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DNA タイプ別のゲノム DNA 抽出
あらゆる DNA 抽出ニーズに対応する製品ラインアップ
当社の DNA 抽出製品には、セルフリー DNAや微生物 DNA、配列特異的 DNA、 PCR 産物の精製が可能なキットおよび試薬のラインアップがあります。
以下の DNA 抽出製品の詳細をご覧ください。
セルフリーサンプルからの DNA 抽出
血漿、血清、尿などの体液検体は、セルフリー DNA （cfDNA ）が含まれています。cfDNA は病原体の検出に使用され、cfDNA ターゲットは腫瘍学研究のバイオマーカーとして使用されます。cfDNA の単離は、通常のサンプル量では cfDNA 量が少ないために困難です。病原体の検出では、一般にウイルス粒子の個体数が少ないことから、その捕捉が困難です。そのため、分析に十分な量の cfDNA 量を得るには、大量の体液が必要です（取り扱いが難しい場合があります）。当社は、大量の体液の処理をしながら、いくつかのフォーマットオプションで、幅広い検体タイプから cfDNA を効率的に回収できる拡張性の高い製品を開発しました。
血漿、血清、尿、どの検体に対する DNA 抽出キットが適していますか？
| 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | |
| ウイルス核酸の迅速単離 | 使いやすく、高感度 | 大量の血漿を処理できる自動化フォーマット | |
|---|---|---|---|
| PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit | PureLink Pro 96 Viral RNA/DNA Purification Kit | MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit | |
| サンプルインプット | 500 μL | 200 μL | 0.5 ～ 10 mL |
| 対応サンプル | 血漿、血清、脳脊髄液 | 血漿、血清、脳脊髄液 | 血漿、血清、尿 |
| 単離法 | シリカメンブレン | フィルタープレート | 磁気ビーズ |
| ハイスループット対応 | No | Yes | Yes |
| 対応アプリケーション | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング |
| 調製時間 | 15 分 | 35 分 | 24 < 1 時間でサンプリング |
| 調製サイズ | 50 調製 | 4 × 96 調製 | 50 調製 |
PureLink Microbiome DNA Purification Kit
Invitrogen PureLink Microbiome DNA Purification Kitにより、糞便や土壌などの困難なサンプルを含むさまざまなサンプルから、高品質の微生物および宿主 DNA を迅速に単離できます。このキットでは、実績のある PureLink スピンカラムテクノロジーを使用して、細菌や真菌から精製した DNA を確実に回収し、PCR やシーケンスなどのダウンストリームアプリケーションに対応します。きわめて効率的なトリプル溶解アプローチ、阻害物質の迅速な除去、DNA 抽出手順の多様性により、マイクロバイオーム研究プロジェクトや、さまざまなサンプルに含まれる病原菌の迅速な検出を目的としたプログラムのために適したキットです。
PureLink Microbiome DNA Purification Kit によって以下が可能となります：
- 熱的、化学的および機械的な破壊と特殊ビーズを組み合わせることにより、あらゆる微生物（複雑で厚い細胞壁を持つ丈夫な種を含む）を効率的に溶解
- 新規のクリーンアップバッファーを用いた沈殿による阻害化合物の除去
- さまざまな生体サンプル用に効率化されたプロトコル
- PCR、シーケンシング、その他多くのダウンストリーム解析に対応した高純度 DNA の回収
多様なサンプルタイプから微生物および宿主 DNA を単離する唯一のキット
PureLink Microbiome DNA Purification Kit は、多様な生体サンプルでの使用に最適化されているため、「専用」キットの注文は不要です。この多用途キットを用いれば、以下のサンプルから微生物（および該当する場合は宿主）DNA の精製が可能になります。
|
|
ビデオ：糞便サンプルから微生物および宿主 DNA を精製する方法
サンプリングされた微生物コミュニティ内の多様な微生物を正確に反映する微生物 DNA を単離する方法を学びます。このビデオでは、糞便の微生物の DNA 単離の概要、ヒントおよびコツを紹介します。PureLink Microbiome DNA Purification Kit は、糞便のほかにも、尿、唾液、スワブサンプル、輸送培地、微生物培養、および土壌から DNA を単離するために使用できます。
