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更少的测序步骤

BigDye Direct 循环测序试剂盒是 BigDye 产品系列的最新创新产品,通过将 PCR 后纯化和循环测序合并为一个步骤,简化了行业标准 Sanger 测序工作流程。

" 极佳的试剂盒。工作流程非常简单,跳过了 PCR 后纯化步骤。单流处理可保护样本完整性和同一性,这在我们的环境中非常重要。该试剂盒经济。”

— Andrew Hadd,Asuragen, Inc. 的高级科学家。

优势

  • 数据的准确性:通过在单个试管中执行从 PCR 到毛细管电泳的所有步骤,降低引入实验差异性的可能性
  • 测序质量:在使用 POP-7™ 聚合物进行基因特异性引物测序后,读长尽可能接近一个碱基
  • 简化的测序工作流程:减少手动处理步骤,节省时间。将 M13 通用测序引物(正向和反向)整合到试剂盒中,无需采购多种试剂
  • 节省时间:使用 BigDye Direct 循环测序试剂盒,获得序列读段的速度最高可提高 40%,同时缩短手动操作时间。

BigDye Direct
循环测序试剂盒

3500 系列基因分析仪

可下载版本

1.BigDye® Direct 循环测序中包括哪些组分,组分含量是多少。 答案

 试剂盒组分和含量
P/N

BigDye® Direct
PCR 预混液

BigDye® Direct
测序混合物

BigDye Direct
M13 正向
引物

BigDye® Direct
M13 反向
引物

DNA 对照品
445868924 rxn24 rxn24 rxn24 rxn足够用于 200 rxns
4458687100 rxn100 rxn100 rxn100 rxn足够用于 200 rxns
4452688100 rxn100 rxn100 rxn100 rxn足够用于 200 rxns

 

2.在什么平台上支持 BigDye® Direct 循环测序试剂盒? 答案

仪器

OS

数据采集

3130/XLXP SP23.0 和 3.1
3500/XL(也称为 DX)Vista SP11.0
4452688XP SP23.0 和 3.1

 

辅助分析软件

版本

Seq A5.4、5.3.1 和 5.3
SeqScape2.7 和 2.6
Variant Reporter1.1 和 1.0

 

3.在什么平板规格上兼容 BigDye® Direct 循环测序试剂盒? 答案

96 孔和管(联排管或单管)。

 

4.BigDye® Direct 循环测序试剂盒的储存条件是什么? 答案

描述储存
条件
稳定性

冻融
-20°C← →环境温度

 

BigDye® Direct
PCR 预混液
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C参阅有效期 
BigDye® Direct
测序预混液
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C4 周 
BigDye® Direct
测序引物(正向/反向)
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C4 周 
对照 CEPH DNA-20°C参阅有效期N/A

*如果 BigDye Direct 循环测序试剂盒已在室温下放置 >8 小时,建议客户不要再使用该试剂盒。

 

5.在什么条件下 DNA 可在各 BigDye Direct 循环测序步骤中均保持稳定? 答案


描述储存条件稳定性
已配制 PCR 反应混合物环境条件16 h
扩增 PCR-20°C4 周
4°C16 h
已配制测序反应混合物环境条件16 h
测序产品(未纯化)-20°C4 周
4°C16 h
测序产品(BDx 纯化后)-20°C10 天
4°C10 天
环境条件16 h

 

6.客户能否将其他 PCR 混合物与 BigDye Direct 循环测序试剂盒配合使用? 答案

不可以,BigDye Direct 循环测序试剂盒的所有组分经过专门配制和优化才能够配合使用,不能与其他 PCR 预混液结合使用。

 

7.客户是否可以使用标准基因特异性 PCR 引物? 答案

不可以,客户不能使用 BigDye Direct 循环测序试剂盒的标准基因特异性 PCR 引物。要求客户使用通用引物,特别是 M13 通用引物。序列如下所示:

用于引物设计的 M13 通用序列

  • M13 正向引物序列:5’ TGTAAAACGACGGCCAGT 3’
  • M13 反向引物序列:5’ CAGGAAACAGCTATGACC 3'

 

8.客户是否可以使用标准基因特异性测序引物? 答案

不可以,客户不能使用 BigDye Direct 循环测序试剂盒的标准基因特异性测序引物。要求客户使用试剂盒中包括的 M13 通用引物。

 

9.推荐的模板 DNA 浓度(PCR 前)是多少? 答案

推荐的 DNA 浓度为 4 ng

 

10.BigDye XTerminator® 纯化试剂盒中样本的 DNA 在什么温度和时间条件下保持稳定? 答案

样本可储存在 BigDye Xterminator 纯化试剂盒中,有关储存条件,请参阅问题 #4。

 

11.与 BigDye Direct循环测序试剂盒配合使用时,最好使用新鲜的 PCR 产物,还是最好使用储存的产物?如果要进行储存,应使用什么温度条件? 答案

始终建议使用新鲜 PCR 产物,但如果需要储存,请参阅问题 #4,以了解储存条件。

 

12.样本最好进行干燥储存还是保存在 Hi-Di™ 甲酰胺中?哪种温度最合适? 答案

建议在 -20°C 下干燥储存样本。

 

13.客户是否可以稀释 BigDye Direct 循环测序试剂盒? 答案

BigDye Direct 循环测序试剂盒的配方经过优化,请在原始浓度下使用。稀释本产品将导致不良结果。

 

14.是否需要更新当前数据采集软件或辅助分析软件? 答案

客户需要下载 BigDye Direct 循环测序试剂盒安装程序来更新迁移文件。

 

