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Flujo de trabajo de secuenciación de Sanger
Obtenga datos de secuenciación Sanger de alta calidad con nuestro flujo de trabajo comprobado
Nuestro sencillo y rápido flujo de trabajo de secuenciación Sanger puede completarse en menos de un día laborable, desde la muestra hasta la respuesta. Thermo Fisher Scientific ofrece productos de Applied Biosystems para apoyar muchos pasos de nuestro flujo de trabajo recomendado, desde la amplificación PCR hasta el análisis de datos.
Vídeo: Vea cómo realizar la secuenciación de Sanger
Flujo de trabajo
Herramienta de diseño de primers para PCR y secuenciación de Sanger
Utilice nuestra herramienta en línea Invitrogen™ Primer Designer™ para encontrar el par de primers de secuenciación PCR/Sanger adecuado. Nuestra base de datos cuenta con aproximadamente 650 000 pares de primers prediseñados, que le premiten secuenciar el exoma humano y el genoma mitocondrial humano. Elija entre diferentes longitudes de amplicón para adaptarse a diversas aplicaciones de investigación y tipos de muestras biológicas.
- Nuestros primers son libres de SNP y dímeros conocidos, son altamente específicos y se utilizan bajo condiciones de PCR universales.
- Cobertura completa para el flujo de trabajo de confirmación de Ion Torrent™ AmpliSeq™ Exome Panel y Ion Torrent™ AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v.2 Sanger.
- Configuración de primers flexible para satisfacer sus necesidades de investigación: los primers se pueden pedir sin modificar, con cola M13, purificados por HPLC o desalinizados
- Todos los primers fueron verificados por espectrometría de masas y pasaron rigurosas métricas bioinformáticas: las pruebas de validación de banco de laboratorio mostraron una tasa de éxito >95 %
Platinum II Taq Hot-Start DNA Polymerase
Invitrogen Platinum II Taq La Platinum II Taq Hot-Start DNA Polymerase de Invitrogen lo ayuda a ejecutar las reacciones de secuenciación más rápido. Una combinación única de buffer innovador, DNA polimerasa Taq de alto rendimiento y tecnología superior Platinum Hot-Start lo ayuda a lograr resultados de PCR excepcionales, incluso en las aplicaciones más difíciles.
- El ciclado universal a 60 °C permite la amplificación de todos los ensayos, lo que reduce los tediosos pasos de optimización.
- Una Taq polimerasa de diseño permite una síntesis de DNA 4 veces más rápida, es resistente a inhibidores y genera una amplificación robusta.
- La tecnología hot start ofrece una especificidad, sensibilidad y rendimiento superiores y permite la preparación de la reacción a temperatura ambiente
- El formato de master mix 2X ayuda a reducir los errores reduciendo los pasos de pipeteo
Conozca los formatos disponibles y obtenga más información en thermofisher.com/platinumiitaq.
ExoSAP-IT Express Reactivo ExoSAP-IT Express: el método de limpieza de PCR más rápido
El reactivo ExoSAP-IT Express de Applied Biosystems ofrece tiempos de respuesta rápidos y una mayor eficiencia al mismo tiempo que proporciona la misma limpieza superior que el reactivo ExoSAP-IT original. Deseche las columnas de centrifugación, las beads magnéticas, la sedimentación, la filtración y la purificación en gel. La nueva tecnología ExoSAP-IT Express permite una reducción significativa en el tiempo de limpieza de muestras con mínima cantidad de pasos, proporcionando el flujo de trabajo más simple.
- Protocolo de 5 minutos
- Limpieza de PCR en un único tubo y en un solo paso
- Nueva tecnología enzimática
- 100% de recuperación de productos PCR
Video: Cómo limpiar las reacciones de PCR con el reactivo ExoSAP-IT Express
Kit de secuenciación BigDye Direct
El kit de secuenciación BigDye Direct de Applied Biosystems simplifica el flujo de trabajo de secuenciación estándar de Sanger al combinar la limpieza posterior a la PCR y la secuenciación en un solo paso. Este kit requiere primers de PCR con colas M13, cuya secuencia está disponible en la Herramienta Primer Designer.
Video: Secuenciación con el kit de secuenciación BigDye Direct
Kit de secuenciación BigDye Terminator v3.1
Creado por expertos y perfeccionado por equipos globales, el kit de secuenciación BigDye Terminator v3.1 ofrece una versatilidad excepcional y un alto rendimiento. Es una solución integral y exhaustiva diseñada para la secuenciación, resecuenciación y terminación de novo con productos de PCR, plásmidos, fásmidos y modelos BAC.
