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精准医疗科学中心 (PMSC) 与健康和科学创新者合作,加速他们的科研到临床应用之旅。 该中心使用最先进的组学技术,帮助合作者开发分析工作流程,以生成精确的患者分子图谱和知识,并最终用于改善供体预后。
除了可以获取行业最先进的分析技术,PMSC 科学家还可以补充围绕标准协议开发的专门知识,所有努力都是为了帮助合作者快速从生物标记物发现进入检测开发。 PMSC 的目标是:基于标准化工作流程和创新的分析功能,加速精准医疗项目的研发。
PMSC 体现了 Thermo Fisher Scientific 的承诺:提供分析仪器、相关技术和专业知识,扩展整个多组学范围,将生成的数据与临床研究观察结合使用时,可以揭示系统生物学在个体水平上的复杂性。 此承诺以及以更低成本实现更好患者预后的承诺即 Thermo Fisher 对精准医疗的定义。
“对于健康和科学创新者,生物标记物发现与其在护理方面的广泛应用之间存在瓶颈。 PMSC 的使命是打破瓶颈,帮助科学家和医学科学家加速从发现进入临床应用的过程。 我们的合作将组学相关技术的范围从下一代测序扩展到质谱,我们与合作伙伴通力协作,帮助他们开发标准化和可重现的协议和新检测,可以广泛且可靠地用于精准医疗。” – Emily Chen,PMSC 资深总监
PMSC 使用下一代技术,可进行基因组、蛋白质组和代谢组分析。 从使用测序仪生成基因组数据,到使用先进的质谱技术分析蛋白质和代谢物,合作者可以快速从研究进入临床工作流程开发。 借助 PMSC 的支持,合作者可以:
Van Eyk 博士是希德斯-西奈医疗中心医学部教授,芭芭拉·史翠珊女性健康中心基础科学研究部主任,以及新成立的高级临床生物系统研究所主任(最近离开约翰·霍普金斯大学加入该研究所)。 她最近成为 Cedars Sinai Precision Health 的联合主任,重点研究医疗保健的院内和种群个体化。 Van Eyk 博士是临床蛋白质组学领域的国际领军人物,她的实验室重点研究开发面向从头发现和更大规模的定量质谱分析方法的技术渠道。
这包括多反应监测(MRM,又称为 SRM)和最新的数据非依赖性采集。 众所周知,她的实验室生成的数据具有极高的技术品质,向关键的临床问题应用这些数据时实施严格的质量控制(使用严谨的 %CV)。 其目标是最大化通量和再现性,以便将靶向和强大的发现方法引入大种群健康连续评估以及集中于脑和心血管疾病的临床等级分析。
PMSC 与 Van Eyk 医生合作开发血浆蛋白质组学工作流程,包含从样品制备到使用基于质谱的技术可靠地定量分析数百种血浆蛋白质。 此合作可促进开发基于质谱的高度多重检测,用于分析靶向生物标记物。
PMSC 的工作人员由内部科学家团队组成,他们具有不同的背景,包括生物化学、质谱、分子生物学和数据科学。 该团队不断壮大,并与合作者密切协作,推动其举措从概念进入成功执行。
Emily 负责监督 PMSC 的所有活动和合作。 在加入 Thermo Fisher 担任该职位之前,她是哥伦比亚大学医疗中心蛋白质组学共享资源部主任。 Emily 致力于挖掘精准医疗在医疗行业的潜能,尤其是进一步简化并更加可行地通过各种方式将科学知识引入临床环境,证明它们可以改善预后并可普遍提高效率。 她个人热衷于利用科学克服长期存在的挑战并解决与人类健康和福利有关的大问题。
Yue 主导多项 PMSC 合作,与科学家密切合作开展与蛋白质组学图谱分析和定量分析工作流程开发相关的项目。 她最近的工作包括与美国国家癌症研究所开展“癌症登月计划”。 在加入 PMSC 之前,Yue 在质谱领域深耕12年之久,曾开发出最先进的蛋白质组学和生物制药学蛋白质表征应用。 她坚信我们正在快速进入多组学驱动精准医疗的时代,并期待看到合作者的发现进入临床环境。
Dave 是开发和部署血浆、尿液、外排体和福尔马林固定石蜡包埋组织样本的生物标记物图谱分析和定量分析工作流程的专家。 在加入 Thermo Fisher 之前,他是哈佛遗传与基因组学合作伙伴中心的蛋白质组学实验室主任,负责管理能源部、美国全国癌症研究所以及新英格兰地区生物防御和新发传染病卓越中心的项目。 Dave 认为我们还需要了解更多关于疾病背后的生物学知识,PMSC 目前开展的精准医疗工作将显著改善我们的整体理解。
Sebastien 通过专注于改善蛋白质组学分析工作流程,重点是面向临床可行的靶向蛋白质检测板的靶向分析,为 PMSC 合作者提供支持。 他之前供职于卢森堡临床蛋白质组学研究中心,重点开发新的质谱相关方法,为临床研究应用提供支持。 Sebastien 乐于看到精准医疗在引导治疗决策方面的潜能,该决策基于通过基于组学方法,尤其是蛋白质组学获得的个体分子图谱。