15.使用什么染料组进行光谱校准? 答案

请使用 BigDye Terminator v3.1 长读测序标准品对仪器的染料组 Z 进行光谱校准。

 

16.如果出现由异常数据引起的上拉峰,可采取何种措施? 答案

建议尝试以下方法之一:
  • PCR 循环次数减少 2-3 次
  • 对受影响的样本进行重新进样
  • 通过缩短时间或降低电压优化进样参数

BigDye Direct
循环测序试剂盒

3500 系列基因分析仪

可下载版本

1.BigDye® Direct 循环测序中包括哪些组分,组分含量是多少。 答案

 试剂盒组分和含量
P/N

BigDye® Direct
PCR 预混液

BigDye® Direct
测序混合物

BigDye Direct
M13 正向
引物

BigDye® Direct
M13 反向
引物

DNA 对照品
445868924 rxn24 rxn24 rxn24 rxn足够用于 200 rxns
4458687100 rxn100 rxn100 rxn100 rxn足够用于 200 rxns
4452688100 rxn100 rxn100 rxn100 rxn足够用于 200 rxns

 

2.在什么平台上支持 BigDye® Direct 循环测序试剂盒? 答案

仪器

OS

数据采集

3130/XLXP SP23.0 和 3.1
3500/XL(也称为 DX)Vista SP11.0
4452688XP SP23.0 和 3.1

 

辅助分析软件

版本

Seq A5.4、5.3.1 和 5.3
SeqScape2.7 和 2.6
Variant Reporter1.1 和 1.0

 

3.在什么平板规格上兼容 BigDye® Direct 循环测序试剂盒? 答案

96 孔和管(联排管或单管)。

 

4.BigDye® Direct 循环测序试剂盒的储存条件是什么? 答案

描述储存
条件
稳定性

冻融
-20°C← →环境温度

 

BigDye® Direct
PCR 预混液
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C参阅有效期 
BigDye® Direct
测序预混液
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C4 周 
BigDye® Direct
测序引物(正向/反向)
-20°C参阅有效期5 个循环
4°C4 周 
对照 CEPH DNA-20°C参阅有效期N/A

*如果 BigDye Direct 循环测序试剂盒已在室温下放置 >8 小时,建议客户不要再使用该试剂盒。

 

5.在什么条件下 DNA 可在各 BigDye Direct 循环测序步骤中均保持稳定? 答案


描述储存条件稳定性
已配制 PCR 反应混合物环境条件16 h
扩增 PCR-20°C4 周
4°C16 h
已配制测序反应混合物环境条件16 h
测序产品(未纯化)-20°C4 周
4°C16 h
测序产品(BDx 纯化后)-20°C10 天
4°C10 天
环境条件16 h

 

6.客户能否将其他 PCR 混合物与 BigDye Direct 循环测序试剂盒配合使用? 答案

不可以,BigDye Direct 循环测序试剂盒的所有组分经过专门配制和优化才能够配合使用,不能与其他 PCR 预混液结合使用。

 

7.客户是否可以使用标准基因特异性 PCR 引物? 答案

不可以,客户不能使用 BigDye Direct 循环测序试剂盒的标准基因特异性 PCR 引物。要求客户使用通用引物,特别是 M13 通用引物。序列如下所示:

用于引物设计的 M13 通用序列

  • M13 正向引物序列:5’ TGTAAAACGACGGCCAGT 3’
  • M13 反向引物序列:5’ CAGGAAACAGCTATGACC 3'

 

8.客户是否可以使用标准基因特异性测序引物? 答案

不可以,客户不能使用 BigDye Direct 循环测序试剂盒的标准基因特异性测序引物。要求客户使用试剂盒中包括的 M13 通用引物。

 

9.推荐的模板 DNA 浓度(PCR 前)是多少? 答案

推荐的 DNA 浓度为 4 ng

 

10.BigDye XTerminator® 纯化试剂盒中样本的 DNA 在什么温度和时间条件下保持稳定? 答案

样本可储存在 BigDye Xterminator 纯化试剂盒中,有关储存条件,请参阅问题 #4。

 

11.与 BigDye Direct循环测序试剂盒配合使用时,最好使用新鲜的 PCR 产物,还是最好使用储存的产物?如果要进行储存,应使用什么温度条件? 答案

始终建议使用新鲜 PCR 产物,但如果需要储存,请参阅问题 #4,以了解储存条件。

 

12.样本最好进行干燥储存还是保存在 Hi-Di™ 甲酰胺中?哪种温度最合适? 答案

建议在 -20°C 下干燥储存样本。

 

13.客户是否可以稀释 BigDye Direct 循环测序试剂盒? 答案

BigDye Direct 循环测序试剂盒的配方经过优化,请在原始浓度下使用。稀释本产品将导致不良结果。

 

14.是否需要更新当前数据采集软件或辅助分析软件? 答案

客户需要下载 BigDye Direct 循环测序试剂盒安装程序来更新迁移文件。

 

15.使用什么染料组进行光谱校准? 答案

请使用 BigDye Terminator v3.1 长读测序标准品对仪器的染料组 Z 进行光谱校准。

 

16.如果出现由异常数据引起的上拉峰,可采取何种措施? 答案

建议尝试以下方法之一:
  • PCR 循环次数减少 2-3 次
  • 对受影响的样本进行重新进样
  • 通过缩短时间或降低电压优化进样参数

仅供科研使用,不可用于诊断目的。