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疫苗帮助锻炼我们的免疫系统以保护我们免受传染病的侵害,并识别和抵御癌症等疾病。由于研究人员继续努力开发新疫苗、提高疫苗疗效并减少不良事件,仍有许多问题需要回答。 我们如何确定合适的疫苗靶标?是否有可用于预测疫苗疗效的生物标记物?剂量或微生物组等因素如何影响疫苗的免疫应答?
大规模并行高通量测序 (NGS) 以及快速 DNA 和 RNA 测序和分析功能的出现有助于我们了解疫苗响应背后的遗传学知识并促进疫苗开发研究。
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Ion Torrent 靶向 NGS 在开发工作流程(从发现到疫苗疗效)中为疫苗研究提供了快速、多维的大规模基因分析。无论您是需要研究病原体生物学和靶标发现还是全面分析宿主免疫应答,Ion Torrent 都具有帮助研究人员快速、经济实惠地研究和改进疫苗开发的解决方案。
使用 Ion Torrent 靶向 NGS 进行疫苗开发研究的优点包括:
对整个 SARS-CoV-2 病毒基因组进行测序可为 SARS-CoV-2 和新型药物靶点提供新生物学见解,这些见解可以影响疫苗和治疗研究。在疫苗或治疗开发过程中,必须考虑所有病毒突变,否则,随着病毒的继续发展,候选药物的有效性可能降低。
Ion Torrent NGS 实现对整个 SARS-CoV-2 基因组的测序,以确定关键突变,从而研究可能影响疫苗研究的 SARS-CoV-2 的社会面蔓延和不断进化。Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight Research 测定试剂盒是快速、自动且准确的靶向 NGS 工作流程的一部分,在一天内实现冠状病毒分型,覆盖 >99% 的 SARS-CoV-2 基因组和变异,包括所有血清型。这种端到端解决方案还包括研究人员开发的减缓病毒传播的测定试剂盒和插件套件。
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NGS 解决方案 | ||
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靶向 NGS 有助于鉴别与产生免疫应答的毒性、抗原和肿瘤抗原相关的基因模式以及可能导致免疫或可能导致不良事件的基因因子。遗传信息推动了疫苗开发研究,可能使治疗特异性更好,以更好地预防感染或在未来改善疾病(如癌症)的治疗结果。
疫苗使我们的适应性免疫系统能够快速识别和抵御传染病并增强我们的免疫系统以攻击癌症等疾病。需要采用准确的靶向 NGS 方法对这些复杂的基因重排进行正确测序,并了解免疫系统如何针对 SARS-CoV-2 等致病因子不断发展或了解癌症免疫循环以改善癌症疫苗治疗。免疫组库分析还可实现临床研究的样品分层,以帮助解释和潜在提高疫苗疗效。
先天免疫应答涉及干扰素和细胞因子等分子,但人们对它们对应答和不良事件的相对贡献仍知之甚少。靶向基因表达分析提供了一种可扩展的经济实惠方法,以了解基因如何响应抗原和疫苗来进行调节。表征先天免疫和各种免疫信号通路可能有助于提高疫苗的疗效,尽量降低不良事件的风险并提供有关适当选项的信息。
肠道微生物组被认为是我们的“第二基因组”,人们认为它会影响人类免疫,包括可能影响疫苗响应和潜在疫苗疗效的微生物间的复杂相互作用以及宿主与微生物关系。靶向 NGS 可以捕获因其免疫调节和抗病毒特性而可能至关重要的种属信息,包括可能不可培养的微生物。
与其他 NGS 方法不同,用于疫苗开发研究的 Ion Torrent 聚焦 NGS 解决方案提供您所需的速度、可扩展性和准确性,让您腾出较多时间开发疫苗解决方案并花费较少时间来寻找疫苗解决方案。
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*适用于人和小鼠模型
样本通过实操的自动化工作流程在一天内报告
Genexus 系统是首款全套 NGS 解决方案,可以自动实现从样本到报告的工作流程,仅需两个用户接触点即可在一天内提供结果。*
仅供科研使用,不可用于诊断目的。