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UPAC 核苷酸代码 | 碱基 |
---|---|
A | 腺嘌呤 |
C | 胞嘧啶 |
G | 鸟嘌呤 |
T(或 U) | 胸腺嘧啶(或尿嘧啶) |
R | A 或 G |
是 | C 或 T |
S | G 或 C |
W | A 或 T |
K | G 或 T |
M | A 或 C |
B | C 或 G 或 T |
D | A 或 G 或 T |
H | A 或 C 或 T |
V | A 或 C 或 G |
否 | 任意碱基 |
答案取决于您项目的具体情况。通常,有利的是将文库的多样性保持尽可能低,仅靶向可能具有重要功能的基因/蛋白质区域。以下信息可以帮助您确定:晶体结构、保守基序、同系物的存在等。请随时与我们联系,我们将为您传授我们的丰富经验。
用于简并文库创建的常规方案(例如,易于出错的 PCR)包含许多不必要的突变。而且,DNA 改组等方法通常不能引起直接相邻突变的重组。另一方面,合成组合文库将突变限制在所需精确频率下的指定区域内。此外,邻近的突变将被重组(改组),与它们的接近程度无关。
使用三核苷酸诱变(TRIM)技术创造多样性可替换完整的密码子而不改变单个核苷酸。因此,您可以完全控制哪些氨基酸以给定的位置和比例出现,同时避免引入不必要的终止密码子。由于替换了完整密码子,TRIM 技术相比其他诱变技术产生的框外突变更少。
我们通常对最常见的表达宿主(人、CHO 和 大肠杆菌)使用优化密码子。也可根据要求提供其他密码子。有关详细信息,请联系我们。
理由如下:
如果您需要具有特殊设计的简并库,请联系我们。我们兼顾每个项目,大多数情况下,都可以找到满足您需求的解决方案。
是。GeneArt 组合文库可以根据您的需要使用任意核苷酸混合物进行随机化处理,低至指定核苷酸的个位数百分比。
不需要任何材料。文库创建只需要序列文件(以电子版的方式提交)以及欲随机化位点的位置和性质信息。我们可以通过 在线订购系统为您的项目提供报价。您可在启动项目之前根据需要将有关文库要求的详细信息发送给我们的生产科学家。
是。我们可以将您的基因亚克隆到任意上市 Invitrogen 载体或您提供给我们的定制载体上。
有两个标准选项:
以下三个标准对于简并文库来说很重要,并且在所有 GeneArt 简并文库中均受质量控制(除 GeneArt Strings DNA 文库外):
对于 GeneArt 诱变服务,我们需要您欲诱变的基因 DNA 或氨基酸序列,您计划使用的宿主生物(如果您选择将其包含在您的请求中,这对于基因优化来说很重要),5’/3’ 端所需的限制性位点和/或避免内部修饰,以及您是否想要任何其他添加的序列(例如,Kozak 序列、终止密码子等)。可通过 GeneArt 门户网站在线索求变体。对于各个文库,请访问您感兴趣文库类型的相应主页。在这些页面上,您可以下载并填写特定的调查表,并将信息发送至 geneartsupport@thermofisher.com。我们将为您回复报价和预期处理时间。
变体最多可包含以下四种修饰:
各个修饰(无论是内部还是 5’/3’端)必须至少间隔 100 bp。
GeneArt Strings DNA 文库包含具有以下参数的克隆线性 DNA 片段:
GeneArt Strings DNA 文库不适于使用 TRIM 技术或定制核苷酸混合物。如果您需要这种随机化类型,请咨询我们的其他文库产品。
请将您的问题通过电子邮件发送至 geneartsupport@thermofisher.com,我们将亲自回答您的问题。
仅供科研使用,不可用于诊断目的。