Mass Spectral Libraries

通过库和信息存量鉴定更多化合物

质谱谱图库和数据库提供了自动分析大量 MSn 数据和鉴定多种小分子化合物的机会,同时将研究中的信息转化为为更常规的定量应用。然而,分析者需要确证未知物质鉴定结果,这意味着谱库、数据库和信息存量必须包含高质量、准确的数据。

进一步了解如何为未知物质鉴定提供置信度,即使在谱库中没有找到匹配,或者了解如何整理自己的高质量谱库以分享您的知识。

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受欢迎的小分子未知物质分析软件


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了解高分辨率质谱库在应对小分子未知物质表征的挑战上带来的优势,以及强大的数据分析工具如何充分利用这些谱库。

利用全面的高分辨率 MS/MS 和多级 MSn 质谱,结合大量元数据,世界上较大(就每个化合物的总谱图和数据而言)和最广泛的精选质谱谱图库可提供强大的未知物质鉴定功能。

对每个质谱图都进行了过滤、重新校准、平均和完全结构注释。除了这些高质量数据,每个 MSn 碎片质谱都是在各种碰撞能量下获得的,包括多种加合态,包括碰撞诱导和更高能量的碰撞解离。与 mzLogic 结合使用时,mzCloud 的强大功能更加明显。

访问 mzCloud

主要优点

未知物质鉴定的可靠性了解更多未知物质从质谱数据获知结构信息从研究和常规应用的灵活性
所有质谱库谱图的全面整合,具有广泛、完全注释和可搜索的碎裂谱图,为您的结果提供可靠性。针对不同化学结构的大量碎裂谱图,利用自动去卷积和谱图库检索鉴定未知物质,从而实现小分子应用。通过直接注入或 LCMS,常规或高分辨率数据的解决方案,即使没有谱库匹配,您也可以确信 MSn 谱图将为您提供可使用的结果。 mzCloud.org上免费在线搜索,或通过 Compound Discoverer 和 Mass Frontier 直接访问。不在线?mzVault 为您提供了执行离线谱库搜索功能。
Identify more unknowns with MSn and SubTree search

充分利用在线数据库结构检索功能或用户提供的结构,即可通过 MSn 与亚结构的质谱匹配来可靠地鉴定更多未知化合物。

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全球最大的质谱谱图裂解库 mzCloud 是如何创建的?

使用可靠的元素组成搜索海量的在线结构库,以获得潜在结构。即使您有数百或数千个候选物质,mzLogic 也将充分利用您的高质量 MSn 质谱数据来鉴定海量的 mzCloud 谱库中常见的亚结构信息。

该亚结构信息用于对候选物质进行排名,并通过比较常见亚结构重叠相似度来显著减少候选物质列表。此过程可以在 Compound Discoverer 软件中完全自动化。为获得更大的可靠性,Mass Frontier 软件可让您深入了解减少后的候选物质列表的碎裂机理,从而增加任何推定鉴定的确定性。

主要优点

结合多个质谱谱图库和数据库的优势消除关于未知物质鉴定的一些猜测从成千上万的潜在候选物质到少数几个候选物质
从最全面的质谱谱图裂解库 mzCloud 到众多在线结构数据库,mzLogic 可将许多内容结合以帮助进行未知物质的结构鉴定。即使在 mzCloud 中没有发现匹配物质,仍然可以使用大量的碎片信息鉴定来自 MSn 数据的常见亚结构信息,从而有助于推定鉴别。使用元素组成来搜索结构数据库可获得数以千计的潜在未知物质;mzLogic 使用您的 MSn 数据和完整的 mzCloud 裂解库来解释尽可能多的结构信息,从而根据结构相似性将成千上万的潜在候选物质至少缩减到少数几个。
mzLogic algorithm and the high quality, structurally diverse mass spectral fragmentation information

通过结合 mzLogic 算法和 mzCloud 中高质量、结构多样的质谱碎片信息,消除关于小分子未知物质鉴定的一些猜测,从而提出并对结构鉴定进行确证。


专题视频

了解 mzLogic 如何帮助您在没有谱库匹配时自动鉴定真正未知的未知物质。通过结合谱库相似性搜索与化学数据库搜索来排列并可靠地提出最可能的候选物质,从而最大限度利用您的实测碎片数据。

当小分子未知物质未提供谱图匹配信息时,我们还可以如何鉴别它们?
mzVault

您的数据具有内在价值,因为这是您获得的知识。mzVault 为您提供了离线访问和搜索 mzCloud 的 MS2 级质谱数据或存储您自己的谱库信息的功能。质谱信息和您的谱图结果可以自动从 Compound Discoverer 发送至新的或现有的质谱库中,然后使用 Compound Discoverer 或 Mass Frontier 进行搜索。

