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従来の small/short hairpin RNA(shRNA)配列は通常、Pol III プロモーターを含むベクターから細胞核の中に転写されます。 ループで繋がったターゲット遺伝子のセンスおよびアンチセンス配列を含む shRNA は核から細胞質に移動し、そこで Dicer が shRNA を small/short interfering RNAs(siRNA)に加工します。 この時点でタンパク質発現のノックダウンに進みます。 当社は、改良ベクターテクノロジーである BLOCK-iT™ Pol II miR RNAi Vectors を提供しており、これは従来の shRNA ベクターと比較してより多くの利点を有しています。
当社は、shRNA ベクターを作成するためのシンプルで効率化したアプローチを実現する 2 種類のキットを提供しています。 BLOCK-iT™ U6 RNAi Entry Vectors は shRNA の構成的発現を実現し、BLOCK-iT™ Inducible H1 Entry Vectors は、テトラサイクリンによりshRNA 配列の発現を誘導するためのプロモーターを使用しています。 目的の shRNA を含んでいる BLOCK-iT™ エントリーベクターを哺乳細胞に直接トランスフェクションするか、shRNA カセットを他の BLOCK-iT™-DEST ベクター(アデノウイルスまたはレンチウイルスのデリバリー用ベクターを含む)に容易に導入できます。
図 1. BLOCK-iT™ shRNA Entry Vectors
shRNA の誘導的かつ構成的な BLOCK-iT™ エントリーベクターへの簡単なクローニング。 shRNA を発現しているベクターは、センス-ループ-アンチセンス配列を目的遺伝子にコードする二本鎖短 DNA オリゴをデザインすることによって作成されます。 この配列はいずれかの側で、エントリーベクターコンストラクトに対応できる 4 ヌクレオチドのオーバーハングを有し、短時間のライゲーション反応によって pENTR™/H1/TO または pENTR™/U6 エントリーベクターにクローンできます 。 エントリーベクターは、TATA 領域に隣接する 2 つのテトラサイクリンオペレーターサイトを有する H1 プロモーター、または U6 Pol III タイプのプロモーターおよび Pol III 終結配列のいずれかを含みます。 二本鎖オリゴ配列がベクターにクローンされると、shRNA を発現している RNAi カセットが作成されます。
shRNA ベクターを簡単に 5 分で作成するには BLOCK-iT™ Inducible H1 RNAi Entry Vector Kit をご使用ください。 BLOCK-iT™ Inducible H1 RNAi Entry Vector Kit を使用すると、エントリークローンを直接トランスフェクションでき、 Zeocin™ を使用して安定株のな選別ができます。 テトラサイクリン抑制遺伝子を発現している細胞株では、目的の shRNA 発現を細かくコントロールできるため、以下のことが可能です。
または、一過性の shRNA 発現が必要な場合は、BLOCK-iT™ U6 RNAi Entry Vector Kit を使用して、多数の哺乳細胞タイプで shRNA 配列を導入および発現できます。
shRNA カセットを一つまたは複数の BLOCK-iT™ DEST ベクターに導入して、shRNA を高効率で哺乳細胞にデリバリーおよび発現できます。 各デスティネーション(DEST)ベクターは Gateway® テクノロジーによりデザインされているため、RNAi カセットを BLOCK-iT™ pENTR™ ベクターから BLOCK-iT™-DEST ベクターへ 1 時間以内に導入できます。 細胞タイプや選別ニーズに合わせて使用するベクターをお選びください。 最適な BLOCK-iT™ ウイルスベクターを選択することで、トランスフェクションが困難な細胞や初代細胞、非分裂性の細胞タイプなど、ほぼすべてのタイプの哺乳細胞に導入できます。
速やかにトランスフェクションできる細胞タイプを使用している場合は、長期の shRNA 発現用に pBLOCK-iT™6- DEST ベクターを選択できます。 Geneticin® または ブラストサイジンでのセレクションには、shRNA カセットをこれらのベクターに導入します。
ベクタータイプ | 特性 | アプリケーション | 利点 | |
---|---|---|---|---|
