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功能强大的多层面 2D-5D 软件，用于生命科学和生物医学科学领域显微镜成像的可视化、处理和分析
Thermo Science Amira 软件是一款功能强大、全面和多功能的 2D-5D 解决方案，用于可视化、分析和理解来自多种图像模态（包括光学和电子显微镜、CT、MRI 和其他成像技术）的生命科学和生物医学研究数据。 Amira 软件具有极其出色的速度和灵活性，支持从结构和细胞生物学到组织成像、神经科学、临床前成像和生物工程研究领域内的先进 2D-5D 生物成像工作流程。 通过任何 3D 图像数据（包括时间序列和多通道），Amira 软件提供全套数据可视化、处理和分析功能。Amira 软件供生命科学和生物医学研究人员在不同规模和任何模态下获得数据的宝贵见解。
成像数据
处理
可视化
分析
可靠
凭借功能 强大的 分割和 图像 处理能力 与工作流程以及与科学界和数千名研究人员超过 20 年 的合作， 现已证明，我们基于数字成像的工作流程为 生物医学和生命科学研究提供了 可靠解决方案。
定制
由于您的需求独一无二且不断变化，我们的软件解决方案非常灵活并且可以定制。借助我们的脚本编写界面（Python、TCL）、与 MATLAB 桥接以及编程 API，您可以扩展我们的软件解决方案并整合您自己的 IP（知识产权）。如果需要，我们的专业服务团队可以帮助设计符合您需求的独特解决方案。
帮助科学家回答实现生命科学、材料科学和工业领域的突破性发现的问题。
通过相关光电子显微镜和 Amira 软件了解癌症的复杂性
关联成像
Amira 软件长期应用于多模态成像技术，是许多研究人员处理各种成像模态数据的首选工具。Amira 架构支持从底层开始进行多体积数据处理和可视化。配备 Multi-Planar Workroom 的标准版 Amira 软件已集成自动配准工具，为较常用的自动配准指标和优化器赋予了灵活性，使其能够调整配准参数以满足您的数据需求。
膜检测
Amira 软件通过使用细胞特征（如丝状体和膜）的自动检测来加快分割。通过对冷冻断层扫描图进行高级图像分析和统计，Amira 软件将来自这些单个结构的数据结合起来，计算平均噪声并提高对比度，以创建分辨率更高的复合模型。
细胞检测
球状体是 3D 细胞培养物，比传统的细胞单层更能代表体内组织，可提高研究人员在许多应用中研究癌症、糖尿病或干细胞的能力。但是，在这种 3D 多细胞对象中进行细胞分析可能并不准确，尤其是在不破坏研究对象的情况下。Amira 软件可以自动分离细胞，并在这些球状体的 3D 图像数据中对单个细胞及其细胞核进行体积、形态和强度测量。Amira 软件还可以帮助研究人员分析传统的 2D 细胞单层。
高内涵筛选
Amira 软件支持多通道定量分析功能，以研究 HCS 中使用的较严苛的科学和实验模型，包括免疫肿瘤学、神经科学和类器官健康。Amira 软件具有极高速度和灵活性，帮助实现从结构和细胞生物学到神经元和球体形态的研究领域内的 3D 模型的先进的 2D-5D 生物成像工作流程。为了促进这些先进的分析，Amira 软件提供深度学习，以改善培训和预测，包括智能去噪功能"
多通道和时间序列可视化
借助 Amira 软件的全新 Xplore5D 扩展，生命科学家可以在一个平台上轻松地可视化、关联和处理大量多通道和时间序列数据，无需担心图像大小或存储限制。凭借其智能文件格式，Xplore5D 可以压缩所有成像数据而不丢失采集过程中收集的宝贵信息。
丝状体追踪
通过 Amira 软件，您可以使用模板匹配算法在充满噪声的 cryo-EM 或 DualBeam 数据中自动检测和追踪提取这些微细丝状体。此外，Amira 软件还供您重建纤丝网络并编辑产生的图形数据，以删除错误识别为纤丝的图像特征或添加网络的缺失部分。然后可通过测量参数（如数量、长度、厚度、方向、等级等）来定量分析纤丝的图形。可以根据重建的模型和计算出的参数创建引人注目的 3D 渲染。
关联成像
Amira 软件长期应用于多模态成像技术，是许多研究人员处理各种成像模态数据的首选工具。Amira 架构支持从底层开始进行多体积数据处理和可视化。配备 Multi-Planar Workroom 的标准版 Amira 软件已集成自动配准工具，为较常用的自动配准指标和优化器赋予了灵活性，使其能够调整配准参数以满足您的数据需求。
膜检测
Amira 软件通过使用细胞特征（如丝状体和膜）的自动检测来加快分割。通过对冷冻断层扫描图进行高级图像分析和统计，Amira 软件将来自这些单个结构的数据结合起来，计算平均噪声并提高对比度，以创建分辨率更高的复合模型。
细胞检测