ビデオ：隠れた細菌を明らかに：マイクロバイオームを理解する
アリゾナ大学がんセンターの Genomics Shared Service の共同ディレクター、ワッツ博士は、ヒトマイクロバイオームの理解と疾患の発症と進行における役割の理解に焦点を合わせています。とりわけ、16S RNA シーケンスを採用して、糖尿病性足潰瘍の患者に認められるすべての細菌を正しく同定しています。
裏付けとなる実験データ
図 1.ヒト糞便からの微生物および宿主 DNA の精製PureLink Microbiome DNA Purification Kit（PL）および主要な競合他社キット（MB）を用いて、3 人のドナー（D1–D3）から採取した 0.2 g の糞便サンプル（3 組）から DNA を単離しました。 （A）Thermo Scientific NanoDrop スペクトロメーターおよび Invitrogen Qubit 蛍光光度計で測定した DNA 濃度および DNA 純度（A260／A230、A260／A280）。溶出量：両キットで 100 μL。PureLink キットでは、他社キットに比べ 2 ～ 5 倍の回収できました。 （B）0.8％アガロースゲル上での DNA 解析M：1 kb ラダー。PureLink キットにより、他社キットよりもはるかに大量の、高品質な DNA を回収できました。 （C）対応する Applied Biosystems TaqMan アッセイを用いた 3 種の細菌ターゲット（Bifidobacterium、E. coli および Bacteroides／Prevotella）の qPCR 解析。PureLink キットで作成したサンプルは、他社キットで生成したサンプルよりも閾値サイクル（Ct）が低く、良好な PCR 増幅を示しています。大量の DNA テンプレートと低レベルの阻害物質の両方が、PCR 増幅の効率に寄与します。
図 2.培地からの細菌 DNA の精製E. coli DNA は、PureLink マイクロバイオーム DNA 精製キットを使用して、0.2、0.4、および 1 mL の培養サンプル（3 組）から単離されました。 （A） Thermo Scientific NanoDrop スペクトロメーター（青いバー）および Invitrogen Qubit 蛍光光度計（赤いバー）で測定した DNA 濃度を示します。すべての調製 において、DNA は高純度でした：A260/A280 ＝ 1.9、A260/A230 ＝ 2.1–2.3。 （B） E. coli 特異的 TaqMan アッセイによる qPCR 解析。3 種のサンプルインプット量で実行された単離の閾値サイクル（Ct）が表示されます。
ユーザーガイド
DNA の複雑な混合物からの PCR クリーンアップ
PCR クリーンアップはルーチン作業ですが、時間のかかるラボラトリー手順です。より簡単で迅速、かつ安全なメソッドを使用して、より良好な結果が得られます。短いプライマー、未結合の dNTP、酵素、短く不完全な PCR 産物、塩などを PCR 反応から効率的に除去する、簡単かつ迅速な PCR クリーンアップメソッドを用いて、DNA を精製できます。
単離された DNA は、シーケンシング、PCR、トランスクリプション、マッピング、クローニング、およびラベリングにすぐに使用できます。当社は、幅広い Invitrogen PCR クリーンアップキットに加え、高純度の DNA を高収率で得るために必要なサポートも提供しています。
最適な PCR 産物クリーンアップキットは？
| 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | |
| 副産物の迅速で効率的な除去 | 低収量 PCR 産物の濃縮に最適 | 迅速で拡張可能なメソッド、96-ウェルフォーマット | 迅速で拡張可能な磁気ビーズフォーマット | |
|---|---|---|---|---|
| PureLink PCR Purification Kit | PureLink PCR Micro Purification Kit | PureLink 96 PCR Purification Kit | ChargeSwitch PCR Clean-Up Kit | |
| フォーマット | スピン／真空カラム | スピン／真空カラム | 96-ウェルプレート（真空／遠心分離器） | 磁気ビーズ |
| プロトコル時間 | 15 分 | 15 分 | 15 分 | 5 分 |
| サンプル量 | 50 ～ 100 μL | 50～ 100 μL | 50～ 100 μL | 25～ 50 μL |
| プラスミド DNA 収量 | 最大 40 μg | 最大 20 μg | 最大 20 μg | 最大 30 μg |
