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在大样本研究获得疾病分子机制的知识体系基础上,以生物医学特别是组学数据为依据,根据患者个体在基因型、表型、环境和生活方式等各方面的特异性,制订快速有效的个性化精准预防、精准诊断和精准治疗方案。
从2015 年初,奥巴马提出精准医学计划,大规模测定癌症病人的全基因组,获得大数据,挖掘癌症驱动基因,实现个性化精准用药,解决癌症对人类的威胁。2016 年初,拜登的癌症登月计划(Cancer Moonshot 2020)使精准医学计划正式落地,与此同时国内相继启动的HLPP(人类肝脏蛋白质组计划)、人类表型组计划等更是推进医疗发展精准化、数字化,其中基于高分辨质谱的蛋白质组学及代谢组学技术更是起到重要作用。
蛋白质组真正用于临床检测需要从样本前处理到获得结果的一整套简单、快速的分析流程。基于Orbitrap 开发出的临床蛋白质组检测流程,从指尖采血、到大规模自动化的样品前处理、到30 分钟的快速质谱分析、再到高通量数据处理并最终获得报告,全程只需要3 个小时,能获得300 多种蛋白的定量结果,其中包含近50 种FDA 批准的疾病标志物。相比传统免疫荧光检测方案,极大提高检测通量及速度。
图注:大样本临床蛋白质组检测流程的开发
(Cell Systems, 2016, 2: 185)
中药成分众多,且含量、理化性质差异较大,中药质量科学评价是中医药现代化亟待解决的问题。赛默飞可提供中药复杂体系检测的一站式解决方案。
中药山楂叶中的黄酮是其心血管活性的有效成分,但使用单一C18液相色谱柱的表征未能实现主要黄酮成分的有效分离,课题组尝试基于Vanquish Core设计在线二维色谱方法对此黄酮部位进行分离,以满足定性定量的需求。
色谱图结果
一维色谱图(红色标记为切入二维分析的共流出峰)
二维色谱图(从一维切到二维里的共流出峰)
“首次尝试在线二维液相色谱,将以往的研究思路进行了拓展,本次实验充分发挥了双泵的优势,经两个不同分离模式的色谱成功实现同系物的分离,对下一步研究有着重要的指导意义,Vanquish Core对于细节创新与简单易用,值得信赖。”
Vanquish Core新品延续了Vanquish系列液相充满科技感的外形,灵活配置与可扩展性受到格外的关注,与CAD检测器联用或者开发在线二维液相色谱方法或都将成为中药创新领域的重要基石。
肽图和二硫键分析作为生物药表征必不可少的项目,在保证确保药物的质量、疗效和安全方面至关重要。Orbitrap Exploris 240可以用于生物药的常规表征,仅用一种酶切即可实现抗体轻重链100%序列覆盖,高灵敏度带来高可信的低丰度翻译后修饰的鉴定结果,高分辨率带来超高的质量精度鉴定结果,Biopharma Finder对复杂数据分析轻松得到可信的链内和链间二硫键鉴定结果。
在肽图分析中需要获得高序列覆盖率,CDRs区和关键区域需要被检测到。得益于Exploris 240的高选择性、高捕获率和高灵敏度等特性,Denosumab仅用一种酶切的结果中,轻重链蛋白序列覆盖率即均达到100%,表明蛋白序列正确。
高灵敏度使得低丰度翻译后修饰能轻松被检测到,下图为低丰度的脱酰胺翻译后修饰,一级质谱提供高质量精度的结果,质量偏差小于3 ppm,通过二级谱图中特征碎片b2和b3离子对脱酰胺修饰位点定位充分确定。
比较还原和非还原Denosumab样品来确定其二硫键的连接方式,链内和链间二硫键均鉴定到,一级质量偏差均小于3 ppm。