ampliseq-transcriptome-270

新特性:Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒

与 Ion GeneStudio S5 系列高通量测序系统配合使用,Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒可以从数量有限的样品中快速、经济地进行基因表达分析。在单个管中同时扩增超过 20,000 个 RefSeq 基因,低至 10 ng 的总 RNA,该试剂盒是肿瘤学和转化研究中的最佳选择。Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒提供:

  • 样品起始量低至 10 ng 总 RNA
  • 简单的工作流程,快速的基因表达分析——使用 Ion GeneStudio S5 系列和 Ion Chef 系统的自动化工作流程,从 RNA 到数据,只需不到 2 天,并且只需约 45 分钟的手动操作时间
  • 简化数据分析——使用 Torrent Suite 软件将数据导出到现有的分析软件中

Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒应用资料

了解有关使用 Ion AmpliSeq RNA panels 进行靶向 RNA 测序的更多信息 ›

浏览和订购产品

Transcriptome-RNA-sequencing-250px

Ion AmpliSeq 小鼠基因表达试剂盒数据与全转录组 RNA-Seq 数据之间 DEG 的相关性等于 0.943。


Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒

Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒和 Ion GeneStudio S5 系列测序系统以低至 10 ng 起始 RNA 量、快速和 FFPE 兼容的流程来改善客户的研究,实现大于 20,000 个 RefSeq 转录本检测。

  • 实现经济有效的转录组测序,无需等待数周累积样品
  • 进行基因水平表达研究,只需1小时的手动操作时间进行文库制备,并在不到2天的时间内,完成从 RNA 到基因表达水平的数据分析
  • 软件工具包括用于快速简单分析测序 reads;使用您现有的下游微阵列或二代测序(NGS)方法进行基因差异表达水平的数据分析
  • 使用低至10 ng的起始 RNA检测珍贵的 FFPE 样品

阅读同行评审的出版物:

Li 等人(2015)综合评估 AmpliSeq 转录组,是一种用于全基因表达分析的全新的靶向全转录组 RNA 测序方法。BMC Genomics 16:1069

Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒说明手册
阅读 Ion AmpliSeq 转录组应用说明,了解基因表达分析的简化工作流程,
阅读 Ion S5 应用说明,了解 Ion S5 系统如何用于癌症基因组学和转录组学研究

查看我们的“网络讲座”,了解如何利用靶向 NGS 基因表达方法来发现生物标志物。

观看网络讲座

使用 Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒寻找三阴乳腺癌研究样品中的基因表达特征

是否只有一种方法可以进行 RNA-Seq 文库制备?印第安纳大学的 Milan Radovich 博士讨论了他对三阴乳腺癌基因表达基因特征的研究。

定量和差异基因表达分析是许多生物研究应用的基础,包括基因调控分析,将基因表达与表型相关联,以及细胞的通路分析。常规基因表达谱分析方法包括基于杂交的(微阵列)和基于扩增的(qRT-PCR)技术。但是,方法存在一些限制:

  • 尽管需要大量的 RNA,但微阵列的灵敏度和特异性仍然是有限的
  • 虽然被认为是基因表达分析的金标准,但 qRT-PCR 通常是低通量的,如果要检测大量基因,则需要大量的 RNA

因此,分析数量和质量有限的样品(例如来自 FFPE 组织降解的 RNA)时,这两种技术都存在一定挑战。使用 NGS 和 Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒进行靶向测序不仅可以提供绝对表达量,还可以快速、轻松地从完整或降解的样品中鉴定和定量出低丰度转录本。

Ion-ampliseq-human-kit-350px

使用 Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒和 Ion Proton 高通量测序系统提高了基因水平转录本的检测。Venn 显示图展示了通过 MAQC 微阵列数据和 Ion AmpliSeq 转录组人类基因表达试剂盒鉴定的基因一致性。


Ion AmpliSeq 转录组人或小鼠基因表达试剂盒的工作流程
select-target-icon-grey

在单个反应中扩增> 20,000 个目标

产品:

  • Ion AmpliSeq 转录组人或小鼠基因表达试剂盒
s5-icon-grey-120

使用 Ion S5 系统或 Ion Proton 系统进行测序

产品:

  • Ion 540 Chip Kit

详细了解 Ion S5 系统 ›

analyze-grey-120x91
  • 运行 AmpliSeqRNA 插件以生成简单易用的读取数据文件
  • 执行简单的统计分析或将文件导入现有的微阵列分析通路中

详细了解 Torrent Suite 软件 ›

select-target-icon-grey

在单个反应中扩增> 20,000 个目标

产品:

  • Ion AmpliSeq 转录组人或小鼠基因表达试剂盒
s5-icon-grey-120

使用 Ion S5 系统或 Ion Proton 系统进行测序

产品:

  • Ion 540 Chip Kit

详细了解 Ion S5 系统 ›

analyze-grey-120x91
  • 运行 AmpliSeqRNA 插件以生成简单易用的读取数据文件
  • 执行简单的统计分析或将文件导入现有的微阵列分析通路中

详细了解 Torrent Suite 软件 ›


Ion GeneStudio S5 系列高通量测序系统

现在实验室中使用 NGS 比以往任何时候都更加简单。Ion GeneStudio S5 系列高通量测序系统为实验室提供了最简单的靶向测序工作流程,并且具有出色的速度和经济性。将您的研究重点放在具有潜在影响力的应用上。这些 NGS 系统具有模块化构建,实验室可以灵活地在单个系统上执行多个靶向的测序应用程序。

详细了解 Ion GeneStudio S5 系列系统 ›

仅供科研使用,不可用于诊断目的。