| DNA フラグメントサイズ | 100 bp ～ 15 kb | 100 bp ～ 15 kb | 100 bp ～ 15 kb | 90 bp ～ 40 kb |
| 結合容量 | 最大 40 μg | 最大 40 μg | 最大 40 μg | ～ 25 μg/mg ビーズ |
| ダウンストリームアプリケーション | シーケンシング、シーケンシング（次世代）、核酸ラベリング、PCR、クローニング | シーケンシング、核酸ラベリング、PCR、クローニング | シーケンシング、クローニング | シーケンシング、シーケンシング（次世代）、マイクロアレイ解析、PCR、クローニング |
| ハイスループット対応 | No | No | Yes | Yes |
| パックサイズ | 50 調製 250 調製 | 50 調製 250 調製 | 4 プレート | 100 調製 960 調製 |
| 製品番号 | K310001 K310002 | K310050 K310250 | K3100-96A | CS12000 CS12000-10 |
PCR 精製とゲル抽出の両方を実施する場合
同一のキットでいずれのプロセスも可能な当社の Invitrogen PureLink Combo Kit をご検討ください。
Invitrogen PureLink Quick Gel Extraction and PCR Purification Combo Kit についてご覧ください。
DNA の迅速かつ簡単なゲル抽出
PureLink Quick Gel Extraction Kit は、30 分以内にアガロースゲルから DNA 断片を精製できます。シンプルな手順では、独自のシリカメンブレンスピンカラムを使用して、pH 調整の必要なく 40 bp ～ 10 kb の DNA フラグメントを捕捉し精製します。単離された DNA はタンパク質、色素、アガロースを含んでおらず、DNA シーケンス、PCR、in vitro 転写、制限マッピング、クローニング、ラベリングなどのさまざまなアプリケーションにすぐに使用できます（図 1）。
図 1.PureLink Quick Gel Extraction Kit を使用して単離された DNA の増幅。組み換え Taq DNA ポリメラーゼを用いて、サイズが 100 bp ～ 5.4 kb の PCR アンプリコンを調製しました。各 PCR 反応の一部を 1％ UltraPure Agarose ゲルで実行し（データは示していません）、アンプリコンバンドを切り取り、PureLink Quick Gel Extraction Kit を用いて抽出しました。未精製のゲル抽出 PCR 産物を 1％アガロースゲルにロードし、SYBR Safe DNA Gel Stain を用いて可視化しました。
PureLink Quick Gel Extraction Kit の環境利点
PureLink Combo Kit
複雑な PCR 混合物から DNA を単離し、アガロースゲルからバンドを回収しますか？コンボキットをお試しください。
PureLink クイックゲル抽出キットおよび PCR 精製コンボキットは、ゲル抽出と PCR 精製を一つのキットで実行する機能を提供します。
PureLink Quick Gel Extraction および PCR Purification Combo Kit についてご紹介します。 ›
テクニカルリソース
|
シーケンス特異的な RNA／DNA 精製
Invitrogen ストレプトアビジン結合 Dynabeads は、特定の RNA または DNA 配列を捕捉し、溶液中から直接回収するために使用できる確実で汎用性のあるツールです。これらのモノサイズの超常磁性 Dynabeads は、ニトロセルロースに代わる、効率的な固相の代替手段を提供し、他に例を見ないレベルの製品品質で、データ整合性を提供します。優れた近液相反応動態により、きわめて迅速なプロトコルが可能となります。磁気処理では、ダウンストリームの操作やバッファー変更が簡単に行えます。ビーズに結合した標的をマグネットによってチューブ壁で濃縮し、上澄み液を廃棄するのと同様のシンプルさです。これらのビーズは、ほとんどの体液、植物、動物および微生物由来の粗溶解物、ならびに精製したトータル RNA またはトータル DNA などの、きわめて広範囲の種類のサンプルに適用可能です。これらの Dynabeads は特異的ターゲットの RNA または DNA のみに相互作用するため、トータル RNA またはトータル DNA のアップストリームでの精製はほとんどの場合不要です。
ダイレクトキャプチャー法では、二本鎖 PCR 産物のビーズ上への固定が含まれます。これらは一本鎖ビーズ結合テンプレートに簡単に変換された後、特定の RNA 分子または DNA 分子を溶液から直接捕捉するために使用されます。
