. Os mesmos alvos também foram amplificados usando polimerases de DNA da concorrência: A – Merck KOD Hot Start , B – KAPA HiFi HotStart PCR Kit , C – PrimeSTAR GXL. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

A alta sensibilidade da DNA polimerase Platinum SuperFi II permite a detecção de alvos de DNA de baixa abundância com resultados precisos. A alta sensibilidade é vantajosa em experimentos onde há uma quantidade limitada de material inicial ou o DNA-alvo está em baixa concentração na amostra.

Etapas diagramadas que ilustram a amplificação de um produto de PCR com o Platinum SuperFi II Green PCR Master Mix e a resolução da mistura de reação verde para marcadores azuis e amarelos.

Figura 7. Alta sensibilidade e amplificação confiável de baixas quantidades de DNA de entrada. A DNA polimerase Platinum SuperFi II (painel à esquerda) mostra amplificação .confiável de um fragmento de 2 kb a partir de 0,4 ng, 2 ng, 10 ng, 50 ng e 250 ng de DNA genômico humano (as quantidades de DNA são indicadas acima de cada faixa). O mesmo alvo foi amplificado com polimerases de DNA da concorrência: A – PfuUltra II Fusion Hot Start, B – HotStar HiFidelity DNA Polymerase Kit, C – Expand HiFiPLUS Enzyme Blend. O número de cópias estimado é de aproximadamente 100 cópias por 0,4 ng de DNA genômico humano. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

A polimerase de DNA Platinum SuperFi II é projetada com um domínio de ligação ao DNA, resultando em alta capacidade de processamento e maior tolerância a inibidores comuns de PCR, como hemina (componente de glóbulos vermelhos), xilana (biopolímero de planta) e ácido húmico (encontrado no solo).

Gel de PCR de um fragmento de 2 kb amplificado a partir de 50 ng de DNA genômico humano em que foram adicionados ácido húmico, hemina e sal biliar

Figura 8. A DNA polimerase Platinum SuperFi II apresenta alta tolerância aos inibidores de PCR comuns. Um fragmento de DNA genômico humano de 2 kb foi amplificado a partir de 50 ng de DNA genômico humano usando a polimerase de DNA Platinum SuperFi II ou polimerases de DNA de alta fidelidade do concorrente:  A – Q5 Hot Start High-Fidelity, B – PrimeSTAR GXL, C – Merck KOD Hot Start e D – KAPA HiFi HotStart PCR Kit em misturas de reação contendo 1 – Sem inibidor, 2 – µm de ácido húmico (4 µg/mL), 3 – hemina (20 µM) ou 4 – de sal biliar (1 mg/mL). O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

A estabilidade ampliada da polimerase de DNA   Platinum SuperFi II à temperatura ambiente permite aplicações de alta produtividade. Atecnologia superior da Platinum permite que a enzima tenha estabilidade na bancada e alta especificidade.

Gel de PCR mostrando fragmento de 0,5 kb amplificado a partir de 50 ng de DNA genômico humano após 24 horas da montagem da reação à temperatura ambiente

Figura 9. As reações montadas com a DNA polimerase Platinum SuperFi II são estáveis à temperatura ambiente. Um fragmento de 0,5 kb foi amplificado a partir de 50 ng de DNA genômico humano. As reações de PCR foram montadas e deixadas e deixadas em temperatura ambiente por 0 h e 24 h antes do carregamento no termociclador ProFlex da Applied BioSystems. Mesmo após 24 horas da montagem da reação à temperatura ambiente, a polimerase de DNA Platinum SuperFi II (Lane P) produz resultados com alta especificidade e rendimento. O mesmo experimento também foi realizado com polimerases de DNA da concorrência: A – Q5 Hot Start High-Fidelity, B – KAPA HiFi HotStart PCR Kit, C – PrimeSTAR GXL. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

PCR de diferentes modelos com a polimerase de DNA Platinum SuperFi II

A DNA polimerase Platinum SuperFi II .amplifica uma ampla gama de sequências com alta de conteúdo sequencial com alta especificidade, devido à robustez da enzima e ao tampão especialmente formulado. O tampão Platinum SuperFi II permite a amplificação de alvos ricos em GC, sem a necessidade de aditivos para a denaturação do DNA.

