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未来世界是数据化的世界!随着计算能力,分析能力,储存能力的高速迭代,使得对于临床样本数字化变为可能,但如何标准化、规模化地记录样本中的所有信息,构建数字样本库和疾病数据库,数据深度挖掘能力,分析稳定性等逐渐成为该概念的主要障碍。
2015年,国际上提出的“癌症登月计划”,目标就是显著降低癌症的发病率和死亡率,使癌症可被预防、可被发现、可被治疗。赛默飞依靠自身技术优势,积极推进该项目落地,在全球展开项目概念验证及应用合作,并取得积极结果。
基于Orbitrap 的DIA-MS 是最适合蛋白质组样本数字化的技术:重现性好、方法统一、定量准确度高,特别适合规模化、标准化的组织、体液、活检等临床样本的采集。
• 全部11个实验室平均可以鉴定超过8000个蛋白(1% FDR),定量超过6000个蛋白
• 1小时定量6000个蛋白,50000个肽段的超高通量下,HRMS1-DIA工作流仍能提供高于90%的准确性
注:跨国际跨实验室癌症蛋白质组学标准流程的开发
(BioRxiv, 2020)
在复杂基质中,由于代谢物含量很低,同时又有很强的背景干扰,使得传统DDA数据采集方法很难触发所有代谢物的二级信息。Acquire X智能数据采集功能,可对样品信息进行深度覆盖,收集所有代谢物的全面LC/MS数据,大幅提升数据覆盖度广度。
同时,只有高质量的数据才能获得更有意义的信息,而不是单纯的获得更多数据。质量精度越高,二级碎片越丰富,越有利于对未知代谢物进行准确鉴定。配备EASY IC离子源的Orbitrap质谱平台,可使仪器的质量精度长期保持在亚ppm级别,同时stepped NCE碎裂方式可获得相应母离子丰富的二级碎片,使得鉴定结果更加可靠。
在复杂基质中,Orbitrap高分辨质谱平台凭借超高的分辨率和质量精度,可以很好地解决准确定性的问题。
如果检测共流出的乙二唑和异吡嗪(分子量相差0.01道尔顿),三万分别率下,完全无法基线分离。只有达到12万或24万分辨率时,才可以做到彻底的基线分离,从而准确定性。只有高分辨率,才能正在在未知物定量中,避免假阴性等结果;同样,只有在定性准确的前提下,定量准确性的讨论才有意义,只有数据达到极致,方能所见差异。
制药领域对合规要求超过了其他领域,在新的监管要求下,药品企业对分析工作流程的质量控制要求变得日益严格,以确保满足数据完整性法规和原始数据归档的需求。赛默飞的变色龙色谱数据系统,能够智能化管理实验室海量数据,可以在不牺牲效率的情况下,满足实验室合规要求。在数据完整性等合规方面,变色龙色谱数据系统通过用户管理、全局性策略、归档策略以及具有时间戳的审计追踪等功能,确保实验室的数据安全性,为制药客户保驾护航。