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如何使用 TaqMan 测定搜索工具
新版 TaqMan 测定搜索工具支持您搜索超过 2000 万种专业设计的测定和阵列产品，这些产品由由 TaqMan 性能保证提供支持。 该工具的新功能包括与每种测定有关的较新、较相关的出版物。下文是有关如何导航搜索工具并找到适合您研究的解决方案的快速概览。 TaqMan 测定始终值得信赖，已出现在超过 40,000 种出版物中，是任何其他 5’ 核酸酶测定的 3 倍。
TaqMan 测定搜索工具包括适合以下应用的测定和阵列：
- 基因表达
- SNP 基因分型
- 拷贝数
- miRNA
- 突变检测
TaqMan 测定搜索工具
工具使用帮助
简单搜索方式
- 从 Thermo Fisher 主页 (www.thermofisher.com) 开始
- 从页面顶部的搜索下拉列表中选择 TaqMan 测定；输入您的靶标、基因或通路；然后搜索。
- 选择所需测定/阵列类型项下的结果集（如果搜索术语应用于多种类型）（图1）。
图 1.如果搜索术语适用于多种测定/阵列类型，将显示一个如上文所示的搜索结果。相关测定或阵列的数量将显示在类型项下，并链接到该类型的搜索结果集。
4.如果需要，用筛选器（物种、测定属性等）优化搜索（图2）。
图 2.TaqMan 基因表达测定可用的筛选器。
搜索多个靶标
如果您正在为一个项目寻找多种测定，或者正在创建一个要包含在阵列中的测定列表，您可以一次搜索多个靶标：
- 执行搜索后，单击搜索结果页面顶部搜索框右侧的 Build a Search（构建搜索）（或使用上面的搜索工具）。
- 单击 Enter multiple targets（输入多个靶标）。
- 输入关键字，用逗号或回车分隔，然后搜索。 支持的多靶标搜索关键字类型因测定类型而异。 您也可以选择上传关键字列表。
- 将显示搜索到的每个靶标的最匹配测定结果。 要查看完整结果，请单击每个关键字的 Show more（显示更多）。
- 要导航到感兴趣的特定关键字，请单击搜索结果上方的蓝色关键字链接，该链接显示所搜索的关键字和为每个关键字找到的结果数量。
图 3.多靶标搜索结果示例。
按序列搜索
对于基因表达测定和 microRNA 测定，您可以输入靶标序列查找与该序列对应的预设计测定：
- 执行搜索后，在搜索结果页面顶部搜索框左侧下拉菜单中选择 Gene Expression（基因表达）或“miRNA”，然后单击搜索框右侧的 Build a Search（构建搜索）（或使用上面的搜索工具）。
- 单击 Enter target sequence（输入靶标序列）。（注：对于基因表达测定，您需要首先选择一个物种才会显示此选项。）
- 输入您希望测定检测的序列，然后进行搜索。 您还可以选择同时搜索多个序列。 对于此选项，需要一个名称匹配输入序列，以搜索结果。
按染色体位置搜索
对于 SNP 基因分型和拷贝数测定，您可以输入染色体位置查找与该位置对应的测定：
- 执行搜索后，在搜索结果页面顶部搜索框左侧下拉菜单中选择 SNP Genotyping（SNP 基因分型）或 Copy Number（拷贝数），然后单击搜索框右侧的 Build a Search（构建搜索）（或使用上面的搜索工具）。
- 选择一个物种，这将激活 Enter chromosome position（输入染色体位置）链接。
- 单击 Enter Chromosome position（输入染色体位置），输入染色体编号、起始位置和停止位置，然后搜索。
搜索 qPCR 阵列
搜索 TaqMan 阵列时，您可以使用以下任一类型的关键字进行搜索：
- 检测组合名称（例如人 HedgeHog 通路）
- 检测组合中的靶标（例如 GAPDH）
- 检测组合中的测定 ID（例如 Hs99999901_s1）
要订购 TaqMan 测定，需要提供两组信息：
- 货号
- 测定 ID
TaqMan 测定的货号与序列无关，并定义了测定的其他属性，包括：
- 测定类型（例如基因表达）
- 规格（例如小规格）
- 报告基团染料（FAM 或 VIC）
- 库存类型（库存或按订单生产）
- 引物浓度（标准或引物限定）
测定 ID 是每种测定的唯一标识符，这些测定设计为 Thermo Fisher Scientific 全面的预设计测定系列的一部分，或者作为使用我们的一种定制测定设计工具设计的定制测定。
查找测定 ID
使用 TaqMan 测定搜索工具搜索测定（参见"如何搜索 TaqMan 测定和阵列？"）。
在搜索结果中，测定 ID 以粗体突出显示在检测结果框顶部。 产品目录号直接列在下面，如果您改变染料或规格，目录号会随之改变（图 1）。
图 1.