また、別のインダイレクトキャプチャーアプローチでは、より速い反応速度を得られる場合があります。このインダイレクトキャプチャー法により、磁気ビーズを固定する前に標的配列を捕捉できます。まず、ビオチン化された捕捉配列（一本鎖 DNA）をサンプルと共にインキュベートし、溶液中の標的 RNA 分子または DNA 分子にハイブリダイズします。次に、ストレプトアビジンコート済みの Dynabeads を混合物に添加し、ハイブリダイズした配列をストレプトアビジン-ビオチン結合を介して Dynabeads に固定します。
1 μm Dynabeads MyOne Streptavidin C1 は、ビーズ 1 mg あたりの表面積が非常に大きく、微量の RNA または DNA を高濃縮できます。研究の目的が、脳脊髄液のような粘性の高いサンプルから核酸を捕捉する場合は、より大きな 2.8 μm サイズの Dynabeads M-270 Streptavidinの使用を推奨いたします。 これらの Dynabeads（MyOne Streptavidin C1 および M-270 Streptavidin）は、最適なデザインにより表面がわずかに負に帯電しており、標的以外の核酸配列への非特異的な結合を無視できます。
アプリケーションの例；RNA／DNA 感染性因子（1、2、3、4）の単離、サブトラクティブハイブリダイゼーション（5、6、7）、cDNA の選択および濃縮、変異した配列の検出および単離（8、9、10）、細胞特異的な転写物の単離および mRNA の示差表示が挙げられます。
核酸捕捉アッセイについて学ぶ ›
- Meng Q. et al.(2001) Automated multiplex assay system for simultaneous detection of hepatitis B virus DNA, hepatitis C virus RNA and human immunodeficiency virus type 1 RNA.J.Clin.Microbiol.39(8):2937-2945.
- Stevens SJC. et al.(1999) Monitoring of Epstein-Barr virus DNA load in peripheral blood by quantitative competitive PCR.J.Clin.Microbiol.37:2852-2857.
- Mangiapan G. et al.(1996) Sequence capture-PCR improves detection of mycobacterial DNA in clinical specimens.J. Clin.Microbiol.34(5):1209-1215.
- Shuber AP. et.al.(2002) Accurate, noninvasive detection of Helicobacter pylori DNA from stool samples: potential usefulness for monitoring treatment.J. Clin.Microbiol.40(1):262-264.
- Hansen-Hagge TE. et.al.(2001) Identification of sample-specific sequences in mammalian cDNA and genomic DNA by the novel ligation-mediated subtraction (LIMES).Nucl.Acids Res.29(4):e20.
- Pradel N. et.al.(2002) Genomic subtraction to identify and characterize sequences of Shiga toxin-producing Escherichia coli O91:H21.Appl.Env.Microbiol.68(5):2316-2325.
- Laveder P. et.al.(2002) A two-step strategy for constructing specifically self-subtracted cDNA libraries.Nucleic Acids Res.30(9):e38.
- Lindblad-Toh K.et.al.(2000) Large-scale discovery and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the mouse.Nature Genetics.24:381-386.
- Miyashiro I. et.al.(2001) Molecular strategy for detecting metastatic cancers with use of multiple tumor-specific MAGE-A genes.Clin.Chem.47(3):505-512.
