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SuperScript IV 反转录酶
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SuperScript IV 反转录酶是 Invitrogen SuperScript 系列的最新一代反转录酶。其为一种专有的 MMLV 突变体,具有更低的 RNase H 活性、更高的热稳定性以及高效合成全长 cDNA 的能力。与上一代 SuperScript 反转录酶相比,SuperScript IV 反转录酶的持续合成能力有了显著提升,即使对于具有挑战性的 RNA 样本,也能实现快速反应、高抑制剂耐受性和出色的性能。SuperScript IV 反转录酶有多种类型可供选择,适合特定的实验应用,并且在文献中被广泛引用。
SuperScript IV 反转录酶因其具有高反应效率、高灵敏度、强劲扩增能力、缩短的反应时间和高热稳定性而闻名。点击下列属性以查看支持数据。
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一款高效的反转录酶可以转录低丰度 RNA 或已降解的 RNA。SuperScript IV 反转录酶非常强劲高效,当转录已降解的 RNA 时,cDNA 得率可达其他市售反转录酶的100倍(图1)。SuperScript IV 反转录酶是 cDNA 合成的上上之选,无论使用哪种类型的 RNA;即使对于已降解或样本量非常有限的 RNA,也可获得出色结果。
图1.对于降解的 RNA 进行高效扩增。使用不同品牌的商业化反转录酶与 Applied Biosystems TaqMan Assay对来自人类细胞和植物组织的已降解 RNA (RIN 1–3) 进行 RT-qPCR。Delta Ct 值 (ΔCt = Ct – Ct SuperScript IV) 显示,SuperScript IV 反转录酶的 cDNA 得率相比 SuperScript III 和其他商业化反转录酶高达100倍,而且 Ct 值更低。
为了进行可靠的 cDNA 合成,反转录酶须具有较高的反应灵敏度和较低的变异性。 与其他反转录酶相比,SuperScript IV 反转录酶的 Ct 值减少了8个循环(图2)。针对三种不同起始量的已降解 RNA 进行三次重复 RT-qPCR 反应,结果显示 SuperScript IV 反转录酶的 Ct 值最低(减少了 8 个循环)。此外,RT-qPCR 结果的变异性也是最低,因此它可以提供出色的可重复性和可信度较高的实验结果。
即使使用彻底的RNA纯化方法,在RNA样本中仍然可能含有许多对反转录有抑制作用的化合物。这些化合物会干扰cDNA合成,导致错误的RT-PCR和RT-qPCR结果,从而对实验结果造成错误解读。反转录抑制剂包括RNA提取过程中使用的试剂,以及来自生物样本的共纯化污染物(表1)。与 Invitrogen SuperScript III和其它市售反转录酶相比,SuperScript IV反转录酶具有明显更好的抗抑制剂能力(图3)。
表 1.常见的 cDNA 合成抑制剂及其来源
抑制剂 | 来源 |
---|---|
乙醇/异丙醇、盐、酚/氯仿、去垢剂 | 样本制备 |
血红素、胆盐 | 血液,粪便 |
腐植酸、多酚、多糖 | 土壤、植物 |
福尔马林、石蜡 | FFPE |
图 3.在存在生物抑制剂或样本制备抑制剂的情况下,也能高效进行 cDNA 合成。根据实验方案,在含 oligo(dT)20 的 10 μL SuperScript IV 反转录反应中使用 0.5–10 kb RNA ladder 作为模板。同时使用其它供应商的反转录酶进行比较。在引物退火或加入反转录反应混合物之前,将抑制剂加入到 RNA 样本中。所获得的第一链 cDNA 通过碱性凝胶电泳分离,用 Invitrogen SYBR Gold Nucleic Acid Gel Stain对 cDNA 进行染色。在电泳过程中,NaOH 会水解所有 RNA,仅剩下 cDNA 可见。
SuperScript IV反转录酶是一款具有极强合成能力的RNA反转录酶,可快速完成cDNA合成,获得全长cDNA片段。图4表明,SuperScript IV反转录酶可在10分钟内合成长达9 kb的cDNA,而大多数其他市售反转录酶只能在相同的时间内合成1.5-3 kb或更短的cDNA。
图4.快速 cDNA 合成能力。根据实验方案,将 Invitrogen Millennium RNA Marker 加入含 oligo(dT) 的 10 μL SuperScript IV反转录反应体系中进行反转录。同时使用其它的反转录酶,反应时间均缩至 10 分钟。合成的第一链 cDNA 通过碱性凝胶电泳进行分离,然后用 SYBR Gold 核酸凝胶染料对 cDNA 进行染色。在电泳过程中,NaOH 会水解所有 RNA,仅剩下 cDNA 可见。