Gel de PCR de alvos ricos AT e GC amplificados a partir de 50 ng de DNA genômico humano

Figura 10. Amplificação robusta de alvos ricos em AT e GC pela polimerase de DNA Platinum SuperFi II. Quinze alvos de teor de GC variável foram amplificados a partir de 50 ng de DNA genômico humano sem nenhum aditivo tampão suplementar que ajudasse na desnaturação do DNA. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

Gel de PCR de alvos ricos em GC (73% a 77%) amplificado de 50 ng de DNA genômico humano

Figura 11. Amplificação aprimorada de alvos ricos em GC. A DNA polimerase Platinum SuperFi II proporciona alta especificidade e rendimento de alvos difíceis, ricos em GC (painel à esquerda), sem a necessidade de aditivos para a denaturação do DNA. Quatro fragmentos ricos em GC (0,74 kb, 0,58 kb, 0,71 kb e 0,72 kb de comprimento; conteúdo de GC indicado acima) foram amplificados a partir de 50 ng de DNA genômico humano. Os mesmos alvos também foram amplificados usando polimerases de DNA da concorrência, de acordo com os protocolos recomendados pelos fabricantes para PCR rica em GC: A – Polimerase de DNA PrimeSTAR GXL, B – KAPA Kit em tampão de reação especializado para fragmentos ricos em GC HiFi HotStart PCR, C – Polimerase de DNA Merck KOD Hot Start com 10% de DMSO adicionado. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

Devido à alta capacidade de processamento e taxa de erro extremamente baixa, a DNA polimerase Platinum SuperFi II é ideal para amplificar fragmentos longos (até 20 kb) com precisão, alta produtividade e especificidade. A amplificação de alvos mais longos (até 40 kb) é possível, mas pode exigir otimização adicional, como o uso de amostras de alta qualidade (puros, frescos e intactos) e soluções frescas de primer. A redução da concentração do primer para 0,2 μm também pode melhorar os resultados.

Géis de PCR de dois alvos de 20 kb amplificados a partir de 200 ng de DNA genômico humano

Figura 12. Amplificação de fragmentos longos. A polimerase de DNA Platinum SuperFi II (lane P) amplifica com sucesso alvos de 20 kb a partir de 200 ng de DNA genômico humano. As polimerases de DNA da concorrência também foram testadas usando os mesmos conjuntos de primer: A – Q5 Hot Start High-Fidelity, B – Kit de PCR KAPA HiFi HotStart, C – Merck KOD Hot Start e D – PrimeSTAR GXL e E – PfuUltra II Fusion HotStart. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

Géis de PCR de fragmentos longos (30 kb e 40 kb) amplificados a partir de 50 ng de DNA genômico de E. coli
Figura 13. Amplificação de alvos de >20 kb. A DNA polimerase Platinum SuperFi II  (lane P) amplifica com sucesso alvos de 30 kb  e alvos de 40 kb a partir de 50 ng de DNA genômico de E.coli com sucesso. As polimerases de DNA da concorrência também foram testadas usando os mesmos conjuntos de primer: A – Q5 Hot Start High-Fidelity, B – Kit de PCR KAPA HiFi HotStart, C – Merck KOD Hot Start,  e D – PrimeSTAR GXL e  E – PfuUltra II Fusion HotStart. O marcador de peso molecular é o TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder.

Com alta especificidade e capacidade de processamento, a polimerase de DNA Platinum SuperFi II pode atuar em uma ampla gama de concentrações de amostra com o tampão fornecido, sem a necessidade de otimização significativa.

Gel de PCR de 15 fragmentos variando de 199 bp a 1,6 kbp, amplificado na mesma reação de 2,5 ng, 25 ng e 250 ng de DNA genômico humano
Figura 14. Uso da tecnologia PCR multiplex em uma vasta gama de concentrações de amostras utilizando a DNA polimerase Platinum SuperFi II. 15 alvos (99 bp; 131 bp; 160 bp; 199 bp; 251 bp; 300 bp; 345 bp; 400 bp; 516 bp; 613 bp; 735 bp; 908 bp; 1,005 bp; 1,190 bp; e 1,606 bp) foram amplificados a partir de 2.5 ng, 25 ng e 250 ng de DNA genômico humano (as quantidades de amostra são indicadas acima de cada faixa). O marcador de peso molecular é o TrackIt 100 bp DNA Ladder.

Devido à alta especificidade e tolerância do inibidor, a DNA polimerase Platinum SuperFi II possibilita a amplificação eficiente do DNA de qualidade abaixo do ideal, como de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE).

