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Ion 16S™ 宏基因组解决方案
Ion 16S 宏基因组试剂盒和 Ion Reporter 宏基因组工作流程解决方案
采用 Ion Torrent 测序系统实现多细菌研究样本的无培养、快速鉴定。
使用 Ion Torrent 测序系统快速鉴定多细菌研究样本
Ion 16S™ 宏基因组试剂盒
和Ion Reporter™ 宏基因组工作流程解决方案
采用Ion PGM™系统，无需进行培养处理，即可快速鉴别出病原菌研究样品
离子半导体测序通过细菌 16S rRNA 基因的全基因组或靶向测序（16S 测序）加速并简化宏基因组研究。通过避免在测序前克隆或培养样本，消除了采样中的一种主要偏差。可以在含 Ion Hi-Q ™ 化学试剂的 Ion GeneStudio S5™ 系统或 Ion PGM ™ 系统上直接对样本进行快速测序，并使用更多扩增子，在属和种水平上更准确地区分微生物。
Ion 16S 宏基因组试剂盒
Ion 16S ™ 宏基因组试剂盒设计用于对混合微生物群进行快速、综合性且广泛的研究分析。 该试剂盒使用两个引物池扩增七个高变区（V2、V3、V4、V6、V7、V8 和 V9）的细菌 16S rRNA。两个引物池的组合可以实现从复杂混合群体中对细菌进行广泛、基于序列的鉴定。
然后在 Ion GeneStudio S5 系统或 Ion PGM 系统上对扩增片段进行测序，并使用 Ion Reporter™ 软件中的宏基因组学工作流程进行分析。
视频：微生物的多样性
经过几十年的分析和数百项研究，我们已经了解到微生物的多样性甚至比想象的还要大，这些物种的多样性及其相互作用可能与炎症性肠病 (IBD)、肥胖和慢性难愈创面等疾病有关。来听听 George Watts 博士和 Charles Li 博士在临床和环境研究应用中如何使用 Ion 16S 测序。
观看视频 ›
Ion 16S 宏基因组解决方案的优势包括：
- 直接在没有培养的样本上使用，或在混合或纯培养物上使用
- 用于多个 V 区的引物集可利用带 MicroSEQ™ ID 16S rRNA 参考数据库和 Greengenes 数据库的 Ion Reporter 软件，准确检测和鉴定属或种水平的各类细菌
- 灵活性—作为两个引物池提供的引物集允许使用单独的池进行单独的分析
- 引物也可采用条形码标记
16s 测序应用文档、文献和出版物
Ion 16S 宏基因组试剂盒和 Ion Reporter 宏基因组工作流程宣传页
Ion Reporter 宏基因组 16S 算法白皮书
通过 16S 单 V 或多 V 区域测序评估多微生物研究样本中微生物群的多样性
对多微生物样本中的细菌鉴定进行快速 16S 新一代测序
ASM 2015 海报
在细菌和病毒分型研究、宏基因组学和未知微生物发现领域，引用 Ion Torrent™ 测序的同行评审出版物已超过900篇。
查看 Ion Torrent 出版物 >
适用于 Ion GeneStudio S5 系统的集成、经济高效、可扩展的 16S rRNA 测序工作流程，和一个从文库到已分析结果的快速工作流程。文库构建和模板制备后，Ion 520™ 和 Ion 530™ 芯片仅需4小时即可完成 400 bp 测序运行。 使用 Torrent Suite™ 软件生成的 BAM 文件在 Ion Reporter 软件 16S 宏基因组工作流程中自动分析、注释和分类分配。
Ion GeneStudio S5 系统
现在，在实验室中使用 NGS 比以往任何时候都要简单。Ion GeneStudio S5 新一代测序系统可助力实验室打造简单的靶向测序工作流程，它具有行业令人满意的的速度，且具有成本效益。将您的研究重点放在具有潜在影响力的应用上。Ion GeneStudio S5 系统采用模块化设计，因此实验室可以灵活地在单个系统上执行多种靶向测序应用。
Ion Reporter 软件宏基因组工作流程
Ion Reporter 软件能够在属或种水平上鉴定复杂多细菌样本中的微生物，并使用优质精选的 MicroSEQ ™ ID 16S rRNA 参考数据库和精选的 Greengenes 数据库。Ion Reporter 软件宏基因组工作流程还可提供引物信息、分类信息、ID 百分比和谱图信息。通过易于使用的交互式 Krona 图表显示，您可以在任何分类学水平上为您的研究解释种群多样性。
在 Ion Reporter 软件中实施自动分析、注释和分类学分配。使用更严格的分析参数在平衡模拟细菌样本的属水平上达成一致意见。属水平上的多个分类分配（斜线识别）用红色圈出。
仅供科研使用，不可用于诊断目的。