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发现相关的蛋白质生物标记物

蛋白质和相关分子通常是转化研究的重点。 它们在诊断标志物和疗法方面拥有巨大潜力。 转化蛋白质组学最常涉及发现潜在临床相关蛋白质标志物以及从蛋白质的阳性鉴定尽快转移到以标志物形式进行检验和验证上。 研究蛋白通路、翻译后修饰表征、蛋白质表达谱分析和蛋白质变体表征同样是转化研究的一部分。 赛默飞世尔科技科技是蛋白质研究液相色谱质谱仪解决方案领域的全球领导者。 我们的样品制备技术、仪器系统和数据分析软件可以推进蛋白质组学知识的极限。

专题视频

哈佛大学医学院的 Steven Gygi 博士介绍多通路蛋白质组学的功能及其新成立的多通路蛋白质组学中心。

剑桥大学的 Kathryn Lilley 博士探讨了蛋白质的细胞定位以及质谱法和质量标记的进展可以更全面地了解蛋白质分布和功能。


蛋白质组学:从发现到常规

转化研究的最初阶段包括假定生物标记物的发现,要求仪器和工作流程方法能够解析大量分析物并提供相对差异定量,以鉴定蛋白质和其它目标化合物。  随着研究进入生物标记物确认、检测开发和确认工作,目标分析物的数量大幅减少,而对更高灵敏度定量和样品通量的需求则成为最重要的问题。

  1. 发现——样品鉴定、表征、备选目标列表的确定、生物学解释
  2. 验证——备选(既往检测分析物的子集)目标的靶向定量,生成验证数据
  3. 确认——更大数量样品中的“已验证”备选目标的靶向定量,以解释生物学变异

进入下一阶段——为常规检测而开发的测定方法

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专题视频和网络研讨会

Eletherios Diamandis 博士和 Andrei Drabovich 博士,均来自西奈山医院和加拿大多伦多大学,讨论了转化蛋白质组学以及将生物标记物发现成果应用于癌症和其他病症诊断检测的种种困难。

发现

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转化蛋白质组学的发现阶段包括具有潜在生物标记物科学价值的丰度差异蛋白质的鉴定和表征。 采用高分辨率准确质量 (HRAM) 质谱法生成推定生物标记物的列表,之后可进行验证和确认。 Thermo Scientific™ Orbitrap Fusion™ 和 Q Exactive™ 质谱仪生成高质量、信息丰富的 HRAM 数据,供生物标记物发现之用。Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ 软件和 Pinpoint™ 软件都兼容 HRAM 数据,可极大地促进发现实验的成功。

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靶向方法开发

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推定蛋白质生物标记物的验证和确认涉及分析更少的靶向分析物,但要分析较大量的样品。 这些靶向高通量分析传统上是三重四极杆质谱仪的范围,现在可使用 Thermo Scientific™ TSQ 系列三重四极杆质谱仪进行分析,也可以使用高分辨率准确质量 Q Exactive 组合型四极杆 Orbitrap 仪器进行分析。 Thermo Scientific™ Pinpoint™ 软件经过专门设计,有助于定量数据采集并在工作流程的这一阶段中进行方法改进。

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