Mejora la calidad de los resultados y las tasas de éxito, especialmente en muestras difíciles
- Adecuado para una amplia gama de aplicaciones de secuenciación
- Optimizado para longitudes de lectura largas
- Características sofisticadas de movilidad del colorante
- Lectura de rendimiento refinada a través de regiones ricas en GT
- Balance de señal óptimo
- Finalización rápida de proyectos de secuenciación
Obtenga más información sobre el kit de secuenciación BigDye Terminator v3.1 ›
Kit de secuenciación BigDye Terminator v1.1
El kit de secuenciación BigDye Terminator v1.1 de Applied Biosystems está diseñado para aplicaciones especiales que requieren una lectura de base óptima junto al primer y para secuenciar productos de PCR cortos con módulos de ejecución de electroforesis rápida.
Obtenga más información sobre el kit de secuenciación BigDye Terminator v1.1 ›
Kit de purificación BigDye XTerminator
El kit de purificación BigDye XTerminator de Applied Biosystems proporciona un método de purificación rápido y simple para reacciones de secuenciación de DNA para eliminar terminadores y sales BigDye no incorporados. ¡No más manchas de colorante! La limpieza se completa en menos de 40 minutos y normalmente requiere menos de 10 minutos de trabajo.
Video: Cómo purificar reacciones de secuenciación con el kit BigDye XTerminator
Una gama de plataformas para satisfacer sus necesidades | ||||
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Los consumibles son componentes críticos de la ejecución de un ensayo de secuenciación. El uso de los productos de Applied Biosystems correctos puede ayudar a reducir la tasa de repetición y permitirle obtener datos reproducibles de alta calidad.
Cartucho SeqStudio
El cartucho SeqStudio de Applied Biosystems es un consumible fácil de usar que incluye capilares, polímero universal POP-1, buffer y bomba. El polímero POP-1 universal brinda flexibilidad para realizar secuenciación de Sanger y el análisis de fragmentos en el sistema SeqStudio Genetic Analyzer. Simplemente cargue las muestras, haga clic en el cartucho y listo.
Buscar otros consumibles en el instrumento
Video: Cómo configurar un ensayo de análisis de fragmentos o de secuenciación de Sanger
Software de búsqueda de variantes menores
La sensibilidad mejorada obtenida con el software gratuito Applied Biosystems Minor Variant Finder hace que la secuenciación de Sanger sea la opción ideal para oncólogos y/o patólogos que desean identificar variantes somáticas de baja frecuencia (5 % o menos), donde el número de objetivos relevantes suele ser limitado. La utilización de este software no implica ningún cambio en su flujo de trabajo de secuenciación de Sanger habitual.
Las ventajas incluyen:
- Identificar variantes menores con un nivel de detección tan bajo como 5%
- Secuenciar un número moderado de objetivos a bajo costo
- Confirmar los resultados de secuenciación de próxima generación utilizando la vista de alineación y el diagrama de Venn
Vídeo: Cómo detectar variantes menores utilizando la secuenciación de Sanger
Módulos de análisis de Sanger: herramientas gratuitas en la nube
Los módulos de análisis Sanger de Applied Biosystems son herramientas de análisis de datos secundarios innovadoras, GRATUITAS y basadas en la nube que reúnen múltiples conjuntos de datos en una ubicación conveniente. Esta solución en línea facilita la visualización, el almacenamiento y el análisis de los datos de secuenciación de Sanger.
Las características principales incluyen:
- Confirmación de secuenciación de próxima generación (NGS): una opción ideal para confirmar sus variantes de NGS
- Informe de variantes en coordenadas genómicas absolutas: elimina la necesidad de calcular a partir de la referencia
- Búsqueda automatizada en bases de dato:– informe automático de anotaciones genómicas para SNP
Obtenga más información sobre el software de secuenciación de Sanger y análisis de fragmentos ›
Sanger Sequencing Kit
The Applied Biosystems Sanger Sequencing Kit provides a convenient and affordable solution for preparing sequencing reactions. The kit provides all reagents needed for PCR cleanup, cycle sequencing, and sequencing product cleanup. Learn more ›
What makes a gold standard sequencing product?
Gold standard represents quality and dependability. We commit to quality to help ensure results you can rely on.
Learn more ›
Sanger sequencing chemistry guide
A perfect handbook for scientists and researchers using Sanger sequencing. In this chemistry guide, you will learn the basic principles of Sanger sequencing from workflow to applications.
- Sanger sequencing applications
- DNA template preparation
- Cycle sequencing
- Purification of extension products
- Capillary electrophoresis
- Data analysis
- Troubleshooting
Build your knowledge
Get bite-sized answers to your everyday Sanger sequencing and fragment analysis questions
Learn about the history of sequencing and how to pick the right platform for your research needs