アグリゲノミクス用 Axiom Genotyping Solution

アグリゲノミクス用 Axiom Genotyping Solution は、ブリーダーや研究者に、動植物の複雑な遺伝形質の同定、検証、スクリーニングに効果的なジェノタイピングツールを提供します。アレイには、Axiom Genomic Database から取得したジェノタイプ検証済みのコンテンツや、お客様にとって重要な de novo マーカーが搭載されています。このソリューションは、ジェノタイピングアレイ、試薬キット、完全に自動化されたワークフロー、簡便な無料のデータ解析ツールで構成されています。あらゆるハイスループット用途に対しても、ジェノタイピングアレイやパネルを当社がお手伝いさせていただくため、興味のあるマーカーはカスタムアレイ上でターゲットとして搭載することができます。

Axiom myDesign Genotyping Arrays

Axiom myDesign Genotyping Arrays では、ゲノムワイド関連解析、レプリケーション解析、ファインマッピング、および候補遺伝子解析のためにすべてをカスタマイズ、あるいは一部をカスタマイズしたジェノタイピングアレイを作製することが可能です。300 から 260 万マーカーが搭載されたすべてをカスタマイズ、あるいは一部をカスタマイズしたアレイのデザインが可能です。1 種当たりのマーカー数に制限なく、一つのアレイで複数の生物種を解析するアレイもサポートされています。

専門家によりデザインされた Axiom ジェノタイピングアレイ

動植物のブリーディングおよびゲノミクスにおいて、幅広い用途に使用できる低、中、および高密度アレイを提供します。これらの用途としては、マーカーと表現型の相関の調査、優良系統の評価、マルチライン品種の参照集団の識別や、さらにはゲノムワイド解析や選択的スイープ解析などにも用いられます。

Axiom Analysis Suite ソフトウェア

Axiom Analysis Suite は、多倍数体および 2 倍体のゲノムから得たデータの自動クラスタリングおよび遺伝子型判定を行います。このソフトウェアでは簡単に、サンプルやアレイプレートの QC 、遺伝子型判定や SNP 分類の自動出力をワンステップで解析実行でき、QC 結果、集計表、SNP クラスターグラフを確認することができます。

Axiom CNV Summary Tools ソフトウェア

Axiom CNV Summary Tools は、シグナル強度と遺伝子型を使用して、ジェノタイピングデータから log2 比と B アレル頻度を計算します。Affymetrix CNV Viewer も含まれており、ゲノム全体のコピー数変異の可視化が可能です。

GeneTitan Multi-Channel Instrument

GeneTitan Multi-Channel(MC)Instrument は、ハイブリダイゼーションオーブン、洗浄染色処理、最新の撮影装置を組み合わせて一つのベンチトップ機器にすることで、ターゲットのハイブリダイゼーションからデータ作成までのアレイ処理を自動化します。

Axiom Services

Affymetrix Research Services Laboratory(ARSL)は、マイクロアレイを使用する大規模な研究のために迅速なジェノタイピングサービスを手頃な価格で提供するハイスループットジェノタイピング施設です。

アグリゲノミクス用 Axiom Genotyping Solution では、以下を提供します。

  • カスタマイズ可能なコンテンツ—コストパフォーマンスが高く完全にカスタマイズ可能な Axiom myDesign Genotyping Array は、 96 アレイレイアウト(最大 650,000 のSNP およびindel)または 384 アレイレイアウト(最大 50,000 の SNP および indel)上で、あらゆる種、ゲノムサイズ、または倍数性レベルの遺伝子型判定を行うことが可能です。ここには、個々のゲノム配列決定プロジェクトにより得た独自のマーカーを入れることができます。Axiom Genotyping Solution では、各設計階層内で追加費用なく、より多くのコンテンツを提供します。

  • 100%のフィデリティ、SNP の欠損なし—Axiom ジェノタイピングアレイは製造バッチ間で毎回全く同じ製品を提供できるよう、独自のフォトリソグラフィー技術を使用して合成されます。
アグリゲノミクス
  • 安定したアッセイ—ユーザーによる判断を必要最小限として、安定した信頼性の高い遺伝子型を判定を行います。コストと処理の複雑さの低減にも役立ちます。事前に最適化された試薬と検証済みのワークフローを用いてバリデートされた SNPs で、最も信頼性の高い結果を提供します。

  • 複数生物種アレイBioinformatics Services でコンサルティングされた後、お客様が選択した複数の生物種に対するアレイをひとつのアレイ上に設計します。一つの種当たりのマーカー数に制限はありません。

  • 完全に自動化されたワークフロー — ターゲットの調製から解析までのすべてを自動化して、96 サンプルまたは 384 サンプルを 2.5 時間以内の作業時間で処理します。この徹底した自動化ソリューションは、実際にかかる作業時間を短縮し、ユーザー介入を最低限に抑えます。

能率的なアッセイ

全ゲノム DNA(150 ng)を増幅し、ランダムに 25 ~ 125 塩基対(bp)のフラグメントをフラグメント化します。このフラグメントを精製し、再懸濁し、Axiom Genome-Wide および myDesign アレイプレートにハイブリダイズします。ハイブリダイゼーション後、無作為なライゲーションにより生じるバックグラウンドを最小限に抑えるために、結合したターゲットを厳重な条件下で洗浄して非特異的なバックグラウンドを除去します。各塩基多型をアレイ表面でのマルチカラーライゲーションを通じて照会します。ライゲーション後、GeneTitan MC Instrument でアレイを染色し、画像を取得します。

Axiom-Genome-Wide-Genotyping-Assay

包括的なワークフローソリューション

Axiom Genotyping Solution には、Axiom Genomic Database から得たバリデーション済みのゲノムコンテンツで事前設計されカスタマイズされたアレイプレートに加え、完全な試薬キット、データ解析ツール、GeneTitan Multi-Channel(MC)Instrument を利用する完全自動化ワークフローが含まれています。

Axiom Genome-Wide Genotyping Assay

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.