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细菌分型
用于疫情调查研究的快速、经济测序方法
Ion Torrent 系统具有较高的灵敏度、可扩展性和快速周转时间，这对疫情研究至关重要。
Ion GeneStudio S5 系统细菌分型工作流程
Ion Plus 片段化文库试剂盒或 Ion Xpress Plus 片段化文库试剂盒可在短短两小时内实现 gDNA 和扩增子文库的低成本样本制备。
- Ion Chef 仪器仅需数分钟的手动操作时间，即可实现简单、全自动的高通量的模板制备
- OneTouch 2 系统是一种可供选择的半自动模板制备解决方案，可进行高达 600 bp 的测序
Ion GeneStudio S5 系统可在 Ion 520 芯片或 Ion 530 芯片上分别在4小时或2.5小时内进行400或 200 bp 的快速测序。
采用 Torrent Suite 软件进行初始数据分析。Ridom SeqSphere+ 软件包为细菌分型提供了后续解决方案。
Ion Plus 片段化文库试剂盒或 Ion Xpress Plus 片段化文库试剂盒可在短短两小时内实现 gDNA 和扩增子文库的低成本样本制备。
- Ion Chef 仪器仅需数分钟的手动操作时间，即可实现简单、全自动的高通量的模板制备
- OneTouch 2 系统是一种可供选择的半自动模板制备解决方案，可进行高达 600 bp 的测序
Ion GeneStudio S5 系统可在 Ion 520 芯片或 Ion 530 芯片上分别在4小时或2.5小时内进行400或 200 bp 的快速测序。
采用 Torrent Suite 软件进行初始数据分析。Ridom SeqSphere+ 软件包为细菌分型提供了后续解决方案。
应用文档与出版物
阅读应用文档及同行评审出版物，了解 Ion Torrent 测序系统如何应用于细菌和病毒分型研究。
数据集
下载 Ion PGM™ 系统生成的数据集，亲自查看相关结果。
信息学解决方案
了解细菌鉴定信息学解决方案，以便快速获取生物学研究结果。
细菌分型研究信息学解决方案
Torrent Suite 软件提供了从原始序列数据获得信息学结果的工具，涵盖了优化的信号处理、碱基识别、序列比对和变异分析等功能。在运行后，直接右键单击，即可下载测序数据。报告含有扩展分析图和直观的图表，其中汇集了有助于确认测序运行是否为高质量的关键结果。
Torrent Browser Plugin Store 为 Torrent Suite 软件用户提供了查找和快速安装所需的插件、扩展自身 Torrent 服务器分析功能所需的简单的一站式平台。在此提供了可供进行微生物重测序（Alignment、PathFinder 和 PathogenDetector）、从头装配 (AssemblerSPAdes) 和其他应用的插件。
同时提供了专用于第三方软件包（例如 Ridom SeqSphere+ 软件包）细菌和病毒分型的工作流程，可实现下游分析自动化。SeqSphere+ 可支持实验室进行微生物全基因组分型 (MLST+)、传统 MLST 或 16S rDNA 测序项目。此软件可帮助单独或分散的工作组（客户端/服务器模式）轻松分享数据。
了解更多关于该软件如何简化您的数据分析过程。
文献
出版物
在细菌和病毒分型研究、宏基因组学和未知微生物发现领域，引用 Ion Torrent 测序的同行评审出版物已超过900篇。
Rapid High Resolution Genotyping of Francisella tularensis by Whole Genome Sequence Comparison of Annotated Genes (“MLST+”). Antwerpen MH (2015) PLoS ONE 10(4): e0123298. doi:10.1371/journal.pone.0123298
A genome-based identification approach for members of the genus Bifidobacterium. Ferrario et al.FEMS Microbiol Ecol.2015 Mar;91(3). pii: fiv009. doi: 10.1093/femsec/fiv009.Epub 2015 Jan 27.
Ion Torrent Personal Genome Machine sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information. Vogel et al.(2012) J Clin Microbiol JCM.00038-12 [pii];10.1128/JCM.00038-12 [doi].
Multilocus sequence typing of total-genome-sequenced bacteria. Larsen et al.(2012).J Clin Microbiol.JCM.06094-11 [pii];10.1128/JCM.06094-11 [doi].
仅供科研使用，不可用于诊断目的。