- Dong SM. et.al.(2001) Detection of colorectal cancer in stool with the use of multiple genetic targets.J Natl.Cancer Inst.93(11):858-865.
セルフリーサンプルからの DNA 抽出
血漿、血清、尿などの体液検体は、セルフリー DNA （cfDNA ）が含まれています。cfDNA は病原体の検出に使用され、cfDNA ターゲットは腫瘍学研究のバイオマーカーとして使用されます。cfDNA の単離は、通常のサンプル量では cfDNA 量が少ないために困難です。病原体の検出では、一般にウイルス粒子の個体数が少ないことから、その捕捉が困難です。そのため、分析に十分な量の cfDNA 量を得るには、大量の体液が必要です（取り扱いが難しい場合があります）。当社は、大量の体液の処理をしながら、いくつかのフォーマットオプションで、幅広い検体タイプから cfDNA を効率的に回収できる拡張性の高い製品を開発しました。
血漿、血清、尿、どの検体に対する DNA 抽出キットが適していますか？
| 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | |
| ウイルス核酸の迅速単離 | 使いやすく、高感度 | 大量の血漿を処理できる自動化フォーマット | |
|---|---|---|---|
| PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit | PureLink Pro 96 Viral RNA/DNA Purification Kit | MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit | |
| サンプルインプット | 500 μL | 200 μL | 0.5 ～ 10 mL |
| 対応サンプル | 血漿、血清、脳脊髄液 | 血漿、血清、脳脊髄液 | 血漿、血清、尿 |
| 単離法 | シリカメンブレン | フィルタープレート | 磁気ビーズ |
| ハイスループット対応 | No | Yes | Yes |
| 対応アプリケーション | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング | クローニング、qPCR、シーケンシング、ジェノタイピング |
| 調製時間 | 15 分 | 35 分 | 24 < 1 時間でサンプリング |
| 調製サイズ | 50 調製 | 4 × 96 調製 | 50 調製 |
PureLink Microbiome DNA Purification Kit
Invitrogen PureLink Microbiome DNA Purification Kitにより、糞便や土壌などの困難なサンプルを含むさまざまなサンプルから、高品質の微生物および宿主 DNA を迅速に単離できます。このキットでは、実績のある PureLink スピンカラムテクノロジーを使用して、細菌や真菌から精製した DNA を確実に回収し、PCR やシーケンスなどのダウンストリームアプリケーションに対応します。きわめて効率的なトリプル溶解アプローチ、阻害物質の迅速な除去、DNA 抽出手順の多様性により、マイクロバイオーム研究プロジェクトや、さまざまなサンプルに含まれる病原菌の迅速な検出を目的としたプログラムのために適したキットです。
PureLink Microbiome DNA Purification Kit によって以下が可能となります：
- 熱的、化学的および機械的な破壊と特殊ビーズを組み合わせることにより、あらゆる微生物（複雑で厚い細胞壁を持つ丈夫な種を含む）を効率的に溶解
- 新規のクリーンアップバッファーを用いた沈殿による阻害化合物の除去
- さまざまな生体サンプル用に効率化されたプロトコル
- PCR、シーケンシング、その他多くのダウンストリーム解析に対応した高純度 DNA の回収
多様なサンプルタイプから微生物および宿主 DNA を単離する唯一のキット
PureLink Microbiome DNA Purification Kit は、多様な生体サンプルでの使用に最適化されているため、「専用」キットの注文は不要です。この多用途キットを用いれば、以下のサンプルから微生物（および該当する場合は宿主）DNA の精製が可能になります。
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ビデオ：糞便サンプルから微生物および宿主 DNA を精製する方法
サンプリングされた微生物コミュニティ内の多様な微生物を正確に反映する微生物 DNA を単離する方法を学びます。このビデオでは、糞便の微生物の DNA 単離の概要、ヒントおよびコツを紹介します。PureLink Microbiome DNA Purification Kit は、糞便のほかにも、尿、唾液、スワブサンプル、輸送培地、微生物培養、および土壌から DNA を単離するために使用できます。
