Thermo Scientific PEPotec SRM ペプチドライブラリーは、完全合成の粗ペプチドで、定量的質量分析（MS）ワークフローにおけるmid～highスループットの単一反応モニタリング（SRM）と多重反応モニタリング（MRM）アッセイ開発のためにカスタマイズされたものです。プロテオーム、サブプロテオームおよびタンパク質パスウェイの研究では、多くの場合SRMおよびMRMアッセイの同定および検証に依存した定量的MS分析を必要になります。PEPotec * SRMペプチドライブラリーは、定量的MSのアプローチの開発において利便性と柔軟性を提供し、またMS実験の準備時間を短縮して、生物学的アッセイを加速します。これらのペプチドライブラリーは、SRMAtlasプロジェクトへの参加により開発されたもので、全ヒトプロテオームのマッピングを試みています。

標準サービスでは C末端アミノ酸として、アルギニン（R）またはリシン（K）のいずれかを有するペプチドを提供します。これはSRMアッセイ開発に用いられる最も一般的なトリプシンプロテオタイピックペプチドに相当します。標準的な最大ペプチド長は25アミノ酸ですが、この長さは随意に30アミノ酸に増やすことが可能です。それにより、信頼できるSRM分析への適合性を持つ潜在的なproteotypicペプチドの大部分が確実にカバーされます。

図 1。 質量分析法による標的アッセイ開発。 標的定量の重要なステップは、標的ペプチドの絶対定量のための十分なシグナル強度を有する、シーケンス特異的またはユニークな標的ペプチドを同定することです。 このステップは、ペプチドおよびスペクトルのデータベース検索や計算的予測(in silico)の​​組み合わせで始まり、Thermo Scientific Pinpoint Softwareなどの特定のプログラムを用いて、複数の目的のタンパク質に対応する潜在的ペプチドの最初のリストを識別します。 粗ペプチドライブラリーは、液体クロマトグラフィー質量分析（LCMS）による候補ペプチドのスクリーニングのために合成されます。 結果を分析して、LCおよびMSワークフローを最適化し、ターゲットの定量に最適なproteotypicなシーケンスを同定します。 これらのシーケンスを用いて、 LCMSによる絶対標的定量のために、同位体標識された「重」ペプチドを調製します。

最低注文サイズは24ペプチドです。修飾（オプションサービス）により、リン酸化、カルバミドメチル化および重アミノ酸での標識などの追加の柔軟性が提供されます。

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Prakash、A., et al. (2009)。Expediting the development of targeted SRM Assays:Using data from shotgun proteomics to automate method development.J Proteome Res8(6):2733-9。