Sarah 将其 Ion Torrent 技术方面的专门知识引入 PMSC,使合作者能够对患者样本进行基因组学检查。 之前她是 Thermo Fisher 临床测序部门的研发科学家,曾为 Ion Torrent 平台开发了文库制备和测序化学方法。 她过去8年时间都在设计测序工作流程,以解决临床和基础生物学问题。 当基因组、转录组和蛋白质组数据结合使用时可测定表型和机制时,Sarah 很高兴看到精准医疗对患者预后的强大影响。
PMSC 的创新技术、解决方案和专门知识有助于加速精准医疗的研究和产品/工作流程开发,使合作者能够快速从研究和发现进入临床试验。 研究技术包括最先进的质谱法和下一代测序仪器,可支持多种工作流程,比如非标记蛋白质组图谱分析和定量以及串联质量标签复用。
可靠、临床相关生物标记物的发现推动了临床和转化研究。 其目标是尽快从阳性鉴定发现进入验证和确认。 缩小从发现到验证及确认的差距需要高性能的仪器和软件,以及基于质谱的生物标记物发现和用于生物标记物验证的方法开发的能力。 这些都是 PMSC 为合作者带来的优势。
下一代测序 (NGS) 可以对 DNA 或 RNA 样本中的碱基对进行快速测序。 PMSC 可以支持各种应用,包括基因表达谱分析、染色体计数、检测表观遗传变化和分子分析,它们都有助于促进发现和实现未来的个体化医学。
质谱法和下一代测序相结合,给合作者创造了更多的可能性。 随着包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学在内的“组学”技术的来临,分子图谱分析获得快速发展。 这些分析方法的组合使临床医生能够理解健康和患病个体之间的生物进程差异,以及对健康监测、预防和精准医疗有价值的信息。
PMSC 致力于帮助合作者使用跨越整个多组学范围的分析、研究技术,生成的数据与临床研究观察结合使用时,可以揭示系统生物学在个体水平上的复杂性。 对标准化的需求推动 PMSC 完成所有工作,加速基于标准协议和质量控制以及再现性的精准医疗的研发,所以医疗专业人员可以依赖任何地方生成和分析的组学数据。
仅供研究使用。 不可用于诊断操作。
通过适合临床研究的靶向方法开发,PMSC 将重点放在帮助合作者开发包含生物标记物发现在内的工作流程。
迄今为止开发的分析工作流程中,非标记蛋白质组图谱分析和定量以及串联质谱标签复用旨在提供再现性和标准化。
仅供研究使用。 不可用于诊断操作。
前体水平定量是非标记定量的新标准。 使用此方法可减少缺失的定量值,以提供完整定量。 此工作流程可为大样本组提供再现性和准确性,旨在提高灵活性,为蛋白质组学和临床研究领域提供最佳服务。
串联质量标签 (TMT) 工作流程是一种大规模多重定量蛋白质组学方法,使用等量异位标签或标记实现高通量定量筛选。 它是蛋白质组学中最精确和可重现的定量工作流程。
PMSC 使用下一代技术,可进行基因组、蛋白质组和代谢组分析。 从使用测序仪生成基因组数据,到使用先进的质谱技术分析蛋白质和代谢物,合作者可以快速从研究进入临床工作流程开发。 借助 PMSC 的支持,合作者可以:
Van Eyk 博士是希德斯-西奈医疗中心医学部教授,芭芭拉·史翠珊女性健康中心基础科学研究部主任,以及新成立的高级临床生物系统研究所主任(最近离开约翰·霍普金斯大学加入该研究所)。 她最近成为 Cedars Sinai Precision Health 的联合主任,重点研究医疗保健的院内和种群个体化。 Van Eyk 博士是临床蛋白质组学领域的国际领军人物,她的实验室重点研究开发面向从头发现和更大规模的定量质谱分析方法的技术渠道。
这包括多反应监测(MRM,又称为 SRM)和最新的数据非依赖性采集。 众所周知,她的实验室生成的数据具有极高的技术品质,向关键的临床问题应用这些数据时实施严格的质量控制(使用严谨的 %CV)。 其目标是最大化通量和再现性,以便将靶向和强大的发现方法引入大种群健康连续评估以及集中于脑和心血管疾病的临床等级分析。
PMSC 与 Van Eyk 医生合作开发血浆蛋白质组学工作流程,包含从样品制备到使用基于质谱的技术可靠地定量分析数百种血浆蛋白质。 此合作可促进开发基于质谱的高度多重检测,用于分析靶向生物标记物。
PMSC 的工作人员由内部科学家团队组成,他们具有不同的背景,包括生物化学、质谱、分子生物学和数据科学。 该团队不断壮大,并与合作者密切协作,推动其举措从概念进入成功执行。
