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アグリゲノミクス用 Axiom Genotyping Solution は、ブリーダーや研究者に、動植物の複雑な遺伝形質の同定、検証、スクリーニングに効果的なジェノタイピングツールを提供します。アレイには、Axiom Genomic Database から取得したジェノタイプ検証済みのコンテンツや、お客様にとって重要な de novo マーカーが搭載されています。このソリューションは、ジェノタイピングアレイ、試薬キット、完全に自動化されたワークフロー、簡便な無料のデータ解析ツールで構成されています。あらゆるハイスループット用途に対しても、ジェノタイピングアレイやパネルを当社がお手伝いさせていただくため、興味のあるマーカーはカスタムアレイ上でターゲットとして搭載することができます。
Axiom myDesign Genotyping Arrays では、ゲノムワイド関連解析、レプリケーション解析、ファインマッピング、および候補遺伝子解析のためにすべてをカスタマイズ、あるいは一部をカスタマイズしたジェノタイピングアレイを作製することが可能です。300 から 260 万マーカーが搭載されたすべてをカスタマイズ、あるいは一部をカスタマイズしたアレイのデザインが可能です。1 種当たりのマーカー数に制限なく、一つのアレイで複数の生物種を解析するアレイもサポートされています。
動植物のブリーディングおよびゲノミクスにおいて、幅広い用途に使用できる低、中、および高密度アレイを提供します。これらの用途としては、マーカーと表現型の相関の調査、優良系統の評価、マルチライン品種の参照集団の識別や、さらにはゲノムワイド解析や選択的スイープ解析などにも用いられます。
Axiom Analysis Suite は、多倍数体および 2 倍体のゲノムから得たデータの自動クラスタリングおよび遺伝子型判定を行います。このソフトウェアでは簡単に、サンプルやアレイプレートの QC 、遺伝子型判定や SNP 分類の自動出力をワンステップで解析実行でき、QC 結果、集計表、SNP クラスターグラフを確認することができます。
Axiom CNV Summary Tools は、シグナル強度と遺伝子型を使用して、ジェノタイピングデータから log2 比と B アレル頻度を計算します。Affymetrix CNV Viewer も含まれており、ゲノム全体のコピー数変異の可視化が可能です。
GeneTitan Multi-Channel(MC)Instrument は、ハイブリダイゼーションオーブン、洗浄染色処理、最新の撮影装置を組み合わせて一つのベンチトップ機器にすることで、ターゲットのハイブリダイゼーションからデータ作成までのアレイ処理を自動化します。
Affymetrix Research Services Laboratory(ARSL)は、マイクロアレイを使用する大規模な研究のために迅速なジェノタイピングサービスを手頃な価格で提供するハイスループットジェノタイピング施設です。
全ゲノム DNA(150 ng)を増幅し、ランダムに 25 ~ 125 塩基対(bp)のフラグメントをフラグメント化します。このフラグメントを精製し、再懸濁し、Axiom Genome-Wide および myDesign アレイプレートにハイブリダイズします。ハイブリダイゼーション後、無作為なライゲーションにより生じるバックグラウンドを最小限に抑えるために、結合したターゲットを厳重な条件下で洗浄して非特異的なバックグラウンドを除去します。各塩基多型をアレイ表面でのマルチカラーライゲーションを通じて照会します。ライゲーション後、GeneTitan MC Instrument でアレイを染色し、画像を取得します。
Axiom Genotyping Solution には、Axiom Genomic Database から得たバリデーション済みのゲノムコンテンツで事前設計されカスタマイズされたアレイプレートに加え、完全な試薬キット、データ解析ツール、GeneTitan Multi-Channel(MC)Instrument を利用する完全自動化ワークフローが含まれています。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
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