重新订购测定
有多种方法重新订购测定：
- 测定搜索：使用 TaqMan 测定搜索工具搜索测定。 要获得更有效的方法，请按测定 ID 搜索，然后单击 Add to cart（加入购物车）。
- 快速订购：如果您知道测定 ID 和货号，可以直接将该信息输入快速订购表。 要访问此表单，请访问 www.thermofisher.com，然后单击最右上角的 Quick Order（快速订购）（图 2）。
图 2.
我们提供多种工具帮助您选择适合的基因表达测定：
- 较佳覆盖度建议
- 测定设计和转录本详细信息
- 重要信息
- 引文
- 交叉反应性筛选器
图 1.
较佳覆盖度建议
所有 TaqMan 测定均采用我们行业前列的生物信息学设计流程设计，并且符合我们所有的高质控质量标准。对于任何给定的靶标，我们比较了该靶标的所有测定，并选择了一种较佳覆盖度测定进行标准基因表达实验，检测感兴趣的基因的最大转录本数。我们还根据以下设计标准，使用更符合标准的推荐的测定进行评估。
- 不会检测具有类似序列（同系物）的基因产品
- 设计为跨越一个外显子-外显子连接
- 具有短扩增子，提供更有效的 PCR 反应
- 不会检测脱靶序列，因此提高了反应的特异性（测定与基因组中多次出现的序列进行杂交时，可能会进行脱靶检测）
- 不会映射到多个基因，从而提高实验的特异性
- 不会以 5' 非翻译区 (UTR) 为靶标。转录本的 5' UTR 在转录本之间具有可变序列。
测定设计和转录本详细信息
对于任何基因表达测定，提供有关测定设计及其检测的转录本的信息。
在测定结果框中，Assay Design（测定设计）指示引物和探针在转录本的外显子结构内的位置，并定期更新。 单击 Assay Design（测定设计）下方的链接打开 "View Details"（查看详细信息）项下的部分，显示有关测定设计的更多详细信息（图 2）。
图 2.
单击 Transcripts（转录本）下方的链接也会打开 View Details（查看详细信息）部分，并显示测定检测到的转录本的 RefSeq 登录号信息。
引文
您可以查看引用该测定的出版物数量以及测定搜索结果中这些出版物的列表（图 3）。 （更多信息，请参见"如何查看测定出版物？"）。 引文最多的测定结果还带有一个旗状标记。
图 3.
重要信息
重要信息文本框提供了您在确定实验更适合的测定时可能需要考虑的信息（图 4）。 这些文本框中的信息类型包括：
- 基础 SNP 信息
- 测定映射到与基因表达微阵列相同的靶标时
- 测定可能检测基因组 DNA 时
图 4.
交叉反应性筛选器
筛选器始终位于搜索页面顶部，有助于优化搜索结果。 （如果您看不到筛选器，请单击搜索栏右侧的 View filters（查看筛选器））。对于基因表达结果，有多种参数可供筛选，包括交叉反应性。
交叉反应性筛选器可用于在转基因动物实验中检查测定的物种交叉反应性。 当您在交叉反应性筛选器中选择一个物种时，结果列表将更新，以便从结果中排除任何可能与所选物种发生交叉反应的测定。 列表中保留的任何测定都不会表现出物种交叉反应性，因此适用于转基因研究。
现在您可以直接在搜索结果中查看测定的新近出版物。 对于每个测定 ID，您可找到以下出版物相关信息：
- 引文数量
- 引文列表及链接
- 基于出版物数据的评分（通过 Bioz 计算）
您可以通过以下方法导出搜索结果：使用复选框（图 1）选择要包括在内的测定或阵列，然后打开 Select action（选择操作）下拉菜单。
图 1.
在 Select action（选择操作）下拉菜单中，有两个选项可导出测定搜索结果：
- Email the selected results as an attached csv file（将所选结果作为 csv 文件附件发送电子邮件）
- Export the selected results as a tab-delimited text file（将所选结果导出为制表符分隔的文本文件）
导出的文件包含您选择的测定的详细信息。 例如，基因表达测定导出文件将包含所选的每个测定 ID 的以下信息：
- 订购信息（测定 ID 和货号）
- 可用性（库存或按订单生产）
- 基因（基因符号、基因名称、基因别名）
- RefSeq 及 GenBank 登录号
- 扩增子长度
如果您要导出 TaqMan 阵列产品的信息，您将获得一份 xls 文件，其中包含选择的每种产品（通过产品目录号或阵列 ID 确定）的选项卡以及每个阵列的测定布局信息。
仅供科研使用，不可用于诊断目的。