在采用 siRNA 处理的细胞系中，TaqMan® 蛋白定量可用作监测蛋白敲低的有效方法。该方法速度更快，使用的材料明显少于蛋白质免疫印迹 （Western Blot）法。此外，由于需要非常小量的样本，因此可使用相同样本分析 siRNA 对其他蛋白的影响。此外，还可轻松包括与 mRNA 水平的相关性分析（使用 TaqMan® 基因表达检测试剂盒进行）。

TaqMan® 蛋白定量证实 IHC 染色结果

对睾丸生殖细胞肿瘤 (TGCT) 和已知表达 OCT3/4 和 SOX2 的衍生细胞系进行分析的结果表明，这些多能性标记物确实是鉴定恶性干细胞（精原细胞瘤和胚胎癌细胞及其常见的前体癌原位细胞）的信息工具。这些结果证实了通过免疫组织化学技术获得的观察结果，但使用 TaqMan® 蛋白定量进行的分析可进行定量测定，速度更快且操作更简单，并且使用的样本起始量更小。

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