ビデオ：隠れた細菌を明らかに：マイクロバイオームを理解する
アリゾナ大学がんセンターの Genomics Shared Service の共同ディレクター、ワッツ博士は、ヒトマイクロバイオームの理解と疾患の発症と進行における役割の理解に焦点を合わせています。とりわけ、16S RNA シーケンスを採用して、糖尿病性足潰瘍の患者に認められるすべての細菌を正しく同定しています。
裏付けとなる実験データ
図 1.ヒト糞便からの微生物および宿主 DNA の精製PureLink Microbiome DNA Purification Kit（PL）および主要な競合他社キット（MB）を用いて、3 人のドナー（D1–D3）から採取した 0.2 g の糞便サンプル（3 組）から DNA を単離しました。 （A）Thermo Scientific NanoDrop スペクトロメーターおよび Invitrogen Qubit 蛍光光度計で測定した DNA 濃度および DNA 純度（A260／A230、A260／A280）。溶出量：両キットで 100 μL。PureLink キットでは、他社キットに比べ 2 ～ 5 倍の回収できました。 （B）0.8％アガロースゲル上での DNA 解析M：1 kb ラダー。PureLink キットにより、他社キットよりもはるかに大量の、高品質な DNA を回収できました。 （C）対応する Applied Biosystems TaqMan アッセイを用いた 3 種の細菌ターゲット（Bifidobacterium、E. coli および Bacteroides／Prevotella）の qPCR 解析。PureLink キットで作成したサンプルは、他社キットで生成したサンプルよりも閾値サイクル（Ct）が低く、良好な PCR 増幅を示しています。大量の DNA テンプレートと低レベルの阻害物質の両方が、PCR 増幅の効率に寄与します。
図 2.培地からの細菌 DNA の精製E. coli DNA は、PureLink マイクロバイオーム DNA 精製キットを使用して、0.2、0.4、および 1 mL の培養サンプル（3 組）から単離されました。 （A） Thermo Scientific NanoDrop スペクトロメーター（青いバー）および Invitrogen Qubit 蛍光光度計（赤いバー）で測定した DNA 濃度を示します。すべての調製 において、DNA は高純度でした：A260/A280 ＝ 1.9、A260/A230 ＝ 2.1–2.3。 （B） E. coli 特異的 TaqMan アッセイによる qPCR 解析。3 種のサンプルインプット量で実行された単離の閾値サイクル（Ct）が表示されます。
ユーザーガイド
DNA の複雑な混合物からの PCR クリーンアップ
PCR クリーンアップはルーチン作業ですが、時間のかかるラボラトリー手順です。より簡単で迅速、かつ安全なメソッドを使用して、より良好な結果が得られます。短いプライマー、未結合の dNTP、酵素、短く不完全な PCR 産物、塩などを PCR 反応から効率的に除去する、簡単かつ迅速な PCR クリーンアップメソッドを用いて、DNA を精製できます。
単離された DNA は、シーケンシング、PCR、トランスクリプション、マッピング、クローニング、およびラベリングにすぐに使用できます。当社は、幅広い Invitrogen PCR クリーンアップキットに加え、高純度の DNA を高収率で得るために必要なサポートも提供しています。
最適な PCR 産物クリーンアップキットは？
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| 副産物の迅速で効率的な除去 | 低収量 PCR 産物の濃縮に最適 | 迅速で拡張可能なメソッド、96-ウェルフォーマット | 迅速で拡張可能な磁気ビーズフォーマット | |
|---|---|---|---|---|
| PureLink PCR Purification Kit | PureLink PCR Micro Purification Kit | PureLink 96 PCR Purification Kit | ChargeSwitch PCR Clean-Up Kit | |
| フォーマット | スピン／真空カラム | スピン／真空カラム | 96-ウェルプレート（真空／遠心分離器） | 磁気ビーズ |
| プロトコル時間 | 15 分 | 15 分 | 15 分 | 5 分 |
| サンプル量 | 50 ～ 100 μL | 50～ 100 μL | 50～ 100 μL | 25～ 50 μL |
| プラスミド DNA 収量 | 最大 40 μg | 最大 20 μg | 最大 20 μg | 最大 30 μg |
| DNA フラグメントサイズ | 100 bp ～ 15 kb | 100 bp ～ 15 kb | 100 bp ～ 15 kb | 90 bp ～ 40 kb |
| 結合容量 | 最大 40 μg | 最大 40 μg | 最大 40 μg | ～ 25 μg/mg ビーズ |
