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Oncomine 信息学
Oncomine 信息学产品可帮助您：
- 对变异进行优先次序排序，找到相关的新变异
- 检出变异，确定并注释癌症驱动变异
- 快速生成自定义的实验室报告
Oncomine 信息学产品
Oncomine Knowledgebase Reporter
无论您所在的是大规模实验室，还是高度协作的多站点机构，均可通过从本地服务器版Oncomine Knowledgebase Reporter，到 Thermo Fisher Cloud 支持的 Thermo Fisher Connect 提供的最新网页版选项，满足您的需求。
网页版 Oncomine Knowlegebase Reporter 由 Thermo Fisher Connect 提供，可通过按需付费结构实现安全、可扩展的分析平台。
- 精选的相关证据将基因变异与相关的标签、指导原则和全球临床实验关联在一起
- 易用的界面，方便用户通过几个简单的步骤生成报告：上传，过滤和报告
- 提供十种语言的自定义报告模板
Oncomine Knowledgebase Reporter 可帮助您在一份报告中找到相关的介个癌症驱动变异，让您可以针对样本特定变异进行情境调查，了解如何结合相关的标签、指导原则和全球临床实验使用。此基因组分析工具专门针对 NGS 数据的进一步检查而开发，可通过以下三个简单步骤，流水线化获取最终的报告：上传癌症研究变异，采用 精选内容比对您的来源数据进行过滤，为您的实验室创建定制报告（图1）。
Oncomine Knowledgebase Reporter 需要来自于 Ion Reporter 软件的 VCF 或 ZIP 格式文件，支持如下 Ion Torrent 检测：
- Oncomine Focus 检测
- Oncomine Comprehensive Assay
- Oncomine Breast cfDNA Assay
- Oncomine Colon cfDNA Assay
- Oncomine Lung cfDNA Assay
- Oncomine BRCA Research Assay
图 1.可定制报告。报告标题和页脚含有 许多自定义字符。Variant Summary 根据来源和变异显示了样本特异性数据。在 Relevant Therapy Summary 之中，以易读的图示形式进一步显示了各个变异的详情。
Ion Reporter 软件和 Oncomine Variant Annotator 插件
采用 Ion Reporter 软件简化您的生物信息学发现路径。此软件可帮助您清除 NGS 数据分析过程中的障碍，使您可以集中精力探索自己的数据的生物学意义。
- 插件可帮助您根据 Oncomine Knowledgebase 中的信息，找到相关的新 癌症驱动变异。
- 插件 可根据 Oncomine Knowledgebase 之中的 48 种癌症类型的>5,300 对肿瘤和正常外显子组的分析结果，对各个变异进行功能获得或功能缺失归类。
- 插件 可实现仅适用于肿瘤的工作流程
- Ion Reporter 软件为各类研究应用提供了轻松的数据分析方法
- Ion Reporter 软件采用优化的工作流程和用户工具，可以快速获得结果
关于 Oncomine Knowledgebase
采集、评估、标准化、分析、获得信息、重复验证
要获取相关信息并推动药物发现和伴随诊断开发项目，必须对 NGS 研究产生的大量基因组学数据集进行分析、标注，并最终由经验丰富的生物信息学专家进行解读。
Oncomine Knowledgebase Reporter 是由来自于全球临床实验、美国和欧洲的标签和指导原则的数据组成的精选数据集，可实现自定义的样本专用报告功能。
- 可以将变异与各种标签、指导原则和全球临床实验关联起来
- 告知 Oncomine 检测的设计信息
- 逐季度更新
Oncomine Knowledgebase 是一套稳定、精选并经过验证的数据库，其中含有可实现靶向检测设计的癌症基因组数据：
- 告知Oncomine 检测的设计信息
- 告知 Oncomine Variant Annotator 插件信息
- 从公共资源、同行评审文献以及相关作者处采集数据
- 推动 Oncomine Platform软件的后台数据
Oncomine Platform 软件
Oncomine Platform 软件包含一套计算基因表达签名、群集和基因组模块的强大分析功能，可从相关数据自动提取生物学解读视角。
- 支持发现新型癌症的信息
- 有助于更快获得发表成果的解读视角
*A single page report depends on the number of variants in the sample.
仅供科研使用，不可用于诊断目的。