球状体是 3D 细胞培养物，比传统的细胞单层更能代表体内组织，可提高研究人员在许多应用中研究癌症、糖尿病或干细胞的能力。但是，在这种 3D 多细胞对象中进行细胞分析可能并不准确，尤其是在不破坏研究对象的情况下。Amira 软件可以自动分离细胞，并在这些球状体的 3D 图像数据中对单个细胞及其细胞核进行体积、形态和强度测量。Amira 软件还可以帮助研究人员分析传统的 2D 细胞单层。
高内涵筛选
Amira 软件支持多通道定量分析功能，以研究 HCS 中使用的较严苛的科学和实验模型，包括免疫肿瘤学、神经科学和类器官健康。Amira 软件具有极高速度和灵活性，帮助实现从结构和细胞生物学到神经元和球体形态的研究领域内的 3D 模型的先进的 2D-5D 生物成像工作流程。为了促进这些先进的分析，Amira 软件提供深度学习，以改善培训和预测，包括智能去噪功能"
多通道和时间序列可视化
借助 Amira 软件的全新 Xplore5D 扩展，生命科学家可以在一个平台上轻松地可视化、关联和处理大量多通道和时间序列数据，无需担心图像大小或存储限制。凭借其智能文件格式，Xplore5D 可以压缩所有成像数据而不丢失采集过程中收集的宝贵信息。
丝状体追踪
通过 Amira 软件，您可以使用模板匹配算法在充满噪声的 cryo-EM 或 DualBeam 数据中自动检测和追踪提取这些微细丝状体。此外，Amira 软件还供您重建纤丝网络并编辑产生的图形数据，以删除错误识别为纤丝的图像特征或添加网络的缺失部分。然后可通过测量参数（如数量、长度、厚度、方向、等级等）来定量分析纤丝的图形。可以根据重建的模型和计算出的参数创建引人注目的 3D 渲染。
入门培训
通过专门为 Amira、Avizo 和 PerGeos 软件新用户设计的入门培训，缩短学习曲线，使投资收益最大化。
课程包括一个讲座及互动提问环节。培训材料重点讲述 Amira、Avizo 和 PerGeos 软件的基本特点和功能。
高级培训
通过专为 Amira、Avizo 和 PerGeos 软件的现有用户设计的高级培训使投资收益最大化并缩短取得成果的时间。
课程包括一个讲座及互动提问环节。培训材料重点讲述 Amira、Avizo 和 PerGeos 软件的高级特点和功能。
定制开发
赛默飞世尔科技在 3D 和图像处理方面拥有超过 25 年的经验，向众多小型和大型机构交付了数百个定制项目，可根据您的特定需求为您提供量身定制的解决方案。
我们可以定制和扩展我们不同级别的软件解决方案。
兽医大学 VetCore 使用 Amira 软件
"维也纳兽医大学的研究十分多样化，涵盖临床和临床前研究领域。目前有四人在成像设施中工作，为图像采集（宽视野显微镜、CLSM、转盘式共聚焦显微镜以及不久后推出的 STORM 超分辨率显微镜、显微 X 射线计算断层扫描）以及数据可视化和分析领域的研究人员提供设备和支持。Amira 软件可帮助您构建网络，实现数据对象之间的复杂交互。生物学也很复杂，生物相互作用就是复杂网络。复杂问题需要复杂工具才能应对。在这方面，在涉及复杂数据分析时，Amira 软件中使用的分析网络等超越了其他大多数软件方法。此外，我喜欢 Amira 软件的一点就是，在深度学习网络和脚本编辑（Tcl、Matlab、Python……）的集成方面，它非常开放。"
Stephan Handschuh 博士
维也纳兽医大学 VetCore
EMBL 和 DKFZ 使用 Amira 软件
本示例着重阐述了 Amira 软件在多模态相关显微镜项目中如何为德国海德堡 EMBL 和 DKFZ 的 Matthia A.Karreman 博士提供支持，帮助她在体内有效靶向单个肿瘤细胞。阅读参考论文。
视频：6 min
导入和处理您的成像数据
- 处理任何规模、任何大小及任何模态的数据：
- 生物数据格式
- 位图格式
- 显微镜：电子和光学
- 医学和神经图像格式
- 分子格式
- 其他图像采集设备（MRI、放射摄影术等）
- 有限元建模、几何建模、CAD
- 支持多数据/多视图、多通道、时间序列、超大数据
- 缩放、校准、转换、重新采样
- 图像增强、能满足各种需求的滤波和卷积、傅立叶变换
- 伪影消除算法
- 先进的多模式 2D/3D 自动配准
- 图像对齐、算术运算、相关、融合
轻松分割成像数据
- 阈值和自动分割、对象分离、自动标记
- 区域生长、活动轮廓、插值、卷绕、平滑
- 形态学处理，包括分水岭和盆地
- 基于机器学习的分割
- 自动追踪单个纤维和丝状体
- 骨架化和纤丝网络提取
- 交互式工具，用于生成或编辑分割和空间图形
- 3D 表面重建
- FEA/CFD 载网生成
导出您的分析和可视化工作以便无缝发布并演示
- 动画和视频生成
- 高级关键帧和物体动画
- 混合图像、几何模型、测量和模拟
- 注释、测量图例、柱状图和曲线图
- 导出电子表格、3D 模型和高质量图像
- 主动和被动 3D 立体视觉
- 单屏和多屏显示
- 沉浸式环境
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