| ダウンストリームアプリケーション | シーケンシング、シーケンシング（次世代）、核酸ラベリング、PCR、クローニング | シーケンシング、核酸ラベリング、PCR、クローニング | シーケンシング、クローニング | シーケンシング、シーケンシング（次世代）、マイクロアレイ解析、PCR、クローニング |
| ハイスループット対応 | No | No | Yes | Yes |
| パックサイズ | 50 調製 250 調製 | 50 調製 250 調製 | 4 プレート | 100 調製 960 調製 |
| 製品番号 | K310001 K310002 | K310050 K310250 | K3100-96A | CS12000 CS12000-10 |
PCR 精製とゲル抽出の両方を実施する場合
同一のキットでいずれのプロセスも可能な当社の Invitrogen PureLink Combo Kit をご検討ください。
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DNA の迅速かつ簡単なゲル抽出
PureLink Quick Gel Extraction Kit は、30 分以内にアガロースゲルから DNA 断片を精製できます。シンプルな手順では、独自のシリカメンブレンスピンカラムを使用して、pH 調整の必要なく 40 bp ～ 10 kb の DNA フラグメントを捕捉し精製します。単離された DNA はタンパク質、色素、アガロースを含んでおらず、DNA シーケンス、PCR、in vitro 転写、制限マッピング、クローニング、ラベリングなどのさまざまなアプリケーションにすぐに使用できます（図 1）。
図 1.PureLink Quick Gel Extraction Kit を使用して単離された DNA の増幅。組み換え Taq DNA ポリメラーゼを用いて、サイズが 100 bp ～ 5.4 kb の PCR アンプリコンを調製しました。各 PCR 反応の一部を 1％ UltraPure Agarose ゲルで実行し（データは示していません）、アンプリコンバンドを切り取り、PureLink Quick Gel Extraction Kit を用いて抽出しました。未精製のゲル抽出 PCR 産物を 1％アガロースゲルにロードし、SYBR Safe DNA Gel Stain を用いて可視化しました。
PureLink Quick Gel Extraction Kit の環境利点
PureLink Combo Kit
複雑な PCR 混合物から DNA を単離し、アガロースゲルからバンドを回収しますか？コンボキットをお試しください。
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テクニカルリソース
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シーケンス特異的な RNA／DNA 精製
Invitrogen ストレプトアビジン結合 Dynabeads は、特定の RNA または DNA 配列を捕捉し、溶液中から直接回収するために使用できる確実で汎用性のあるツールです。これらのモノサイズの超常磁性 Dynabeads は、ニトロセルロースに代わる、効率的な固相の代替手段を提供し、他に例を見ないレベルの製品品質で、データ整合性を提供します。優れた近液相反応動態により、きわめて迅速なプロトコルが可能となります。磁気処理では、ダウンストリームの操作やバッファー変更が簡単に行えます。ビーズに結合した標的をマグネットによってチューブ壁で濃縮し、上澄み液を廃棄するのと同様のシンプルさです。これらのビーズは、ほとんどの体液、植物、動物および微生物由来の粗溶解物、ならびに精製したトータル RNA またはトータル DNA などの、きわめて広範囲の種類のサンプルに適用可能です。これらの Dynabeads は特異的ターゲットの RNA または DNA のみに相互作用するため、トータル RNA またはトータル DNA のアップストリームでの精製はほとんどの場合不要です。
ダイレクトキャプチャー法では、二本鎖 PCR 産物のビーズ上への固定が含まれます。これらは一本鎖ビーズ結合テンプレートに簡単に変換された後、特定の RNA 分子または DNA 分子を溶液から直接捕捉するために使用されます。
また、別のインダイレクトキャプチャーアプローチでは、より速い反応速度を得られる場合があります。このインダイレクトキャプチャー法により、磁気ビーズを固定する前に標的配列を捕捉できます。まず、ビオチン化された捕捉配列（一本鎖 DNA）をサンプルと共にインキュベートし、溶液中の標的 RNA 分子または DNA 分子にハイブリダイズします。次に、ストレプトアビジンコート済みの Dynabeads を混合物に添加し、ハイブリダイズした配列をストレプトアビジン-ビオチン結合を介して Dynabeads に固定します。