Emily 负责监督 PMSC 的所有活动和合作。 在加入 Thermo Fisher 担任该职位之前,她是哥伦比亚大学医疗中心蛋白质组学共享资源部主任。 Emily 致力于挖掘精准医疗在医疗行业的潜能,尤其是进一步简化并更加可行地通过各种方式将科学知识引入临床环境,证明它们可以改善预后并可普遍提高效率。 她个人热衷于利用科学克服长期存在的挑战并解决与人类健康和福利有关的大问题。
Yue 主导多项 PMSC 合作,与科学家密切合作开展与蛋白质组学图谱分析和定量分析工作流程开发相关的项目。 她最近的工作包括与美国国家癌症研究所开展“癌症登月计划”。 在加入 PMSC 之前,Yue 在质谱领域深耕12年之久,曾开发出最先进的蛋白质组学和生物制药学蛋白质表征应用。 她坚信我们正在快速进入多组学驱动精准医疗的时代,并期待看到合作者的发现进入临床环境。
Dave 是开发和部署血浆、尿液、外排体和福尔马林固定石蜡包埋组织样本的生物标记物图谱分析和定量分析工作流程的专家。 在加入 Thermo Fisher 之前,他是哈佛遗传与基因组学合作伙伴中心的蛋白质组学实验室主任,负责管理能源部、美国全国癌症研究所以及新英格兰地区生物防御和新发传染病卓越中心的项目。 Dave 认为我们还需要了解更多关于疾病背后的生物学知识,PMSC 目前开展的精准医疗工作将显著改善我们的整体理解。
Sebastien 通过专注于改善蛋白质组学分析工作流程,重点是面向临床可行的靶向蛋白质检测板的靶向分析,为 PMSC 合作者提供支持。 他之前供职于卢森堡临床蛋白质组学研究中心,重点开发新的质谱相关方法,为临床研究应用提供支持。 Sebastien 乐于看到精准医疗在引导治疗决策方面的潜能,该决策基于通过基于组学方法,尤其是蛋白质组学获得的个体分子图谱。
Sarah 将其 Ion Torrent 技术方面的专门知识引入 PMSC,使合作者能够对患者样本进行基因组学检查。 之前她是 Thermo Fisher 临床测序部门的研发科学家,曾为 Ion Torrent 平台开发了文库制备和测序化学方法。 她过去8年时间都在设计测序工作流程,以解决临床和基础生物学问题。 当基因组、转录组和蛋白质组数据结合使用时可测定表型和机制时,Sarah 很高兴看到精准医疗对患者预后的强大影响。
PMSC 的创新技术、解决方案和专门知识有助于加速精准医疗的研究和产品/工作流程开发,使合作者能够快速从研究和发现进入临床试验。 研究技术包括最先进的质谱法和下一代测序仪器,可支持多种工作流程,比如非标记蛋白质组图谱分析和定量以及串联质量标签复用。
可靠、临床相关生物标记物的发现推动了临床和转化研究。 其目标是尽快从阳性鉴定发现进入验证和确认。 缩小从发现到验证及确认的差距需要高性能的仪器和软件,以及基于质谱的生物标记物发现和用于生物标记物验证的方法开发的能力。 这些都是 PMSC 为合作者带来的优势。
下一代测序 (NGS) 可以对 DNA 或 RNA 样本中的碱基对进行快速测序。 PMSC 可以支持各种应用,包括基因表达谱分析、染色体计数、检测表观遗传变化和分子分析,它们都有助于促进发现和实现未来的个体化医学。
质谱法和下一代测序相结合,给合作者创造了更多的可能性。 随着包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学在内的“组学”技术的来临,分子图谱分析获得快速发展。 这些分析方法的组合使临床医生能够理解健康和患病个体之间的生物进程差异,以及对健康监测、预防和精准医疗有价值的信息。
PMSC 致力于帮助合作者使用跨越整个多组学范围的分析、研究技术,生成的数据与临床研究观察结合使用时,可以揭示系统生物学在个体水平上的复杂性。 对标准化的需求推动 PMSC 完成所有工作,加速基于标准协议和质量控制以及再现性的精准医疗的研发,所以医疗专业人员可以依赖任何地方生成和分析的组学数据。
仅供研究使用。 不可用于诊断操作。
通过适合临床研究的靶向方法开发,PMSC 将重点放在帮助合作者开发包含生物标记物发现在内的工作流程。
迄今为止开发的分析工作流程中,非标记蛋白质组图谱分析和定量以及串联质谱标签复用旨在提供再现性和标准化。
仅供研究使用。 不可用于诊断操作。
前体水平定量是非标记定量的新标准。 使用此方法可减少缺失的定量值,以提供完整定量。 此工作流程可为大样本组提供再现性和准确性,旨在提高灵活性,为蛋白质组学和临床研究领域提供最佳服务。
串联质量标签 (TMT) 工作流程是一种大规模多重定量蛋白质组学方法,使用等量异位标签或标记实现高通量定量筛选。 它是蛋白质组学中最精确和可重现的定量工作流程。