BLOCK-iT™ Entry Vectors | ベクター: pENTR™/U6 系:プラスミド 選別: なし プロモーター: U6 | トランスフェクション可能な哺乳細胞の一過性 RNAi | - shRNA 発現用の構成的プロモーター - ベンチで 5 分でできる shRNA カセットのクローニング - shRNA カセットの他の BLOCK-iT™ DEST ベクターへの簡単な導入 - 費用効果が高く簡単に再利用できるベクター | BLOCK-iT™ U6 RNAi Entry Vector Kit(K4945-00) |
ベクター: pENTR™/H1/ TO 系:プラスミド セレクター: Zeocin™ プロモーター: H1/TO | プラスミド | - shRNA 発現の低ベースで効果的な活性のためのテトラサイクリン誘導性 H1 プロモーター - ベンチで 5 分でできる shRNA カセットのクローニング - shRNA カセットの他の BLOCK-iT™ DEST ベクターへの簡単な導入 - 費用効果が高く簡単に再利用できるベクター | BLOCK-iT™ Inducible H1 RNAi Entry Vector Kit(K4920-00) | |
Viral BLOCK-iT™ DEST Vectors | ベクター: pLenti4/BLOCK-iT™ -DEST 系:レンチウイルス 選別: Zeocin™ プロモーター:なし | ほぼすべての哺乳細胞または動物モデルの安定した RNAi | - レンチウイルスの効果的な組込みから shRNA の効率的な長期発現 - 初代細胞および非分裂性細胞の再現性のある導入 - 1 時間で簡単にできる H1/TO または U6 shRNA カセットの組み換え - テトラサイクリンリプレッサー発現性細胞株の誘導性 H1/TO の発現と互換性のある Zeocin™ 選別 | BLOCK-iT™ Lentiviral RNAi Zeo Gateway® Vector Kit (V488-20) BLOCK-iT™ Inducible H1 Lentiviral RNAi System (K4925-00) |
ベクター: pLenti6 /BLOCK-iT™ -DEST 系:レンチウイルス 選別:ブラストサイジン プロモーター:なし | レンチウイルス | - レンチウイルスの効果的な組込みから shRNA の効率的な長期発現 - 初代細胞および非分裂性細胞の再現性のある導入 - 1 時間で簡単にできる H1/TO または U6 shRNA カセットの組み換え - 効果的なブラストサイジン選別剤による迅速な選別 | BLOCK-iT™ Lentiviral RNAi Gateway® Vector Kit (K4943-00) BLOCK-iT™ Lentiviral RNAi Expression System (K4944-00) | |
ベクター: pAd/BLOCK-iT™ -DEST 系:アデノウイルス 選別:なし プロモーター:なし | アデノウイルス | - ほぼすべてタイプの哺乳細胞への効率的で再現性のある導入 - 多数の実験や動物作業に備えるための高力価のウイルスストック - シャトルベクターまたは他の面倒なメソッドを必要としない、1 時間で簡単にできる H1/TO または U6 shRNA カセットの組み換え | ||
pBLOCK-iT™ -DEST Vectors | ||||
ベクター: pBLOCK-iT™6 -DEST 系:プラスミド 選別:ブラストサイジン プロモーター:なし | プラスミド | - 安定した長期発現 - 効果的なブラストサイジン選別剤による迅速な選別 | pBLOCK-iT™ 6-DEST (V487-20) | |
サポートベクター | ベクター: pLenti6/TR 系:レンチウイルス 選別:ブラストサイジン プロモーター: CMV | テトラサイクリンリプレッサー(TR)を構成的に発現している安定細胞株の作成 | - レンチウイルスによる導入による、ほぼすべてのタイプの哺乳細胞への効率的な導入と安定した長期の組込み - 誘導系を使用する際に shRNA を超低ベースで発現させるためのテトラサイクリンリプレッサータンパク質を高レベルで発現させるための CMV プロモーター - 効果的なブラストサイジン選別剤による、テトラサイクリンリプレッサータンパク質発現細胞の迅速な選別 | pLenti6/TR Vector Kit(V480-20) |
ベクター pcDNA6/TR 系:プラスミド 選別:ブラストサイジン プロモーター: CMV | プラスミド | - 誘導系を使用する際に shRNA を超低ベースで発現させるためのテトラサイクリンリプレッサータンパク質を高レベルで発現させるための CMV プロモーター - 効果的なブラストサイジン選別剤による、テトラサイクリンリプレッサータンパク質発現細胞の迅速な選別 | pcDNA™6/TR(V1025-20) |
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