为什么使用阵列断层成像进行体积电子显微镜检查?

阵列断层成像可以快速定位组织中的细胞及其相互作用伴侣。 阵列断层成像具有较大的成像视野,特别适用于研究组织的组织学。 无需对整个动物或整个器官进行超微结构分析,因此,对于可以存储和重新成像的样本,阵列断层成像可提供简单的导览。

 

通过增加自动化阵列断层成像,将 Thermo Scientific SEM 转换成体积 EM 显微镜。

小鼠大脑的阵列断层成像分析

阵列断层成像 SEM 是如何工作的?

Thermo Scientific Maps Correlative Electron Microscopy 软件 用于采集阵列断层成像的 3D 体积。当用户采用基于 SEM 的方法进行 3D 重建时,如果所选体积过大,总采集时间就可能较长,不便于实际操作。在这种情况下,能够精确识别感兴趣区域就显得特别重要。考虑到其能在高分辨率下创建大的概览,并与荧光图像相关联,Maps 能够提供 2D 图来采集目标 3D 图(例如,使用 Thermo Scientific Auto Slice & View 软件),从而更快地获得结果。 
 

此外,Maps 软件的模块化体系结构能够集成更复杂的、基于 SEM 的 3D 采集方案。Maps 软件使用户能定义切面上的多个成像区域,并可指导用户设置切片和成像参数。使用 SEM/DualBeam 系统的可选阵列断层成像插件,Maps 软件能帮助用户对 3D 重建的连续切片进行成像。


果蝇肠道的 Amira 软件渲染图

在 Helios G4 Plasma-FIB-SEM 上以 3.9 nm 分辨率记录的 80 个切片的非常大的 3D 数据集的 Thermo Scientific Amira 软件立体渲染图。 


使用阵列断层成像的科学家

“在具有阵列断层成像功能的 Maps 中,成像区域放置的切片间变异性小于 10 µm,从而大大减少了成像开销。在其他解决方案中,这种变异性可能达数百微米。以较少的开销成像,大大加快了数据获取速度,特别是在成像小的目标结构时。”

 

Narayanan 'Bobby' Kasthuri,美国芝加哥大学神经科学家

“电子显微镜分析经常较为复杂。我们附带 Maps 的阵列断层成像方案提供了较直接的电子显微镜数据分析。这有助于处理和采集大样本表面和中等体积的 EM 数据。鉴于该方法总体易于使用,我们认为它不仅可用于解决科学问题,还可作为诊断工具。” 

 

Irnia Kolotuev,EM 设施协调员,瑞士洛桑大学


阵列断层成像相关资源

用于阵列断层成像的 Maps 软件

Thermo Scientific Maps 软件是一款成像和相关工作流程软件套件,与整个 Thermo Scientific SEM、FIB SEM 和 TEM 平台产品线兼容。

方案:使用 SEM 阵列断层成像的靶向 3D EM 和相关显微镜方法

用于不对称样本和模式生物的体积阵列断层成像的优化的扫描电子显微镜工作流程。