Gel de PCR de fragmento de 0,2 kb, 0,3 kb e 0,4 kb amplificado a partir de 10 g de DNA de camundongo extraído de blocos FFPE

Figura 15. Amplificação do DNA extraído de FFPE. A DNA polimerase Platinum SuperFi II amplifica com sucesso alvos de até 0,4 kb a partir de 10 ng de DNA de FFPE extraído de camundongos usando o Kit de isolamento de ácido nucléico total Invitrogen RecoverAll para FFPE. O marcador de peso molecular é o TrackIt 100 bp DNA Ladder.

Vídeo: Enzima de PCR de revisão com fidelidade ultra-alta, amplificação de longo alcance e fácil de usar.

Veja as vantagens para seu PCR feito com da DNA polimerase Invitrogen Platinum SuperFi II, entre elas, ultra fidelidade, intervalo dinâmico superior e protocolo de anelamento universal.

Diferenças entre a DNA polimerase Platinum SuperFi II e a polimerase de DNA Platinum SuperFi

A DNA polimerase Platinum SuperFi II é fornecida com um tampão de reação que é especialmente formulado com componentes isoestabilizantes. Essa composição de tampão exclusiva oferece várias vantagens: Sem necessidade de cálculo de T m para primers, amplificação mais robusta de alvos ricos em GC, amplificação aprimorada de sequências longas e protocolo de PCR universal para PCR de grande processamento (Tabela 1).

Tabela 1. Comparação da DNA polimerase Platinum SuperFi II com a polimerase de DNA Platinum SuperFi.

 Polimerase de DNA
Platinum SuperFi II
Polimerase de DNA
Platinum Super-Fi
Fidelidade (vs. Taq)>300x>300x
Tecnologia Modificação Hot-startSimSim
Calculadora de Tm necessáriaNão (hibridização de primers a 60º C)Sim
Protocolo PCR universalSimNão
Amplificação rica em GCSim (aditivo para região GC não necessário)Sim (aditivo para região GC recomendado)
Amplificação em intervalo dinâmico superiorAté 20 kb (desempenho aprimorado)Até 20 kb
Estabilidade na bancadaAté 24 hAté 24 h
Tolerância do inibidorAltoAlto
Extremidade 3’ de ampliconsExtremidade cegaExtremidade cega
Baixo nível de DNA residual certificado (por 50 μL rxn)≤1 cópia de DNA bacteriano
≤0,3 cópia de DNA humano  
≤1 cópia de DNA bacteriano
≤0,2 cópia de DNA humano

 Dados de referência das polimerases de DNA Platinum SuperFi II e Platinum SuperFi

 

Referências

Pesquisa viral

UsoReferência
Amplificação do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaBotelho-Souza LF, Nogueira-Lima, FS, Roca TP et al. (2021) Vigilância genômica do SARS-CoV-2 em Rondônia, Amazônia Ocidental Brasileira. Sci Rep 11: 3770. 
Captura de alvo e enriquecimento de pools de cDNA de SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaChoudhury Y, Cher CY, Wan ZY et al. (2021) A viral fragmentation signature for SARS-CoV-2 in clinical samples correlating with contagiousness. medRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.11.21249265 
Clonagem do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para estudos funcionaisKotaki T, Xie X, Shi PY et al. (2021) A PCR amplicon-based SARS-CoV-2 replicon for antiviral evaluation. Sci Rep 11: 2229. 
RT-PCR de genes virais de amostras de sérum humano, seguida de sequenciamento SangerLan Y, He X, Xin R (2021) Genetic characteristics of HIV-1 CRF12_BF first identified in Guangdong province, China. AIDS Res Hum Retroviruses 37(2):157–161. 
Amplificado gene do HIV-1Lugongolo MY, Manoto SL, Maphanga C et al. (2021) Label-free detection of mutations in the HIV genome using a surface plasmon resonance biosensor. SPIE BiOS https://doi.org/10.1117/12.2578317
Amplificação do genoma completo do SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaNascimento VAD, Corado ALG, Nascimento FOD et al. (2020) Caraterização genômica e filogenética de um caso importado de SARS-CoV-2 no Estado do Amazonas, Brasil. Mem Inst Oswaldo Cruz 115:e200310.
Cloning of SARS-CoV1 and SARS-CoV-2 spike variants for binding assaysStamatatos L, Czartoski J, Wan YH et al. (2021) Antibodies elicited by SARS-CoV-2 infection and boosted by vaccination neutralize an emerging variant and SARS-CoV-1. medRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.05.21251182
Clonagem de grandes fragmentos de genes virais para a montagem do genoma inteiroXie X, Lokugamage KG, Zhang X et al. (2021) Engineering SARS-CoV-2 using a reverse genetic system. Nat Protoc 16(3):1761–1784.
Clonagem do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para estudos funcionaisXie X, Muruato A, Lokugamage KG, et al. (2020) An Infectious cDNA Clone of SARS-CoV-2. Cell Host Microbe 27(5):841–848.

