Axiom 农业基因组学基因分型解决方案

Axiom 农业基因组学基因分型解决方案为育种人员和研究人员提供了强大的基因分型工具,以便高效地发现、验证、筛选植物或动物中的复杂遗传性状。本解决方案中的基因芯片包括对您来说重要的 Axiom 基因组数据库中的已测基因型的位点或从头测序获得的位点。这一完整的解决方案包括基因分型芯片、试剂盒、全自动的工作流程以及易于使用的免费数据分析工具。我们可为您定制基因分型芯片或panel,让您可以自信的开展任何高通量的行业应用,因为您所关注的所有标记都可以生产在定制化芯片上,从而被靶向检测到。

Axiom myDesign基因分型芯片

通过 Axiom myDesign 基因分型芯片,您可以为全基因组关联分析、重复性验证、精细定位和候选基因研究创建全定制或半定制基因分型芯片。此类全定制或半定制芯片可设计为包含 300 到 260 万个标记位点。芯片可支持多物种设计,且每个物种的标记数量不受限制。

Axiom 专家设计基因分型芯片

此类低/中等/高密度的基因芯片可为广泛的动植物育种和基因组学应用提供强大的性能和分辨率。此类应用包括:研究标记-性状关联性、评估骨干系、发现多系参考群体,以及全基因组分析研究应用和选择性清扫分析研究。

Axiom Analysis Suite软件

Axiom Analysis Suite软件可对多倍体和二倍体基因组数据进行自动化聚类和基因型检出。从样本和检测板质控到自动化基因型检出和 SNP 分类,本款易于使用的软件只需一步操作即可进行分析,并使您可以查看质控结果、汇总表、和 SNP 聚类图。

Axiom CNV Summary Tools软件

Axiom CNV Summary Tools软件使用强度和基因型分析,从基因分型数据中计算 log2 比率和 B 等位基因频率。本软件还包括 Affymetrix CNV Viewer模块,可以显示基因组中拷贝数的变化。

GeneTitan多通道仪器

通过将杂交炉、洗涤和最先进的成像装置组合成一台独立的台式仪器,GeneTitan 多通道 (MC) 仪器可自动完成从靶标杂交到数据生成的阵列处理。

Axiom 服务

Affymetrix 研究服务实验室配备高通量基因分型设施,可为大规模的基于基因芯片的研究提供价格合理且快速的基因分型服务。

Axiom 农业基因组学基因分型解决方案的优势:

  • 定制化内容——采用完全定制化、高性价比的 Axiom myDesign 基因分型芯片,可以对任意物种、基因组大小和倍性水平进行基因分型。格式为96 格式(可涵盖多达 650,000个SNP位点和插入/缺失位点)或 384 格式(可涵盖多达 50,000个SNP位点 和插入/缺失位点),可包含您设计的专有标记或来自于您的基因组测序数据的标记。Axiom 基因分型解决方案可在每个设计层级中包含更多内容,无需任何附加成本。

  • 100% 保真;无 SNP位点丢失——Axiom 基因分型芯片采用专利的光刻技术进行原位合成,可确保各生产批次内和批次间始终能够提供完全相同的内容
农业基因组学
  • 稳定的检测——以最少的人工干预生成稳定、可靠的基因分型结果,同时帮助降低成本和工艺复杂程度。经优化的试剂和经验证的工作流程与经实际验证的 SNP位点设计相结合,有助于产生最可靠的结果。

  • 多物种芯片——咨询生物信息学服务设计您的芯片,在一张芯片上覆盖您所选的多个物种。每个物种的标记或数量不受限制。

  • 全自动的工作流程——从靶标制备到分析,对您的样品进行端到端的自动化处理,每 96 或 384 份样品的手动操作时间通常小于 2.5 小时。端到端的自动化解决方案有助于缩短手动处理时间,最大限度避免人为操作的影响。

经简化的检测

总基因组 DNA (150 ng) 被扩增然后随机片段化为 25 至 125 碱基对 (bp) 的片段。将这些片段纯化、重悬并杂交到 Axiom 全基因组和 myDesign 芯片上。杂交之后,在严格的条件下洗涤结合的靶标以去除非特异性背景,最大限度减少因随机连接而导致的背景噪音。通过在芯片表面进行多色连接,检测每个多态性核苷酸。连接后,对芯片进行染色并在 GeneTitan MC 系统上成像。

Axiom-Genome-Wide-Genotyping-Assay

完整的工作流程解决方案

Axiom 基因分型解决方案包括使用来自 Axiom 基因组数据库的经验证的基因组内容的商品化和定制化的芯片,以及全套试剂盒、数据分析工具和采用 GeneTitan 多通道 (MC) 系统的全自动工作流程。

Axiom 全基因组基因分型检测

仅供科研使用,不可用于诊断目的。

仅供科研使用,不可用于诊断目的。