1 μm Dynabeads MyOne Streptavidin C1 は、ビーズ 1 mg あたりの表面積が非常に大きく、微量の RNA または DNA を高濃縮できます。研究の目的が、脳脊髄液のような粘性の高いサンプルから核酸を捕捉する場合は、より大きな 2.8 μm サイズの Dynabeads M-270 Streptavidinの使用を推奨いたします。 これらの Dynabeads（MyOne Streptavidin C1 および M-270 Streptavidin）は、最適なデザインにより表面がわずかに負に帯電しており、標的以外の核酸配列への非特異的な結合を無視できます。
アプリケーションの例；RNA／DNA 感染性因子（1、2、3、4）の単離、サブトラクティブハイブリダイゼーション（5、6、7）、cDNA の選択および濃縮、変異した配列の検出および単離（8、9、10）、細胞特異的な転写物の単離および mRNA の示差表示が挙げられます。
核酸捕捉アッセイについて学ぶ ›
- Meng Q. et al.(2001) Automated multiplex assay system for simultaneous detection of hepatitis B virus DNA, hepatitis C virus RNA and human immunodeficiency virus type 1 RNA.J.Clin.Microbiol.39(8):2937-2945.
- Stevens SJC. et al.(1999) Monitoring of Epstein-Barr virus DNA load in peripheral blood by quantitative competitive PCR.J.Clin.Microbiol.37:2852-2857.
- Mangiapan G. et al.(1996) Sequence capture-PCR improves detection of mycobacterial DNA in clinical specimens.J. Clin.Microbiol.34(5):1209-1215.
- Shuber AP. et.al.(2002) Accurate, noninvasive detection of Helicobacter pylori DNA from stool samples: potential usefulness for monitoring treatment.J. Clin.Microbiol.40(1):262-264.
- Hansen-Hagge TE. et.al.(2001) Identification of sample-specific sequences in mammalian cDNA and genomic DNA by the novel ligation-mediated subtraction (LIMES).Nucl.Acids Res.29(4):e20.
- Pradel N. et.al.(2002) Genomic subtraction to identify and characterize sequences of Shiga toxin-producing Escherichia coli O91:H21.Appl.Env.Microbiol.68(5):2316-2325.
- Laveder P. et.al.(2002) A two-step strategy for constructing specifically self-subtracted cDNA libraries.Nucleic Acids Res.30(9):e38.
- Lindblad-Toh K.et.al.(2000) Large-scale discovery and genotyping of single-nucleotide polymorphisms in the mouse.Nature Genetics.24:381-386.
- Miyashiro I. et.al.(2001) Molecular strategy for detecting metastatic cancers with use of multiple tumor-specific MAGE-A genes.Clin.Chem.47(3):505-512.
- Dong SM. et.al.(2001) Detection of colorectal cancer in stool with the use of multiple genetic targets.J Natl.Cancer Inst.93(11):858-865.
互換性
当社の製品を使用して、以下を含む多くの基本的なダウンストリーム分子生物学実験のために優れた再現性で高品質の DNA を抽出できます。
- 次世代シーケンス
- PCR
- DNA クローニング
- DNA シーケンス
- DNA 電気泳動
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