Pesquisa viral

UsoReferência
Amplificação do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaBotelho-Souza LF, Nogueira-Lima, FS, Roca TP et al. (2021) Vigilância genômica do SARS-CoV-2 em Rondônia, Amazônia Ocidental Brasileira. Sci Rep 11: 3770. 
Captura de alvo e enriquecimento de pools de cDNA de SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaChoudhury Y, Cher CY, Wan ZY et al. (2021) A viral fragmentation signature for SARS-CoV-2 in clinical samples correlating with contagiousness. medRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.11.21249265 
Clonagem do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para estudos funcionaisKotaki T, Xie X, Shi PY et al. (2021) A PCR amplicon-based SARS-CoV-2 replicon for antiviral evaluation. Sci Rep 11: 2229. 
RT-PCR de genes virais de amostras de sérum humano, seguida de sequenciamento SangerLan Y, He X, Xin R (2021) Genetic characteristics of HIV-1 CRF12_BF first identified in Guangdong province, China. AIDS Res Hum Retroviruses 37(2):157–161. 
Amplificado gene do HIV-1Lugongolo MY, Manoto SL, Maphanga C et al. (2021) Label-free detection of mutations in the HIV genome using a surface plasmon resonance biosensor. SPIE BiOS https://doi.org/10.1117/12.2578317
Amplificação do genoma completo do SARS-CoV-2 para sequenciamento IlluminaNascimento VAD, Corado ALG, Nascimento FOD et al. (2020) Caraterização genômica e filogenética de um caso importado de SARS-CoV-2 no Estado do Amazonas, Brasil. Mem Inst Oswaldo Cruz 115:e200310.
Cloning of SARS-CoV1 and SARS-CoV-2 spike variants for binding assaysStamatatos L, Czartoski J, Wan YH et al. (2021) Antibodies elicited by SARS-CoV-2 infection and boosted by vaccination neutralize an emerging variant and SARS-CoV-1. medRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.05.21251182
Clonagem de grandes fragmentos de genes virais para a montagem do genoma inteiroXie X, Lokugamage KG, Zhang X et al. (2021) Engineering SARS-CoV-2 using a reverse genetic system. Nat Protoc 16(3):1761–1784.
Clonagem do genoma inteiro do SARS-CoV-2 para estudos funcionaisXie X, Muruato A, Lokugamage KG, et al. (2020) An Infectious cDNA Clone of SARS-CoV-2. Cell Host Microbe 27(5):841–848.

Informações para pedidos

Polimerase de DNA Platinum Super Fi

A Invitrogen Platinum SuperFi DNA é uma polimerase de DNA com atividade revisora que combina a fidelidade superior com a confiável tecnologia hot-start Platinum, desenvolvida para fornecer o maior sucesso em PCR. Com a fidelidade >100x Taq, a polimerase de DNA Platinum SuperFi é ideal para clonagem, mutagenese e outras aplicações que se beneficiam da precisão suprema da sequência gerada.

  • Excepcional fidelidade >100x Taq
  • Alta especificidade e maior rendimento com a tecnologia hot-start Platinum
  • Amplificação robusta de alvos difíceis de amplificar, incluindo aqueles de pureza não ideal ou com conteúdo de GC ˃65%
  • Fluxo de trabalho prático com a montagem da reação à temperatura ambiente e carregamento direto no gel com o uso dos tampões verdes

 Calculadora de T m

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Todas as marcas comerciais são propriedade da Thermo Fisher Scientific e de suas subsidiárias, salvo disposição contrária. Q5 é uma marca comercial da New England BioLabs Inc. PrimeSTAR é uma marca comercial da Takara-Clontech Laboratories, Inc. Merck é uma marca comercial da Merck KGaA. KAPA HiFi HotStart é uma marca comercial da Roche Inc. HotStar é uma marca comercial da Qiagen GmbH. Roche Expand é uma marca comercial da Roche Molecular Systems Inc. PfuUltra é uma marca comercial da Agilent, Inc.

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