RNA 二级结构(尤其是富含 GC 的模板)会干扰 cDNA 的合成,尤其当在较低温度(低于42℃)下进行反应时。SuperScript IV反转录酶具有高热稳定性,可在 50℃ 或更高温度下进行反应,这有助于确保含复杂二级结构 RNA 模板的成功反转录(图5)。
图 5.SuperScript IV 反转录酶的高热稳定性。根据实验方案,在含 oligo(dT) 的10 μL SuperScript IV 反应体系中对 0.5–10 kb RNA ladder 进行反转录,不同之处在于反应温度在 50℃ 和 65℃ 之间变化。合成的第一链 cDNA 通过碱性凝胶电泳进行分离,然后用 SYBR Gold 核酸凝胶染料对 cDNA 进行染色。在电泳过程中,NaOH 会水解所有 RNA,仅剩下 cDNA 可见。使用 TotalLab 软件对每个反应温度下的 cDNA 条带进行量化分析。使用每个反应温度下的值除以 50°C 下的值来计算 SuperScript IV 反转录酶的活性百分比。
SuperScript IV 反转录酶有多种类型可供选择,包括:
SuperScript IV 反转录酶 | SuperScript IV VILO 预混液 | SuperScript IV 第一链 cDNA 合成系统 | SuperScript IV 一步法 RT-PCR 系统 | SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒 | SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒 | |
实验应用 | 对所有类型的 RNA 都能进行高效 cDNA 合成,包括难转录的模板 | 第一链 cDNA 合成反应预混液,用于两步法 RT-qPCR | 灵活应用于各种反应条件 | 快速、简单的 RT-PCR 实验流程 | 针对单细胞或少量 RNA 进行 cDNA 合成和预扩增 | 直接从哺乳动物细胞中合成 cDNA |
最佳反应温度 | 50–55°C | 50°C | 50–55°C | 50–55°C | 50°C | 50°C |
反应时间 | 10 min | 10 min | 10 min | 10 min | 10 min | 10 min |
可提供的规格 |
单酶可在反应配制中提供较大的灵活性:
M-MLV 反转录酶 | SuperScript II 反转录酶 | Superscript III 反转录酶 | Superscript IV 反转录酶 | |
关键属性 | 重组的 M-MLV 反转录酶,适合常规、要求不高的实验应用 | 基因工程改造的 M-MLV 反转录酶,RNase H 活性降低 | 基因工程改造的 M-MLV 反转录酶,具有更低的 RNase H 活性和更高的热稳定性 | 新一代基因工程改造的反转录酶,提供出色的 cDNA 合成性能 |
最佳反应温度 | 37°C | 42°C | 50°C | 50–55°C |
反应时间 | 50 min | 50 min | 30-50 min | 10 min |
灵敏度 | 1 ng | 1 ng | 10 pg | 10 pg |
最大 cDNA 合成长度 | 长达 7 kb | 长达 12.3 kb | 长达 12.3 kb | >12 kb |
处理已降解或含抑制剂 RNA 的能力 | 低 | 低 | 中 | 高 |
降低的 RNase H 活性 | 否 | 是 | 是 | 是 |
观看本视频,了解 SuperScript IV 反转录酶的优势。
了解 SuperScript IV 反转录酶如何在 qPCR 反应中始终保持低 Ct 值。
了解 SuperScript IV 反转录酶如何在有抑制剂的情况下同样表现出优异性能。
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SuperScript IV 酶经过基因工程改造,具有更高的热稳定性、持续合成能力和 cDNA 得率。在有抑制剂的情况下,它的性能更出色;反应缓冲液也经过优化,能够针对多种样本进行可靠的 cDNA 合成。
在合成 9 kb内 cDNA 的反应中,与 SuperScript III 反转录酶(或其他生产商的反转录酶)相比,SuperScript IV 反转录酶只需 10 分钟便能成功合成,并且得率相当(或更高)。
SuperScript IV 反转录酶在高达 56.4°C 的温度下可保持 100% 活性,在高达 65°C 的温度下可保持 70% 活性,而野生型 MMLV 反转录酶或 MMLV RNase H– 反转录酶在高于 45°C 时通常表现出非常低的活性或无活性。由于 SuperScript IV 反转录酶能够在较高的温度下发挥作用,所以它能反转录具有复杂结构的 RNA 靶标。
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