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mzLogic 数据分析算法
mzLogic 算法的主要优点
| 结合多个质谱库和数据库的优势 | 消除关于未知物质鉴定的漫长猜测 | 从成千上万的潜在候选物质到少数几个候选物质 |
|---|---|---|
| mzLogic 将 mzCloud 中丰富的高质量、高分辨率准确质量、多级（MSn）碎片信息谱图与许多在线结构数据库相结合，为可靠鉴定未知物质提供了极大的机会。 | mzLogic 使用 mzCloud 和多种其他数据源中的数据来鉴定 MSn 数据中的常见亚结构特征，并在进行下一阶段的鉴定之前尽可能多地解析您的碎片数据。 | 使用元素组成来搜索结构数据库可获得数以千计的潜在候选物质；mzLogic 使用 MSn 数据和 mzCloud 碎片数据库信息来解析尽可能多的结构信息，从而根据结构相似性将成千上万的潜在候选物质缩减至少数几个可靠的候选物质。 |
当小分子未知物质未提供谱图匹配信息时，我们还可以如何鉴别它们？
了解有关 mzLogic 用于未知化合物确定的更多信息
mzLogic：极大限度利用 MSn 数据
了解 mzLogic 如何帮助您在没有谱库匹配时自动鉴定真正未知的未知物质。通过结合谱库相似性搜索与化学数据库搜索来排列并可靠地提出最可能的候选物质，从而极大限度利用您的真实碎片数据。
无论您是正在努力更好地表征和了解代谢和药物分析物、食品和环境样品、化学合成致幻药还是萃取物和溶出物，使用质谱库和在线数据库都可以帮助您鉴定样品中的化合物。但是，随着化合物类别之间的交叉不断增多、新杂质、微妙的化合物转化或代谢以及降解产物，有时可能无法找到与您所使用谱库完全匹配的信息。
通过诸如 AcquireX 之类的数据采集工具以及一般硬件改进，获取全面的高分辨率、准确质量 MS/MS 和 MSn 数据的过程已得到简化。获得包含广泛化学多样性、丰富碎片和可靠而简洁数据的质谱库已成为极为棘手的挑战。
mzCloud 质谱数据库是规模独占鳌头（就每种化合物的总质谱图数量和数据而言）、完全可公开使用的在线质谱谱库。它包含高分辨率、准确质量（HRAM）谱图，包括详尽的高分辨率 MS/MS 和多级 MSn 谱图。每个条目都包含相当多的元数据，最重要的是它们都经过详尽整理（即，过滤、重新校准、取平均和注释）以确保其内容的质量绝对可靠。
高质量 MS、MS/MS 和 MSn 数据可用于查询完全整理和注释的质谱云谱库 mzCloud 。可从丰富的碎片信息中使用常见亚结构信息，有助于使用 mzLogic 算法进行未知化合物鉴定。
每个 mzCloud 库条目都包含丰富的碎片信息，这些信息均使用一系列碰撞能量和碎裂技术（碰撞诱导碎裂和高能碰撞碎裂，CID 和 HCD）获得。当把这些信息与库条目的丰富化学多样性相结合时，一些或所有未知结构可以与库中现有碎片进行匹配的可能性便增加。
mzLogic 使用在线结构数据库和 mzCloud 中丰富的碎片信息减少假定候选物质。
如上图所示，mzLogic 作为 Mass Frontier 软件和 Compound Discoverer 软件包的组成部分提供，其工作流程如下：
- 可以使用元素组成搜索在线数据库，例如，包含7000万个以上结构的 ChemSpider。即使能够使用 Orbitrap 质量分析器的高分辨率和准确质量功能揭示精细同位素信息，数以百计甚至数以千计的潜在结构也可能与元素组成相匹配。
- mzCloud 中所含的高质量碎片信息与实验数据进行比较。
- mzLogic 通过正向和反向搜索快速鉴定结构相似的碎片。
- 根据已确定的亚结构，在线搜索的结构候选物质，按有多少结构可以通过亚结构匹配来解释进行排序。
- 这一排序基于实际数据的使用，需要数以百计或数以千计的潜在候选物质，并需将其缩减为包含在明显更小列表中的假定结构，并使用可视化工具来解释排序以及结构在库碎片中的占比。
使用 mzLogic 的排序结果，要么显示该候选物质所有的结构都可以被考虑，要么显示仍有一些来自该拟议候选物质的结构信息不能被考虑。MS/MS 和/或 MSn 碎片谱通常包含大量结构信息，可以使用 Compound Discoverer 或 Mass Frontier 软件进一步研究。
如果需要对 MSn 碎片数据进行完整、深入的分析，Mass Frontier 软件会直观显示碎片裂解途径并使用丰富的 MSn 数据让大家了解碎片裂解途径。Fragments and Mechanisms（碎片和机理）工具可模拟拟议结构的非分子解离，包括重排和预测碎片，还可用于通过碎片注释解释实验碎片数据，以帮助确定哪些候选物质确实看似合理。Mass Frontier 软件不是编码的碎片裂解算法，而是以在95%以上同行评议科学期刊中发表的碎片裂解机理为基础的。
这种方法通过 mzCloud 中高质量数据和丰富质谱树提供的深度碎片裂解和表征信息，增加了推定结构鉴定的确定性。
使用 MSn 质谱树的自动化碎片注释，实现可靠的结构确证。也可以根据提交的结构预测碎片裂解途径，并充分利用 HighChem Fragmentation Library。该库包含来自同行评议文献中超过52,000个碎片裂解方案、217,000个单独反应、256,000个化学结构和216,000个解码机理的信息。
使用 mzCloud 和 mzLogic 加速您的小分子未知物质鉴定研究，此过程利用 Compound Discoverer 软件 和 Mass Frontier 软件中包含的精简数据分析和质谱预测工具。
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全球大型质谱子离子碎片谱库 mzCloud 是如何创建的？
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