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当您需要整理专有质谱库并确保最高质量的数据时,Mass Frontier 可为您提供与建立 mzCloud 相同的工具,这意味着您可以确保您的质谱数据都经过了过滤、重新校准、平均和完全结构注释,可随时准备在您的组织内分享您的谱库。

主要优点

线下了解更多未知物质创建并分享您的信息我以前见过这种未知物质吗?整理您的高质量数据
有时无法联机并访问 mzCloud。mzVault 包含 mzCloud 中包含的所有 MS2 级质谱数据,从而实现可靠的未知物质鉴定。建立、存储并搜索您自己的内部质谱库。一旦通过 mzLogic 鉴定出未知物质,或者您拥有享有专利的化合物,请确保这些有价值的信息可以被利用。即使有完备的在线结构数据库,且有 mzLogic 提出结构或亚结构,有时候未知物质依然存在。存储此信息并重新使用,以查看您之前是否观察到任何未知物质。在需要整理您的宝贵数据时,Mass Frontier 的 Curator 工具允许您使用与建立 mzCloud 相同的工具,确保创建您自己的高质量 mzVault 专有质谱库。
Metabolika

使用新的 Metabolika 模块创建、编辑和搜索反应通路,将您的知识提升至新的水平。凭借可以在 Thermo Scientific Compound Discoverer 3.0 或更高版本以及 Thermo Scientific Mass Frontier Software 8.0 或更高版本中创建和编辑反应通路的出版级图形功能,以及370多种用于一系列生物体的精选和注释的生化通路,分享您的通路知识比以往更容易。

Metabolika 模块还用于亚结构搜索、碎片预测和 mzLogic,进一步增加了未知化合物鉴定的机会。

Compound Discoverer 软件中使用时,该模块可以通过交互式统计数据覆盖(包括代谢通量分析数据)将您的数据可视化提升至新的水平。

主要优点

建立、编辑和存储反应通路获取>370种代谢通路的信息为您的数据映射通路,并将您的统计信息可视化
从包含的>370种代谢通路直到您自己的反应通路,轻松整理和编辑您的知识,以便将来在 Compound DiscovererMass Frontier 软件中使用。所包含的通路的综合信息不仅限于 Metabolika,该信息也充分用于亚结构搜索以及 mzLogic。通过高度可视化和交互式的演示,可以轻松地将通路映射到您在 Compound Discoverer 软件中检测到的化合物。此外,您可以在 Metabolika 通路中显示来自通量分析的统计信息,轻松实现数据可视化。
Example of Metabolika pathways analysis tool with flux analysis data included

有一个包含通量分析数据的 Metabolika 通路分析工具的例子,显示了一项来自稳定同位素标记实验的交换率的定性通量分析。

Curator

凭借在 Thermo Scientific Mass Frontier 8.0 或更高版本中创建、整理和共享质谱库的能力,您可以在整个组织内分享您的见解。

Mass Frontier 软件的 Curator 功能允许您使用与建立 mzCloud 相同的工具来创建您自己的高质量质谱库。使用完整的前体和碎片离子结构和分子式补充您的库信息,包括质量重新校准、加合物检测和注释,以及您自己的 MSn 质谱树的碰撞能量裂解曲线。

您可以在 Mass Frontier 软件 Data Manager 中轻松管理您的质谱库,这些信息通过所包含的 Server Manager 在您的网络中共享。

主要优点

存储您的信息并获取其价值建立高质量的质谱碎片裂解库完全注释您的数据,并包含有用的元数据
您的数据具有价值,这是您收集的有用信息,有助于做出明智的决策。Curator 确保您可以抓取并充分利用您的数据、信息,并获取其真正的价值。通过使用用于建立 mzCloud 的相同工具创建质谱树,确保您的数据具有最高的质量;去除噪音谱图和伪图,并完全重新校准您的数据。通过前体和碎片离子峰的完整结构和公式注释、碰撞能量分解曲线以及公共来源的元数据检索,补充您的高质量质谱碎片数据。
Curated spectral record – local mzCloud

新的策展器模块可为您的专有化合物自动进行质谱树整理、碎片注释和质量重新校准,以构建优质精选的本地 MSn 库。

Automated fragmentation annotation and understanding

通过使用 MSn 质谱树的自动化碎片注释,实现可靠的结构确证。碎片通路也可以基于一种结构的提交进行预测,并充分利用 HighChem Fragmentation Library™:这包含来自超过52,000个裂解方案、217,000个单独反应、256,000个化学结构以及源于同行评审文献的216,000个解码机制的信息。



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