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用于 MSI 数据分析的 TrueMark MSI 分析软件
MSI 标记物和样本的自动化调用
Applied Biosystems TrueMark MSI 分析软件专门设计用于 TrueMark MSI 检测，以便更容易进行分析和报告。
适用于 TrueMark MSI 检测法 MSI 分析的简单自动化软件
TrueMark MSI 分析软件是一款基于桌面的应用程序，可从 SeqStudio 或 3500 系列基因分析仪生成的 TrueMark MSI 检测结果中获取片段分析文件，并提供易于解读的结果分析和报告。该软件可进行实验 QC 测量，使用户可以快速确定哪些样本提供了准确的数据，以及哪些样本应该重新运行。此外，该软件还会返回所分析的每个基因座的稳定性状态，以及考虑到所有基因座的微卫星不稳定性 (MSI) 调用。最后，TrueMark MSI 分析软件利用大量正常样本来校准在这些基因座观察到的正常长度范围。该信息可用于分析样本，无需同时运行正常对照样本。这项突破性功能有助于减少 MSI 分析通常所需的时间、材料和成本。
TrueMark MSI 分析软件的功能包括：
- 自动调用标记物和样本
- QC 和审查步骤简单
- 对单个和批量标本进行简单审查
- 工作流程简单，可选择要包括在分析中的标记物并可在需要时进行手动调用
- 可将结果快速导出为多种格式 (PDF, CSV, VCF)
- 与 Oncomine Reporter 兼容，可生成清晰、简明的报告，其中总结了相关生物标记物，并提供了来自靶向治疗、指南和全球临床试验的相关信息
点击图片放大图 1.TrueMark MSI 分析软件主页屏幕，显示的是使用八份标本的一个批次。本示例在标本 ID 列中描述了阴性对照品 (Neg) 和无模板对照 (NTC) 这两种特殊样本类型，在总体调用列中描述了不同总体调用值、在审查标记列中提供了警告审查标记（黄色三角形）的一个示例，在反应孔对状态列中提供了空、匹配和无调用状态的示例。
点击图片放大图 2.TrueMark MSI 分析软件中的自定义算法可分析 MSI 状态并返回考虑所有基因座的总体调用。如果需要，可以手动检查和修改每个基因座的状态。该软件还可将肿瘤与正常样本之间的 STR 基因座进行比较，以验证匹配情况。尽管可以与正常 gDNA 同时进行比较，但不需要这样做，因为该软件经过设计能够仅分析肿瘤样本。
点击图片放大图 3.TrueMark MSI 分析软件生成的最终 PDF 报告易于解读，可用于总结 MSI 分析结果。
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仅供科研使用，不可用于诊断目的。