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作为国内专业的化学合成DNA公司之一,Invitrogen生物技术有限公司为保证质量,采购优质的原材料,引入多种高品质仪器。
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仪器设备
为了进一步保证合成质量,我们引进了多种高品质设备。合成系统中包括Invitrogen和Stanford大学共同研发生产的一种高效大通量合成仪,ABI和PE的合成仪如ABI3900, ABI394, ABI391以及PE Expidite等用于一些特殊目的的合成系统和氨解仪。质检、纯化过程中我们也投入了高精尖仪器,包括BIOTEK,HPLC,质谱仪,毛细管电泳。
纯化方法与应用指南
为了适合不同的实验要求,您可以选用以下不同的纯化方法:
应用 | 建议纯化方法(保证最小纯度) |
---|---|
常规PCR/RT-PCR | 脱盐 |
测序 | 脱盐 |
RT-PCR的第一条链cDNA合成 | 脱盐 |
PCR,引物的关键在于5'序列 (如限制性酶切位点) | 高亲和纯化/iPAGE/TON纯化 |
指定位点突变 | 高亲和纯化/iPAGE/TON纯化 |
合成文库时的第一条链cDNA合成 | 高亲和纯化/iPAGE/TON纯化 |
克隆接头的产生 | 高亲和纯化/iPAGE/TON纯化 |
凝胶迁移分析 | 高亲和纯化/iPAGE/TON纯化 |
GeneTrapper筛选 | PAGE |
PCR产物用于克隆表达研究或基因重组等 | PAGE |
全基因合成 | 建议用PAGE,熟悉后再考虑试用其他纯化方式 |
各种纯化方式的特点:
纯化方法 | 描述/优点 |
---|---|
脱盐(iDSL) | 合成完全的寡核苷酸通过高纯氨气混合水蒸汽,在高温高压下将连接在CPG上的引物切下来后通过普通相层析柱进行层析除盐 |
高亲和纯化/Cartrige纯化 | 基于特异或反向层析法,从合成好的产物中去除失败序列.提供某些应用中的全长序列,适于35个碱基以下的引物.HPLC鉴定纯度介于85-90%,毛细管电泳(Capillery Electrophoresis)鉴定纯度介于75-80%. /td> |
聚丙烯酰胺电泳(PAGE) | 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)基于尺寸和构象分离全长产物和失败序列,可以分离相差一个碱基的引物(120碱基以内),从而提供高纯度的引物. HPLC鉴定纯度大于95%甚至97%, 毛细管电泳(Capillery Electrophoresis)鉴定纯度大于85%. |
高效液相(HPLC) | 反相高效液相(HPLC)同高亲和纯化/Cartrige纯化的原理一样,可以除去失败序列或未结合的标记物.但因HPLC柱的分辨率更高,因此可以提供比高亲和纯化/Cartrige纯化纯度更高的引物.HPLC鉴定纯度大于95%, 毛细管电泳(Capillery Electrophoresis)鉴定纯度大于85%. HPLC纯化的引物会随着碱基数的增加而纯度降低,一般不适于50个碱基以上的引物 |
修饰引物种类与应用
提供多种修饰引物合成服务,种类包括:
5'修饰 | 3'修饰 | 内部修饰 |
---|---|---|
5'Phosphorylation | 3'Phosphorylation | dT-Dabcyl |
5'Biotin | 3'Biotin | dT-Bitoin |
5'Digoxigenin | 3'Digoxigenin | dT-Digoxigenin |
5'Aminolinker C6 | 3'Aminolinker C6 | dT C6-Aminolinker |
5'Aminolinker C12 | 3'Thiol C6 | Thiol-C6 S-S |
5'Thiol C6 | 3'spacer C3 | Spacer 18 |
5'FITCA | 3'FITC | Phospothioate |
5'FAM | 3'FAM | dU |
5'TET | 3'TET | dI |
5'JOE | 3'JOE | |
5'HEX | 3'HEX | |
5'TAMRA | 3'TAMRA | |
5'ROX | 3'ROX | |
5'CY-3 | 3'DABCYL | |
5'CY-5 | 3'BHQ1 | |
5'CY-3.5 | 3'BHQ2 | |
5'Thiol-C6 S-S | 3'Thiol-C6 S-S |
常用染料和荧光修饰基团
染料 | 激发光 | 发射光 | 颜色 | 摩尔消光系统 | BHQ淬灭基团选 |
---|---|---|---|---|---|
6-FAM | 495 | 520 | Yellow-green | 83,000 | BHQ-0 λmax 495nm range: 430-520nm |
Fluorescein | 495 | 520 | 83,000 | BHQ-1 λmax 534nm range: 480-580nm | |
TET | 521 | 536 | 73,000 | ||
JOE | 527 | 548 | Yellow | 71,000 | |
HEX | 536 | 556 | 73,000 | ||
CY3 | 550 | 570 | Yellow-orange | 150,000 | BHQ-2 λmax 579nm range: 550-650nm |
TAMRA | 544 | 576 | 90,000 | ||
ROX | 576 | 601 | Orange | 82,000 | |
Cy3.5 | 588 | 604 | Orange-red | 116,000 | |
Cy5 | 650 | 670 | Red | 250,000 |